BioLiP

>protein
MVDIIIAEHAGFCFGVKRAVKLAEESLKESQGKVYTLGPIIHNPQEVNRLKNLGVFPSQGEEFKEGDTVIIRSHGIPPEK
EEALRKKGLKVIDATCPYVKAVHEAVCQLTREGYFVVLVGEKNHPEVIGTLGYLRACNGKGIVVETLEDIGEALKHERVG
IVAQTTQNEEFFKEVVGEIALWVKEVKVINTICNATSLRQESVKKLAPEVDVMIIIGGKNSGNTRRLYYISKELNPNTYH
IETAEELQPEWFRGVKRVGISAGASTPDWIIEQVKSRIQEI

The query sequence (length=281) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3dnf:B	282	281	1.0000	0.9965	1.0000	0.0	3dnf:A
2	3t0f:A	314	287	0.3310	0.2962	0.3240	5.88e-50	4eb3:A, 4eb3:B, 3f7t:A, 3f7t:B, 4h4c:A, 4h4c:B, 4h4d:A, 4h4d:B, 4h4e:A, 4h4e:B, 3ke8:A, 3ke8:B, 3ke9:A, 3ke9:B, 3kef:A, 3kef:B, 3kel:A, 3kel:B, 3kem:A, 3kem:B, 4mux:A, 4mux:B, 4muy:A, 4muy:B, 4mv0:A, 4mv0:B, 4mv5:A, 4mv5:B, 3szl:A, 3szl:B, 3szo:A, 3szo:B, 3szu:A, 3szu:B, 3t0f:B, 3t0g:A, 3t0g:B, 3urk:A, 3urk:B, 3utc:A, 3utc:B, 3utd:A, 3utd:B, 3uv3:A, 3uv3:B, 3uv6:A, 3uv6:B, 3uv7:A, 3uv7:B, 3uwm:A, 3uwm:B, 3zgl:A, 3zgl:B, 3zgn:A, 3zgn:B
3	4n7b:A	318	263	0.2954	0.2610	0.3156	1.83e-37
4	5ugh:B	365	98	0.1032	0.0795	0.2959	0.082	6fbn:B, 4ktt:A, 4ktt:C, 4ktv:C, 4ndn:C, 7rw5:D
5	6umq:A	415	130	0.1068	0.0723	0.2308	1.2	6umq:B
6	5tsh:E	387	47	0.0605	0.0439	0.3617	2.3	5tsg:B, 5tsg:C, 5tsg:D, 5tsh:A, 5tsh:B, 5tsh:C, 5tsh:D, 5tsh:F, 5zfr:A, 5zfr:B, 5zfr:C
7	2ioy:A	274	108	0.0925	0.0949	0.2407	2.5	2ioy:B
8	2gbp:A	309	54	0.0712	0.0647	0.3704	3.1	2fvy:A, 2fw0:A, 8fxt:A, 3ga5:A, 3ga5:B, 3gbp:A, 1gca:A, 1gcg:A, 1glg:A, 2hph:A, 2ipl:A, 2ipm:A, 2ipn:A, 2qw1:A
9	5ot0:A	328	36	0.0534	0.0457	0.4167	3.4	5ot0:B, 5ot0:C, 5ot0:D, 5ot0:E, 5ot0:F
10	8p4h:A	388	100	0.1032	0.0747	0.2900	3.6	5a19:A, 5a1g:A, 5a1i:A, 8axz:A, 7bhr:A, 7bhs:A, 7bht:A, 7bhu:A, 7bhv:A, 7bhw:A, 7bhx:A, 6fbn:A, 6fbo:A, 6fbp:A, 6fbp:B, 6fcb:A, 6fcd:A, 6g6r:A, 7kcc:A, 7kce:A, 7kcf:A, 7kda:A, 7kdb:A, 4ktt:B, 4ktt:D, 4ktv:A, 4ktv:B, 4ktv:D, 7l1a:A, 7lnh:A, 7lnh:B, 4ndn:A, 4ndn:B, 4ndn:D, 8oog:A, 2p02:A, 8p1t:AAA, 8p1v:AAA, 8p1w:AAA, 8p4h:B, 8p4h:C, 8p4h:D, 6p9v:A, 8qdy:A, 8qdz:A, 8qe0:A, 8qe1:A, 8qe2:A, 8qe3:A, 7rw5:A, 7rw5:B, 7rw5:C, 7rw7:A, 7rwg:A, 7rwh:A, 7rxv:A, 7rxw:A, 7rxx:A, 5ugh:A, 5ugh:C, 5ugh:D, 6wkb:A, 6wkb:B, 8xam:A, 8xam:B, 8xar:A, 8xb0:A
11	2fty:A	532	45	0.0534	0.0282	0.3333	9.1	2fty:B, 2fty:C, 2fty:D, 2fvk:A, 2fvk:B, 2fvk:C, 2fvk:D, 2fvm:A, 2fvm:B, 2fvm:C, 2fvm:D
12	3j1o:J	159	65	0.0676	0.1195	0.2923	9.4	3rj1:J, 3rj1:Q, 7ui9:h, 7uif:h, 7uig:h, 7uio:Ah, 7uio:Bh

[Back]