BioLiP

>protein
MKPVTLYDVAEYAGVSVATVSRVVNQASHVSAKTREKVEAAMAELNYIPNRCAQQLAGKQSL

The query sequence (length=62) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1lbg:A	357	62	0.9516	0.1653	0.9516	1.22e-34	2bjc:A, 2bjc:B, 1cjg:A, 1cjg:B, 1efa:A, 1efa:B, 1efa:C, 1jwl:B, 1jwl:A, 1jwl:C, 2kei:A, 2kei:B, 2kej:A, 2kej:B, 2kek:A, 2kek:B, 1l1m:A, 1l1m:B, 1lbg:D, 1lbh:A, 1lbh:B, 1lbh:C, 1lbh:D, 1lcc:A, 1lcd:A, 1osl:A, 1osl:B, 2p9h:A, 2p9h:B, 2paf:A, 2paf:B, 2pe5:A, 2pe5:B, 2pe5:C, 4rzt:A, 4rzt:B, 4rzt:C, 4rzt:D, 1tlf:A, 1tlf:B, 1tlf:C, 1tlf:D
2	3oqo:A	333	58	0.4839	0.0901	0.5172	3.14e-11	3oqm:A, 3oqm:C, 3oqn:A, 3oqn:C, 3oqo:C
3	1rzr:G	332	58	0.4839	0.0904	0.5172	8.57e-11	2jcg:A, 2nzu:G, 2nzv:G, 1rzr:C, 1rzr:A, 1rzr:D, 1sxg:B, 1zvv:A, 1zvv:B, 1zvv:G
4	5ysz:A	327	53	0.4355	0.0826	0.5094	1.65e-09
5	1jft:A	340	52	0.3871	0.0706	0.4615	3.34e-07	1bdh:A, 1bdi:A, 1jfs:A, 1jh9:A, 1pnr:A, 2pua:A, 2pub:A, 2puc:A, 2pud:A, 2pue:A, 2puf:A, 2pug:A, 1qp0:A, 1qp4:A, 1qp7:A, 1qpz:A, 1qqa:A, 1qqb:A, 1vpw:A, 1wet:A, 1zay:A
6	7ce1:T	292	52	0.2903	0.0616	0.3462	3.88e-05
7	7ce1:S	259	52	0.2903	0.0695	0.3462	4.35e-05
8	7ce1:K	333	52	0.2903	0.0541	0.3462	4.58e-05	7cdx:A, 7cdx:B, 7ce1:A, 7ce1:B, 7ce1:C, 7ce1:D, 7ce1:G, 7ce1:H, 7ce1:L, 7ce1:O, 7ce1:P
9	5ui5:V	323	25	0.1774	0.0341	0.4400	0.45	2o8k:A, 2o9l:A, 5ui5:I
10	7qv9:M	417	26	0.1774	0.0264	0.4231	1.1	8f1i:M, 8f1j:M, 8f1k:M, 7qwp:M, 7qxi:M, 8re4:M, 8rea:M
11	5nss:M	388	26	0.1774	0.0284	0.4231	1.1	6gfw:M, 6gh5:M, 5nsr:M
12	8reb:M	350	26	0.1774	0.0314	0.4231	1.7	8rec:M, 8red:M, 8ree:M
13	6gh6:M	315	26	0.1774	0.0349	0.4231	2.6
14	4axs:A	291	39	0.2097	0.0447	0.3333	2.6
15	4i2o:A	198	24	0.1452	0.0455	0.3750	3.1	4i2o:B
16	2w57:A	131	36	0.2258	0.1069	0.3889	4.0	2w57:B
17	1svu:A	307	31	0.2097	0.0423	0.4194	6.2
18	10mh:A	327	31	0.2097	0.0398	0.4194	6.2	2c7o:A, 2c7p:A, 2c7q:A, 2c7r:A, 5ciy:A, 3eeo:A, 1fjx:A, 1hmy:A, 2hmy:B, 2hr1:A, 2i9k:A, 1m0e:A, 1mht:A, 3mht:A, 4mht:A, 5mht:A, 6mht:A, 7mht:A, 8mht:A, 9mht:A, 1skm:A, 1svu:B, 2uyc:A, 2uyh:A, 2uz4:A, 2z6a:A, 2z6q:A, 2z6u:A, 2zcj:A
19	8j6w:A	145	36	0.2258	0.0966	0.3889	6.3
20	6sga:Fd	96	28	0.1613	0.1042	0.3571	6.5	7pua:Fd, 6sgb:Fd
21	4im7:A	483	40	0.3065	0.0393	0.4750	6.8
22	5gmd:A	325	38	0.1774	0.0338	0.2895	7.4	5gme:A
23	4yd9:A	1656	20	0.1452	0.0054	0.4500	8.4	4yd9:D, 4yd9:G, 4yd9:J, 4yd9:M, 4yd9:P, 4yd9:S, 4yd9:V, 4yd9:Y, 4yd9:b
24	3uk6:L	233	27	0.1452	0.0386	0.3333	8.9
25	3wnb:A	361	16	0.1613	0.0277	0.6250	9.9	3wnc:A

[Back]