BioLiP

>protein
MQTLLALNWKMNKTPTEARSWAEELTTKYAPAEGVDLAVLAPALDLSALAANLPAGIAFGGQDVSAHESGAYTGEISAAM
LKDAGASCVVVGHSERREYHDESDATVAAKARQAQANGLLPIVCVGENLDVRERGEHVPQTLAQLRGSLEGVGADVVVAY
EPVWAIGTGKTATADDAEELAAAIRGALREQYGARAEGIRVLYGGSVKPENIAEICGKPNVNGALVGGASLKVPDVLGML
DALR

The query sequence (length=244) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4y90:A	244	244	1.0000	1.0000	1.0000	4.77e-178	4y90:B, 4y90:C, 4y90:D
2	3tao:A	256	242	0.5082	0.4844	0.5124	5.35e-66
3	3uwv:A	255	254	0.4221	0.4039	0.4055	6.13e-58	3uwu:A, 3uwu:B, 3uwv:B, 3uww:A, 3uww:B, 3uwz:A, 3uwz:B
4	1btm:A	251	249	0.4221	0.4104	0.4137	2.18e-57	1btm:B, 2btm:A, 2btm:B
5	1aw1:A	255	231	0.4016	0.3843	0.4242	1.15e-54	1aw1:B, 1aw1:D, 1aw1:E, 1aw1:G, 1aw1:H, 1aw1:J, 1aw1:K
6	8w06:B	251	240	0.4221	0.4104	0.4292	3.33e-54	8v09:A, 8v0a:B, 8w06:A, 8w06:C, 8w06:D, 8w06:E, 8w06:F, 8w06:G, 8w06:H
7	6nee:B	252	242	0.4098	0.3968	0.4132	7.71e-52	6nee:A
8	6bve:A	242	238	0.4016	0.4050	0.4118	1.05e-51	6bve:B
9	4y96:A	250	247	0.4221	0.4120	0.4170	1.62e-50	4y96:B
10	6oog:A	252	243	0.3934	0.3810	0.3951	1.27e-48
11	5zfx:B	248	242	0.4016	0.3952	0.4050	5.31e-48
12	4mva:A	255	231	0.3852	0.3686	0.4069	7.28e-47	4mva:B
13	4bi7:A	256	244	0.3934	0.3750	0.3934	2.53e-46	4bi6:A, 3pf3:A
14	1amk:A	250	248	0.3852	0.3760	0.3790	6.57e-46	7abx:A, 7az3:A, 7az4:A, 7az9:A, 7aza:A, 1if2:A, 1n55:A, 1qds:A, 2vxn:A, 2y61:A, 2y62:A, 2y63:A
15	1hti:B	248	238	0.3934	0.3871	0.4034	7.00e-46	4owg:A, 4owg:B, 4poc:B, 4pod:B, 1r2r:B, 7rde:B, 7t0q:A, 6up5:B, 6upf:A, 6upf:B, 7uxv:A, 7uxv:B
16	4ff7:A	247	240	0.3893	0.3846	0.3958	1.59e-45	4ff7:B, 7tim:A, 7tim:B, 2ypi:A, 2ypi:B, 3ypi:A, 3ypi:B
17	5eyw:A	244	239	0.3852	0.3852	0.3933	2.14e-45	5eyw:B
18	1ssg:A	247	240	0.3975	0.3927	0.4042	8.28e-45	1ssg:B, 1su5:A, 1su5:B, 1sw0:A, 1sw0:B, 1sw3:A, 1sw3:B, 1sw7:A, 1sw7:B, 1tpb:1, 1tpb:2, 1tpc:1, 1tpc:2, 1tph:1, 1tph:2, 1tpu:A, 1tpu:B, 1tpv:A, 1tpv:B, 1tpw:A, 1tpw:B
19	5gzp:A	246	232	0.3279	0.3252	0.3448	3.22e-43	5gv4:A, 5gzp:B, 1lyx:A, 1lzo:B, 1lzo:D, 1m7p:A, 1m7p:B, 1o5x:A, 1o5x:B, 3pvf:A, 1woa:A, 1woa:B, 1woa:C, 1woa:D, 1wob:A, 1wob:B, 1wob:C, 1wob:D
20	6ooi:C	255	235	0.3730	0.3569	0.3872	1.31e-42	6ooi:A, 6ooi:B, 6ooi:D, 6ooi:E, 6ooi:F, 6ooi:G, 6ooi:H
21	1ci1:B	249	181	0.3402	0.3333	0.4586	8.39e-42
22	1ag1:T	249	249	0.3934	0.3855	0.3855	2.54e-39	5i3h:B, 5i3i:A, 5i3i:B, 5i3i:C, 5i3i:D, 5i3k:B, 5i3k:C, 5i3k:D, 1iig:B, 2j27:A, 2j27:B, 1kv5:A, 1kv5:B, 4tim:B, 6tim:B, 1trd:B, 1tsi:A, 2v2c:A
23	2y6z:A	256	171	0.3115	0.2969	0.4444	1.23e-33	1ml1:A, 1ml1:C, 1ml1:E, 1ml1:G, 1ml1:I, 1ml1:K, 4pc8:A, 1tti:A, 1ttj:A, 2v2h:A, 2v2h:B, 2v2h:C, 2vek:B, 2vel:A, 2vel:B, 2vem:A, 2vem:B, 2wsr:A, 2x1r:A, 2x1r:B, 2x1s:A, 2x1s:B, 2x1t:B
24	2jgq:A	231	237	0.2787	0.2944	0.2869	5.99e-28	2jgq:B
25	5csr:C	220	133	0.1557	0.1727	0.2857	6.39e-07	5csr:A, 5csr:B, 5csr:D, 5css:A, 5css:B, 5css:C, 5css:D
26	1hg3:A	224	124	0.1311	0.1429	0.2581	6.50e-04	1hg3:B, 1hg3:C, 1hg3:D, 1hg3:E, 1hg3:F, 1hg3:G, 1hg3:H
27	1w0m:A	225	140	0.1639	0.1778	0.2857	0.095	1w0m:B, 1w0m:C, 1w0m:D, 1w0m:E, 1w0m:F, 1w0m:G, 1w0m:H
28	1wza:A	488	110	0.1189	0.0594	0.2636	1.4
29	7zm7:A	711	137	0.1475	0.0506	0.2628	2.7	7zmb:A, 7zmg:A
30	1rcq:A	357	62	0.0779	0.0532	0.3065	3.3
31	6ywe:i	124	53	0.0820	0.1613	0.3774	3.9	6yws:i, 6ywv:i, 6ywx:i, 6ywy:i
32	1i7q:A	517	63	0.0820	0.0387	0.3175	6.5	1i7q:C, 1i7s:A, 1i7s:C
33	4rk9:A	384	54	0.0656	0.0417	0.2963	7.2	4rk9:B
34	4wtv:B	426	45	0.0697	0.0399	0.3778	7.4
35	3j7a:M	138	17	0.0369	0.0652	0.5294	8.1	3jbn:M, 3jbo:M, 3jbp:M, 6okk:M, 8tpu:SM

[Back]