BioLiP

>protein
MNPFHELEPGPEVPEVVYALIEIPKGSRNKYELDKKTGLLKLDRVLYSPFFYPVDYGIIPQTWYDDGDPFDIMVIMREPV
YPLTIIEARPIGIMKMEDSGDKDWKVLAVPVEDPYFNDWKDISDVPKAFLDEIAHFFQRYKELQGKTTKIEGWGNAEEAK
REILRAIEMYKEKF

The query sequence (length=174) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3q46:A	178	174	0.9943	0.9719	0.9943	1.22e-125	3i98:A, 3i98:B, 3i98:C, 3i98:D, 3i98:E, 3i98:F, 3q3l:A, 3q3l:B, 3q3l:C, 3q3l:D, 3q3l:E, 3q3l:F, 3q4w:A, 3q5v:A, 3q5v:B, 3r5u:A, 3r5u:B, 3r5v:A, 3r5v:B, 3r5v:C, 3r5v:D, 3r5v:E, 3r5v:F, 5ucq:A, 5ucq:B, 5ucq:C
2	1qez:A	169	166	0.4828	0.4970	0.5060	4.21e-53	1qez:F, 1qez:B, 1qez:C, 1qez:D, 1qez:E
3	4z71:B	163	152	0.4310	0.4601	0.4934	2.27e-47	5kde:A, 5kdf:A, 1wcf:A, 4z70:A, 4z70:B, 4z70:C, 4z71:A, 4z71:C, 4z72:A, 4z73:A, 4z73:B, 4z73:C, 4z73:D, 4z73:F, 4z73:G, 4z73:E, 4z73:H, 4z73:I, 4z73:J, 4z73:K, 4z73:L, 4z74:A, 4z74:B, 4z74:C, 4z74:D, 4z74:F, 4z74:G, 4z74:E, 4z74:H, 4z74:I, 4z74:J, 4z74:K, 4z74:L
4	6k21:A	173	172	0.3966	0.3988	0.4012	4.56e-42	6k27:A, 6k27:B, 6k27:C, 6k27:D, 6k27:E, 6k27:F, 6k27:G, 6k27:H, 6ki8:A, 6ki8:B, 6ki8:C
5	2au6:A	175	168	0.4080	0.4057	0.4226	4.58e-41	2au7:A, 2au8:A, 2au9:A, 2auu:A, 1i40:A, 1i6t:A, 1ino:A, 1ipw:A, 1ipw:B, 1jfd:A, 1jfd:B, 1mjw:A, 1mjw:B, 1mjx:A, 1mjx:B, 1obw:A, 1obw:B, 1obw:C, 4um4:A, 4um4:B, 4um4:C
6	3tr4:B	171	158	0.3908	0.3977	0.4304	7.82e-38	3tr4:A, 3tr4:C, 3tr4:D, 3tr4:E, 3tr4:F
7	3ej2:A	182	173	0.4023	0.3846	0.4046	1.27e-37	3eiy:A, 3ej0:A
8	2bqy:A	170	158	0.3736	0.3824	0.4114	1.35e-36
9	5tea:B	174	169	0.3736	0.3736	0.3846	1.88e-36	5tea:A, 5tea:C, 5tea:D, 5tea:E, 5tea:F
10	7btn:A	275	162	0.3161	0.2000	0.3395	8.21e-19
11	2ik0:B	286	151	0.2816	0.1713	0.3245	2.58e-14	117e:A, 117e:B, 1e6a:A, 1e6a:B, 1e9g:A, 1e9g:B, 1huj:A, 1huj:B, 1huk:A, 1huk:B, 2ihp:A, 2ihp:B, 2ik0:A, 2ik1:A, 2ik1:B, 2ik2:A, 2ik2:B, 2ik4:A, 2ik4:B, 2ik6:A, 2ik6:B, 2ik7:A, 2ik7:B, 2ik9:A, 1m38:A, 1m38:B, 8prk:A, 8prk:B, 1wgi:A, 1wgi:B, 1wgj:A, 1wgj:B, 1ypp:A, 1ypp:B
12	5cuy:D	396	147	0.2701	0.1187	0.3197	1.40e-12	5c5v:A, 5c5v:B, 5cuy:A, 5cuy:B, 5cuy:C
13	5wrt:A	235	203	0.3333	0.2468	0.2857	1.97e-12	5wrt:B
14	5cuv:A	382	147	0.2816	0.1283	0.3333	2.66e-12	5cuu:A, 5cuu:B, 5cuv:B, 5cux:A, 5cux:B
15	4qlz:A	284	170	0.3046	0.1866	0.3118	5.72e-12	4qlz:B
16	8qpt:B	289	172	0.2701	0.1626	0.2733	1.08e-11	8qpt:A
17	5wru:B	308	147	0.2241	0.1266	0.2653	1.23e-07
18	8axs:A	573	74	0.1379	0.0419	0.3243	0.60	8axi:A, 8axi:B, 8axs:B, 8axt:A, 8axt:B, 8hls:A, 8hls:B
19	6hqw:A	395	50	0.0862	0.0380	0.3000	2.5
20	3hkz:A	836	45	0.0862	0.0179	0.3333	2.6	3hkz:I, 2y0s:A, 2y0s:W
21	6meq:A	416	26	0.0747	0.0312	0.5000	2.7	5k8r:A, 6mer:A
22	4ayb:A	872	45	0.0862	0.0172	0.3333	2.9	2pmz:A, 2pmz:Q, 4v8s:AW, 4v8s:BA, 2waq:A, 2wb1:A, 2wb1:W
23	1wf3:A	296	63	0.1494	0.0878	0.4127	4.5
24	8ieo:P	1031	48	0.0805	0.0136	0.2917	4.9	8iem:P
25	6d6q:M	709	41	0.0690	0.0169	0.2927	6.6	6d6r:M, 7z52:B
26	5hwn:B	310	38	0.0747	0.0419	0.3421	7.2	5hwm:A, 5hwm:B, 5hwm:C, 5hwm:D, 5hwn:A, 5hwn:C, 5hwn:D, 4ur8:A, 4ur8:B, 4ur8:C, 4ur8:D
27	4u79:A	337	33	0.0747	0.0386	0.3939	8.9	2b1p:A, 8bzp:B, 3cgo:A, 3da6:A, 4e73:A, 6ekd:A, 6emh:C, 6emh:D, 8enj:A, 6eq9:B, 2exc:X, 3fi2:A, 3fi3:A, 3fv8:A, 4g1w:A, 4hys:A, 4hyu:A, 4izy:A, 7ksk:A, 3kvx:A, 2o0u:A, 2o2u:A, 2ok1:A, 3oxi:A, 3oy1:A, 2p33:A, 2r9s:A, 2r9s:B, 3rtp:A, 3ttj:A, 1ukh:A, 4z9l:A, 2zdu:A
28	3a43:A	139	27	0.0575	0.0719	0.3704	9.5	3a44:A, 3a44:B, 3a44:D, 5aun:A, 5auo:A, 5aup:A, 5aup:H, 5yxy:D, 5yxy:E, 5yxy:F, 5yy0:B

[Back]