BioLiP

>protein
MDIRLLRPSDIPLIQHANLENLPENYFLKYYLYHALSWPQLSFVAVDVSRPAKSPYDYPKIVGYVLAKMEEEPADGVPHG
HITSLSVMRTHRRLGIAEKLMRQSQLAMVETYNAHYVSLHVRVSNKAAIHLYRDTLGFKTEKVEAKYYADGEDAYCMKLD
LTALREQIAAQREKELEE

The query sequence (length=178) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5nnp:B	179	178	1.0000	0.9944	1.0000	1.35e-132	5nnp:F
2	4kvm:E	153	162	0.5843	0.6797	0.6420	1.47e-71	4kvm:F, 4kvm:G, 4kvm:H, 4kvo:E, 4kvo:F, 4kvo:G, 4kvo:H, 4kvx:A, 4kvx:B
3	6c95:B	160	168	0.5787	0.6438	0.6131	6.77e-70	6ppl:C, 6pw9:C
4	4hnx:B	213	185	0.5506	0.4601	0.5297	1.78e-59	4hnw:B, 6o07:B, 4xnh:B, 4xpd:B, 4y49:B, 4y49:H, 4y49:N
5	5c88:A	158	162	0.3539	0.3987	0.3889	2.62e-22	6ag4:A, 6ag5:A, 5c88:B, 4lx9:A, 4r3k:A, 4r3l:A, 2x7b:A
6	8g0l:A	158	165	0.3034	0.3418	0.3273	4.50e-19	7stx:A, 6vp9:A
7	6zmp:A	190	189	0.3371	0.3158	0.3175	2.32e-17	6zmp:B
8	5k18:B	179	167	0.2472	0.2458	0.2635	1.27e-13	5k04:B, 5k18:D
9	7mx2:A	152	151	0.2697	0.3158	0.3179	4.21e-13	7rb3:A
10	7l1k:A	149	136	0.2416	0.2886	0.3162	3.51e-12
11	6ygb:A	159	150	0.2697	0.3019	0.3200	1.62e-10	6ygc:A, 6ygd:A
12	4pv6:G	154	155	0.2303	0.2662	0.2645	1.11e-05	4pv6:C, 4pv6:I, 4pv6:F, 4pv6:A, 4pv6:H, 4pv6:J, 4pv6:E
13	6th0:A	176	167	0.2360	0.2386	0.2515	5.75e-05	6tgx:A, 6tgx:B, 6th0:B
14	2ob0:C	166	122	0.2022	0.2169	0.2951	1.01e-04	2ob0:A, 2ob0:B, 6ppl:A, 2psw:A, 2psw:B, 2psw:C, 3tfy:A, 3tfy:B, 3tfy:C, 6wf3:A, 6wf3:B, 6wf3:C, 6wf3:D, 6wf3:E, 6wf3:F, 6wf5:A, 6wf5:B, 6wfg:A, 6wfg:C, 6wfg:E, 6wfk:A, 6wfk:B, 6wfk:C, 6wfn:A, 6wfo:A, 6wfo:B, 6wfo:C, 4x5k:A
15	2cnm:A	151	57	0.1348	0.1589	0.4211	0.012	2cnm:B, 2cnm:C, 2cns:A, 2cns:B, 2cns:C, 2cnt:A, 2cnt:B, 2cnt:C, 2cnt:D
16	5hmn:B	159	95	0.1629	0.1824	0.3053	0.096	5hmn:A, 5hmn:C, 5hmn:E, 5hmn:F
17	5us1:A	189	66	0.1011	0.0952	0.2727	0.28	7jzs:A, 5us1:B, 5us1:C, 5us1:D, 5us1:E, 5us1:F, 5us1:G, 5us1:H, 5us1:I, 5us1:K, 5us1:L, 6vou:A, 6vou:B, 6vr2:A, 6vr2:B, 6vr3:A, 6vr3:B, 6vta:A, 6vta:B
18	4evy:A	147	67	0.1180	0.1429	0.3134	0.43	4evy:B
19	6e1x:C	176	51	0.1011	0.1023	0.3529	0.66	5cnp:B, 5cnp:D, 5cnp:F, 6cx8:A, 6cx8:B, 6cx8:C, 6cx8:D, 6cx8:E, 6cx8:F, 6e1x:A, 6e1x:B, 6e1x:D, 4mhd:A, 4mhd:B, 4mhd:C, 4mi4:A, 4mi4:B, 4mi4:C, 4ncz:A, 4ncz:C, 4ncz:B, 4r57:A, 4r57:B, 4r57:C, 4r57:D, 4r57:E, 4r57:F, 4r57:G, 4r57:H, 4r57:I, 4r57:J, 4r57:K, 4r57:L, 4r87:A, 4r87:B, 4r87:C, 4r87:D, 4r87:E, 4r87:F, 4r87:G, 4r87:H, 4r87:I, 4r87:J, 4r87:K, 4r87:L, 5ug4:A, 5ug4:B, 5ug4:C, 4ygo:A, 4ygo:C, 4ygo:D, 4ygo:E
20	6ehb:C	320	130	0.1742	0.0969	0.2385	0.74	6ehb:B, 6ehc:A, 6ehc:B, 5onu:A, 5onu:B, 5onu:C
21	5grf:B	335	87	0.1404	0.0746	0.2874	0.78	5gre:B, 5gri:B, 5grl:B, 6l57:B, 6l59:B, 5yvt:B
22	4kub:A	160	85	0.1180	0.1313	0.2471	1.7	4klv:A, 4klw:A, 4kor:A, 4kos:A, 4kot:A, 4kou:A, 4kov:A, 4kow:A, 4kox:A, 4koy:A, 4l89:A, 4l8a:A, 4m3s:A, 4oad:A, 4oae:A, 3pgp:A, 5vd6:A, 5vdb:A
23	6wqc:A	293	25	0.0787	0.0478	0.5600	6.1	6wqb:A
24	3nsj:A	530	36	0.0674	0.0226	0.3333	7.7	7pag:A, 5ug7:A, 4y1s:A, 4y1t:A

[Back]