BioLiP

>protein
PADIRRATEADMPAVCTIVNHYIETSTVNFRTEPQEPQEWTDDLVRLRERYPWLVAEVDGEVAGIAYAGPWKARNAYDWT
AESTVYVSPRHQRTGLGSTLYTHLLKSLEAQGFKSVVAVIGLPNDPSVRMHEALGYAPRGMLRAAGFKHGNWHDVGFWQL
DFSLPVPPRPVLPVT

The query sequence (length=175) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5t7e:D	175	175	1.0000	1.0000	1.0000	1.82e-130	5t7d:A, 5t7d:B, 5t7d:C, 5t7d:D, 5t7e:A, 5t7e:B, 5t7e:C
2	5wph:A	179	161	0.3371	0.3296	0.3665	6.13e-31	6m7g:A, 6m7g:C, 6m7g:B, 6m7g:D, 6m7g:E, 6m7g:F, 6m7g:L, 5wph:B
3	5dwn:A	181	160	0.3314	0.3204	0.3625	1.50e-29	5dwn:B, 5dwn:C, 5dwn:D
4	4jxr:B	185	160	0.2971	0.2811	0.3250	1.19e-26
5	2j8m:A	171	165	0.3314	0.3392	0.3515	1.05e-22	2bl1:A, 2j8m:B, 2j8r:A, 2j8r:B
6	3dr8:A	173	168	0.3314	0.3353	0.3452	1.60e-22	3dr8:B
7	4mbu:A	165	164	0.2857	0.3030	0.3049	2.91e-22	4mbu:B
8	4jwp:A	165	159	0.2857	0.3030	0.3145	9.44e-22
9	2jlm:F	180	157	0.2514	0.2444	0.2803	6.72e-18
10	2cy2:A	174	145	0.2343	0.2356	0.2828	1.25e-05
11	4qvt:D	146	86	0.1657	0.1986	0.3372	1.94e-04	2pdo:H, 2pdo:B, 4qvt:A, 4qvt:B, 4qvt:C, 4qvt:E, 4qvt:F, 4qvt:G, 4qvt:H
12	2cnm:A	151	88	0.1429	0.1656	0.2841	3.25e-04	2cnm:B, 2cnm:C, 2cns:A, 2cns:B, 2cns:C, 2cnt:A, 2cnt:B, 2cnt:C, 2cnt:D
13	6e1x:C	176	129	0.1657	0.1648	0.2248	0.002	5cnp:B, 5cnp:D, 5cnp:F, 6cx8:A, 6cx8:B, 6cx8:C, 6cx8:D, 6cx8:E, 6cx8:F, 6e1x:A, 6e1x:B, 6e1x:D, 4mhd:A, 4mhd:B, 4mhd:C, 4mi4:A, 4mi4:B, 4mi4:C, 4ncz:A, 4ncz:C, 4ncz:B, 4r57:A, 4r57:B, 4r57:C, 4r57:D, 4r57:E, 4r57:F, 4r57:G, 4r57:H, 4r57:I, 4r57:J, 4r57:K, 4r57:L, 4r87:A, 4r87:B, 4r87:C, 4r87:D, 4r87:E, 4r87:F, 4r87:G, 4r87:H, 4r87:I, 4r87:J, 4r87:K, 4r87:L, 5ug4:A, 5ug4:B, 5ug4:C, 4ygo:A, 4ygo:C, 4ygo:D, 4ygo:E
14	7wx5:A	288	136	0.1714	0.1042	0.2206	0.002	7wx6:A, 7wx7:A
15	7wx5:A	288	41	0.0686	0.0417	0.2927	2.5	7wx6:A, 7wx7:A
16	6wqc:A	293	133	0.1657	0.0990	0.2180	0.012	6wqb:A
17	4pv6:G	154	91	0.1314	0.1494	0.2527	0.023	4pv6:C, 4pv6:I, 4pv6:F, 4pv6:A, 4pv6:H, 4pv6:J, 4pv6:E
18	3f8k:A	131	87	0.1371	0.1832	0.2759	0.16
19	7daj:B	150	97	0.1486	0.1733	0.2680	0.29	7daj:A, 7dak:A, 7dak:B, 7dal:A, 7dal:B
20	2ge3:A	164	105	0.1486	0.1585	0.2476	0.36	2ge3:B, 2ge3:C
21	8v4a:A	466	105	0.1600	0.0601	0.2667	2.1	9bnj:A, 9bnj:B, 9bnj:C, 9bnj:D, 8v2k:A, 8v2k:B, 8v2k:C, 8v2k:D, 8v4a:B, 8v4a:C, 8v4a:D, 8v6p:A, 8v6p:B, 8v6p:C, 8v6p:D, 8v9p:A, 8v9p:B, 8v9p:C, 8v9p:D, 5w19:A, 5w19:B, 5w19:C, 5w19:D
22	2ob0:C	166	47	0.0571	0.0602	0.2128	2.3	2ob0:A, 2ob0:B, 6ppl:A, 2psw:A, 2psw:B, 2psw:C, 3tfy:A, 3tfy:B, 3tfy:C, 6wf3:A, 6wf3:B, 6wf3:C, 6wf3:D, 6wf3:E, 6wf3:F, 6wf5:A, 6wf5:B, 6wfg:A, 6wfg:C, 6wfg:E, 6wfk:A, 6wfk:B, 6wfk:C, 6wfn:A, 6wfo:A, 6wfo:B, 6wfo:C, 4x5k:A
23	3b8g:A	424	116	0.1429	0.0590	0.2155	2.8	3d2m:A, 3d2p:A, 3d2p:B, 4i49:A, 2r8v:A, 2r98:A
24	7k0a:A	196	54	0.1029	0.0918	0.3333	3.6	7k09:A, 7k09:B, 7k09:C, 7k09:D, 7k09:E, 7k09:F, 7k0a:B
25	5nx7:A	308	55	0.1143	0.0649	0.3636	3.8	5nx6:A, 5nx6:B, 5nx7:B
26	6k35:A	640	41	0.0914	0.0250	0.3902	4.9	6k35:B
27	6z00:A	156	102	0.1200	0.1346	0.2059	6.7	6yzz:A, 6z00:B
28	6vfn:A	167	40	0.0571	0.0599	0.2500	8.0	6vfn:F, 6vfn:B, 6vfn:C, 6vfn:D, 6vfn:E, 6vfn:H, 6vfn:I, 6vfn:J, 6vfn:G, 6vfn:L, 6vfn:K
29	7w2t:A	773	16	0.0571	0.0129	0.6250	8.8	5bvu:A, 5bx2:A, 5bx3:A, 5bx4:A, 5bx5:A, 7dks:A, 7dkt:A, 7dku:A, 7dkv:A, 7dkw:A, 7dkw:B, 7dkx:A, 7dky:A, 8i5o:A, 8i5p:A, 8i5p:B, 8i5q:A, 8i5q:B, 8i5r:A, 8i5s:A, 8i5t:A, 8i5u:A, 8jbo:A, 8jbo:B, 5ncx:A, 5npf:A, 5o0s:A, 5ost:A, 8r06:A, 7w2s:A, 7w2t:B, 7w2v:A, 7w2w:A, 7w2x:A
30	5fjs:A	733	16	0.0571	0.0136	0.6250	9.4
31	5fjs:B	702	16	0.0571	0.0142	0.6250	9.5

[Back]