BioLiP

>protein
MYFQDIIMTLHKFWAEKGCLIWQPYDVEVGAGTMNPATFLKVLGKKPWNVAYVEPSRRPQDGRYGENPNRLQHYYQFQVI
LKPAPRNPQEIYLESLERLGINPLEHDIRFVEDDWESPTLGAWGLGWEVWLDGMEITQFTYFQQAGGLDLDEISVEITYG
LERIAMYIQDKDSVFDIEWKEGITYGEIFKRSEWEWSKYNFELADTDMLFQVYEMFEKESKRMVEEGLIFPAYDYLLKCS
HVFNILDARGAISVQERARYIRRMNNLAREIAKLYLQVFENVG

The query sequence (length=283) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5f5w:A	283	283	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5f5w:B, 5f5w:C, 5f5w:D, 5f5w:E
2	3rgl:A	292	279	0.5936	0.5753	0.6022	1.88e-128	3rgl:B, 3ufg:A, 3ufg:B
3	7eiv:B	300	287	0.6042	0.5700	0.5958	9.59e-127	7eiv:A, 7yse:A, 7yse:B
4	7lu4:B	977	281	0.6396	0.1853	0.6441	1.63e-123
5	8h1c:B	983	283	0.5936	0.1709	0.5936	1.25e-115	8h1c:A, 7xjz:A, 7xk0:A, 7xk1:A, 7xk1:C
6	8ea1:A	317	68	0.0601	0.0536	0.2500	1.6
7	1yfr:A	448	121	0.1272	0.0804	0.2975	1.8	1yfr:B, 1yfs:A, 1yfs:B, 1ygb:A
8	7r8b:B	564	51	0.0601	0.0301	0.3333	1.9
9	7r89:B	529	51	0.0601	0.0321	0.3333	2.1
10	2fo0:A	466	94	0.0848	0.0515	0.2553	3.8	1abo:A, 1abo:B, 1bbz:A, 1bbz:E, 1bbz:C, 1bbz:G, 6bl8:A, 6bl8:B, 7cc2:A, 7cc2:B, 3cs9:A, 3cs9:D, 3dk3:A, 3dk3:B, 3dk6:A, 3dk6:B, 3dk7:A, 3dk7:B, 7dt2:A, 7dt2:B, 2e2b:A, 2e2b:B, 3eg1:A, 3eg1:B, 2f4j:A, 1fpu:A, 1fpu:B, 2g1t:A, 2g1t:B, 2g1t:C, 2g1t:D, 2g2f:A, 2g2f:B, 2g2h:A, 2g2h:B, 2g2i:A, 2g2i:B, 2gqg:A, 2gqg:B, 8h7f:A, 8h7f:B, 8h7h:A, 8h7h:B, 6hd4:A, 6hd4:B, 6hd6:A, 6hd6:B, 2hiw:A, 2hiw:B, 3hmi:A, 5hu9:A, 2hyy:A, 2hyy:B, 2hyy:C, 2hyy:D, 2hz0:A, 2hz4:A, 2hz4:C, 2hz4:B, 2hzi:A, 2hzi:B, 2hzn:A, 1iep:A, 1iep:B, 3ik3:A, 3ik3:B, 4j9c:A, 4j9d:A, 4j9d:C, 4j9d:E, 4j9e:A, 4j9e:C, 4j9e:E, 4j9f:A, 4j9f:C, 4j9f:E, 4j9g:A, 4j9g:C, 4j9g:E, 4j9h:A, 4j9h:B, 4j9h:F, 4j9h:E, 4j9h:D, 4j9h:C, 4j9i:A, 4j9i:C, 4j9i:E, 3k5v:A, 3k5v:B, 3kf4:A, 3kf4:B, 3kfa:A, 3kfa:B, 1m52:A, 1m52:B, 3ms9:A, 3ms9:B, 3mss:A, 3mss:B, 3mss:C, 3mss:D, 7n9g:A, 7n9g:B, 6npe:A, 6npu:A, 6npv:A, 2o88:A, 2o88:B, 1opj:A, 1opj:B, 1opk:A, 1opl:A, 1opl:B, 3oxz:A, 3oy3:A, 3oy3:B, 3pyy:A, 2qoh:A, 2qoh:B, 3qri:A, 3qri:B, 3qrj:A, 3qrj:B, 3qrk:A, 4twp:A, 4twp:B, 3ue4:A, 3ue4:B, 2v7a:A, 2v7a:B, 7w7x:A, 7w7x:B, 7w7y:A, 7w7y:B, 4wa9:B, 4xey:A, 4xli:A, 4xli:B, 2xyn:A, 2xyn:B, 2xyn:C, 4yc8:A, 4yc8:B, 2z60:A, 4zog:A, 4zog:B
11	7bez:A	214	31	0.0353	0.0467	0.3226	4.9	7bez:B, 7bf0:A, 7bf0:B, 3uk8:A, 3uk8:B
12	4r3a:A	318	54	0.0601	0.0535	0.3148	5.8	4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
13	4xey:B	359	94	0.0848	0.0669	0.2553	6.3	7n9g:C, 4wa9:A
14	4g75:A	292	48	0.0565	0.0548	0.3333	6.6
15	4r3a:B	278	53	0.0601	0.0612	0.3208	7.6
16	3pif:D	1023	79	0.0883	0.0244	0.3165	9.8
17	3pif:C	1066	79	0.0883	0.0235	0.3165	9.9	3pif:A, 3pif:B
18	8bx8:C	3947	54	0.0601	0.0043	0.3148	9.9	7k58:C, 7k5b:C, 7kek:C

[Back]