BioLiP

>protein
MRLESVAKFHSPKSPMMSDSPRATASDSLSGTDVMAAMGMAQSQAGFGMAAFCGKHELSQNDKQKAINYLMQFAHKVSGK
YRGVAKLEGNTKAKVLQVLATFAYADYCRSAATPGARCRDCHGTGRAVDIAKTELWGRVVEKECGRCKGVGYSRMPASAA
YRAVTMLIPNLTQPTWSRTVKPLYDALVVQCHKEESIADNILNAVTR

The query sequence (length=207) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7ubn:Q	207	207	1.0000	1.0000	1.0000	5.60e-158	4mo1:A, 4mo1:B, 7ubj:A, 7ubj:B, 7ubk:A, 7ubk:B, 7ubl:A, 7ubm:Q
2	2jkb:A	661	58	0.0918	0.0287	0.3276	0.71	4fow:A, 4foy:A, 4fp2:A, 4fp3:A, 4fpc:A, 4fpe:A, 4fpf:A, 4fpg:A, 4fph:A, 4fpj:A, 4fpk:A, 4fpl:A, 4fpo:B, 4fpy:A, 4fq4:A, 2vw1:A, 2vw2:A, 4xe9:A, 4xhb:A, 4xhx:A, 4xil:A, 4xj9:A, 4xja:A, 4xju:A, 4xjw:A, 4xma:A, 4xog:A, 4xyx:A
3	6btm:A	221	69	0.0725	0.0679	0.2174	1.3
4	6k76:A	485	30	0.0531	0.0227	0.3667	1.8	6k76:B
5	9fe6:B	261	48	0.0676	0.0536	0.2917	1.9	9feb:D, 9feb:A, 9feb:B, 9feb:C
6	8dgt:A	431	48	0.0725	0.0348	0.3125	2.4	9axx:B, 9axy:A, 6b8u:A, 9bfb:A, 3c4c:A, 3c4c:B, 8c7x:A, 8c7x:B, 8c7y:A, 8c7y:B, 5c9c:A, 5csw:A, 5csx:A, 5ct7:A, 5ct7:B, 3d4q:A, 3d4q:B, 4dbn:A, 4dbn:B, 8dgs:A, 4e26:A, 4e26:B, 4e4x:A, 4e4x:B, 4ehe:A, 4ehe:B, 4ehg:A, 4ehg:B, 8f7o:A, 8f7o:B, 8f7p:A, 8f7p:B, 2fb8:A, 2fb8:B, 4fc0:B, 5fd2:A, 4g9c:A, 4g9c:B, 4g9r:A, 4g9r:B, 4h58:A, 5hid:A, 5hid:B, 5hie:A, 5hie:B, 3idp:B, 3idp:A, 3ii5:A, 3ii5:B, 5j18:A, 5j2r:A, 5jrq:A, 5jsm:A, 5jsm:B, 5jsm:C, 5jsm:D, 5jt2:A, 4jvg:B, 4jvg:A, 4jvg:C, 4jvg:D, 7k0v:A, 7k0v:B, 7k0v:C, 7k0v:D, 4ksp:A, 4ksp:B, 4ksq:A, 4ksq:B, 7m0t:A, 7m0u:A, 7m0v:A, 7m0w:A, 7m0x:A, 7m0y:A, 7m0z:A, 4mbj:A, 4mbj:B, 7mfd:A, 7mfe:A, 7mff:A, 7mff:B, 4mnf:A, 4mnf:B, 6n0p:A, 6n0p:B, 6n0q:A, 6nsq:A, 6nyb:A, 6p3d:A, 7p3v:A, 7p3v:B, 6p7g:A, 6p7g:B, 6p7g:C, 6p7g:D, 3ppj:A, 3ppj:B, 3ppk:A, 3ppk:B, 4pp7:A, 4pp7:B, 6pp9:A, 3prf:A, 3prf:B, 3pri:A, 3pri:B, 3psb:A, 3psb:B, 3psd:A, 3psd:B, 3q4c:A, 3q96:B, 8qqg:A, 8qqg:B, 8qqg:C, 4r5y:A, 4r5y:B, 4rzv:A, 4rzv:B, 7shv:A, 7shv:B, 3skc:A, 3skc:B, 3tv4:A, 3tv4:B, 3tv6:A, 3tv6:B, 6u2g:B, 6u2h:C, 6u2h:D, 6uuo:A, 1uwh:A, 1uwh:B, 1uwj:A, 1uwj:B, 6v2u:A, 6v2w:A, 6v34:A, 5vam:A, 5vam:B, 4wo5:A, 4wo5:B, 6xfp:A, 6xlo:A, 4xv9:A, 4yht:A, 4yht:B
7	2exu:A	192	45	0.0725	0.0781	0.3333	3.3
8	7b9v:c	37	30	0.0435	0.2432	0.3000	5.6
9	6n9l:A	625	83	0.1159	0.0384	0.2892	6.1
10	3pih:A	836	83	0.1159	0.0287	0.2892	6.3
11	1z24:A	189	53	0.0966	0.1058	0.3774	8.4

[Back]