Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
NTKYNKEFLLYLAGFVDGDGSIIAQIKPRASNKFAHQLSLTFAVTQKTQRRWFLDKLVDEIGVGYVYDSGSVSDYRLSEI
KPLHNFLTQLQPFLKLKQKQANLVLAIIEQLPSAKASPDAFLEVCTWVDQIAALNDSKTRATTSATVRAALD

The query sequence (length=152) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3mxa:A 301 148 0.9145 0.4618 0.9392 3.69e-99 4aab:A, 4aab:B, 4aad:A, 4aad:B, 4aae:A, 4aae:B, 4aaf:A, 4aaf:B, 4aag:A, 4aag:B, 4aqu:A, 4aqu:B, 4aqx:A, 4aqx:B, 1bp7:A, 1bp7:B, 1bp7:C, 1bp7:D, 6fb0:A, 6fb0:B, 6fb1:A, 6fb1:B, 6fb2:A, 6fb2:B, 6fb5:A, 6fb5:B, 6fb6:A, 6fb6:B, 6fb7:A, 6fb7:B, 6fb8:A, 6fb8:B, 6fb9:A, 6fb9:B, 1g9y:A, 1g9y:B, 1g9z:A, 1g9z:B, 2i3p:A, 2i3p:B, 2i3q:A, 2i3q:B, 3mx9:A, 3mxb:A, 3mxb:B, 3mxb:R, 3mxb:S, 1n3e:A, 1n3e:B, 1n3e:G, 1n3e:H, 1n3f:A, 1n3f:B, 1n3f:G, 1n3f:H, 1t9i:A, 1t9i:B, 1t9j:A, 1t9j:B, 1u0c:A, 1u0c:B, 1u0d:A, 1u0d:B, 2vbj:A, 2vbj:B, 2vbl:A, 2vbl:B, 2vbn:A, 2vbn:B, 2vbo:A, 2vbo:B, 2xe0:A, 2xe0:B
2 3mxa:A 301 151 0.8816 0.4452 0.8874 4.24e-94 4aab:A, 4aab:B, 4aad:A, 4aad:B, 4aae:A, 4aae:B, 4aaf:A, 4aaf:B, 4aag:A, 4aag:B, 4aqu:A, 4aqu:B, 4aqx:A, 4aqx:B, 1bp7:A, 1bp7:B, 1bp7:C, 1bp7:D, 6fb0:A, 6fb0:B, 6fb1:A, 6fb1:B, 6fb2:A, 6fb2:B, 6fb5:A, 6fb5:B, 6fb6:A, 6fb6:B, 6fb7:A, 6fb7:B, 6fb8:A, 6fb8:B, 6fb9:A, 6fb9:B, 1g9y:A, 1g9y:B, 1g9z:A, 1g9z:B, 2i3p:A, 2i3p:B, 2i3q:A, 2i3q:B, 3mx9:A, 3mxb:A, 3mxb:B, 3mxb:R, 3mxb:S, 1n3e:A, 1n3e:B, 1n3e:G, 1n3e:H, 1n3f:A, 1n3f:B, 1n3f:G, 1n3f:H, 1t9i:A, 1t9i:B, 1t9j:A, 1t9j:B, 1u0c:A, 1u0c:B, 1u0d:A, 1u0d:B, 2vbj:A, 2vbj:B, 2vbl:A, 2vbl:B, 2vbn:A, 2vbn:B, 2vbo:A, 2vbo:B, 2xe0:A, 2xe0:B
3 1mow:A 248 145 0.8289 0.5081 0.8690 1.77e-88 1mow:D, 1mow:G, 1mow:J
4 2fld:A 161 129 0.3158 0.2981 0.3721 1.89e-20 3ko2:A, 3ko2:B, 3ko2:F, 3ko2:G, 1m5x:A, 1m5x:B, 3mis:A, 3mis:B
5 5a72:B 158 142 0.3224 0.3101 0.3451 1.41e-19 5a72:A, 5a74:A, 5a74:B, 5a77:A, 5a77:B, 5a78:A, 5a78:B
6 3fd2:A 338 129 0.3092 0.1391 0.3643 9.17e-19 2fld:B, 3mip:A, 3mip:B
7 3fd2:A 338 129 0.3092 0.1391 0.3643 9.17e-19 2fld:B, 3mip:A, 3mip:B
8 4yhx:A 294 58 0.1250 0.0646 0.3276 2.50e-05
9 4yhx:A 294 95 0.1382 0.0714 0.2211 0.075
10 4lq0:A 298 86 0.1382 0.0705 0.2442 5.54e-05
11 4lq0:A 298 102 0.1513 0.0772 0.2255 4.1
12 4lox:A 300 57 0.1316 0.0667 0.3509 7.68e-05 5e5o:A, 5e5s:A, 5e63:A, 5e67:A, 4z1z:A, 4z1z:B, 4z20:A, 4z20:D
13 4lox:A 300 68 0.1184 0.0600 0.2647 5.4 5e5o:A, 5e5s:A, 5e63:A, 5e67:A, 4z1z:A, 4z1z:B, 4z20:A, 4z20:D
14 7rcf:A 290 60 0.1250 0.0655 0.3167 4.00e-04 7rcc:D, 7rcc:A, 7rcc:G, 7rcd:A, 7rce:A, 7rcg:A
15 6bd0:A 300 56 0.1053 0.0533 0.2857 4.81e-04 6bda:A, 6bdb:A, 3qqy:A, 6uvw:A, 6uvw:D, 6uwg:A, 6uwh:A, 6uwj:A
16 6bd0:A 300 59 0.0987 0.0500 0.2542 0.20 6bda:A, 6bdb:A, 3qqy:A, 6uvw:A, 6uvw:D, 6uwg:A, 6uwh:A, 6uwj:A
17 3e54:A 159 96 0.1711 0.1635 0.2708 7.55e-04 3e54:B
18 5t8d:A 292 58 0.1053 0.0548 0.2759 0.001 5v0q:A
19 4yit:D 277 93 0.1447 0.0794 0.2366 0.001 4yit:A
20 4yit:D 277 96 0.1579 0.0866 0.2500 0.029 4yit:A
21 6uw0:B 295 95 0.1513 0.0780 0.2421 0.002 6uw0:A, 6uwk:A
22 5esp:A 292 93 0.1513 0.0788 0.2473 0.003 5esp:B
23 5esp:A 292 55 0.0921 0.0479 0.2545 0.005 5esp:B
24 4efj:B 291 54 0.1184 0.0619 0.3333 0.066 4efj:A, 4z1x:B, 4z1x:A
25 5t2h:A 296 58 0.1118 0.0574 0.2931 0.081
26 6bci:A 292 56 0.0987 0.0514 0.2679 0.083 6bce:A, 6bcf:D, 6bcf:A, 6bcf:G, 6bcf:J, 6bcg:D, 6bcg:A, 6bcg:G, 6bcg:J, 6bch:A, 6bch:D, 6bch:H, 6bch:L, 6bcn:A, 6bcn:C, 6bcn:G, 6bcn:J, 6bct:A, 3r7p:A
27 5thg:A 294 58 0.1053 0.0544 0.2759 0.20 5thg:D
28 5thg:A 294 59 0.0987 0.0510 0.2542 0.32 5thg:D
29 5t2o:A 293 60 0.1053 0.0546 0.2667 0.28
30 5t2o:A 293 89 0.1382 0.0717 0.2360 0.71
31 4cdn:A 463 47 0.1053 0.0346 0.3404 0.39 4cdm:A, 7f8t:A, 8kcm:A, 5o86:A, 5o8d:A, 5o8e:A, 8oet:A, 8oy3:A, 8oy4:A, 8oy5:A, 8oy6:A, 8oy7:A, 8oy8:A, 8oy9:A, 8oya:A, 8oyb:A, 8oyc:A, 7viw:A, 7vix:A, 7viy:A, 7viz:A, 7vj0:A, 7vj1:A, 7vj2:A, 7vj3:A, 7vj4:A, 7vj5:A, 7vj6:A, 7vj7:A, 7vj8:A, 7vj9:A, 7vja:A, 7vjb:A, 7vjc:A, 7vje:A, 7vjg:A, 7vjh:A, 7vji:A, 7vjj:A, 7vjk:A, 2xry:A, 2xrz:A, 7yc7:A, 7ycm:A, 7ycp:A, 7ycr:A, 7yd6:A, 7yd7:A, 7yd8:A, 7ydz:A, 7ye0:A, 7yeb:A, 7yec:A, 7yee:A, 7yei:A, 7yej:A, 7yek:A, 7yel:A, 7yem:A, 5zcw:A
32 4cdn:B 438 47 0.1053 0.0365 0.3404 0.54 8kcm:B, 8oet:B, 8oy3:B, 8oy4:B, 8oy5:B, 8oy6:B, 8oy7:B, 8oy8:B, 8oy9:B, 8oya:B, 8oyb:B, 8oyc:B, 2xrz:B, 7yc7:B, 7ycm:B, 7ycp:B, 7ycr:B, 7yd6:B, 7yd7:B, 7yd8:B, 7ydz:B, 7ye0:B, 7yeb:B, 7yec:B, 7yee:B, 7yei:B, 7yej:B, 7yek:B, 7yel:B, 7yem:B, 5zcw:B
33 2ex5:A 207 37 0.0921 0.0676 0.3784 0.76 2ex5:B
34 5t2n:A 291 59 0.0921 0.0481 0.2373 1.2
35 4yis:A 295 96 0.1382 0.0712 0.2188 1.8 4yis:B
36 3itb:D 351 73 0.1645 0.0712 0.3425 1.9 3it9:A, 3it9:B, 3ita:A, 3ita:D, 3itb:C
37 1j9j:A 247 69 0.1184 0.0729 0.2609 3.5 1j9j:B, 1j9k:A, 1j9k:B, 1j9l:A, 1j9l:B
38 2q0y:A 153 34 0.0789 0.0784 0.3529 4.1
39 5gky:A 3660 59 0.1184 0.0049 0.3051 6.4 5gky:C, 5gky:E, 5gky:G, 5gkz:A, 5gkz:C, 5gkz:E, 5gkz:G, 5gl0:A, 5gl0:C, 5gl0:E, 5gl0:G, 5gl1:A, 5gl1:C, 5gl1:E, 5gl1:G
40 1t8y:F 461 49 0.1053 0.0347 0.3265 6.7 1t8s:A, 1t8s:B, 1t8s:C, 1t8s:D, 1t8s:E, 1t8s:F, 1t8y:C, 1t8y:B, 1t8y:E, 1t8y:A
41 4ijn:A 376 30 0.0724 0.0293 0.3667 8.0 4ijn:B
42 6upc:A 246 55 0.1053 0.0650 0.2909 8.7 6upc:B, 6upd:A, 6upd:B, 6upe:A, 6upe:B
43 8h0s:C 190 44 0.0789 0.0632 0.2727 9.0 8h0s:A, 8h0t:A, 4poo:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218