Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MLTAHVVYATMTGNNEEVANIVCDSLTNLNVKVTESEISQTDVADFMKADILVVCAYTYDEGAMPEEGLDFYDDLQSTDL
TGKVYGVAGSGDKFYGEYFNTTVDHFDDAFKKAGATSGAEKVKIDLEPYEEDIERLNKFAEGLVKTAS

The query sequence (length=148) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5veg:B 149 148 1.0000 0.9933 1.0000 9.02e-107 5veg:A, 5veg:C
2 5lji:A 145 140 0.4932 0.5034 0.5214 5.39e-45 5lji:C
3 6gaq:A 146 136 0.3378 0.3425 0.3676 1.09e-22 6gaq:B
4 6fsg:A 147 149 0.3581 0.3605 0.3557 6.88e-22 6fsi:A, 6ft1:A
5 6j79:A 816 117 0.2635 0.0478 0.3333 8.32e-11 1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
6 4heq:A 145 128 0.2703 0.2759 0.3125 1.21e-09 4heq:B
7 7k15:A 455 128 0.2095 0.0681 0.2422 4.20e-07
8 5v57:A 645 128 0.2095 0.0481 0.2422 4.48e-07 1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A
9 3esx:B 169 113 0.2027 0.1775 0.2655 2.04e-06 3esx:A, 3esy:A, 3esy:B, 3esy:C, 3esy:D, 3esz:A, 3esz:B, 1flv:A, 5ljp:A, 1obo:A, 1obo:B, 1obv:A, 1rcf:A, 2v5u:A, 2v5u:B, 2v5v:A, 2v5v:B
10 2mok:A 176 117 0.2162 0.1818 0.2735 1.52e-05 1ag9:A, 1ag9:B, 1ahn:A
11 7epe:A 389 128 0.2095 0.0797 0.2422 4.17e-05 7epf:A
12 7ddz:A 437 128 0.2095 0.0709 0.2422 5.38e-05
13 5tgz:A 439 128 0.2095 0.0706 0.2422 5.60e-05 7v3z:A, 5xr8:A, 5xra:A
14 5zkp:A 436 128 0.2095 0.0711 0.2422 1.17e-04
15 6li0:A 441 128 0.2095 0.0703 0.2422 2.14e-04 6li1:A
16 6efv:A 530 127 0.2297 0.0642 0.2677 3.96e-04 1ddg:A, 1ddg:B, 1ddi:A, 1ykg:A
17 2wc1:A 182 101 0.1689 0.1374 0.2475 4.68e-04
18 2mt9:A 173 102 0.1757 0.1503 0.2549 0.001
19 1czh:A 169 88 0.1554 0.1361 0.2614 0.002 1czk:A, 1czl:A, 1czn:A, 1czo:A, 1czr:A, 1czu:A, 1d03:A, 1d04:A, 6kif:P, 6kif:X, 6kif:p, 1ofv:A
20 2fax:A 138 106 0.1757 0.1884 0.2453 0.003 2fdx:A, 1fla:A, 1fld:A, 1fln:A, 2flv:A, 2fox:A, 1fvx:A, 2fvx:A, 3nll:A, 4nll:A, 5nll:A, 4nul:A, 5nul:A, 6nul:A, 5ull:A
21 3kap:A 147 143 0.2230 0.2245 0.2308 0.003 3kaq:A
22 6ohk:A 170 114 0.2095 0.1824 0.2719 0.004 6ohl:A
23 2bmv:A 163 101 0.1824 0.1656 0.2673 0.007 1fue:A, 2w5u:A, 2w5u:B
24 2fcr:A 173 119 0.2297 0.1965 0.2857 0.022
25 8snz:A 167 92 0.1554 0.1377 0.2500 0.024 8snz:B, 8v2y:A
26 8v2y:B 151 104 0.1689 0.1656 0.2404 0.043
27 4bmo:B 118 99 0.1757 0.2203 0.2626 0.070 4bmp:B, 2x2o:A, 2x2p:A, 2xod:A, 2xoe:A, 7z3d:B, 7z3e:B
28 1rlj:A 135 136 0.2095 0.2296 0.2279 0.11
29 2fz5:A 137 111 0.2162 0.2336 0.2883 0.13
30 1tll:A 630 71 0.1216 0.0286 0.2535 0.55 1f20:A, 1tll:B
31 4oxx:A 153 126 0.2568 0.2484 0.3016 0.92
32 8dme:A 1034 77 0.1149 0.0164 0.2208 2.9 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B
33 8itg:A 439 48 0.0811 0.0273 0.2500 5.4 8gq9:A, 8gqa:A, 8gqb:A, 8ith:A
34 7z7h:F 181 34 0.1014 0.0829 0.4412 5.6
35 7jr9:D 339 43 0.0878 0.0383 0.3023 6.2
36 8x38:A 430 48 0.0946 0.0326 0.2917 6.7
37 4j96:B 305 77 0.1081 0.0525 0.2078 6.8 6agx:A, 6agx:B, 6agx:C, 6agx:D, 3b2t:A, 3b2t:B, 3cly:A, 8e1x:A, 8e1x:B, 5eg3:A, 8h75:A, 8h75:B, 4j95:A, 4j95:B, 4j95:C, 4j97:A, 4j97:B, 4j97:C, 4j97:D, 4j98:B, 4j99:A, 4j99:B, 4j99:C, 4j99:D, 7kia:A, 7kia:B, 7kie:A, 7kie:B, 6lvk:A, 6lvk:B, 6lvl:A, 6lvl:B, 1oec:A, 7ozy:AAA, 7ozy:BBB, 2pvy:A, 2pvy:B, 2pvy:C, 2pvy:D, 2pwl:A, 2pwl:B, 2py3:A, 2py3:B, 2pz5:A, 2pz5:B, 2pzp:A, 2pzp:B, 2pzr:A, 2pzr:B, 2q0b:A, 2q0b:B, 3ri1:A, 3ri1:B, 8swe:A, 8swe:B, 5ugl:A, 5ugx:B, 5ugx:A, 5uhn:A, 5ui0:B, 6v6q:A, 6v6q:B
38 5ffj:A 1044 71 0.1486 0.0211 0.3099 7.0
39 5az1:A 327 39 0.1014 0.0459 0.3846 7.0 5az0:A
40 1n6d:A 1023 82 0.1892 0.0274 0.3415 8.4 1n6d:B, 1n6d:C, 1n6d:D, 1n6d:E, 1n6d:F, 1n6e:A, 1n6e:C, 1n6e:E, 1n6e:G, 1n6e:I, 1n6e:K, 1n6f:A, 1n6f:B, 1n6f:C, 1n6f:D, 1n6f:E, 1n6f:F
41 5wid:A 144 140 0.2027 0.2083 0.2143 9.4 5wid:B, 5wid:C
42 3dou:A 175 66 0.1216 0.1029 0.2727 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218