BioLiP

>protein
MKNVGFIGWRGMVGSVLMDRMSQENDFENLNPVFFTTSQALKSAFDIEELKKLDIIVTCQGGDYTNEVYPKLKATGWDGY
WVDAASALRMKDDAIIVLDPVNQHVISEGLKKGIKTFVGGNCTVSLMLMAIGGLFEKDLVEWISVATYQAASGAGAKNMR
ELLSQMGLLEQAVSSELKDPASSILDIERKVTAKMRADNFPTDNFGAALGGSLIPWIDKLLPETGQTKEEWKGYAETNKI
LGLSDNPIPVDGLCVRIGALRCHSQAFTIKLKKDLPLEEIEQIIASHNEWVKVIPNDKEITLRELTPAKVTGTLSVPVGR
LRKLAMGPEYLAAFTVGDQLLWGAAEPVRRILKQLVA

The query sequence (length=357) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1pqu:A	371	371	0.9972	0.9596	0.9596	0.0	1nx6:A, 1pqp:A, 1pqu:B, 1pqu:C, 1pqu:D, 1pr3:A, 1ta4:A, 1tb4:A
2	1gl3:A	367	368	0.7227	0.7030	0.7011	0.0	1gl3:B
3	3pzr:A	370	367	0.6863	0.6622	0.6676	0.0	1mb4:A, 1mb4:B, 3pzr:B, 3q0e:A, 3q0e:B, 4r5m:A, 4r5m:B
4	5bnt:C	371	369	0.6807	0.6550	0.6585	0.0	5bnt:B, 5bnt:A, 5bnt:D
5	7tcm:A	373	367	0.6695	0.6408	0.6512	4.20e-177	7tcm:B
6	8jus:A	335	370	0.2829	0.3015	0.2730	1.17e-24	8jus:B
7	3tz6:A	342	361	0.2717	0.2836	0.2687	8.81e-18	3vos:A
8	2r00:C	336	367	0.2493	0.2649	0.2425	1.05e-15
9	3pyl:C	361	268	0.2157	0.2133	0.2873	3.24e-15	2gz1:A, 2gz1:B, 2gz2:A, 2gz2:B, 2gz3:A, 2gz3:B, 2gz3:C, 2gz3:D, 3pwk:A, 3pwk:B, 3pws:A, 3pws:B, 3pyl:A, 3pyl:B, 3pyx:A, 3pyx:B, 3pzb:A, 3pzb:B, 3q11:A, 3q11:B, 3q1l:A, 3q1l:B, 3q1l:C, 3q1l:D, 4r3n:A, 4r3n:B, 4r3w:A, 4r3w:B, 4r41:A, 4r41:B, 4r4j:A, 4r4j:B, 4r51:A, 4r51:B, 4r54:A, 4r54:B, 4r5h:A, 4r5h:B
10	1ys4:A	348	297	0.1849	0.1897	0.2222	2.18e-05	1ys4:B
11	7jrc:A	501	121	0.0784	0.0559	0.2314	0.023	7jru:A, 7jrv:A, 7jrw:A, 7js5:A, 7js7:A, 7js7:B
12	4ck8:B	450	114	0.0700	0.0556	0.2193	0.15	5ajr:A, 4bmm:A, 4bmm:B, 4bmm:C, 4bmm:D, 4by0:A, 4by0:B, 4c0c:A, 4c27:A, 4c27:B, 4c28:A, 4c28:B, 4ck8:A, 4ck9:A, 4cka:A, 4coh:A, 4coh:B, 6fmo:A, 6fmo:B, 6fmo:C, 6fmo:D, 4h6o:A, 3k1o:A, 3khm:A, 3ksw:A, 4uqh:A, 4uvr:A, 2wuz:A, 2wuz:B, 2wx2:A, 2wx2:B, 3zg2:A, 3zg3:A
13	5xj2:A	454	59	0.0476	0.0374	0.2881	0.44	5xj2:B, 5xj2:C, 5xj2:D, 5zq0:A, 5zq1:A, 5zq8:B, 5zq8:A, 5zth:A
14	1bsv:A	317	73	0.0560	0.0631	0.2740	0.64	1bws:A, 1e6u:A, 1e7q:A, 1e7r:A, 1e7s:A, 1fxs:A
15	5iy6:B	1165	120	0.0840	0.0258	0.2500	2.4	8a40:B, 7b0y:B, 8b3d:B, 8b3f:B, 8bvw:B, 8byq:B, 8bz1:B, 7edx:p, 7eg7:p, 7eg8:p, 7eg9:p, 7ega:p, 7egb:p, 7egc:p, 7ena:PB, 7enc:PB, 6exv:B, 5flm:B, 8gxq:PB, 8gxs:PB, 5iy7:B, 5iy8:B, 5iy9:B, 5iya:B, 5iyb:B, 5iyc:B, 5iyd:B, 7lbm:B, 7nvr:B, 7nvs:B, 7nvt:B, 7nvu:B, 7nvy:B, 7nvz:B, 7nw0:B, 8oeu:B, 8oev:B, 8oew:B, 8of0:B, 5oik:B, 7okx:B, 7oky:B, 7ol0:B, 7oo3:B, 7oob:B, 7oop:B, 7opc:B, 7opd:B, 8p4f:B, 8s52:B, 8s54:B, 8s55:B, 8uha:B, 8uhd:B, 8uhg:B, 8ui0:B, 8uis:B, 8w8e:B, 8w8f:B, 8wak:p, 8wal:p, 8wan:p, 8wao:p, 8wap:p, 8waq:p, 8war:p, 8was:p, 8wat:p, 8wau:p, 8wav:p, 8waw:p, 8wax:p, 8way:p, 8waz:p, 8wb0:p, 7zwd:B, 7zx7:B, 7zx8:B
16	7o1o:A	356	41	0.0392	0.0393	0.3415	2.6	3ciw:A, 3cix:A, 5fep:A, 5fes:A, 5few:A, 5fex:A, 5fez:A, 5ff0:A, 5ff2:A, 5ff3:A, 5ff4:A, 3iix:A, 3iiz:A, 4jxc:A, 4jy8:A, 4jy9:A, 4jyd:A, 4jye:A, 4jyf:A, 7o1p:A, 7o1s:A, 7o1t:A, 7o25:A, 7o26:A, 8qmk:A, 8qml:A, 8qmm:A, 8qmn:A
17	7dvq:3	1193	55	0.0504	0.0151	0.3273	2.8
18	3emr:A	279	38	0.0448	0.0573	0.4211	3.6
19	7ea4:A	762	128	0.0868	0.0407	0.2422	4.1	7ea4:B, 7eby:A, 7eby:B, 7eby:C, 7eby:D, 7eby:E, 7eby:F
20	1wnb:A	474	79	0.0644	0.0485	0.2911	4.8	1wnb:B, 1wnb:C, 1wnb:D, 1wnd:A, 1wnd:B, 1wnd:C, 1wnd:D
21	8qbh:A	377	84	0.0588	0.0557	0.2500	5.1
22	5y6q:A	157	66	0.0560	0.1274	0.3030	5.5
23	8b1r:B	1170	119	0.0868	0.0265	0.2605	7.5	3k70:B, 3k70:E, 5ld2:B, 7mr4:B, 1w36:B, 1w36:E
24	8b1t:B	1141	119	0.0868	0.0272	0.2605	7.7	8b1u:B, 7mr3:B, 6sjb:B, 6sje:B, 6sjf:B, 6sjg:B, 6t2u:B, 6t2v:B
25	4f3x:A	476	49	0.0448	0.0336	0.3265	7.8	4f3x:B, 4f3x:C, 4f3x:D

[Back]