BioLiP

>protein
METLKITVYIVVTFFVLLFVFGFLSGDPARNPKRKDL

The query sequence (length=37) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5b5e:i	38	37	1.0000	0.9737	1.0000	5.64e-21	3a0b:I, 3a0b:i, 3a0h:I, 3a0h:i, 2axt:I, 2axt:i, 5b5e:I, 5b66:I, 5b66:i, 7cji:I, 7cji:i, 7cjj:I, 7cjj:i, 7cou:I, 7cou:i, 7czl:I, 7czl:i, 7d1t:I, 7d1t:i, 7d1u:I, 7d1u:i, 6dhe:I, 6dhe:i, 6dhf:I, 6dhf:i, 6dhg:I, 6dhg:i, 6dhh:I, 6dhh:i, 6dho:I, 6dho:i, 6dhp:I, 6dhp:i, 5e79:I, 5e79:i, 5e7c:I, 5e7c:i, 7eda:I, 9evx:I, 9evx:i, 8ez5:I, 8ez5:i, 8f4c:I, 8f4c:i, 8f4d:I, 8f4d:i, 8f4e:I, 8f4e:i, 8f4f:I, 8f4f:i, 8f4g:I, 8f4g:i, 8f4h:I, 8f4h:i, 8f4i:I, 8f4i:i, 8f4j:I, 8f4j:i, 8f4k:I, 8f4k:i, 4fby:I, 4fby:a, 8gn0:I, 8gn0:i, 8gn1:I, 8gn1:i, 8gn2:I, 8gn2:i, 5gth:I, 5gth:i, 5gti:I, 5gti:i, 5h2f:I, 5h2f:i, 4il6:I, 4il6:i, 8ir5:I, 8ir5:i, 8ir6:I, 8ir6:i, 8ir7:I, 8ir7:i, 8ir8:I, 8ir8:i, 8ir9:I, 8ir9:i, 8ira:I, 8ira:i, 8irb:I, 8irb:i, 8irc:I, 8irc:i, 8ird:I, 8ird:i, 8ire:I, 8ire:i, 8irf:I, 8irf:i, 8irg:I, 8irg:i, 8irh:I, 8irh:i, 8iri:I, 8iri:i, 4ixq:I, 4ixq:i, 4ixr:I, 4ixr:i, 6jlj:I, 6jlj:i, 6jlk:I, 6jlk:i, 6jll:I, 6jll:i, 6jlm:I, 6jlm:i, 6jln:I, 6jln:i, 6jlo:I, 6jlo:i, 6jlp:I, 6jlp:i, 5kaf:I, 5kaf:i, 5kai:I, 5kai:i, 3kzi:I, 5mx2:I, 5mx2:i, 7nho:I, 4pbu:I, 4pbu:i, 4pj0:I, 4pj0:i, 7rf1:I, 7rf1:i, 7rf2:I, 7rf2:i, 7rf3:I, 7rf3:i, 7rf4:I, 7rf4:i, 7rf5:I, 7rf5:i, 7rf6:I, 7rf6:i, 7rf7:I, 7rf7:i, 7rf8:I, 7rf8:i, 4rvy:I, 4rvy:i, 1s5l:i, 5tis:I, 5tis:i, 4tnh:I, 4tnh:i, 4tni:I, 4tni:i, 4tnj:I, 4tnj:i, 4tnk:I, 4tnk:i, 4ub6:I, 4ub6:i, 4ub8:I, 4ub8:i, 5v2c:I, 5v2c:i, 4v62:AI, 4v62:BI, 4v82:AI, 4v82:BI, 6w1o:I, 6w1o:i, 6w1p:I, 6w1p:i, 6w1q:I, 6w1q:i, 6w1r:I, 6w1r:i, 6w1t:I, 6w1t:i, 6w1u:I, 6w1u:i, 6w1v:I, 6w1v:i, 5ws5:I, 5ws5:i, 5ws6:I, 5ws6:i, 3wu2:I, 3wu2:i, 7yq2:I, 7yq2:i, 7yq7:I, 7yq7:i, 5zzn:I, 5zzn:i
2	8wql:ID	36	36	0.7297	0.7500	0.7500	5.09e-13	8wql:IE, 8wql:I1, 8wql:i1, 8wql:iD, 8wql:iE
3	8tow:I	37	36	0.7027	0.7027	0.7222	6.38e-13	7n8o:I, 7n8o:i, 7rcv:I, 7rcv:i, 8tow:i, 6wj6:I
4	8eqm:I	34	33	0.6757	0.7353	0.7576	1.93e-12	8eqm:i
5	6kac:I	35	35	0.7027	0.7429	0.7429	1.94e-12	8bd3:I, 8bd3:i, 6kac:i, 6kad:I, 6kad:i, 6kaf:i, 6kaf:I, 8kde:I, 7pi0:I, 7pi0:i, 7pi5:I, 7pi5:i, 7pin:I, 7pin:i, 7pin:I1, 7pin:i1, 7piw:I, 7piw:i, 7piw:I1, 7piw:i1, 7pnk:I, 7pnk:i, 8zee:I
6	6j3y:I	35	35	0.6757	0.7143	0.7143	5.44e-12	6j3y:i, 6j3z:I, 6j3z:i, 6j40:I, 6j40:i, 8j5k:I, 8j5k:i, 6jlu:I, 6jlu:i, 7vd5:I, 7vd5:i
7	7y5e:IL	35	35	0.6757	0.7143	0.7143	1.30e-11	7y5e:I6, 7y5e:i6, 7y5e:iL, 7y7a:I9, 7y7a:i9, 7y7a:IE, 7y7a:iE, 7y7a:IO, 7y7a:iO, 7y7a:IZ, 7y7a:iZ, 7y7a:Im, 7y7a:im
8	8c29:I	36	36	0.6486	0.6667	0.6667	1.50e-11	8c29:i, 3jcu:I, 3jcu:i, 5mdx:i, 7oui:I, 7oui:i, 5xnl:I, 5xnl:i, 5xnm:I, 5xnm:i, 6yp7:i
9	4yuu:I2	35	35	0.6486	0.6857	0.6857	1.61e-11	4yuu:I1, 4yuu:i1, 4yuu:i2
10	8wb4:I	35	35	0.6757	0.7143	0.7143	1.63e-11	8wb4:i, 8xlp:i, 8xlp:I, 8xr6:i, 8xr6:I
11	7ymi:I	34	33	0.4324	0.4706	0.4848	2.71e-05	7ymi:i, 7ymm:1I, 7ymm:2I, 7ymm:3I, 7ymm:4I
12	8u41:B	451	25	0.2973	0.0244	0.4400	0.13	8u41:A, 8u42:A, 8u42:B, 8ux5:A, 8ux5:B
13	8iew:A	498	15	0.2432	0.0181	0.6000	0.34	8inb:A
14	7xlq:A	1319	29	0.3514	0.0099	0.4483	0.63	8epl:A, 7yg5:A
15	6v35:H	198	28	0.2162	0.0404	0.2857	1.3	6v35:E, 6v35:F, 6v35:G
16	8fhs:A	1282	29	0.2973	0.0086	0.3793	1.4	8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
17	8eoi:K	1116	29	0.2973	0.0099	0.3793	1.6
18	8wea:A	1206	29	0.2973	0.0091	0.3793	1.6
19	7mix:A	1326	29	0.3243	0.0090	0.4138	1.8	7miy:A
20	8x90:A	1377	29	0.3243	0.0087	0.4138	1.9	8x91:A, 8x93:A
21	6kbh:A	765	10	0.2162	0.0105	0.8000	2.1
22	5t2a:AP	223	29	0.2973	0.0493	0.3793	2.1	8a3w:SF, 8a98:SF, 6az1:F, 8ovj:SF, 8rxh:SF, 8rxx:SF
23	7vfs:A	1266	29	0.3243	0.0095	0.4138	2.2	7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
24	6laa:A	753	10	0.1892	0.0093	0.7000	3.7	6gii:A, 6ldl:A
25	4hg6:A	747	28	0.2973	0.0147	0.3929	5.9	5eiy:A, 5ej1:A, 5ejz:A, 4p00:A, 4p02:A
26	8epm:A	991	25	0.3243	0.0121	0.4800	6.5
27	7kyc:A	1178	18	0.2703	0.0085	0.5556	6.8	7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
28	3fia:A	98	35	0.3514	0.1327	0.3714	9.9

[Back]