BioLiP

>protein
MYFIKPGCLIKKKFSIYTSIVISVIDNNSVVIQSYDKSDNGDVISIDREVINVSKIVPIGNIDIKNKSKKEIDGILVEEN
RNLKNKDDVLLMNDFERFKEQLKKEVEDMVIEEMA

The query sequence (length=115) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8p5d:LM0	115	115	1.0000	1.0000	1.0000	3.18e-76	8p60:LM0, 8p60:KM0, 7qca:LM0
2	3tho:B	366	61	0.2174	0.0683	0.4098	0.22	6asc:A, 6asc:B, 4nzv:A, 4nzv:B, 4o24:A, 4o24:B, 4o43:A, 4o43:B, 4o4k:A, 4o4k:B, 4o5g:A, 4o5g:B, 3thn:A, 6x1y:A, 6x1y:B, 6x1z:A, 6x1z:B
3	4jg4:A	114	69	0.1739	0.1754	0.2899	0.35	1a6f:A
4	6zu5:LM0	97	19	0.0957	0.1134	0.5789	0.41
5	5oaf:D	411	49	0.1391	0.0389	0.3265	2.3	9c62:B, 5oaf:F, 8x15:N, 8x19:N, 8xvg:B, 8xvt:B
6	1uzr:B	288	49	0.1565	0.0625	0.3673	3.0	1uzr:A, 1uzr:C
7	7myv:B	239	69	0.2087	0.1004	0.3478	3.3	7myv:A
8	8i4q:A	479	49	0.1478	0.0355	0.3469	3.7	8i4q:B
9	8fl2:NC	511	42	0.1043	0.0235	0.2857	4.4	8fkz:NC, 8fl0:NC, 8fl3:NC, 8fl4:NC, 8idt:A, 8idy:A, 8ie3:A, 8ine:A, 8inf:A, 8ink:w, 8ipd:w, 8ipx:w, 8ipy:w, 8ir1:w, 8ir3:w
10	3n1c:A	309	37	0.1130	0.0421	0.3514	6.1	3cqd:A, 3cqd:B, 3n1c:D, 3n1c:B, 3n1c:C, 3umo:A, 3umo:B, 3ump:A, 3ump:B, 3uqd:A, 3uqd:C, 3uqd:B, 3uqd:D, 3uqe:A, 3uqe:B
11	6b2z:a	249	72	0.2000	0.0924	0.3194	6.5	6b2z:M, 6b8h:a, 6b8h:p
12	7zi4:D	439	46	0.1304	0.0342	0.3261	7.2	9c57:D, 9c57:F, 9c62:D, 9c62:F, 6hts:B, 6hts:D, 6hts:F, 5oaf:B, 7ole:B, 7ole:D, 7ole:F, 8x15:P, 8x15:R, 8x19:P, 8x19:R, 8x1c:N, 8x1c:P, 8x1c:R, 8xvg:D, 8xvg:F, 8xvt:D, 8xvt:F, 7zi4:B, 7zi4:F
13	8a1r:A	593	47	0.1217	0.0236	0.2979	8.5	8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
14	3zq4:A	550	63	0.1391	0.0291	0.2540	8.8	3zq4:C, 3zq4:D, 3zq4:E
15	6due:A	737	56	0.1565	0.0244	0.3214	9.0

[Back]