BioLiP

>protein
NGGVGVDVELITSINVENDTFIERNFTPQEIEYCSAQPSVQSSFAGTWSAKEAVFKSLGVKSLGGGAALKDIEIVRVNKN
APAVELHGNAKKAAEEAGVTDVKVSISHDDLQAVAVAVSTK

The query sequence (length=121) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ql9:D	1765	121	1.0000	0.0686	1.0000	4.61e-76	3hmj:A, 3hmj:B, 3hmj:C, 8prv:A, 8prv:B, 8prw:A, 8prw:B, 8prw:C, 8prw:D, 8prw:E, 8prw:F, 8ps1:A, 6ql6:F, 6ql6:E, 6ql6:D, 6ql6:C, 6ql6:B, 6ql6:A, 6ql9:F, 6ql9:A, 6ql9:E, 6ql9:B, 6ql9:C, 6ta1:A, 6ta1:B, 6ta1:D, 6ta1:K, 6ta1:F, 6ta1:I, 6u5u:A, 2vkz:A, 2vkz:B, 2vkz:C, 2wat:A, 2wat:B, 2wat:C, 2wat:D, 2wat:E, 2wat:F
2	2qg8:A	137	132	0.3554	0.3139	0.3258	8.60e-10
3	5xuk:A	115	98	0.2975	0.3130	0.3673	2.10e-09
4	1fth:A	117	115	0.2893	0.2991	0.3043	2.26e-05	1fth:B, 1fth:C
5	3hqj:A	113	117	0.3140	0.3363	0.3248	2.76e-05
6	3qmn:E	127	120	0.2645	0.2520	0.2667	1.62e-04	3qmn:A, 3qmn:C, 3qmn:B, 3qmn:D, 3qmn:F, 3qmn:G, 3qmn:I, 3qmn:H, 3qmn:J, 3qmn:L, 3qmn:K, 3qmn:Q, 3qmn:M, 3qmn:N, 3qmn:O, 3qmn:P, 3qmn:R, 3qmn:S, 3qmn:U, 3qmn:T, 3qmn:V, 3qmn:W, 3qmn:X
7	3nfd:E	139	129	0.3058	0.2662	0.2868	0.002	3nfd:A, 3nfd:B, 3nfd:C, 3nfd:D, 3nfd:F
8	3hyk:A	117	82	0.2066	0.2137	0.3049	0.012	3hyk:B, 3hyk:C
9	2x41:A	715	66	0.1736	0.0294	0.3182	0.39	2x42:A
10	1ogd:A	131	27	0.1074	0.0992	0.4815	0.67	1ogd:B, 1ogd:C, 1ogd:D, 1ogd:E, 1oge:A, 1oge:B, 1oge:C, 1oge:D, 1oge:E
11	8tug:A	1367	62	0.1322	0.0117	0.2581	1.6	8tvp:A, 8tvq:A, 8tvv:A, 8tvw:A, 8tvx:A
12	8tvs:A	1316	62	0.1322	0.0122	0.2581	1.7
13	8hku:L37A	65	39	0.0826	0.1538	0.2564	3.6	8hkv:L37A, 8hky:L37A, 8hkz:L37A, 8hl1:L37A, 8hl2:L37A, 8hl3:L37A, 8hl4:L37A, 8hl5:L37A
14	2adb:A	127	45	0.0909	0.0866	0.2444	5.9	3zzy:A, 3zzy:B, 3zzz:A, 3zzz:B
15	2d0o:A	606	39	0.0909	0.0182	0.2821	6.6	2d0o:C, 2d0p:A, 2d0p:C
16	5dzy:B	415	63	0.1653	0.0482	0.3175	6.7	5dzx:A, 5dzx:B, 5dzy:D, 5dzy:A, 5dzy:C, 5dzy:E, 5dzy:F
17	4evv:A	145	64	0.1322	0.1103	0.2500	6.8	5chz:A, 4dk9:A, 4e9f:A, 4e9g:A, 4e9h:A, 4ea4:A, 4ea5:A, 4ew0:A, 4ew4:A, 7kz0:A, 7kz1:A, 7kzg:A, 4ofa:A, 4ofe:A, 4ofh:A, 6vjw:A
18	8cen:A	1508	58	0.1240	0.0099	0.2586	8.0	4a3b:A, 4a3c:A, 4a3d:A, 4a3e:A, 4a3f:A, 4a3g:A, 4a3i:A, 4a3j:A, 4a3k:A, 4a3l:A, 4a3m:A, 4a93:A, 2b63:A, 2b8k:A, 4bbr:A, 4bbs:A, 4bxx:A, 4bxz:A, 4by1:A, 4by7:A, 5c3e:A, 5c44:A, 5c4a:A, 5c4x:A, 8ceo:A, 2e2h:A, 2e2i:A, 2e2j:A, 3fki:A, 5fmf:A, 5fyw:A, 5fz5:A, 3gtj:A, 3gtl:A, 3gtm:A, 3gto:A, 3gtp:A, 3gtq:A, 6gyk:A, 6gyl:A, 6gym:A, 3h3v:B, 3hou:A, 3hou:M, 3hov:A, 3how:A, 3hox:A, 3hoy:A, 3hoz:A, 1i3q:A, 3i4m:A, 3i4n:A, 1i50:A, 6i84:A, 5ip7:A, 5ip9:A, 3j0k:A, 2ja5:A, 2ja6:A, 2ja7:A, 2ja7:M, 2ja8:A, 8jch:A, 3k1f:A, 8k5p:A, 3k7a:A, 7kee:A, 7kef:A, 3m3y:A, 3m4o:A, 7mei:a, 7mei:A, 7mk9:A, 7mka:a, 7ml0:A, 7ml1:A, 7ml2:A, 7ml4:A, 7nkx:A, 7nky:A, 2nvq:A, 2nvt:A, 2nvx:A, 2nvy:A, 2nvz:A, 7o4i:A, 7o4j:A, 6o6c:A, 7o72:A, 7o73:A, 7o75:A, 5oqj:A, 5oqm:A, 5ot2:A, 3po2:A, 3po3:A, 3qt1:A, 2r7z:A, 1r9t:A, 2r92:A, 2r93:A, 7riq:A, 3rzd:A, 3rzo:A, 3s14:A, 3s15:A, 3s16:A, 3s17:A, 3s1m:A, 3s1n:A, 3s1q:A, 3s1r:A, 3s2d:A, 3s2h:A, 1sfo:A, 5sva:A, 1twf:A, 5u5q:A, 4v1m:A, 4v1n:A, 4v1o:A, 2vum:A, 1wcm:A, 4x67:A, 4x6a:A, 1y1v:A, 1y1w:A, 4y52:A, 1y77:A, 4y7n:A, 2yu9:A, 7zs9:A, 7zsa:A, 7zsb:A
19	3cqz:A	1349	57	0.1240	0.0111	0.2632	9.9
20	1k83:A	1366	57	0.1240	0.0110	0.2632	9.9	1twa:A, 1twc:A, 1twg:A, 1twh:A
21	8u9x:A	1398	57	0.1240	0.0107	0.2632	9.9	6blo:A, 6blp:A, 6bm2:A, 6bm4:A, 6bqf:A, 1i6h:A, 7ked:A, 1nik:A, 1r5u:A, 1r9s:A, 7rim:A, 7rip:A, 7riw:A, 7rix:A, 7riy:A, 8u9r:A, 8ukq:A, 8ukr:A, 8uks:A, 8ukt:A, 8uku:A, 6upx:A, 6upy:A, 6upz:A, 6uq0:A, 6uq1:A, 6uq2:A, 6uq3:A, 5w4u:A, 5w51:A

[Back]