BioLiP

>protein
NAETNEITVGITVTTTGPAAALGIPERNALEFVAKEIGGHPIKMIVLDDGGDPTAATTNARRFVTESKADVIMGSSVTPP
TVAVSNVANEAQVPHIALAPLPVTPERAKWSVVMPQPIPIMGKVLYEHMKKNNIKTVGYIGYSDSYGDLWFNDLKKQGEA
MGLKIVAEERFARPDTSVAGQVLKLVAANPDAILVGASGTAAALPQTALRERGYNGLIYQTHGAASMDFIRIAGKSAEGV
LMASGPVMDPEGQNDSALTKKPGLELNTAYETKYGPNSRSQFAGHSFDAFKVLERVIPVALKTAKPGTQEFREAIRKALL
TEKDIAASQGVYSFTETDRYGLDDRSRILLTVKNGKYVIVK

The query sequence (length=361) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4jb0:A	367	358	0.9501	0.9346	0.9581	0.0	4eyq:A, 4fb4:A, 3tx6:A, 3uk0:A, 3ukj:A
2	4dqd:A	361	356	0.3906	0.3906	0.3961	4.34e-87	3sg0:A
3	4nqr:A	364	336	0.2161	0.2143	0.2321	1.14e-12	4nqr:B, 4nv3:A, 4nv3:B, 4oat:A, 4oat:B, 4obb:A, 4obb:B, 4og2:A, 4og2:B, 4otz:A, 4otz:B, 4qym:A, 4qym:B, 4rdc:A, 4rv5:A, 4rv5:B
4	8wch:A	396	392	0.2742	0.2500	0.2526	1.43e-12	8wch:B
5	3ip5:A	348	257	0.1911	0.1983	0.2685	2.41e-10	3ip6:A, 3ip7:A, 3ip9:A, 3ipa:A, 3ipc:A
6	4q6w:A	376	386	0.2521	0.2420	0.2358	2.31e-08	4q6w:B
7	3td9:A	350	359	0.2105	0.2171	0.2117	4.04e-08
8	3i45:A	378	88	0.0776	0.0741	0.3182	6.99e-07
9	4n0q:B	345	347	0.2244	0.2348	0.2334	7.34e-07	4n0q:A, 4n0q:C, 4n0q:D
10	4eyg:B	364	249	0.1828	0.1813	0.2651	2.55e-06	4eyg:A
11	4zpj:A	371	96	0.0748	0.0728	0.2812	3.45e-06
12	4gnr:A	348	359	0.2355	0.2443	0.2368	2.42e-04
13	1qo0:B	374	89	0.0665	0.0642	0.2697	0.48	1pea:A, 1qnl:A, 1qo0:A
14	8jd5:2	785	161	0.0914	0.0420	0.2050	0.64	5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
15	1z16:A	344	265	0.1690	0.1773	0.2302	0.86	1z17:A, 1z18:A
16	4etz:B	289	61	0.0554	0.0692	0.3279	1.1	4dmz:A, 4dmz:B, 4dn0:A, 4etz:A, 4eu0:A, 4euv:A
17	3lww:C	871	89	0.0776	0.0321	0.3146	1.3	1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
18	2q5d:B	845	89	0.0776	0.0331	0.3146	1.4
19	8gap:A	1012	49	0.0499	0.0178	0.3673	1.5	5c9h:A, 7lma:A, 7lmb:A, 7uy5:A, 7uy6:A
20	6d6v:A	980	49	0.0499	0.0184	0.3673	1.6	5c9h:B
21	7ylg:A	142	58	0.0443	0.1127	0.2759	3.2
22	5wwr:A	461	86	0.0803	0.0629	0.3372	3.4	5wwr:B, 5wws:A, 5wws:B, 5wwt:A, 5wwt:B
23	3ggl:A	161	40	0.0388	0.0870	0.3500	6.6	6oe2:A
24	3kxi:A	326	39	0.0388	0.0429	0.3590	9.5	2qth:A
25	3tcs:B	367	83	0.0637	0.0627	0.2771	9.9	3tcs:A

[Back]