Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MRFILTGVPGAGKTTVCNKLAEKMSNLSVVNYGDVIFEEAKKLYPSIIQVREDTRKLPRADYRNIQIEAAKKISLITDNL
IVDTHMSLKTPYGFYPGLIPETINIIQPDGIILLEFNPRDVIARREKDRLAGKMESETDILLHQQVNRMFAVSYSAINQC
YVKIIDLTWPQEYEFQHTEYAVNKIIEMLNF

The query sequence (length=191) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7owj:F 197 196 1.0000 0.9695 0.9745 6.08e-141 7owe:E, 7owe:F, 7owe:D, 7owe:A, 7owe:B, 7owe:C, 7owj:A, 7owj:B, 7owj:C, 7owj:D, 7owj:E, 7owk:B, 7owk:A, 7owk:C, 7owk:D, 7owk:E, 7owk:F, 7owl:A, 7owl:B, 7owl:C, 7owl:D, 7owl:E, 7owl:F
2 1nks:C 194 173 0.2880 0.2835 0.3179 1.06e-20 1nks:D, 1nks:F
3 6hf7:A 191 174 0.2984 0.2984 0.3276 1.68e-20 6hf7:B
4 6pjw:A 191 150 0.2723 0.2723 0.3467 2.05e-18 6pjw:B, 6pjw:C, 6pjw:D, 6pjw:E, 6pjw:F, 6pjw:G, 6pjw:H, 6pjw:I, 6pjw:J, 6pjw:K, 6pjw:L, 6psp:A, 6psp:B, 6psp:C, 6psp:D, 6psp:E, 6psp:F
5 1kht:B 191 143 0.2408 0.2408 0.3217 3.67e-17 1kht:C
6 3h86:B 191 149 0.2461 0.2461 0.3154 1.30e-16 3h86:A, 3h86:C, 3h86:G
7 6ln3:A 202 127 0.2461 0.2327 0.3701 1.21e-14
8 3iij:A 175 36 0.0995 0.1086 0.5278 0.002 3iik:A, 3iil:A, 3iim:A, 5jzv:A
9 7sqc:1A 1639 52 0.0890 0.0104 0.3269 0.013
10 7sqc:1B 1660 52 0.0890 0.0102 0.3269 0.013
11 7sqc:1C 1700 52 0.0890 0.0100 0.3269 0.013 7sqc:1D
12 3add:A 251 42 0.0890 0.0677 0.4048 0.048 3a4l:A, 3a4l:B, 3a4m:A, 3a4m:B, 3adb:A, 3adb:B, 3adc:A, 3adc:B, 3add:B, 3am1:A
13 2cdn:A 186 46 0.1047 0.1075 0.4348 0.051
14 7yq0:A 173 97 0.1571 0.1734 0.3093 0.094 7yq0:B, 7yq1:A, 7yq1:B, 7yq1:C, 7yq1:D, 7yq1:E, 7yq1:F
15 6pdy:A 262 65 0.1257 0.0916 0.3692 0.10 6pe0:A
16 4xgu:B 382 22 0.0628 0.0314 0.5455 0.11 4xgu:E
17 6pdw:D 299 65 0.1257 0.0803 0.3692 0.11 6pdw:B, 6pdw:C, 6pdw:E, 6pdw:F, 6pdy:F, 6pdy:C, 6pdy:D, 6pdy:E, 6pdy:B, 6pe0:B, 6pe0:C, 6pe0:D, 6pe0:E, 6pe0:F
18 4cw7:A 181 25 0.0681 0.0718 0.5200 0.13 4cvn:A, 4cvn:B, 4cvn:C, 4cvn:D, 4cw7:C, 4cw7:E, 4cw7:G
19 6f0x:B 398 63 0.1152 0.0553 0.3492 0.14 6f0x:A, 6f0x:C, 6f0x:D, 6f0x:E, 7l9p:A, 7l9p:B, 7l9p:C, 7l9p:D, 7l9p:E
20 7wi4:A 410 58 0.1099 0.0512 0.3621 0.22 7wi4:D, 7wi4:E, 7wi4:F, 7wi4:B, 7wi4:C
21 5vqa:A 368 22 0.0576 0.0299 0.5000 0.23 5wc2:A
22 2bbw:A 220 41 0.0733 0.0636 0.3415 0.25 2bbw:B
23 6hd3:A 450 138 0.2094 0.0889 0.2899 0.25 6hd3:C
24 2jas:C 195 164 0.1990 0.1949 0.2317 0.26 2jaq:A, 2jaq:B, 2jas:A, 2jas:B, 2jas:D, 2jas:E, 2jas:F, 2jat:A, 2jat:B
25 4mkh:A 218 51 0.0838 0.0734 0.3137 0.31 3dkv:A, 4mkg:A, 4qbf:A, 4tyq:A, 4tyq:B
26 8a8h:B 146 92 0.1675 0.2192 0.3478 0.34
27 1y63:A 168 92 0.1152 0.1310 0.2391 0.40
28 3zuh:A 286 32 0.0733 0.0490 0.4375 0.45 3zuh:B, 3zuh:C, 3zuh:D, 3zuh:E, 3zuh:F
29 4ike:A 206 45 0.0838 0.0777 0.3556 0.62 4cf7:A, 4cf7:B, 4ike:B, 4jky:A, 4jky:B, 4jl5:A, 4jl5:B, 4jl6:A, 4jl6:B, 4jl8:A, 4jl8:B, 4jla:A, 4jla:B, 4jlb:A, 4jlb:B, 4jld:A, 4jld:B, 4jlo:A, 4jlo:B, 4jlp:A, 4jlp:B, 2rgx:A, 3sr0:A, 3sr0:B
30 9d8a:A 172 42 0.0628 0.0698 0.2857 0.64
31 2bwj:B 195 37 0.0838 0.0821 0.4324 0.70
32 2k5u:A 181 70 0.1152 0.1215 0.3143 0.78 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
33 3ndb:B 420 121 0.1885 0.0857 0.2975 0.96 2v3c:C, 2v3c:D, 4xco:D
34 6or5:A 2058 38 0.0890 0.0083 0.4474 1.0
35 5d4w:A 688 26 0.0628 0.0174 0.4615 1.1 5d4w:B, 5d4w:C, 5zui:A
36 8bqf:D 215 36 0.0785 0.0698 0.4167 1.1 1ake:A, 1ake:B, 1ank:A, 1ank:B, 7apu:A, 7apu:B, 8bqf:A, 8bqf:B, 8bqf:C, 8bqf:E, 8bqf:F, 8crg:AA, 8crg:BA, 1e4v:A, 1e4v:B, 1e4y:A, 1e4y:B, 2eck:A, 2eck:B, 5eje:A, 5eje:B, 6ham:A, 6hap:A, 3hpq:A, 3hpq:B, 3hpr:A, 3hpr:B, 4jzk:A, 4jzk:B, 8q2b:A, 8q2b:B, 8rj4:A, 8rj4:B, 8rj4:C, 8rj4:D, 8rj6:A, 8rj6:B, 8rj9:A, 8rj9:B, 3x2s:A, 3x2s:B, 4x8l:A, 4x8l:B, 4x8o:A, 4x8o:B
37 4qbh:A 217 52 0.0785 0.0691 0.2885 1.1 4qbh:B, 4qbi:A, 4qbi:B, 1zin:A, 1zio:A, 1zip:A
38 2fko:A 173 63 0.0942 0.1040 0.2857 1.2 1v3w:A, 1v67:A
39 6oa9:D 489 80 0.1204 0.0470 0.2875 1.3 6oaa:E, 6oab:E
40 6opc:B 741 80 0.1204 0.0310 0.2875 1.3 8dar:A, 8dar:B, 8dar:C, 8dar:D, 8dar:E, 8dar:F, 8das:A, 8das:B, 8das:C, 8das:D, 8das:E, 8das:F, 8dat:A, 8dat:B, 8dat:C, 8dat:D, 8dat:E, 8dat:F, 8dau:A, 8dau:B, 8dau:C, 8dau:D, 8dau:E, 8dau:F, 8dav:A, 8dav:B, 8dav:C, 8dav:D, 8dav:E, 8dav:F, 8daw:A, 8daw:B, 8daw:C, 8daw:D, 8daw:E, 8daw:F, 6oa9:A, 6oa9:B, 6oa9:C, 6oa9:E, 6oa9:F, 6oaa:B, 6oaa:C, 6oaa:D, 6oab:D, 6oab:B, 6oab:C, 6oab:A, 6omb:A, 6omb:B, 6omb:C, 6omb:D, 6omb:E, 6opc:A, 6opc:C, 6opc:D, 6opc:E
41 2p0e:A 190 121 0.1466 0.1474 0.2314 1.4 2qg6:A, 2ql6:A, 2ql6:E, 2ql6:B, 2ql6:C, 2ql6:F, 2ql6:D, 2ql6:G, 2ql6:H, 2ql6:I, 2ql6:M, 2ql6:J, 2ql6:K, 2ql6:L, 2ql6:N, 2ql6:O, 2ql6:P, 2qsy:A, 2qsz:A, 2qt0:A, 2qt1:A
42 5g3z:A 215 23 0.0628 0.0558 0.5217 1.4 5g40:A, 5g41:A
43 7w46:B 402 183 0.2408 0.1144 0.2514 1.5
44 8aaj:A 357 87 0.1204 0.0644 0.2644 1.5 8aas:A, 8c5y:A, 8c5y:D, 8c5y:G, 8c5y:J, 8c5z:A, 8c5z:D, 8c5z:G, 8c5z:J, 8oej:A, 8oej:D, 8oel:A, 8oel:D
45 6g0z:A 290 23 0.0524 0.0345 0.4348 1.7 6g0z:B, 6g12:A, 6g12:B, 6g14:B, 6g14:A, 6g15:A, 6g15:B
46 1s3g:A 217 23 0.0576 0.0507 0.4783 1.7 5x6j:A
47 1puj:A 261 23 0.0524 0.0383 0.4348 2.0 6ppk:W
48 5cb8:B 176 36 0.0838 0.0909 0.4444 2.0 5cb6:A, 5cb6:B, 5cb6:C, 5cb6:D, 5cb6:E, 5cb6:F, 5cb8:A
49 8smr:G 312 46 0.0838 0.0513 0.3478 2.1
50 2iyv:A 179 24 0.0471 0.0503 0.3750 2.4 3baf:A, 4bqs:A, 4bqs:B, 4bqs:C, 2dfn:A, 2dft:A, 2dft:B, 2dft:C, 2dft:D, 2g1k:A, 2iyq:A, 2iyr:A, 2iyr:B, 2iys:A, 2iyu:A, 2iyw:A, 2iyx:A, 2iyy:A, 2iyz:A, 1l4u:A, 1l4y:A, 1u8a:A, 1we2:A, 1zyu:A
51 4nu0:A 212 35 0.0628 0.0566 0.3429 2.5 4nu0:B, 4w5j:A, 4w5j:B, 4w5j:C, 4w5j:D
52 6p14:A 265 52 0.0890 0.0642 0.3269 2.5
53 5c1s:A 288 25 0.0524 0.0347 0.4000 2.5 5c1s:B, 5c1t:A, 5c1t:B
54 7mhs:E 489 98 0.1414 0.0552 0.2755 2.6
55 1uky:A 196 37 0.0838 0.0816 0.4324 2.6 1ukz:A
56 3be4:A 215 39 0.0785 0.0698 0.3846 2.7
57 3cnl:A 233 25 0.0576 0.0472 0.4400 2.9 3cnn:A, 3cno:A
58 4typ:C 190 51 0.0785 0.0789 0.2941 3.0 4typ:D
59 7tfh:B 320 36 0.0733 0.0437 0.3889 3.0 8dqw:B, 8dqx:B, 8dqz:B, 8dr0:B, 8dr1:B, 8dr3:B, 8dr4:B, 8dr5:B, 8dr6:B, 8dr7:B, 8fs3:B, 8fs4:B, 8fs5:B, 8fs6:B, 8fs7:B, 8fs8:B, 7sgz:B, 7sh2:B, 7st9:B, 7stb:B, 7ste:B, 1sxj:B, 7tfi:B, 7tfj:B, 7tfk:B, 7tfl:B, 7thj:B, 7thv:B, 8thb:B, 8thc:B, 8thd:B, 7ti8:B, 7tib:B, 7tic:B, 7tid:B, 7tku:B, 8tw7:4, 8tw8:4, 8twa:4, 8twb:4, 7u19:B, 7u1a:B, 7u1p:B
60 7obr:x 488 18 0.0524 0.0205 0.5556 3.5 2go5:W, 2j37:W, 5l3q:A, 5l3q:C, 1mfq:C, 7nfx:x, 7qwq:x, 1ry1:W, 4ue5:D, 6y2z:A, 6y32:A, 6y32:C, 6y32:E, 6y32:G
61 3jaj:z 426 18 0.0524 0.0235 0.5556 3.5 6frk:x, 3jan:z, 7obq:x, 6r6g:AB
62 6chs:H 550 80 0.1204 0.0418 0.2875 3.6 6chs:I, 6chs:J, 6chs:D, 6chs:E, 6chs:F
63 8csq:a 263 20 0.0524 0.0380 0.5000 3.7
64 6qp0:A 188 138 0.1675 0.1702 0.2319 4.1
65 6d4g:B 187 38 0.0628 0.0642 0.3158 4.3
66 4h8n:A 303 104 0.1414 0.0891 0.2596 4.8 4h8n:B
67 4mkf:A 217 51 0.0785 0.0691 0.2941 4.8 3dl0:A, 3dl0:B, 2eu8:A, 2eu8:B, 4mkf:B, 2oo7:A, 2oo7:B, 2ori:A, 2ori:B, 2osb:A, 2osb:B, 1p3j:A, 2p3s:A, 2qaj:A, 2qaj:B, 5x6i:A
68 2c9y:A 218 22 0.0628 0.0550 0.5455 4.9
69 3uk6:L 233 38 0.0628 0.0515 0.3158 5.2
70 7pds:A 457 46 0.0942 0.0394 0.3913 5.2 7pds:B, 7pds:C, 7pds:D, 7pds:E, 7pds:F
71 4k46:A 214 36 0.0733 0.0654 0.3889 5.3
72 7uqi:E 558 57 0.0995 0.0341 0.3333 5.4 7uqk:E
73 5vc7:A 544 72 0.1099 0.0386 0.2917 5.6 5vc7:C, 5vc7:D, 5vc7:E, 5vc7:F, 5vc7:G
74 5vc7:A 544 64 0.1152 0.0404 0.3438 5.8 5vc7:C, 5vc7:D, 5vc7:E, 5vc7:F, 5vc7:G
75 7upr:E 300 90 0.1361 0.0867 0.2889 5.7 7upr:C, 7upr:D, 7upr:B, 7upr:F, 7upt:A, 7upt:B, 7upt:C, 7upt:D, 7upt:E
76 2o52:A 167 143 0.1675 0.1916 0.2238 5.8 2o52:B
77 1zak:A 220 140 0.1623 0.1409 0.2214 6.0 1zak:B
78 6hyp:A 2272 22 0.0576 0.0048 0.5000 6.1
79 7x5b:A 312 67 0.0995 0.0609 0.2836 6.1 6blb:A, 7x7p:M, 7x7p:P, 7x7q:M, 7x7q:P
80 5oxf:B 591 47 0.0890 0.0288 0.3617 6.2
81 7p04:A 1353 32 0.0733 0.0103 0.4375 6.3 7p05:A
82 3fb4:A 215 23 0.0576 0.0512 0.4783 6.3
83 6oay:F 558 26 0.0576 0.0197 0.4231 6.3 6og2:F
84 5oxf:A 703 47 0.0890 0.0242 0.3617 6.3
85 7p06:A 1350 32 0.0733 0.0104 0.4375 6.4
86 5jcs:s 2003 22 0.0576 0.0055 0.5000 6.5
87 6qs4:C 630 26 0.0576 0.0175 0.4231 6.5 5og1:C, 5og1:D, 6qs4:D, 6qs4:E, 6qs6:C, 6qs6:D, 6qs7:C, 6qs7:D, 6qs7:E, 6qs8:C, 6qs8:D, 6qs8:E
88 4ciu:A 657 26 0.0576 0.0167 0.4231 6.6
89 8j9q:A 73 35 0.0628 0.1644 0.3429 6.6 8j9q:B, 8j9q:C, 8j9r:A
90 4tmk:A 210 54 0.0890 0.0810 0.3148 6.6 5tmp:A
91 7ln6:F 714 80 0.1204 0.0322 0.2875 6.7 3cf0:A, 3cf0:B, 3cf0:C, 3cf0:D, 3cf0:E, 3cf0:F, 3cf0:G, 3cf0:H, 3cf0:I, 3cf0:J, 3cf0:K, 3cf0:L, 3cf0:M, 3cf0:N, 6g2v:A, 6g2w:A, 6g2x:A, 6g2y:A, 6g2z:A, 6g30:A, 7lmz:F, 7ln0:F, 7ln1:F, 7ln2:F, 7ln3:F, 7ln4:F, 7ln5:F, 6mck:A, 6mck:B, 6mck:C, 6mck:D, 6mck:E, 6mck:F, 6mck:G, 6mck:H, 6mck:I, 6mck:J, 6mck:K, 6mck:L, 8vku:A, 8vku:B, 8vku:C, 8vku:D, 8vku:E, 8vku:F, 8vls:A, 8vls:B, 8vls:C, 8vls:D, 8vls:E, 8vls:F, 8vls:G, 8vls:H, 8vls:I, 8vls:J, 8vls:K, 8vls:L, 8vov:A, 8vov:B, 8vov:C, 8vov:D, 8vov:E, 8vov:F
92 6rn4:F 680 26 0.0576 0.0162 0.4231 6.7 6rn3:F, 6rn4:A
93 3dhr:A 141 51 0.0681 0.0922 0.2549 6.8 3dhr:C, 3dhr:E, 3dhr:G, 3mju:A, 2r80:A, 2r80:C
94 7vcs:A 766 80 0.1204 0.0300 0.2875 7.3 8b5r:A, 8b5r:B, 8b5r:C, 5b6c:A, 9boq:A, 9boq:B, 9boq:C, 9boq:D, 9boq:E, 9boq:F, 9boq:G, 9boq:H, 9boq:I, 9boq:J, 9boq:K, 9boq:L, 7bp8:A, 7bp8:B, 7bp8:C, 7bp8:D, 7bp8:E, 7bp8:F, 7bp9:A, 7bp9:B, 7bp9:C, 7bp9:D, 7bp9:E, 7bp9:F, 7bpa:A, 7bpa:F, 7bpa:B, 7bpa:C, 7bpa:D, 7bpa:E, 7bpb:A, 7bpb:F, 7bpb:B, 7bpb:C, 7bpb:D, 7bpb:E, 5c18:A, 5c18:B, 5c18:C, 5c18:D, 5c18:E, 5c18:F, 5c1a:A, 5c1a:B, 5c1a:C, 5c1a:D, 5c1a:E, 5c1a:F, 5c1a:G, 5c1a:H, 5c1a:I, 5c1a:J, 5c1a:K, 5c1a:L, 5c1b:D, 5c1b:A, 5c1b:B, 5c1b:C, 5c1b:E, 5c1b:F, 3cf1:A, 3cf1:B, 3cf1:C, 3cf2:A, 3cf2:B, 3cf2:C, 3cf2:D, 3cf3:A, 3cf3:B, 3cf3:C, 5dyg:A, 5dyi:A, 5dyi:B, 5dyi:C, 5dyi:D, 5dyi:E, 5dyi:F, 5dyi:G, 5dyi:H, 5dyi:I, 5dyi:J, 5dyi:K, 5dyi:L, 1e32:A, 5epp:A, 8fcl:A, 8fcl:B, 8fcl:C, 8fcl:D, 8fcl:E, 8fcl:F, 8fcm:B, 8fcm:E, 8fcm:D, 8fcm:C, 8fcm:A, 8fcm:F, 8fcn:F, 8fcn:E, 8fcn:D, 8fcn:C, 8fcn:B, 8fcn:A, 8fco:C, 8fco:B, 8fco:A, 8fco:F, 8fco:E, 8fco:D, 8fcp:E, 8fcp:D, 8fcp:C, 8fcp:B, 8fcp:A, 8fcp:F, 8fcq:B, 8fcq:A, 8fcq:F, 8fcq:E, 8fcq:D, 8fcq:C, 8fcr:A, 8fcr:B, 8fcr:C, 8fcr:D, 8fcr:E, 8fcr:F, 8fct:F, 8fct:A, 8fct:B, 8fct:C, 8fct:D, 8fct:E, 5ftj:A, 5ftj:B, 5ftj:C, 5ftj:D, 5ftj:E, 5ftj:F, 5ftk:A, 5ftk:B, 5ftk:C, 5ftk:D, 5ftk:E, 5ftk:F, 5ftl:A, 5ftl:B, 5ftl:C, 5ftl:D, 5ftl:E, 5ftl:F, 5ftm:A, 5ftm:F, 5ftm:B, 5ftm:C, 5ftm:D, 5ftm:E, 5ftn:A, 5ftn:B, 5ftn:C, 5ftn:D, 5ftn:E, 5ftn:F, 5glf:A, 5glf:C, 5glf:E, 5glf:G, 6hd0:B, 6hd0:T, 6hd0:U, 6hd0:V, 6hd0:A, 6hd0:C, 8hl7:B, 8hrz:A, 8hrz:B, 8hrz:C, 8hrz:D, 8hrz:E, 8hrz:F, 8hrz:G, 8hrz:H, 8hrz:I, 8hrz:J, 8hrz:K, 8hrz:L, 3hu1:A, 3hu1:B, 3hu1:C, 3hu1:D, 3hu1:E, 3hu1:F, 3hu2:A, 3hu2:B, 3hu2:C, 3hu2:D, 3hu2:E, 3hu2:F, 3hu3:A, 3hu3:B, 5ifs:B, 5ifs:D, 7jy5:A, 7jy5:F, 7jy5:B, 7jy5:C, 7jy5:D, 7jy5:E, 8kg2:A, 8kg2:B, 8kg2:C, 8kg2:D, 8kg2:E, 8kg2:F, 8kg2:G, 8kg2:H, 8kg2:I, 8kg2:J, 8kg2:K, 8kg2:L, 5kiw:A, 5kiw:B, 5kiy:A, 4kln:A, 4kln:B, 4kln:C, 4kln:D, 4kln:E, 4kln:F, 4ko8:A, 4ko8:B, 4kod:A, 4kod:B, 4kod:C, 4kod:D, 4kod:E, 4kod:F, 4kod:G, 4kod:H, 4kod:I, 4kod:J, 4kod:K, 4kod:L, 7lmy:A, 7lmy:B, 7lmy:C, 7lmy:D, 7lmy:E, 7lmy:F, 7lmz:B, 7lmz:C, 7lmz:D, 7lmz:E, 7lmz:A, 7ln0:B, 7ln0:C, 7ln0:D, 7ln0:E, 7ln0:A, 7ln1:B, 7ln1:C, 7ln1:D, 7ln1:E, 7ln1:A, 7ln2:A, 7ln2:B, 7ln2:C, 7ln2:D, 7ln2:E, 7ln3:A, 7ln3:B, 7ln3:C, 7ln3:D, 7ln3:E, 7ln4:A, 7ln4:B, 7ln4:C, 7ln4:D, 7ln4:E, 7ln5:A, 7ln5:B, 7ln5:C, 7ln5:D, 7ln5:E, 7ln6:A, 7ln6:B, 7ln6:C, 7ln6:D, 7ln6:E, 7mdm:B, 7mdm:C, 7mdm:D, 7mdm:E, 7mdm:A, 7mdm:F, 7mdo:A, 7mdo:B, 7mdo:C, 7mdo:D, 7mdo:E, 7mdo:F, 7mhs:A, 7mhs:B, 7mhs:C, 7mhs:D, 7oat:B, 8ooi:A, 8ooi:F, 8ooi:B, 8ooi:D, 8ooi:C, 8ooi:E, 8pqx:A, 8pqx:B, 8pqx:C, 8pqx:D, 8pqx:E, 8pqx:F, 7pux:A, 3qq7:A, 1r7r:A, 7r7s:A, 7r7s:B, 7r7s:C, 7r7s:D, 7r7s:E, 7r7s:F, 7r7t:A, 7r7t:B, 7r7t:F, 7r7t:E, 7r7t:D, 7r7t:C, 7rl6:A, 7rl6:B, 7rl6:C, 7rl6:D, 7rl6:E, 7rl6:F, 7rl7:A, 7rl7:B, 7rl7:C, 7rl7:D, 7rl7:E, 7rl7:F, 7rl9:A, 7rl9:B, 7rl9:C, 7rl9:D, 7rl9:E, 7rl9:F, 7rla:A, 7rla:F, 7rla:B, 7rla:C, 7rla:D, 7rla:E, 7rlb:A, 7rlb:B, 7rlb:C, 7rlb:D, 7rlb:E, 7rlb:F, 7rlc:A, 7rlc:B, 7rlc:C, 7rlc:D, 7rlc:E, 7rlc:F, 7rld:A, 7rld:B, 7rld:C, 7rld:D, 7rld:E, 7rld:F, 7rlf:A, 7rlf:B, 7rlf:C, 7rlf:D, 7rlf:E, 7rlf:F, 7rlg:A, 7rlg:B, 7rlg:C, 7rlg:D, 7rlg:E, 7rlg:F, 7rlh:A, 7rlh:B, 7rlh:C, 7rlh:D, 7rlh:E, 7rlh:F, 7rli:A, 7rli:B, 7rli:C, 7rli:D, 7rli:E, 7rli:F, 7rli:G, 7rli:H, 7rli:I, 7rli:J, 7rli:K, 7rli:L, 7rlj:A, 7rlj:B, 7rlj:C, 7rlj:D, 7rlj:E, 7rlj:F, 7rlj:L, 7rlj:G, 7rlj:H, 7rlj:I, 7rlj:J, 7rlj:K, 8rsb:A, 8rsb:B, 8rsb:C, 8rsb:D, 8rsb:E, 8rsb:F, 8rsc:A, 8rsc:B, 8rsc:C, 8rsc:D, 8rsc:E, 8rsc:F, 1s3s:A, 1s3s:B, 1s3s:C, 1s3s:D, 1s3s:E, 1s3s:F, 3tiw:A, 3tiw:B, 8uv2:A, 8uv2:B, 8uv2:C, 8uv2:D, 8uv2:E, 8uv2:F, 8uvo:A, 8uvo:B, 8uvo:C, 8uvo:D, 8uvo:E, 8uvo:F, 8uvp:A, 8uvp:B, 8uvp:C, 8uvp:D, 8uvp:E, 8uvp:F, 8uvq:A, 8uvq:B, 8uvq:C, 8uvq:D, 8uvq:E, 8uvq:F, 7vcs:B, 7vcs:C, 7vcs:D, 7vcs:E, 7vcs:F, 7vcs:G, 7vcs:H, 7vcs:I, 7vcs:J, 7vcs:K, 7vcs:L, 7vct:A, 7vct:B, 7vct:C, 7vct:D, 7vct:E, 7vct:F, 7vcu:K, 7vcu:B, 7vcu:C, 7vcu:D, 7vcu:E, 7vcu:F, 7vcu:A, 7vcu:L, 7vcu:G, 7vcu:H, 7vcu:I, 7vcu:J, 7vcv:A, 7vcv:F, 7vcv:E, 7vcv:D, 7vcv:C, 7vcv:B, 7vcx:A, 7vcx:B, 7vcx:C, 7vcx:D, 7vcx:E, 7vcx:F, 7wub:A, 7wub:B, 7wub:C, 7wub:D, 7wub:E, 7wub:F, 7wub:G, 7wub:H, 7wub:I, 7wub:J, 7wub:K, 7wub:L, 7y4w:A, 7y4w:B, 7y4w:E, 7y4w:F, 7y53:A, 7y53:B, 7y53:C, 7y53:D, 7y53:E, 7y53:F, 7y59:A, 7y59:B, 7y59:C, 7y59:D, 7y59:E, 7y59:F
95 6qs4:B 582 26 0.0576 0.0189 0.4231 7.5 6oax:C, 6oax:E, 6oax:D, 6oax:B, 6oax:A, 6oax:F, 6oay:C, 6oay:E, 6oay:D, 6oay:B, 6oay:A, 5og1:B, 6og1:F, 6og1:A, 6og2:A, 6qs4:A, 6qs4:F, 6qs6:A, 6qs6:B, 6qs6:E, 6qs6:F, 6qs7:A, 6qs7:B, 6qs7:F, 6qs8:A, 6qs8:B, 6qs8:F
96 9iuk:A 1335 21 0.0576 0.0082 0.5238 7.6 9iul:A, 9ium:A
97 7upt:F 236 78 0.1152 0.0932 0.2821 7.8
98 3q8x:D 271 48 0.0838 0.0590 0.3333 7.8
99 5og1:A 819 26 0.0576 0.0134 0.4231 8.2 5ofo:C, 5ofo:F, 5ofo:E, 5ofo:D, 5ofo:B, 5ofo:A, 5og1:E, 6rn2:A, 6rn2:B, 6rn2:C, 6rn2:D, 6rn2:F, 6rn2:E, 6rn3:A, 6rn3:B, 6rn3:C, 6rn3:D, 6rn3:E, 6rn4:B, 6rn4:C, 6rn4:D, 6rn4:E
100 5g3y:A 213 23 0.0628 0.0563 0.5217 8.2
101 7epk:A 426 18 0.0576 0.0258 0.6111 8.8
102 3tlx:B 240 139 0.1728 0.1375 0.2374 8.8 3tlx:A
103 7abr:F 536 23 0.0524 0.0187 0.4348 8.8
104 6nz4:A 467 31 0.0576 0.0236 0.3548 9.5 6nz4:B, 6nz5:B, 6nz6:A, 6nz6:B
105 4qbg:B 217 51 0.0733 0.0645 0.2745 9.7 4typ:B, 4typ:A
106 1qzw:A 432 18 0.0576 0.0255 0.6111 9.8 3kl4:A, 5l3s:A, 5l3s:C, 5l3s:E, 5l3s:G, 5l3v:A, 5l3v:B, 1qzw:C, 1qzw:E, 1qzw:G, 3zn8:M
107 5ifw:B 702 64 0.1099 0.0299 0.3281 9.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218