BioLiP

>protein
MESLTLQPIARVDGTINLPGSKSVSNRALLLAALAHGKTVLTNLLDSDDVRHMLNALTALGVSYTLSADRTRCEIIGNGG
PLHAEGALELFLGNAGTAMRSLAAALCLGSNDIVLTGEPRMKERPIGHLVDALRLGGAKITYLEQENYPPLRLQGGFTGG
NVDVDGSVSSQFLTALLMTAPLAPEDTVIRIKGDLVSKPYIDITLNLMKTFGVEIENQHYQQFVVKGGQSYQSPGTYLVE
GDASSASYFLAAAAIKGGTVKVTGIGRNSMQGDIRFADVLEKMGATICWGDDYISCTRGELNAIDMDMNHIPDAAMTIAT
AALFAKGTTTLRNIYNWRVKETDRLFAMATELRKVGAEVEEGHDYIRITPPEKLNFAEIATYNDHRMAMCFSLVALSDTP
VTILDPKCTAKTFPDYFEQLARISQAA

The query sequence (length=427) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2aa9:A	427	427	0.9977	0.9977	0.9977	0.0	2aay:A, 3fjx:A, 3fjz:A, 3fk0:A, 3fk1:A, 1g6s:A, 1g6t:A, 1mi4:A, 2pq9:A, 1q36:A, 2qfq:A, 2qfs:A, 2qft:A, 2qfu:A, 1x8r:A, 1x8t:A
2	7tm5:B	427	427	0.8876	0.8876	0.8876	0.0	7tm5:A, 7tm6:A, 7tm6:B
3	3nvs:A	426	426	0.7494	0.7512	0.7512	0.0
4	8umj:A	443	436	0.5433	0.5237	0.5321	5.26e-146	8umj:B, 8umk:A, 8umk:B, 8uml:A, 8uml:B, 8umm:A, 8umm:B, 8umn:A, 8umn:B
5	7tbu:A	450	429	0.4169	0.3956	0.4149	2.30e-87	7tbu:B
6	6hqv:A	1555	448	0.4403	0.1209	0.4196	1.86e-81	6hqv:B
7	7m0o:A	400	412	0.3630	0.3875	0.3762	1.21e-62
8	3slh:D	440	428	0.3162	0.3068	0.3154	7.89e-42	4egr:A, 4egr:B, 4egr:C, 4egr:D, 4egr:E, 4egr:F, 3slh:A, 3slh:B, 3slh:C, 4znd:A
9	2o0b:A	424	415	0.3091	0.3113	0.3181	1.60e-40	2o0d:A, 2o0e:A, 2o0x:A, 2o0z:A
10	1rf4:A	427	427	0.2553	0.2553	0.2553	2.35e-30	1rf4:B, 1rf4:C, 1rf4:D, 1rf6:A, 1rf6:B, 1rf6:C, 1rf6:D
11	2gg6:A	445	442	0.2951	0.2831	0.2851	3.34e-29	2gga:A, 2ggd:A, 2pqb:A, 2pqc:A, 2pqd:A
12	5u4h:A	420	405	0.2482	0.2524	0.2617	9.67e-15	5u4h:B
13	6cn1:A	422	424	0.2295	0.2322	0.2311	5.46e-07	6cn1:B, 6cn1:C, 6cn1:D, 6cn1:E, 6cn1:F, 6cn1:G, 6cn1:H
14	3vcy:A	419	267	0.1546	0.1575	0.2472	4.49e-06	3vcy:B, 3vcy:C, 3vcy:D
15	2rl1:A	420	300	0.1663	0.1690	0.2367	9.84e-06	2rl2:A, 3swe:A
16	6q03:A	416	292	0.1616	0.1659	0.2363	7.83e-05	6q0a:A, 6q0y:A, 6q11:A
17	5bq2:A	425	296	0.1593	0.1600	0.2297	6.43e-04	5bq2:B, 5bq2:C, 5bq2:D
18	3swg:A	417	361	0.1827	0.1871	0.2161	0.008	2yvw:A
19	5wi5:A	422	429	0.2295	0.2322	0.2284	0.010	6nkj:A, 6nkj:B, 5wi5:B, 5wi5:C, 5wi5:D
20	5z74:A	441	128	0.0820	0.0794	0.2734	0.21	5z74:B
21	5d2e:A	485	122	0.0820	0.0722	0.2869	3.1
22	3ku4:B	293	67	0.0422	0.0614	0.2687	4.8	3ku4:A, 3ku4:C, 3ku4:D, 3kuk:A, 3kuk:B, 3kvr:A, 3kvr:B, 3kvy:A, 3kvy:B
23	4e7b:A	419	52	0.0398	0.0406	0.3269	8.0	1a2n:A, 4e7b:B, 4e7b:C, 4e7b:D, 4e7c:A, 4e7c:B, 4e7d:A, 4e7e:A, 4e7e:D, 4e7f:A, 1eyn:A, 3iss:A, 3iss:B, 3iss:C, 3iss:D, 3iss:E, 3iss:F, 3iss:G, 3iss:H, 3iss:I, 3iss:J, 3iss:K, 3iss:L, 3kqa:A, 3kqa:B, 3kqa:C, 3kqa:D, 3kqj:A, 3kr6:A, 3lth:A, 1q3g:A, 1q3g:B, 1q3g:C, 1q3g:D, 1q3g:E, 1q3g:F, 1q3g:G, 1q3g:H, 1q3g:I, 1q3g:J, 1q3g:K, 1q3g:L, 1q3g:W, 1q3g:X, 1q3g:Y, 1q3g:Z, 1ryw:A, 1ryw:B, 1ryw:C, 1ryw:D, 1ryw:E, 1ryw:F, 1ryw:G, 1ryw:H, 3su9:A, 3swa:A, 3swa:B, 3swd:A, 3swd:B, 3swd:C, 3swd:D, 3swd:E, 3swd:F, 3swd:G, 3swd:H, 3swd:I, 3swd:J, 3swd:K, 3swd:L, 3swi:A, 3swq:A, 1uae:A, 3upk:A, 3v4t:A, 3v4t:B, 3v4t:C, 3v4t:D, 3v4t:E, 3v4t:F, 3v4t:G, 3v4t:H, 1ybg:A, 1ybg:B, 1ybg:C, 1ybg:D, 2z2c:A, 2z2c:B, 2z2c:C, 2z2c:D
24	3eue:A	295	68	0.0422	0.0610	0.2647	8.7	3euf:A, 3euf:B, 3euf:C, 3euf:D, 3nbq:A, 3nbq:B, 3nbq:C, 3nbq:D
25	4ihc:B	395	66	0.0422	0.0456	0.2727	9.2	4ihc:C, 4ihc:D, 4ihc:E, 4ihc:F, 4ihc:H

[Back]