Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MRKKISIIGAGFVGSTTAHWLAAKELGDIVLLDIVEGVPQGKALDLYEASPIEGFDVRVTGTNNYADTANSDVIVVTSGA
LIKVNADITRACISQAAPLSPNAVIIMVNNPLDAMTYLAAEVSGFPKERVIGQAGVLDAARYRTFIAMEAGVSVEDVQAM
LMGGHGDEMVPLPRFSTISGIPVSEFIAPDRLAQIVERTRKGGGEIVNLLKTGSAYYAPAAATAQMVEAVLKDKKRVMPV
AAYLTGQYGLNDIYFGVPVILGAGGVEKILELPLNEEEMALLNASAKAVRATLDTL

The query sequence (length=296) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1uxg:A 308 305 0.9966 0.9578 0.9672 0.0 1guy:A, 1guy:C, 1ur5:A, 1ur5:C, 1uxg:B, 1uxh:A, 1uxh:B, 1uxi:A, 1uxi:B, 1uxj:A, 1uxj:C, 1uxk:A, 1uxk:C
2 7f8d:A 313 307 0.5709 0.5399 0.5505 1.49e-117 7by9:A, 7by9:B, 7by9:C, 7by9:D, 7bya:A, 7bya:B, 7bya:C, 7bya:D, 7f8d:B, 7f8d:C, 7f8d:D, 7x1l:A, 7x1l:B, 7x1l:E, 7x1l:F, 7x1l:C, 7x1l:D
3 1gv0:A 301 293 0.5338 0.5249 0.5392 7.00e-113 1gv0:B
4 4plt:B 319 315 0.5642 0.5235 0.5302 1.30e-111 4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
5 1guz:A 305 304 0.5304 0.5148 0.5164 4.31e-109 1guz:B, 1guz:C, 1guz:D
6 4ros:A 318 308 0.5169 0.4811 0.4968 7.89e-106 5ujk:A
7 3gvh:A 318 303 0.5034 0.4686 0.4917 1.42e-105 3gvh:B, 3gvh:C, 3gvh:D, 3gvi:A, 3gvi:B, 3gvi:C, 3gvi:D, 3gvi:E, 3gvi:F
8 4plf:B 330 309 0.5236 0.4697 0.5016 1.23e-104 4plc:A, 4plc:B, 4plc:C, 4plc:D, 4plf:A, 4plg:A, 4plg:B, 6vdj:A
9 3czm:B 323 308 0.4595 0.4211 0.4416 7.89e-90 3czm:A, 1sow:A, 1sow:B
10 2hjr:B 314 311 0.4730 0.4459 0.4502 1.21e-86 2hjr:A, 2hjr:C, 2hjr:D, 2hjr:E, 2hjr:F, 2hjr:G, 2hjr:H, 2hjr:I, 2hjr:J, 2hjr:K, 2hjr:L
11 6ct6:B 331 304 0.4392 0.3927 0.4276 4.48e-81 6ct6:A
12 2fn7:A 317 304 0.4459 0.4164 0.4342 7.50e-72 2fn7:B, 4nd1:A, 4nd1:B, 4nd2:A, 4nd2:B, 4nd3:A, 4nd3:B, 4nd4:A, 4nd4:B
13 2a92:C 318 297 0.3986 0.3711 0.3973 1.97e-69 2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D
14 1t2e:A 317 299 0.4088 0.3817 0.4047 7.69e-64 4b7u:B, 4b7u:C, 4b7u:D, 1cet:A, 1ldg:A, 1u4o:A, 1u4s:A, 1u5a:A, 1u5c:A, 1xiv:A
15 6r8g:C 312 304 0.3682 0.3494 0.3586 3.31e-62 6r8g:A, 6r8g:B, 6r8g:D, 6y91:A, 6y91:B, 6y91:C, 6y91:D
16 3om9:A 329 290 0.3818 0.3435 0.3897 4.95e-62 3om9:B, 3om9:C, 3om9:D, 1pzf:A, 1pzf:B, 1pzf:C, 1pzf:D, 1pzg:A, 1pzg:B, 1pzg:C, 1pzg:D, 1pzh:A, 1pzh:B, 1pzh:C, 1pzh:D
17 1llc:A 320 312 0.3345 0.3094 0.3173 2.89e-52 6j9t:B, 6j9t:D, 6j9t:E, 6j9t:C, 6j9t:F, 6j9u:A, 6j9u:C, 6j9u:D
18 3wsw:A 316 312 0.3243 0.3038 0.3077 1.19e-51 3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
19 3pqd:B 312 307 0.3277 0.3109 0.3160 3.84e-51 3pqd:A, 3pqd:C, 3pqd:D, 3pqd:F, 3pqd:H, 3pqd:E, 3pqd:G, 3pqf:C, 3pqf:D
20 1ez4:B 318 309 0.3345 0.3113 0.3204 5.19e-50 1ez4:A, 1ez4:C, 1ez4:D
21 6h9s:B 292 301 0.3412 0.3459 0.3355 7.04e-47 6h9s:A
22 1lld:A 313 310 0.3243 0.3067 0.3097 1.88e-46 1lld:B, 1lth:T, 1lth:R
23 3h3j:B 314 303 0.3108 0.2930 0.3036 1.95e-46 3d4p:A, 3d4p:B, 3h3j:A
24 1a5z:A 312 284 0.3345 0.3173 0.3486 1.97e-45
25 4qsm:A 332 305 0.3176 0.2831 0.3082 3.72e-45 4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
26 8rwl:A 312 302 0.3412 0.3237 0.3344 1.03e-44 9end:A, 9end:B, 8rs5:A, 8rs5:B, 8rwl:B
27 4ln1:B 321 307 0.3007 0.2773 0.2899 1.33e-44 4ln1:A, 4ln1:C, 4ln1:D
28 6k13:A 332 308 0.3142 0.2801 0.3019 3.42e-44 6k13:B
29 8ab3:A 330 314 0.3243 0.2909 0.3057 1.00e-43 8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
30 1ldb:A 294 298 0.3007 0.3027 0.2987 1.20e-43
31 7dbj:A 333 302 0.3041 0.2703 0.2980 2.55e-42 6cep:A, 6cep:B, 6cep:C, 6cep:D, 7dbj:B, 7dbj:C, 7dbj:D, 7dbk:A, 7dbk:B, 7dbk:C, 7dbk:D, 7dbk:E, 7dbk:F, 7dbk:G, 7dbk:H, 1i0z:A, 1i0z:B, 5ldh:A, 5ldh:B, 8qde:A, 8qde:B, 8qde:C, 8qde:D, 1t2f:A, 1t2f:B, 1t2f:C, 1t2f:D, 5yta:A, 5yta:B
32 7epm:A 335 305 0.3108 0.2746 0.3016 3.07e-42 7epm:B
33 1ldn:A 316 312 0.3007 0.2816 0.2853 4.46e-42 1ldn:C, 1ldn:B, 1ldn:D, 1ldn:E, 1ldn:F, 1ldn:H, 1ldn:G, 2ldb:A, 2ldb:B, 2ldb:C, 2ldb:D
34 1hyg:A 313 307 0.3345 0.3163 0.3225 9.76e-41 1hye:A, 1hyg:B
35 2e37:C 310 305 0.3243 0.3097 0.3148 3.88e-39 2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
36 1v6a:A 332 285 0.2736 0.2440 0.2842 5.07e-37 1v6a:B
37 7nay:A 322 317 0.2905 0.2671 0.2713 7.65e-36
38 2x0i:A 294 306 0.3142 0.3163 0.3039 5.40e-35 2x0j:A
39 1ldm:A 329 299 0.2736 0.2462 0.2709 8.83e-35 6ldh:A
40 1d3a:A 303 242 0.2534 0.2475 0.3099 5.03e-33 1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
41 6qss:A 303 302 0.2804 0.2739 0.2748 1.06e-25 6qss:D
42 6ihd:B 304 296 0.2770 0.2697 0.2770 2.14e-23 6ihd:A, 6ihe:A, 6ihe:B
43 1hyh:A 297 290 0.2736 0.2727 0.2793 3.38e-21 1hyh:B, 1hyh:C, 1hyh:D
44 3ldh:A 329 303 0.2601 0.2340 0.2541 1.04e-15
45 1emd:A 312 319 0.2973 0.2821 0.2759 9.29e-14 1ib6:A, 1ib6:C, 1ib6:D, 1ie3:A, 1ie3:B, 1ie3:C, 1ie3:D, 5kka:A, 5kka:B
46 6itl:A 312 290 0.2770 0.2628 0.2828 1.51e-13
47 5zi2:A 339 255 0.2264 0.1976 0.2627 3.51e-10 5zi2:B, 5zi4:A, 5zi4:B
48 2dfd:A 314 219 0.2095 0.1975 0.2831 2.82e-09 2dfd:B, 2dfd:C, 2dfd:D, 4wlo:A, 4wlo:B, 4wlo:C, 4wlo:D, 4wlu:A, 4wlu:B, 4wlu:C, 4wlu:D, 4wlv:A, 4wlv:B, 4wlv:C, 4wlv:D
49 7qoz:A 323 231 0.2196 0.2012 0.2814 1.06e-08 7qoz:B, 7qoz:C, 7qoz:D, 7qoz:E, 7qoz:F, 7qoz:G, 7qoz:H
50 1civ:A 374 176 0.1554 0.1230 0.2614 0.007
51 5nue:B 332 214 0.1723 0.1536 0.2383 0.014 5nue:A, 5nue:C, 5nuf:A, 5nuf:B, 5nuf:C
52 4uun:B 337 181 0.1588 0.1395 0.2597 0.12 5a1t:A, 5a1t:B, 4uun:A
53 7kzp:G 577 134 0.1284 0.0659 0.2836 0.32 7kzq:G, 7kzr:G, 7kzs:G, 7kzt:G, 7kzv:G
54 4mdh:A 333 227 0.1655 0.1471 0.2159 0.43 4mdh:B, 5mdh:A, 5mdh:B, 7rm9:A
55 2cul:A 225 21 0.0405 0.0533 0.5714 1.1
56 6aa8:E 281 86 0.0946 0.0996 0.3256 1.2 6aa8:F
57 5x68:B 354 60 0.0676 0.0565 0.3333 1.3 5x68:A
58 2gv8:A 442 156 0.1250 0.0837 0.2372 1.8 2gv8:B, 2gvc:A, 2gvc:B, 2gvc:D, 2gvc:E, 1vqw:A, 1vqw:B
59 7kws:A 390 38 0.0507 0.0385 0.3947 3.0 7kws:B
60 2be7:D 133 78 0.0743 0.1654 0.2821 3.2 2be7:E, 2be7:F
61 1bxr:A 1073 149 0.1385 0.0382 0.2752 4.7 1a9x:A, 1a9x:C, 1a9x:E, 1a9x:G, 1bxr:C, 1bxr:E, 1bxr:G, 1c30:A, 1c30:C, 1c30:E, 1c30:G, 1c3o:A, 1c3o:C, 1c3o:E, 1c3o:G, 1ce8:A, 1ce8:C, 1ce8:E, 1ce8:G, 1cs0:A, 1cs0:C, 1cs0:E, 1cs0:G, 1jdb:B, 1jdb:E, 1jdb:H, 1jdb:K, 1kee:A, 1kee:C, 1kee:E, 1kee:G, 1m6v:A, 1m6v:C, 1m6v:E, 1m6v:G, 1t36:A, 1t36:C, 1t36:E, 1t36:G
62 1g7u:A 284 32 0.0338 0.0352 0.3125 5.5 1g7v:A, 1gg0:A, 1phq:A, 1phw:A, 1pl9:A, 1q3n:A, 1x6u:A
63 3nyc:A 381 27 0.0405 0.0315 0.4444 8.2 3nye:A, 3nyf:A, 6p9d:A, 6pld:A, 7rdf:A, 3sm8:A
64 1mfz:A 436 94 0.0912 0.0619 0.2872 8.4 1mfz:B, 1mfz:C, 1mfz:D, 1muu:C, 1muu:A, 1muu:B, 1muu:D, 1mv8:B, 1mv8:A, 1mv8:C, 1mv8:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218