Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MATFPELLRPLKLGRYTLRNRIIMAPLTRCQATEDDHVPRTESMLKYYEDRASAGLIIAEATMVQPNYTGFLTEPGIYSD
AQIEEWRKIVDAVHKKGGLIFLQLIHAGRAGIPEKILQQSKSDQDPLAGRLLAASAIPIKDHRIPAYFAASGEKETYGVP
EELTDDEVRDGIIPLFVEGAKNAIFKAGFDGVEIHGANGYLLDAFFRESSNKRQSGPYAGTTIDTRCQLIYDVTKSVCDA
VGSDRVGLRISPLNGVHGMIDSNPEALTKHLCKKIEPLSLAYLHYLRGDMVNQQIGDVVAWVRGSYSGVKISNLRYDFEE
ADQQIREGKVDAVAFGAKFIANPDLVERAQQNWPLNEPRPETYYTRTAVGYNDYPTYNK

The query sequence (length=379) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3aty:A 379 379 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 3aty:B, 3atz:A, 3atz:B, 3atz:C, 3atz:D, 4e2b:A, 4e2d:A, 4e2d:B, 4e2d:C, 4e2d:D
2 8e5i:A 357 375 0.4617 0.4902 0.4667 5.54e-101
3 3gka:B 351 377 0.4063 0.4387 0.4085 3.39e-81 3gka:A
4 7tnb:AAA 353 375 0.3826 0.4108 0.3867 4.40e-76
5 4ab4:A 349 370 0.3958 0.4298 0.4054 7.79e-76 4ab4:B, 4aeo:A, 4aeo:B
6 6s32:D 352 377 0.4142 0.4460 0.4164 4.42e-75 6s32:A, 6s32:B, 6s32:C
7 4a3u:A 355 376 0.3958 0.4225 0.3989 1.08e-74 4a3u:B
8 6uff:A 362 378 0.3931 0.4116 0.3942 4.87e-73 6uff:B, 6uff:C, 6uff:D, 6uff:E, 6uff:F, 6uff:G, 6uff:H
9 5dy2:A 378 397 0.3852 0.3862 0.3678 1.45e-72 5dxx:A, 5dxy:A, 5dy3:A
10 1icp:A 358 370 0.3536 0.3743 0.3622 1.33e-71 3hgr:A, 3hgr:B, 1icp:B, 1icq:A, 1icq:B, 1ics:A, 1ics:B
11 2gou:A 365 377 0.3615 0.3753 0.3634 1.39e-71 4aws:A, 4awt:A, 4awu:A, 2gq8:A, 2gq9:A, 2gqa:A
12 9em0:A 376 390 0.3641 0.3670 0.3538 6.64e-69 8aua:A, 8aua:B, 8aub:A, 8aub:B, 8aue:A, 8aue:B, 8auj:A, 8auj:B, 8aul:A, 8aul:B, 8aum:A, 8aum:B, 8aun:A, 8aun:B, 8auo:B, 8auo:A, 8auq:A, 8auq:B, 9em0:B, 9em2:B, 9em2:A, 9em3:A, 9em4:B, 9em4:A, 9em5:A, 9em6:B, 9em6:A, 3hgo:A, 3hgo:B, 3hgs:A, 3hgs:B, 2hs6:A, 2hs6:B, 2hs8:A, 2hs8:B, 2hsa:B, 2hsa:A, 8qmx:A, 8qmx:B, 8qn1:A, 8qn1:B, 8qn1:C, 8qn1:D, 8qn3:A, 8qn3:B, 8qn9:B, 8s8v:A, 8s8v:B, 8s8y:B, 8s8y:A
13 2q3o:B 367 379 0.3588 0.3706 0.3588 2.47e-68 2g5w:A, 2g5w:B, 2q3o:A, 1q45:A, 1q45:B
14 4jic:A 370 380 0.3588 0.3676 0.3579 3.26e-68 4jic:B, 4jic:C, 4jip:A, 4jiq:A, 5n6g:A
15 1gvr:A 364 376 0.3799 0.3956 0.3830 3.18e-67 2aba:A, 2abb:A, 3f03:K, 6gi7:A, 6gi8:A, 6gi9:A, 6gia:A, 1gvo:A, 1gvq:A, 1gvs:A, 1h50:A, 1h51:A, 1h60:A, 1h61:A, 1h62:A, 1h63:A, 3kft:A, 3kft:B, 5lgx:A, 5lgz:A, 3p62:A, 3p67:A, 3p74:A, 3p7y:A, 3p80:A, 3p81:A, 3p82:A, 3p84:A, 3p8i:A, 3p8j:A, 1vyp:X, 1vyr:A, 1vys:X
16 1gwj:A 374 381 0.3773 0.3824 0.3753 3.38e-67 3gx9:A, 2r14:A
17 2q3r:A 351 370 0.3351 0.3618 0.3432 5.51e-66 1vji:A
18 8fw1:A 362 383 0.3773 0.3950 0.3734 8.69e-66 8fw1:B, 8fw1:C, 6myw:A, 6myw:B, 6myw:C, 6myw:D, 6o08:A, 8vcn:A
19 7bn6:B 381 381 0.3773 0.3753 0.3753 2.50e-64 7bn6:A, 7bo0:A, 7bo0:B, 6s0g:B, 6s23:A, 6s23:B, 6s31:A
20 7tmb:A 362 376 0.3694 0.3867 0.3723 7.69e-64 7tmb:B, 7tmb:C, 7tmb:D, 7tmb:E, 7tmb:F
21 8bpp:A 362 376 0.3773 0.3950 0.3803 8.03e-64 8bpp:B, 8bpp:C, 8bpq:A, 8bpq:B, 8bpq:C
22 4b5n:A 354 342 0.3430 0.3672 0.3801 7.55e-63 5k0r:A, 5k1k:A, 5k1m:A, 5k1q:A, 5k1u:A, 5k1w:A
23 4ot7:A 308 377 0.3536 0.4351 0.3554 5.10e-60
24 4qnw:A 369 387 0.3668 0.3767 0.3592 2.83e-55
25 5v4v:A 397 397 0.3245 0.3098 0.3098 7.03e-51 5v4p:A, 5v4p:B, 5v4v:B
26 1bwk:A 399 391 0.3166 0.3008 0.3069 6.82e-49 7bn7:A, 7bn7:B, 7bn7:C, 7bn7:D, 1bwl:A, 4gbu:A, 4ge8:A, 4gwe:A, 4gxm:A, 4h4i:A, 4h6k:A, 1k02:A, 1k03:A, 4k7v:A, 4k7y:A, 4k8e:A, 4k8h:A, 1oya:A, 1oyb:A, 1oyc:A, 3rnd:A, 3tx9:A, 3txz:A, 4yil:A, 4ync:A
27 6agz:A 386 363 0.3298 0.3238 0.3444 6.85e-46 6agz:B
28 4tmc:A 399 392 0.3140 0.2982 0.3036 3.13e-42 4tmb:A, 4tmb:B, 4tmb:C, 4tmb:D, 4tmc:B, 4tmc:C, 4tmc:D
29 4df2:A 404 394 0.3140 0.2946 0.3020 2.58e-38 4m5p:A, 4qai:A, 4qai:B, 4qai:C, 4qai:D, 4qai:E, 4qai:F, 3tjl:A, 3upw:A
30 4rnu:C 385 288 0.2454 0.2416 0.3229 2.91e-37 4rnu:A, 4rnu:B, 4rnu:D, 4rnv:A, 4rnv:B, 4rnv:C, 4rnv:D, 4rnw:A, 4rnw:B
31 4rnu:C 385 69 0.0660 0.0649 0.3623 7.06e-07 4rnu:A, 4rnu:B, 4rnu:D, 4rnv:A, 4rnv:B, 4rnv:C, 4rnv:D, 4rnw:A, 4rnw:B
32 8e5h:A 368 369 0.3113 0.3207 0.3198 6.37e-35
33 4rnx:A 390 233 0.2005 0.1949 0.3262 2.29e-26 4rnx:B
34 4rnx:A 390 112 0.0976 0.0949 0.3304 1.38e-17 4rnx:B
35 1ps9:A 671 371 0.2718 0.1535 0.2776 1.63e-22
36 3kru:A 335 361 0.2718 0.3075 0.2853 1.83e-22 3kru:B, 3kru:C, 3kru:D, 3krz:A, 3krz:B, 3krz:C, 3krz:D
37 3gr7:A 340 359 0.2586 0.2882 0.2730 7.19e-22 3gr7:B, 3gr8:A, 3gr8:B
38 8uat:F 351 237 0.2005 0.2165 0.3207 1.10e-19 3hf3:A, 3hf3:B, 3hf3:C, 3hf3:D, 3hgj:A, 3hgj:B, 3hgj:C, 3hgj:D, 5nux:A, 5nux:B, 5nux:C, 5nux:D, 5ogt:A, 5ogt:B, 5ogt:C, 5ogt:D, 8uaj:A, 8uaj:B, 8uaj:C, 8uaj:D, 8uat:B, 8uat:C, 8uat:D, 8uat:E, 8uat:G, 8uat:H, 8uat:A
39 7blf:A 406 235 0.1847 0.1724 0.2979 2.09e-19 7blf:B
40 1z41:A 337 234 0.1873 0.2107 0.3034 7.16e-19 1z41:B, 1z42:A, 1z42:B, 1z44:A, 1z44:B, 1z48:A, 1z48:B
41 7qfx:C 413 258 0.2084 0.1913 0.3062 1.44e-18 7qfx:B, 7qfx:E, 7qfx:G
42 5ocs:A 369 298 0.2348 0.2412 0.2987 1.48e-18 5ocs:C
43 8auh:A 365 236 0.1926 0.2000 0.3093 1.65e-18 8a8i:B, 8a8i:D, 8au8:A, 8au8:B, 8au9:B, 8au9:A, 8auf:A, 8auf:B, 8aug:A, 8aug:B, 8auh:B, 8aui:A, 8aui:B, 5cpl:A, 5cpl:B, 5cpm:A, 5cpm:B, 5cpn:A, 5cpn:B, 5cpo:A, 5cpo:B, 2h8x:A, 2h8z:A, 2h90:A, 3l5l:A, 3l5m:A, 3l65:A, 3l66:A, 3l67:A, 3l68:A, 5lni:A, 5lnj:A, 3n14:A, 3n19:B, 3n19:D, 5n6q:A, 5n6q:B, 4uth:A, 4uti:A, 4utj:A, 4utk:A, 4utl:A, 4utm:A
44 8j59:B 388 239 0.1873 0.1830 0.2971 5.42e-17 8j59:A
45 7o0t:A 354 376 0.2718 0.2910 0.2739 6.32e-17 7o0t:B, 7o0t:C, 7o0t:D
46 8pun:A 356 364 0.2454 0.2612 0.2555 6.31e-16 8pun:B, 8pun:C, 8pun:D
47 7fev:A 443 287 0.2032 0.1738 0.2683 1.04e-12
48 6qkg:B 664 254 0.1557 0.0889 0.2323 1.54e-11 6qkg:A, 6qkr:A, 6qkr:B, 6qkx:A
49 1djn:A 729 297 0.1900 0.0988 0.2424 1.32e-07 1djn:B, 1djq:A, 1djq:B, 1o94:A, 1o94:B, 1o95:A, 1o95:B, 2tmd:A, 2tmd:B
50 6de6:A 689 249 0.1478 0.0813 0.2249 1.99e-06
51 6de6:B 652 249 0.1478 0.0859 0.2249 2.08e-06
52 6l6j:A 669 243 0.1689 0.0957 0.2634 2.25e-06
53 3k30:A 684 261 0.1398 0.0775 0.2031 1.13e-05 3k30:B
54 6pev:A 478 54 0.0475 0.0377 0.3333 2.2 4eme:A, 4eme:B, 4eme:C, 4eme:D, 6pev:B, 6pev:C, 6pev:D, 6pev:E, 6pev:F, 6pev:G, 6pev:H, 6pev:I, 6pev:J, 6pev:K, 6pev:L
55 6kwy:c 1811 43 0.0396 0.0083 0.3488 3.5 8cvs:c, 6kwx:A, 7naq:c
56 6rey:c 1773 43 0.0396 0.0085 0.3488 3.6 6rey:d
57 8h4p:A 326 91 0.0633 0.0736 0.2637 4.1 8h4p:B
58 3fd5:B 355 31 0.0369 0.0394 0.4516 4.8 3fd5:A, 3fd6:A, 3fd6:B
59 4n78:A 1184 81 0.0633 0.0203 0.2963 5.6
60 6aui:A 745 69 0.0449 0.0228 0.2464 6.0 6aui:B, 6aui:C, 6aui:D, 6aui:E, 6aui:F, 3hnc:A, 3hnc:B, 3hnd:A, 3hnd:B, 3hne:A, 3hne:B, 3hnf:A, 3hnf:B, 6l3r:A, 6l3r:E, 6lkm:A, 6lkm:B, 5tus:A, 5tus:B, 2wgh:B, 4x3v:A, 4x3v:B
61 6ksa:B 611 92 0.0712 0.0442 0.2935 7.3 6kpt:A, 6kpt:B, 6kri:A, 6kri:B, 6ks9:A, 6ks9:B, 6ksa:A, 6ksb:A, 6ksb:B, 6lpy:A, 6lpy:B, 6lq0:A, 6lq0:B, 6lq1:A, 6lq1:B, 6lq2:A, 6lq2:B, 6lq3:A, 6lq3:B, 6lq4:A, 6lq4:B, 6lq5:A, 6lq5:B, 6lq6:A, 6lq6:B, 6lq7:A, 6lq7:B, 6lq8:A, 6lq8:B
62 7ovv:B 196 23 0.0237 0.0459 0.3913 8.2 7ovv:A
63 2dr1:A 381 56 0.0580 0.0577 0.3929 9.7 2dr1:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218