Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MMSKPVLYYDDISPPVRGVLLTVAALGIKDQVELKLVRLFEREHLLEDFVKLNPLHAVPVLKHDDLVLTDSHAIIMYLCD
IFGDFSLKDPKQRARVHNRLCFNNAVLFQRESIVMRGLINRSIVTLEDHHLKPVQEAYDCLEVYLTNSKFVACDQLTVAD
FPIVACMSTVGMVCPLSTSRWPKTAAWFETMKQLPYYQQANQVGVDKLKERLHAVM

The query sequence (length=216) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7ebt:B 222 219 1.0000 0.9730 0.9863 7.17e-161 7ebt:A, 7ebt:C, 7ebt:D, 7ebu:A, 7ebu:B, 7ebu:C, 7ebu:D, 7ebv:A, 7ebv:B, 7ebv:C, 7ebv:D, 7ebw:A, 7ebw:B, 7ebw:C, 7ebw:D
2 6t2t:A 229 216 0.4259 0.4017 0.4259 5.81e-51 7dax:A, 7dax:B, 7day:A, 7day:B, 7daz:A, 7daz:B, 7db0:A, 7db0:B, 7db1:A, 7db1:B, 7db2:A, 7db2:B, 7db3:A, 7db3:B, 7db4:A, 7db4:B, 6ken:AA, 6ken:BA, 6keo:AA, 6keo:BA, 6kep:AA, 6kep:BA, 6ker:AA, 6ker:BA
3 3vwx:C 220 209 0.3935 0.3864 0.4067 5.33e-46 3vwx:A, 3vwx:B, 3vwx:D
4 3zmk:B 222 206 0.3796 0.3694 0.3981 1.31e-43 4gsn:A, 4gsn:C, 4gsn:D, 2imi:A, 2imi:B, 2imk:A, 2imk:B, 3zmk:D, 3zml:A, 3zml:B
5 4gsn:B 220 205 0.3750 0.3682 0.3951 1.67e-42
6 4png:B 223 208 0.3611 0.3498 0.3750 8.29e-41 4png:A
7 4hi7:A 220 211 0.3704 0.3636 0.3791 1.63e-38 4hi7:B
8 4pnf:B 221 209 0.3426 0.3348 0.3541 3.49e-38 4pnf:A, 4pnf:C, 4pnf:D, 4pnf:E, 4pnf:F, 4pnf:G, 4pnf:H, 4yh2:A, 4yh2:B, 4yh2:C, 4yh2:D
9 5ft3:B 221 212 0.3472 0.3394 0.3538 6.58e-38 5ft3:A
10 9f7k:A 222 201 0.3287 0.3198 0.3532 7.14e-34 9f7k:B
11 3wyw:B 214 213 0.3611 0.3645 0.3662 1.51e-32 3wyw:A
12 1jlv:A 207 208 0.3194 0.3333 0.3317 1.65e-31 1jlv:B, 1jlv:C, 1jlv:D, 1jlv:E, 1jlv:F
13 1pn9:A 209 210 0.3194 0.3301 0.3286 2.04e-28 1pn9:B
14 5zwp:A 207 207 0.3102 0.3237 0.3237 2.59e-28 5zwp:B
15 3f63:A 218 194 0.3194 0.3165 0.3557 2.93e-25 3f63:B, 3f6d:A, 3f6d:B, 3g7i:B, 3g7j:A, 3g7j:B
16 7rhp:A 215 202 0.3009 0.3023 0.3218 3.39e-25
17 3mak:A 208 210 0.2870 0.2981 0.2952 5.06e-25 3ein:A
18 4i97:A 207 207 0.2778 0.2899 0.2899 1.19e-22 4i97:B
19 4e8h:B 216 212 0.3009 0.3009 0.3066 8.34e-22 4e8h:A, 4e8h:C, 4e8h:D
20 3gh6:A 209 207 0.2685 0.2775 0.2802 9.32e-21
21 1r5a:A 214 209 0.2917 0.2944 0.3014 1.11e-20
22 1v2a:B 209 209 0.3009 0.3110 0.3110 3.27e-20 1v2a:A, 1v2a:C, 1v2a:D
23 7rka:A 211 199 0.2778 0.2844 0.3015 5.18e-17
24 2c3q:A 239 196 0.2778 0.2510 0.3061 3.15e-12 2c3q:B, 2c3q:C, 2c3q:D
25 4mpg:B 252 192 0.2593 0.2222 0.2917 1.63e-11 1ljr:A, 1ljr:B, 3ljr:A, 3ljr:B, 4mpg:A
26 3qaw:A 219 177 0.2361 0.2329 0.2881 1.65e-11
27 4kdx:A 207 184 0.2361 0.2464 0.2772 2.51e-10 4kdx:B
28 8ai8:A 183 162 0.1898 0.2240 0.2531 2.24e-09 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
29 4ivf:F 227 221 0.2315 0.2203 0.2262 3.14e-09 4ivf:A, 4ivf:B, 4ivf:C, 4ivf:D, 4ivf:E, 4ivf:G, 4ivf:H
30 5f06:A 213 182 0.2222 0.2254 0.2637 1.84e-08 5f06:B
31 4iel:B 206 145 0.2037 0.2136 0.3034 1.98e-08 4iel:A
32 3c8e:A 284 161 0.1944 0.1479 0.2609 2.38e-07 3c8e:B
33 4kh7:B 212 164 0.1852 0.1887 0.2439 2.62e-07 4kh7:A
34 4pua:A 261 198 0.2176 0.1801 0.2374 1.27e-06
35 4f0c:A 228 181 0.1898 0.1798 0.2265 2.11e-06 5o00:A
36 2x64:B 207 167 0.2037 0.2126 0.2635 3.08e-06 2x64:A, 2x64:C, 2x64:D, 2x64:E, 2x64:F
37 3uar:A 203 172 0.2222 0.2365 0.2791 7.11e-06
38 4ri6:A 214 166 0.1898 0.1916 0.2470 7.71e-06 4ri6:B, 4ri7:A, 4ri7:B
39 4nhw:D 217 166 0.1806 0.1797 0.2349 8.98e-06 4nhw:A, 4nhw:B, 4nhw:C
40 8jzk:A 214 157 0.1806 0.1822 0.2484 1.06e-05
41 8ix7:B 221 174 0.2130 0.2081 0.2644 1.67e-05 8ix7:A
42 6tah:B 213 141 0.1481 0.1502 0.2270 3.62e-05 4ecj:A, 4ecj:B, 6tah:AAA, 6tah:CAA, 6tah:DAA
43 8agq:A 213 199 0.2454 0.2488 0.2663 4.09e-05 5f07:A
44 5uun:A 286 158 0.1620 0.1224 0.2215 4.14e-05 5uun:B, 5uuo:B, 5uuo:A
45 1fw1:A 208 172 0.2361 0.2452 0.2965 5.72e-05
46 1bye:A 213 171 0.1852 0.1878 0.2339 9.91e-05 1axd:A, 1axd:B, 1bye:B, 1bye:C, 1bye:D
47 4mzw:A 270 191 0.1852 0.1481 0.2094 2.26e-04 4mzw:B
48 7dwe:A 212 183 0.2037 0.2075 0.2404 2.64e-04 7dwg:A
49 4hz2:B 206 159 0.1898 0.1990 0.2579 2.72e-04 4hz2:A
50 3lsz:A 223 160 0.1620 0.1570 0.2188 0.001 3lsz:B, 3lsz:C, 3lsz:D
51 4xt0:A 243 53 0.1065 0.0947 0.4340 0.002
52 4iw9:B 215 61 0.0926 0.0930 0.3279 0.002 4iw9:A, 4iw9:C
53 5elg:A 212 86 0.1343 0.1368 0.3372 0.002
54 2cz2:A 212 125 0.1620 0.1651 0.2800 0.002
55 2aaw:C 211 215 0.2407 0.2464 0.2419 0.003 2aaw:A, 3fr3:A, 3fr3:B, 3fr9:A, 3fr9:B, 3frc:A, 3frc:B, 1q4j:A, 1q4j:B
56 4qq7:A 204 141 0.1852 0.1961 0.2837 0.005 4qq7:B
57 3ubl:A 212 77 0.1157 0.1179 0.3247 0.005 3ubl:B
58 1pmt:A 201 119 0.1620 0.1741 0.2941 0.006 2pmt:A, 2pmt:B, 2pmt:C, 2pmt:D
59 4zba:A 222 183 0.1944 0.1892 0.2295 0.007 4zb9:A, 4zb9:C, 4zb9:D, 4zba:B, 4zba:C, 4zba:D, 4zbb:A, 4zbb:C, 4zbb:B, 4zbb:D
60 4zb6:D 220 80 0.1019 0.1000 0.2750 0.007 4zb6:A, 4zb6:B, 4zb6:C
61 5f8b:A 215 163 0.1806 0.1814 0.2393 0.008 5fhi:A
62 5f05:C 211 184 0.2037 0.2085 0.2391 0.009 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
63 5lol:A 207 118 0.1435 0.1498 0.2627 0.011
64 4zb8:A 220 80 0.1065 0.1045 0.2875 0.011 4zbd:A, 4zbd:B
65 5a4u:A 211 47 0.0880 0.0900 0.4043 0.017 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
66 4gf0:A 208 78 0.0972 0.1010 0.2692 0.019 4gf0:B
67 2v6k:A 214 68 0.1157 0.1168 0.3676 0.024 2jl4:A, 2jl4:B, 2v6k:B
68 6ezy:B 212 180 0.1806 0.1840 0.2167 0.025 6f01:B, 6f05:A, 6f05:B, 6f05:C, 6f05:D, 6f05:E, 6f05:F, 6f05:G, 6f05:H, 6f05:I, 6f05:J
69 6nv6:B 207 161 0.1667 0.1739 0.2236 0.028
70 4jbb:A 208 50 0.0880 0.0913 0.3800 0.029
71 1jzr:A 234 176 0.1713 0.1581 0.2102 0.044 1k0a:A, 1k0a:B, 1k0b:A, 1k0c:A, 1k0c:B, 1k0d:A, 1k0d:B
72 4mf6:A 240 151 0.1806 0.1625 0.2583 0.046 4mf5:A
73 6zb6:C 227 173 0.1991 0.1894 0.2486 0.047 7obo:AAA, 7odm:AAA, 6riv:B, 6riv:A, 6tk8:AAA, 6zb6:A, 6zb6:E, 6zb6:B, 6zb6:F, 6zb6:D
74 4f0b:A 220 166 0.1574 0.1545 0.2048 0.049 4f0b:B
75 3erg:A 208 214 0.2222 0.2308 0.2243 0.061 3erg:B, 3ibh:A
76 1b48:A 221 101 0.1296 0.1267 0.2772 0.064 1b48:B
77 1vf1:A 226 93 0.1204 0.1150 0.2796 0.077 1vf2:A, 1vf2:B, 1vf3:A, 1vf3:B
78 4hoj:A 197 51 0.0972 0.1066 0.4118 0.095
79 5hfk:A 207 164 0.1574 0.1643 0.2073 0.11 3gx0:A, 5hfk:B
80 6m1t:A 201 61 0.1019 0.1095 0.3607 0.12 6m1t:B
81 4q5q:A 218 198 0.1806 0.1789 0.1970 0.17 4q5q:B
82 1f2e:A 201 60 0.0972 0.1045 0.3500 0.17 1f2e:B, 1f2e:C, 1f2e:D
83 6snl:D 320 119 0.1250 0.0844 0.2269 0.23 6snl:A, 6snl:B, 6snl:C, 6snl:E, 6snl:F
84 4ai6:A 2650 141 0.1667 0.0136 0.2553 0.31 4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
85 4pqi:A 238 198 0.2083 0.1891 0.2273 0.32
86 2gdr:A 202 35 0.0648 0.0693 0.4000 0.34 2dsa:A, 2dsa:B, 2dsa:C, 2dsa:D, 2gdr:B, 2gdr:C, 2gdr:D, 2gdr:E, 2gdr:F
87 5b7c:A 206 149 0.1806 0.1893 0.2617 0.36
88 4nhz:H 246 71 0.0972 0.0854 0.2958 0.36 4nhz:A, 4nhz:B, 4nhz:C, 4nhz:D, 4nhz:E, 4nhz:F, 4nhz:G, 4nhz:I, 4nhz:J, 4nhz:K, 4nhz:L, 4nhz:M, 4nhz:N, 4nhz:O, 4nhz:P
89 6n69:B 199 125 0.1435 0.1558 0.2480 0.41 6n69:A, 1pd2:1, 1pd2:2, 5y9z:A, 5y9z:B
90 6wmt:S 202 126 0.1343 0.1436 0.2302 0.60 6weg:D
91 7aia:AAA 259 81 0.1250 0.1042 0.3333 0.94
92 5e02:A 964 117 0.1528 0.0342 0.2821 0.95
93 4ec0:B 200 125 0.1389 0.1500 0.2400 0.99 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
94 4g9h:A 202 44 0.0833 0.0891 0.4091 1.2 4g9h:B, 4gci:A, 4gci:B
95 6llx:B 215 186 0.1898 0.1907 0.2204 1.3 10gs:A, 10gs:B, 20gs:A, 20gs:B, 11gs:A, 11gs:B, 12gs:A, 12gs:B, 13gs:A, 13gs:B, 17gs:A, 17gs:B, 18gs:A, 18gs:B, 19gs:A, 19gs:B, 2a2r:A, 2a2r:B, 2a2s:A, 2a2s:B, 6ap9:A, 6ap9:B, 1aqv:A, 1aqv:B, 1aqw:A, 1aqw:B, 1aqw:C, 1aqw:D, 1aqx:A, 1aqx:B, 1aqx:C, 1aqx:D, 7bia:A, 7bia:B, 3csh:A, 3csh:B, 3csi:A, 3csi:B, 3csi:C, 3csi:D, 3csj:B, 5dal:A, 5dal:B, 5dcg:B, 3dd3:A, 3dd3:B, 5ddl:A, 5ddl:B, 3dgq:A, 3dgq:B, 5djl:A, 5djl:B, 1gss:A, 1gss:B, 2gss:A, 2gss:B, 3gss:A, 3gss:B, 4gss:A, 4gss:B, 5gss:A, 5gss:B, 6gss:A, 6gss:B, 7gss:A, 7gss:B, 8gss:A, 8gss:B, 8gss:C, 9gss:A, 9gss:B, 3gus:A, 3gus:B, 3hjm:A, 3hjm:B, 3hjm:C, 3hjm:D, 3hjo:A, 3hjo:B, 3hkr:A, 3hkr:B, 3ie3:A, 3ie3:B, 5j41:A, 5j41:B, 2j9h:A, 2j9h:B, 5jcw:A, 5jcw:B, 1kbn:A, 1kbn:B, 3km6:A, 3km6:B, 3kmn:A, 3kmn:B, 3kmo:A, 3kmo:B, 5l6x:A, 5l6x:B, 1lbk:A, 1lbk:B, 6llx:A, 1md3:A, 1md3:B, 1md4:A, 1md4:B, 3n9j:A, 3n9j:B, 1pgt:A, 1pgt:B, 2pgt:A, 2pgt:B, 3pgt:A, 3pgt:B, 4pgt:A, 4pgt:B, 1px6:A, 1px6:B, 1px7:A, 1px7:B, 5x79:A, 5x79:B, 7xba:A, 7xba:B, 6y1e:A, 6y1e:B, 6y1e:C, 6y1e:D, 1zgn:A, 1zgn:B
96 4ofm:B 206 166 0.1852 0.1942 0.2410 1.4 4ofm:A, 4ofm:C, 4ofm:D, 4ofn:A, 4ofn:B
97 1gwc:C 222 61 0.0880 0.0856 0.3115 1.6 1gwc:A, 1gwc:B
98 4nax:A 237 95 0.1111 0.1013 0.2526 1.7 4nax:B
99 2ycd:A 213 44 0.0602 0.0610 0.2955 1.9
100 6to3:AAA 190 164 0.1852 0.2105 0.2439 2.0
101 4isd:A 187 25 0.0509 0.0588 0.4400 2.2 4isd:B, 4isd:C, 4isd:D, 4isd:E
102 2dym:G 262 62 0.0787 0.0649 0.2742 2.3 2dym:A, 2dym:E, 2dym:C, 3w1s:A
103 1jzr:C 255 156 0.1574 0.1333 0.2179 2.7 1k0b:C, 1k0c:C, 1k0c:D, 1k0d:C
104 7y55:A 224 83 0.1111 0.1071 0.2892 3.2 7y55:B, 7y55:C, 7y55:D
105 3bby:A 191 26 0.0602 0.0681 0.5000 4.2
106 6ryx:A 626 74 0.0787 0.0272 0.2297 6.1 6ryv:A, 6ryw:A
107 4pxo:A 216 32 0.0741 0.0741 0.5000 6.1 4pxo:B
108 1bor:A 56 18 0.0324 0.1250 0.3889 9.8 2mwx:A, 5yuf:A, 5yuf:B, 5yuf:C, 5yuf:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218