BioLiP

>protein
MVLYFIGLGLYDERDITVKGLEIAKKCDYVFAEFYTSLMAGTTLGRIQKLIGKEIRVLSREDVELNFENIVLPLAKENDV
AFLTPGDPLVATTHAELRIRAKRAGVESYVIHAPSIYSAVGITGLHIYKFGKSATVAYPEGNWFPTSYYDVIKENAERGL
HTLLFLDIKAEKRMYMTANEAMELLLKVEDMKKGGVFTDDTLVVVLARAGSLNPTIRAGYVKDLIREDFGDPPHILIVPG
KLHIVEAEYLVEMAGAPREILRVNV

The query sequence (length=265) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2dek:A	265	265	0.9962	0.9962	0.9962	0.0	2dsg:A, 2dsh:A, 2dsi:A, 2dv3:A, 2dv4:A, 2dv5:A, 2dv7:A, 2dxv:A, 2dxw:A, 2dxx:A, 2e07:A, 2e08:A, 2e15:A, 2e16:A, 2e17:A, 2e4n:A, 2e4r:A, 2e7r:A, 2e8h:A, 2e8q:A, 2e8r:A, 2e8s:A, 2ed3:A, 2ed5:A, 2eeq:A, 2egb:A, 2egl:A, 2egs:A, 2eh2:A, 2eh4:A, 2eh5:A, 2ehc:A, 2ehl:A, 2ejj:A, 2ejk:A, 2ejz:A, 2ejz:B, 2ek2:A, 2ek3:A, 2ek4:A, 2ek7:A, 2eka:A, 2el0:A, 2el1:A, 2el2:A, 2el3:A, 2eld:A, 2ele:A, 2emr:A, 2emu:A, 2en5:A, 2eni:A, 2hr8:A, 2huq:A, 2hut:A, 2huv:A, 2hux:A, 2owf:A, 2owg:A, 2owk:A, 2owu:A, 2owv:A, 2p2x:A, 2p2x:B, 2p5c:A, 2p5f:A, 2p6d:A, 2p6i:A, 2p6k:A, 2p6l:A, 2p9d:A, 2pb4:A, 2pb5:A, 2pb6:A, 2pca:A, 2pcg:A, 2pch:A, 2pci:A, 2pck:A, 2pcm:A, 1vce:A, 1wng:A, 2z6r:A
2	2qbu:A	228	136	0.1057	0.1228	0.2059	0.12	2qbu:B
3	1cbf:A	239	229	0.2000	0.2218	0.2314	0.40	2cbf:A
4	8dg5:A	1635	56	0.0642	0.0104	0.3036	1.7	8dg7:A
5	6p4u:A	843	92	0.0943	0.0297	0.2717	2.7	6ozv:A, 6p3i:A
6	7vob:C	327	59	0.0792	0.0642	0.3559	2.9	7voc:C
7	4g9b:A	227	101	0.1057	0.1233	0.2772	3.6
8	6j6g:C	920	41	0.0566	0.0163	0.3659	4.1	7b9v:C, 6bk8:B, 7dco:C, 5gm6:C, 5gmk:C, 6j6h:C, 6j6n:C, 6j6q:C, 3jcm:H, 6teo:A, 6teo:C, 5wsg:C, 5y88:C, 5ylz:C, 5zwm:C, 5zwo:C
9	5lj3:C	882	41	0.0566	0.0170	0.3659	4.3	6exn:C, 5gam:C, 5gan:C, 5lj5:C, 5lqw:B, 5mps:C, 5mq0:C, 5nrl:C
10	5ci7:A	277	62	0.0755	0.0722	0.3226	4.9	6mnh:A, 8p5g:A, 8p5g:B, 8p5h:A, 8p5h:B, 8p5i:A, 8p5i:B, 8p5i:C, 8p5i:D, 8p5j:A, 8p5j:B, 8p5k:A, 8p5k:B, 8p5k:C, 8p5k:D, 8p5l:A, 8p5l:B, 6qas:A, 6qas:B, 8sv9:A, 8sv9:B, 4wno:A, 4wnp:A, 4wnp:B, 4wnp:C, 4wnp:D
11	8dfv:A	1664	56	0.0679	0.0108	0.3214	6.0
12	7rab:A	299	114	0.1132	0.1003	0.2632	6.1	7rab:B, 7rab:C, 7rab:D, 7rab:E, 7rab:F, 7rab:G, 7rab:H, 7rac:A, 7rac:B, 7rac:C, 7rac:D, 7rac:E, 7rac:F, 7rac:G, 7rac:H, 7rac:I, 7rac:J, 7rac:K, 7rac:L
13	2r7k:A	358	30	0.0453	0.0335	0.4000	9.4	2r7l:A, 2r7m:A, 2r7n:A
14	9f1t:A	477	73	0.0868	0.0482	0.3151	9.6	9f1t:B, 9f3z:B, 9f3z:A

[Back]