BioLiP

>protein
MRPLDLTEKRGKKVTIYFEGKELEAYEGEKLPVALLANEIYWLTTSNEGRKRGAFTFGPVPMTVNGVKGLEARRIKVKDG
MKIERQGYYDFHEEEIERVVVDVAIIGGGPAGIGAALELQQYLTVALIEERGWLGGDMWLKGIKQEGFNKDSRKVVEELV
GKLNENTKIYLETSALGVFDKGEYFLVPVVRGDKLIEILAKRVVLATGAIDSTMLFENNDMPGVFRRDFALEVMNVWEVA
PGRKVAVTGSKADEVIQELERWGIDYVHIPNVKRVEGNEKVERVIDMNNHEYKVDALIFADGRRPDINPITQAGGKLRFR
RGYYSPVLDEYHRIKDGIYVAGSAVSIKPHYANYLEGKLVGAYILKEFGYDAQPCIYEEKLREYEPESLSIPRIPLDKFN
LEDVQICGCDVSLKKVDEVIRKGITDLQIIKRLTHLAMGFCQGRYCLFNGAVVVSQRTGKKLSEIDLPVARSPIKNVKMG
ILAR

The query sequence (length=484) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1y56:A	484	484	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	2gag:A	965	567	0.2831	0.1420	0.2416	5.95e-10	2gah:A
3	3ad7:A	963	280	0.1674	0.0841	0.2893	3.21e-08	3ad8:A, 3ad9:A, 3ada:A, 1vrq:A, 1x31:A
4	4gcm:B	309	112	0.0826	0.1294	0.3571	4.84e-04	4gcm:A
5	2bc0:A	473	97	0.0682	0.0698	0.3402	0.001	2bc0:B, 2bc1:A, 2bc1:B, 2bcp:A, 2bcp:B
6	2bc0:A	473	59	0.0455	0.0465	0.3729	1.9	2bc0:B, 2bc1:A, 2bc1:B, 2bcp:A, 2bcp:B
7	8uub:A	442	188	0.0971	0.1063	0.2500	0.002
8	2yg3:B	450	43	0.0434	0.0467	0.4884	0.002	2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
9	5k0a:D	322	150	0.0888	0.1335	0.2867	0.003	5jri:A, 5jri:B, 5k0a:A, 5k0a:B, 5k0a:C
10	3rha:A	459	43	0.0413	0.0436	0.4651	0.009	3rha:B
11	1jeh:A	478	36	0.0413	0.0418	0.5556	0.011	1jeh:B, 1v59:A, 1v59:B
12	7a76:A	326	131	0.0744	0.1104	0.2748	0.016	7a76:B, 7a76:C, 7a76:D
13	7rk0:B	262	50	0.0434	0.0802	0.4200	0.024	7rk0:A, 7rk0:C, 7rk0:D
14	1sez:A	465	150	0.0785	0.0817	0.2533	0.030	1sez:B
15	5mh4:A	303	115	0.0764	0.1221	0.3217	0.041	5mip:A, 5miq:A, 5mir:A, 5mis:A, 5mit:A, 5mjk:A, 5mjk:B, 5mjk:C, 5mjk:D
16	6pfz:A	541	179	0.0992	0.0887	0.2682	0.048	6pfz:D, 6pfz:C, 6pfz:B
17	1rp0:A	278	91	0.0517	0.0899	0.2747	0.051	1rp0:B
18	7aaw:A	315	117	0.0764	0.1175	0.3162	0.086	7aaw:B
19	2jae:A	478	38	0.0351	0.0356	0.4474	0.17	2jae:B, 2jb1:A, 2jb1:B, 2jb2:A, 2jb2:B, 2jb3:A, 2jb3:B
20	3bwv:B	168	79	0.0517	0.1488	0.3165	0.17	3bwv:A
21	7mfm:I	490	129	0.0744	0.0735	0.2791	0.18	7mfm:J, 7mft:I
22	2q7v:A	313	37	0.0372	0.0575	0.4865	0.19	2q7v:B
23	1djn:A	729	176	0.0847	0.0562	0.2330	0.20	1djn:B, 1djq:A, 1djq:B, 1o94:A, 1o94:B, 1o95:A, 1o95:B, 2tmd:A, 2tmd:B
24	6b4o:A	451	97	0.0517	0.0554	0.2577	0.34	6b4o:B, 6b4o:C, 6b4o:D
25	4x9m:A	384	77	0.0517	0.0651	0.3247	0.35	4x9n:A
26	4fk1:A	299	206	0.1054	0.1706	0.2476	0.57	4fk1:B, 4fk1:C, 4fk1:D
27	3k30:A	684	181	0.1033	0.0731	0.2762	0.59	3k30:B
28	5uwy:A	306	111	0.0806	0.1275	0.3514	0.61
29	4fx9:B	443	44	0.0331	0.0361	0.3636	0.91	4fx9:A, 5l1n:A, 5l1n:B
30	3ish:A	311	40	0.0351	0.0547	0.4250	0.96	3ish:B, 3ish:C, 2q0k:A, 2q0k:B, 2q0l:A, 2q0l:B
31	7apr:G	293	269	0.1322	0.2184	0.2379	1.1
32	3cgb:A	444	60	0.0372	0.0405	0.3000	1.1	3cgb:B, 3cgc:A, 3cgc:B, 3cgd:A, 3cgd:B, 3cge:A, 3cge:B
33	3r9u:A	314	43	0.0372	0.0573	0.4186	1.1	3r9u:B
34	4ntc:A	325	34	0.0310	0.0462	0.4412	1.1	4ntc:B
35	6u0p:C	585	33	0.0331	0.0274	0.4848	1.2	6u0p:A, 6u0p:B, 6u0p:D, 6u0p:E, 6u0p:F, 6u0s:A, 6u0s:B, 6u0s:C, 6u0s:D, 6u0s:E, 6u0s:F
36	5twb:A	344	38	0.0351	0.0494	0.4474	1.2	6a4j:A, 6a4j:B, 5twc:A
37	8il4:C	619	62	0.0434	0.0339	0.3387	1.3	8il4:A, 8il4:B, 8il4:D
38	6wpu:A	439	84	0.0496	0.0547	0.2857	1.4
39	7a7b:G	265	53	0.0351	0.0642	0.3208	1.4
40	3ukk:A	517	23	0.0269	0.0251	0.5652	1.7	4gde:A, 4gde:B, 4gde:C, 4gde:D, 5hhf:A, 5hhf:B, 5hhf:C, 5hhf:D, 4u8i:A, 4u8i:B, 4u8i:C, 4u8i:D, 4u8j:A, 4u8j:B, 4u8j:C, 4u8j:D, 4u8k:A, 4u8k:B, 4u8k:C, 4u8k:D, 4u8l:A, 4u8l:B, 4u8l:C, 4u8l:D, 4u8m:A, 4u8m:B, 4u8m:C, 4u8m:D, 4u8n:A, 4u8n:B, 4u8n:C, 4u8n:D, 4u8o:A, 4u8o:B, 4u8o:C, 4u8o:D, 4u8p:A, 4u8p:B, 4u8p:C, 4u8p:D, 3uka:A, 3uka:B, 3uka:C, 3uka:D, 3ukf:A, 3ukf:B, 3ukf:C, 3ukf:D, 3ukf:E, 3ukf:F, 3ukf:G, 3ukf:H, 3ukh:A, 3ukh:B, 3ukh:C, 3ukh:D, 3ukh:E, 3ukh:F, 3ukh:G, 3ukh:H, 3ukk:B, 3ukk:C, 3ukk:D, 3ukl:A, 3ukl:B, 3ukl:C, 3ukl:D, 3ukl:E, 3ukl:F, 3ukl:G, 3ukl:H, 3ukp:A, 3ukp:B, 3ukp:C, 3ukp:D, 3ukp:E, 3ukp:F, 3ukp:G, 3ukp:H, 3ukq:A, 3ukq:B, 3ukq:C, 3ukq:D, 3ute:A, 3ute:B, 3ute:C, 3ute:D, 3utf:A, 3utf:B, 3utf:C, 3utf:D, 3utg:A, 3utg:B, 3utg:C, 3utg:D, 3uth:A, 3uth:B, 3uth:C, 3uth:D, 5vwt:A, 5vwt:B, 5vwt:C, 5vwt:D, 5vwu:A, 5vwu:B, 5vwu:C, 5vwu:D, 4wx1:A, 4wx1:B, 4wx1:C, 4wx1:D
41	7jyp:A	305	121	0.0723	0.1148	0.2893	1.8
42	7xpi:A	363	154	0.0930	0.1240	0.2922	2.1	7ytl:A
43	2gmh:A	581	64	0.0475	0.0396	0.3594	2.3	2gmh:B, 2gmj:A, 2gmj:B
44	6kgy:B	441	91	0.0455	0.0499	0.2418	2.3	6kgy:A, 6kgy:C, 6kgy:D, 6kod:A, 6kod:B, 6kod:C, 6kod:D, 6kyy:A, 6kyy:B, 6kyy:C, 6kyy:D
45	7a7b:A	323	53	0.0351	0.0526	0.3208	2.4	7a7b:B, 7a7b:C, 7a7b:D, 7a7b:E, 7a7b:F, 7a7b:H, 7apr:A, 7apr:B, 7apr:C, 7apr:D, 7apr:E, 7apr:F, 7apr:H
46	5nmx:D	409	64	0.0393	0.0465	0.2969	2.5	5nmw:A, 5nmw:B, 5nmw:C, 5nmw:D, 5nmx:A, 5nmx:B, 5nmx:C
47	3ic9:C	483	168	0.0826	0.0828	0.2381	2.6	3ic9:A, 3ic9:B, 3ic9:D
48	3ab1:B	336	38	0.0331	0.0476	0.4211	2.7	3ab1:A
49	6su2:A	498	38	0.0351	0.0341	0.4474	2.8	6su2:B, 6su2:C, 6su2:D
50	4bay:A	670	35	0.0331	0.0239	0.4571	3.4	3abt:A, 3abu:A, 8bop:A, 8box:A, 7cdc:A, 7cdd:A, 7cde:A, 7cdf:A, 7cdg:A, 4czz:A, 7e0g:A, 2ejr:A, 8f2z:A, 8f30:A, 8f59:A, 8f6s:A, 8fdv:A, 8fj4:A, 8fj6:A, 8fj7:A, 8fqj:A, 8fri:A, 8frq:A, 8frv:A, 8fsk:A, 9fwg:A, 5h6q:A, 5h6r:A, 2h94:A, 2hko:A, 8inl:A, 2iw5:A, 8jf5:A, 6k3e:A, 6kgk:A, 6kgl:A, 6kgm:A, 6kgn:A, 6kgo:A, 6kgp:A, 6kgq:A, 6kgr:A, 4kum:A, 5l3b:A, 5l3c:A, 5l3d:A, 5l3e:A, 5l3f:A, 5l3g:A, 5lbq:A, 5lgn:A, 5lgt:A, 5lgu:A, 5lhg:A, 5lhh:A, 5lhi:A, 6nqm:A, 6nqu:A, 6nr5:A, 8q1g:A, 8q1h:A, 8q1j:A, 6s35:A, 6te1:A, 6tuy:A, 4uv8:A, 4uv9:A, 4uva:A, 4uvb:A, 4uvc:A, 2uxn:A, 2uxx:A, 4uxn:A, 2v1d:A, 7vqs:A, 7vqt:A, 7vqu:A, 6vyp:k, 6vyp:m, 6vyp:M, 6vyp:K, 7w3l:A, 6w4k:A, 6wc6:A, 2x0l:A, 5x60:A, 2xaf:A, 2xag:A, 2xah:A, 2xaj:A, 2xaq:A, 2xas:A, 4xbf:A, 7xw8:A, 2y48:A, 5yjb:A, 8ym7:A, 2z3y:A, 2z5u:A, 3zms:A, 3zmt:A, 3zmu:A, 3zmv:A, 3zmz:A, 3zn0:A, 3zn1:A, 7zry:A
51	2dw4:A	634	35	0.0331	0.0252	0.4571	3.5
52	8c16:D	327	83	0.0579	0.0856	0.3373	3.6	8c16:A, 8c16:B, 8c16:C, 6gas:A, 6gas:B, 6gas:C, 6gas:D
53	5jwa:A	495	71	0.0372	0.0364	0.2535	3.6	5jwa:H, 5jwb:A, 5jwb:H, 5jwc:A, 5jwc:H
54	3qv9:B	394	181	0.0909	0.1117	0.2431	3.9
55	8b6h:EN	145	56	0.0351	0.1172	0.3036	6.3	8b6h:En, 8bqs:EN, 8bqs:En
56	6uzi:C	470	36	0.0331	0.0340	0.4444	6.5	6uzi:A, 6uzi:B, 6uzi:D
57	4y4n:A	259	16	0.0248	0.0463	0.7500	6.6	4y4n:H, 4y4n:B, 4y4n:G, 4y4n:C, 4y4n:D, 4y4n:E, 4y4n:F
58	1foh:C	656	38	0.0331	0.0244	0.4211	6.7	1foh:A, 1foh:B, 1foh:D, 1pn0:A, 1pn0:B, 1pn0:C, 1pn0:D
59	7br0:A	318	31	0.0289	0.0440	0.4516	7.5
60	6yv8:A	346	41	0.0289	0.0405	0.3415	7.6	6yv8:B, 6yv9:A, 6yv9:B
61	1mzp:A	217	56	0.0372	0.0829	0.3214	7.8	8hku:AL1P, 8hky:AL1P, 8hkz:AL1P, 8hl1:AL1P, 8hl2:AL1P, 8hl3:AL1P, 8hl4:AL1P, 8hl5:AL1P, 4v49:B5, 4v4a:B5, 4v4g:B7, 4v4g:D7, 4v4g:F7, 4v4g:H7, 4v4g:J7, 4v65:BZ, 4v66:BZ
62	1f8w:A	447	103	0.0558	0.0604	0.2621	8.5	1joa:A, 1nhp:A, 1nhq:A, 1nhr:A, 1nhs:A, 1npx:A, 2npx:A
63	4udq:A	525	56	0.0289	0.0267	0.2500	9.1	6f97:A, 6f97:B, 4udp:A, 4udp:B, 4udq:B, 4udr:A, 4udr:B
64	7kmy:A	465	35	0.0289	0.0301	0.4000	9.4	2a8x:A, 2a8x:B, 8ct4:A, 8ct4:B, 3ii4:A, 3ii4:B, 7kmy:B, 7kmy:C, 7kmy:D, 7kmy:I, 7kmy:J, 7kmy:M, 7kmy:N, 4m52:A, 4m52:D, 4m52:B, 4m52:C, 8u0q:A, 8u0q:B
65	7epw:A	373	20	0.0269	0.0349	0.6500	9.9	4a6n:A, 4a6n:B, 4a6n:C, 4a6n:D, 4a99:A, 4a99:C, 4a99:B, 4a99:D, 7epv:A, 4guv:A, 4guv:B, 4guv:C, 4guv:D, 3p9u:A, 3p9u:B, 3p9u:C, 3p9u:D, 3v3n:A, 3v3n:B, 3v3n:C, 3v3n:D, 3v3o:A, 3v3o:B, 3v3o:C, 3v3o:D, 2xdo:A, 2xdo:B, 2xdo:C, 2xdo:D, 2xyo:A, 2xyo:B, 2xyo:C, 2xyo:D, 2y6q:A, 2y6q:B, 2y6q:C, 2y6q:D, 2y6r:A, 2y6r:B, 2y6r:C, 2y6r:D

[Back]