BioLiP

>protein
MLVKGNEILLKAHKEGYGVGAFNFVNFEMLNAIFEAGNEENSPLFIQASEGAIKYMGIDMAVGMVKIMCERYPHIPVALH
LDHGTTFESCEKAVKAGFTSVMIDASHHAFEENLELTSKVVKMAHNAGVSVEAELGRLVLVNPKEAEQFVKESQVDYLAP
AIGTSQGAFKFKGEPKLDFERLQEVKRLTNIPLVLHGASAIPDNVRKSYLDAGGDLKGSKGVPFEFLQESVKGGINKVNT
DTDLRIAFIAEVRKVANEDKSQFDLRKFFSPAQLALKNVVKERMKLLGSANKI

The query sequence (length=293) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3n9s:A	307	307	0.9966	0.9511	0.9511	0.0	3c4u:A, 3c4u:B, 3c52:A, 3c52:B, 3c56:A, 3c56:B, 3n9r:A, 3n9r:B, 3n9r:K, 3n9r:P, 3n9r:U, 3n9r:Z, 3n9r:e, 3n9r:j, 3n9s:B, 5uck:A, 5uck:B, 5ucn:A, 5ucn:B, 5ucp:A, 5ucp:B, 5ucs:A, 5ucs:B, 5ucz:A, 5ucz:B, 5ud0:B, 5ud2:A, 5ud2:B, 5ud3:A, 5ud3:B, 5ud4:A, 5ud4:B, 5vjf:A, 5vjf:B
2	5ud0:A	282	293	0.9590	0.9965	0.9590	0.0	5ud1:A, 5ud1:B
3	1rv8:B	305	306	0.4983	0.4787	0.4771	1.01e-95	1rv8:A, 1rv8:C, 1rv8:D, 1rvg:A, 1rvg:B, 1rvg:C, 1rvg:D
4	3gay:A	319	295	0.4198	0.3856	0.4169	1.00e-76	3gak:B, 3gay:B, 3gb6:A, 3gb6:B, 2isv:B, 2isw:A, 3ohi:A, 3ohi:B
5	4to8:A	279	303	0.4369	0.4588	0.4224	1.33e-72	4to8:B
6	2isv:A	298	285	0.3993	0.3926	0.4105	1.66e-72	3gak:A
7	3q94:A	285	305	0.4198	0.4316	0.4033	4.02e-70	3q94:B
8	1gvf:B	275	298	0.3652	0.3891	0.3591	2.26e-59	1gvf:A
9	8q5a:A	276	299	0.3481	0.3696	0.3411	3.94e-54	8q58:A
10	8q59:A	280	299	0.3515	0.3679	0.3445	4.18e-54	8q57:A, 8q57:B, 8q59:B
11	6ofu:B	264	276	0.3140	0.3485	0.3333	1.86e-36	6ofu:A, 6ofu:C, 6ofu:D
12	3pm6:A	287	306	0.2935	0.2997	0.2810	8.16e-28
13	3pm6:B	264	294	0.2833	0.3144	0.2823	1.86e-25
14	3qm3:A	350	287	0.2696	0.2257	0.2753	5.98e-13	3qm3:B, 3qm3:C, 3qm3:D, 3qm3:E, 3qm3:F, 3qm3:G, 3qm3:H
15	5gk5:C	335	272	0.2218	0.1940	0.2390	5.02e-11	5gk3:A, 5gk3:B, 5gk4:A, 5gk4:B, 5gk5:A, 5gk5:B, 5gk5:D, 5gk5:E, 5gk5:F, 5gk5:G, 5gk5:H, 5gk6:A, 5gk6:B, 5gk7:A, 5gk7:B, 5gk8:A, 5gk8:B, 1gyn:A
16	1dos:A	358	293	0.2253	0.1844	0.2253	5.37e-08	1b57:A, 1b57:B, 1dos:B, 5vjd:A, 5vjd:B, 5vje:A, 5vje:B, 1zen:A
17	7v6g:B	338	311	0.2457	0.2130	0.2315	1.70e-06	6lnk:A, 6lnk:B, 7v6f:A, 7v6f:B, 7v6g:A, 7yva:A, 7yva:B
18	7rgn:A	340	336	0.2491	0.2147	0.2173	2.58e-06
19	4del:A	345	342	0.2799	0.2377	0.2398	1.92e-05	4a22:A, 4a22:B, 4def:A, 3ekl:A, 3ekz:A, 3elf:A
20	4lv4:A	320	336	0.2662	0.2437	0.2321	2.96e-04
21	1ldc:B	382	82	0.0683	0.0524	0.2439	0.11
22	1kbi:A	504	169	0.1399	0.0813	0.2426	0.36	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
23	5hpz:A	175	43	0.0512	0.0857	0.3488	0.79	5hpz:B, 6s2z:A
24	2zy2:A	521	48	0.0512	0.0288	0.3125	1.7
25	4utu:A	229	79	0.0648	0.0830	0.2405	1.7	4utu:B, 4utw:A, 4utw:B, 4utw:C, 4utw:D
26	8jh1:B	462	37	0.0512	0.0325	0.4054	2.9	8jbb:A, 8jbb:B, 8jh1:A
27	6v11:C	503	64	0.0648	0.0378	0.2969	3.4	6v11:A, 6v11:B, 6v11:F
28	3puj:B	534	67	0.0683	0.0375	0.2985	3.4	3puj:A
29	6on2:B	524	64	0.0648	0.0363	0.2969	3.6	6on2:C, 6on2:A, 6on2:D, 6on2:E, 6on2:F
30	4w8j:A	1017	45	0.0512	0.0147	0.3333	3.8	4arx:A, 4arx:D, 4arx:B, 4arx:C, 4ary:A, 4ary:B, 4ary:C, 4ary:D
31	7xbl:B	136	48	0.0580	0.1250	0.3542	3.9	2gal:A, 2gal:B, 3gal:A, 3gal:B, 4gal:B, 5gal:B, 5h9q:B, 5h9s:B, 7n57:A, 7n57:B, 7n8d:A, 7n8d:B, 7rdg:C, 7rdg:B, 7rdg:A, 7rdg:D, 7tkx:A, 7tkx:B, 7tkz:B, 7tkz:A, 7tro:B, 4uw3:A, 4uw4:B, 4uw5:A, 4uw5:D, 4uw5:F, 4uw6:B, 6vto:A, 6vto:B, 6vtq:A, 6vtq:B, 6vts:A, 6vts:B, 7xac:A, 7xac:B, 4xbq:A, 4xbq:B, 7xbl:A, 4y26:A, 4y26:B, 3zxe:A, 3zxe:B
32	7xsj:A	561	67	0.0683	0.0357	0.2985	3.9
33	7w9h:B	122	96	0.0853	0.2049	0.2604	4.5	7w9h:A
34	3krb:A	307	79	0.0717	0.0684	0.2658	7.2	3krb:B

[Back]