Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MASMRIPEDVRKDIPLTNEVIYFDNTATSLTPKPVVEAMDEYYLKYRANVHRGVHRLSQMATHKYEESRKIVADFIGAKF
EEIVFTKNTSESLNLVALGLGHIFKRGDKIVTTPYEHHSDLLPWQRLATKLGLKLEFIEGDDEGNLDLSDAEKKIKGAKL
VAVQHVSNALGVIHEVEELGKIAKDEGAIFVVDAAQSAGHMEVNVKKLHADFLAFSGHKGPMGPTGIGVLYIREEFFDTF
EPPLIGGGTIEDVSLDGYKLTEPPERFEAGTPNIGGAIGLAAGIRYIERIGLGRIERQEHKLVKRTTEGLDELEVPWYGP
RNLKKHAGVVSFNVPGLHPHDVAAILDDHSIMVRSGHHCALPVMKKLGINGTVRASFHVYNSLEEVETFLGVMEELVKGL
K

The query sequence (length=401) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5b7u:A 402 400 0.9975 0.9950 1.0000 0.0 5b7u:B, 5b87:A, 5b87:B, 5b89:A, 5b89:B
2 7cep:A 414 397 0.4389 0.4251 0.4433 6.43e-113 7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
3 8odq:D 410 394 0.4239 0.4146 0.4315 3.08e-99 8odq:B
4 1t3i:A 406 403 0.4140 0.4089 0.4119 4.46e-95 1t3i:B
5 6ndn:A 406 405 0.4040 0.3990 0.4000 6.14e-89 1c0n:A, 5db5:A, 5db5:B, 1i29:A, 1jf9:A, 1kmj:A, 1kmk:A, 6mr2:A, 6mr6:A, 6mre:A, 6mrh:A, 6mri:A, 6o10:A, 6o11:A, 6o12:A, 6o13:A, 7rrn:A, 7ruj:A, 7rw3:A, 6uy5:A, 6uy5:B
6 6a6e:A 422 396 0.3940 0.3744 0.3990 1.70e-88 6a6e:B, 6a6e:C, 6a6e:D, 6a6g:A, 6a6g:B
7 7tlm:A 415 400 0.3815 0.3687 0.3825 5.24e-87 7tlp:B, 7tlp:C, 7tlp:D, 7tlp:E, 7tlp:F, 7tlq:A, 7tlq:B, 7tlr:A, 7tlr:B
8 7tlp:A 391 399 0.3641 0.3734 0.3659 7.25e-80
9 5ft8:A 401 399 0.3267 0.3267 0.3283 1.21e-71 5ft4:A, 5ft4:B, 5ft5:A, 5ft5:B, 5ft6:A, 5ft6:B, 5ft8:C, 5ft8:E, 5ft8:G, 5ft8:I, 5ft8:K, 5ft8:M, 5ft8:O, 4lw2:A, 4lw2:B, 4lw2:C, 4lw4:A, 4lw4:B
10 1ecx:B 365 386 0.2818 0.3096 0.2927 3.04e-34 1ecx:A, 1eg5:A, 1eg5:B
11 3lvm:B 394 232 0.1870 0.1904 0.3233 2.88e-30 3lvj:A, 3lvj:B, 3lvk:A, 3lvl:B, 3lvm:A, 1p3w:B, 1p3w:A
12 6nzu:A 402 230 0.1820 0.1816 0.3174 4.17e-28 6nzu:E, 8pk8:A, 8pk9:A, 8pka:A, 7rtk:A, 8tvt:A, 6uxe:A, 6w1d:A, 6wi2:A, 6wih:A, 5wkp:A, 5wkp:E, 5wlw:A, 5wlw:E
13 6m4j:A 347 231 0.1895 0.2190 0.3290 3.17e-27 6m4j:B
14 4eb5:A 379 229 0.1845 0.1953 0.3231 6.51e-25 4eb5:B, 4eb7:A, 4eb7:B, 4hvk:A, 4r5f:A
15 5wgb:A 291 222 0.1771 0.2440 0.3198 1.27e-23
16 5zss:A 388 400 0.2643 0.2732 0.2650 7.58e-22
17 5wt6:A 366 232 0.1771 0.1940 0.3060 4.18e-21 7cet:A, 7ceu:A, 6kg0:A, 6kg1:A, 5wt2:A, 5wt4:A, 7xeq:A, 7xes:A
18 3vax:A 358 236 0.1721 0.1927 0.2924 1.79e-16 3vax:B
19 1n31:A 386 406 0.2269 0.2358 0.2241 2.65e-15 1elq:A, 1elq:B, 1elu:A, 1elu:B, 1n2t:A, 1n2t:B, 1n31:B
20 3gzc:A 403 249 0.1820 0.1811 0.2932 2.72e-13 3gzc:B, 3gzd:A, 3gzd:B, 3gzd:C, 3gzd:D
21 5x6b:J 377 322 0.1995 0.2122 0.2484 4.74e-13 5x6b:I
22 8irk:A 379 290 0.1820 0.1926 0.2517 1.02e-12 8irk:B, 8irk:C, 8irk:D, 8iry:A, 8iry:B, 8iry:C, 8iry:D, 8irz:A, 8irz:B, 8is0:A, 8is0:B
23 3a9y:A 403 253 0.1820 0.1811 0.2885 2.08e-12 3a9x:A, 3a9x:B, 3a9y:B, 3a9z:A, 3a9z:B
24 5hh9:A 390 240 0.1322 0.1359 0.2208 5.58e-11 5hh9:B, 5i90:A, 5i90:B
25 5v1x:D 447 184 0.1222 0.1096 0.2663 1.01e-08 5v12:F, 5v12:B, 5v1x:C, 5v1x:A, 5v1x:B
26 9azb:A 396 197 0.1222 0.1237 0.2487 2.28e-07 9aza:A
27 1qz9:A 404 351 0.2095 0.2079 0.2393 1.19e-06
28 2dr1:A 381 269 0.1496 0.1575 0.2230 2.76e-06 2dr1:B
29 1m32:B 362 75 0.0549 0.0608 0.2933 1.43e-05 1m32:A, 1m32:C, 1m32:D, 1m32:E, 1m32:F
30 3isl:A 387 143 0.0898 0.0930 0.2517 1.56e-05 3isl:B
31 2yri:A 352 61 0.0474 0.0540 0.3115 8.77e-05 2yri:B, 2yrr:A, 2yrr:B
32 2e7i:A 344 93 0.0648 0.0756 0.2796 1.10e-04 2e7i:B, 2e7j:A, 2e7j:B
33 2bkw:A 381 210 0.1297 0.1365 0.2476 3.60e-04
34 6mfb:D 386 108 0.0723 0.0751 0.2685 3.70e-04 6mfb:A, 6mfb:B, 6mfb:C
35 4n0w:A 416 99 0.0798 0.0769 0.3232 3.96e-04 4n0w:B, 4n0w:C, 4n0w:D, 4ot8:A, 4ot8:C, 4ot8:B, 4ot8:D, 4otl:A, 4otl:B, 4otl:D, 4otl:C
36 6pd2:C 616 222 0.1347 0.0877 0.2432 0.005 6pd1:A, 6pd1:B, 6pd1:D, 6pd2:A, 6pd2:B, 6pd2:D
37 2z9v:A 392 97 0.0599 0.0612 0.2474 0.011 2z9v:B, 2z9w:A, 2z9w:B, 2z9x:A, 2z9x:B
38 8wko:A 425 94 0.0723 0.0682 0.3085 0.016 8wko:B, 8wkr:A, 8wkr:B, 8wkr:C, 8wkr:D
39 6pk3:B 400 370 0.1945 0.1950 0.2108 0.022 6pk1:A, 6pk1:B, 6pk3:A
40 8ovh:A 400 125 0.0823 0.0825 0.2640 0.063 8ovh:B, 8ovh:C, 8ovh:D
41 4bmk:A 398 167 0.0948 0.0955 0.2275 0.20 4bmk:B, 2jg2:A, 2w8j:A, 2w8t:A, 2w8u:A, 2w8v:A, 2w8w:A, 2xbn:A
42 8uxl:A 4232 79 0.0549 0.0052 0.2785 0.33 7u9q:A, 7u9q:D, 7u9q:B, 7u9q:C, 7u9r:A, 7u9r:D, 7u9r:B, 7u9r:C, 7u9t:A, 7u9t:D, 7u9t:B, 7u9t:C, 7u9x:A, 7u9x:B, 7u9x:C, 7u9x:D, 7u9z:A, 7u9z:B, 7u9z:C, 7u9z:D, 7ua1:A, 7ua1:B, 7ua1:C, 7ua1:D, 7ua5:A, 7ua5:B, 7ua5:C, 7ua5:D, 7ua9:A, 7ua9:B, 7ua9:C, 7ua9:D, 8uq2:A, 8uq2:B, 8uq2:C, 8uq2:D, 8uq3:A, 8uq3:B, 8uq3:C, 8uq3:D, 8uq4:A, 8uq4:B, 8uq4:C, 8uq4:D, 8uq5:A, 8uq5:B, 8uq5:C, 8uq5:D, 8uxc:A, 8uxc:B, 8uxc:C, 8uxc:D, 8uxe:A, 8uxe:B, 8uxe:C, 8uxe:D, 8uxf:A, 8uxf:B, 8uxf:C, 8uxf:D, 8uxg:A, 8uxg:B, 8uxg:C, 8uxg:D, 8uxl:B, 8uxl:C, 8uxl:D, 8uxm:A, 8uxm:B, 8uxm:C, 8uxm:D
43 7ua3:A 4443 79 0.0549 0.0050 0.2785 0.35 7ua3:B, 7ua3:C, 7ua3:D, 7ua4:A, 7ua4:B, 7ua4:C, 7ua4:D
44 1qgn:A 398 179 0.0998 0.1005 0.2235 0.36 1i41:A, 1i41:C, 1i41:B, 1i41:D, 1i41:E, 1i41:G, 1i41:F, 1i41:H, 1i41:I, 1i41:K, 1i41:J, 1i41:L, 1i43:A, 1i43:C, 1i43:B, 1i43:D, 1i43:E, 1i43:G, 1i43:F, 1i43:H, 1i43:I, 1i43:K, 1i43:J, 1i43:L, 1i48:A, 1i48:C, 1i48:B, 1i48:D, 1i48:E, 1i48:G, 1i48:F, 1i48:H, 1i48:I, 1i48:K, 1i48:J, 1i48:L, 1qgn:C, 1qgn:B, 1qgn:D, 1qgn:E, 1qgn:G, 1qgn:F, 1qgn:H
45 8uxh:A 4004 79 0.0549 0.0055 0.2785 0.37 8uxh:B, 8uxh:C, 8uxh:D, 8uxi:A, 8uxi:B, 8uxi:C, 8uxi:D
46 7vml:A 4044 79 0.0549 0.0054 0.2785 0.37 7aih:UA, 7am2:UA, 7ane:UA, 5dat:l1, 5gak:r, 6hd7:r, 6j3z:19, 6j40:19, 6j40:39, 5mc6:AZ, 6n8k:s, 6n8l:s, 6n8m:S, 6n8n:S, 6n8o:S, 7nrc:Lt, 6o1o:F, 6o1o:G, 6o1o:H, 6qik:p, 6qtz:p, 6ri5:p, 7rr5:L1, 6rzz:p, 6s05:p, 5t62:S, 5t6r:S, 6tnu:BT, 7vml:B, 7vml:C, 7vml:D, 7vmm:A, 7vmm:B, 7vmm:C, 7vmm:D, 7vmn:A, 7vmn:B, 7vmn:C, 7vmn:D, 7vmo:A, 7vmo:B, 7vmo:C, 7vmo:D, 7vmp:A, 7vmp:B, 7vmp:C, 7vmp:D, 7vmq:A, 7vmq:B, 7vmq:C, 7vmq:D, 7vmr:A, 7vmr:B, 7vmr:C, 7vmr:D, 7vms:A, 7vms:B, 7vms:C, 7vms:D
47 4l0o:H 373 118 0.0748 0.0804 0.2542 0.37 4l0o:A, 4l0o:C, 4l0o:E, 4l0o:G, 4l0o:M, 4l0o:O
48 8dtz:A 4061 79 0.0549 0.0054 0.2785 0.38 8dtz:B, 8dtz:C, 8dtz:D
49 2ch1:A 388 114 0.0599 0.0619 0.2105 0.39 2ch1:D, 2ch1:B, 2ch1:C, 2ch2:A, 2ch2:D, 2ch2:B, 2ch2:C
50 2ctz:A 421 96 0.0549 0.0523 0.2292 0.45 2ctz:B
51 1cs1:D 384 91 0.0648 0.0677 0.2857 0.47
52 1iug:A 348 218 0.1222 0.1408 0.2248 0.73 1iug:B
53 8erb:K 429 123 0.0773 0.0723 0.2520 0.80 8erb:A, 8erb:C, 8erb:B, 8erb:D, 8erb:G, 8erb:H, 8erb:F, 8erb:P, 8erb:I, 8erb:J, 8erb:M, 8erb:E, 8erb:Q, 8erb:N, 8erb:L, 8erj:A, 8erj:B, 8erj:C, 8erj:D, 8erj:E, 8erj:F, 8erj:H, 8erj:G
54 1eu1:A 767 97 0.0798 0.0417 0.3299 0.90
55 2zyj:A 397 48 0.0399 0.0403 0.3333 1.0 3cbf:A, 3cbf:B, 2egy:A, 2egy:B, 2egy:C, 2egy:D, 2z1y:A, 2z1y:B, 2zp7:A, 2zp7:C, 2zp7:B, 2zp7:D, 2zp7:E, 2zp7:F, 2zyj:B
56 3zrq:A 382 119 0.0623 0.0654 0.2101 1.1 3zrp:A, 3zrp:B, 3zrq:B, 3zrr:A, 3zrr:B
57 1fg3:A 354 121 0.0723 0.0819 0.2397 1.2 1fg7:A, 1gew:A, 1gex:A, 1gey:A, 1iji:A
58 6ld8:A 388 137 0.0923 0.0954 0.2701 1.4 6ld8:D, 6ld8:B, 6ld8:C, 6ld9:A, 6ld9:B, 6ld9:C, 6ld9:D, 6lgo:A, 6lgo:B, 6lgo:C, 6lgo:D
59 5w71:A 413 164 0.1122 0.1090 0.2744 1.7 2c7t:A, 2c81:A, 5w71:B
60 8j6n:A 390 121 0.0648 0.0667 0.2149 2.4 8j6n:D, 8j6n:B, 8j6n:C, 8j6n:E, 8j6n:H, 8j6n:J, 8j6n:K, 8j6n:F, 8j6n:G, 8j6n:I, 8j6n:L
61 8wwu:B 492 132 0.0798 0.0650 0.2424 2.6 8wwu:A, 8wwu:C, 8wwu:D, 8wwu:E, 8wwu:F, 8wwv:A, 8wwv:B, 8wwv:C, 8wwv:D, 8wwv:E, 8wwv:F, 8x6z:A, 8x6z:B, 8x6z:C, 8x6z:D, 8x6z:E, 8x6z:F
62 2huf:A 385 175 0.0898 0.0935 0.2057 3.0 2huf:B, 2hui:A, 2hui:B, 2huu:A, 2huu:B
63 6sr6:C 524 141 0.0848 0.0649 0.2411 3.3 4gni:A, 4gni:B, 5mb9:B, 5mb9:A, 6sr6:A, 7z3n:D, 7z3o:D
64 6t8y:BBB 375 67 0.0623 0.0667 0.3731 3.5 6t8y:AAA, 6t8y:CCC, 6t8y:DDD, 6t8z:AAA, 6t8z:BBB, 6t8z:CCC, 6t8z:DDD, 6t92:AAA, 6t92:BBB, 6t92:CCC, 6t92:DDD, 6t94:AAA, 6t94:BBB, 6t94:CCC, 6t94:DDD
65 1dmr:A 779 91 0.0723 0.0372 0.3187 3.7 1dms:A, 2dmr:A, 3dmr:A, 4dmr:A, 1e18:A, 1e5v:A, 1e5v:C, 1e60:A, 1e60:C, 1e61:A, 1e61:C, 1h5n:A, 1h5n:C
66 4m2j:A 382 55 0.0424 0.0445 0.3091 3.9 4m2k:A, 4m2m:A
67 6z1p:Aq 273 30 0.0299 0.0440 0.4000 3.9
68 8j78:I 651 85 0.0574 0.0353 0.2706 4.2 8j78:C, 8j7d:D, 8j7d:F, 8j7d:I, 8j7d:L, 8jaw:A, 8jaw:C, 8jaw:E, 8jaw:F, 8jaw:H, 8jaw:K, 8k2v:A, 8k2v:B, 8k2v:C, 8k2v:D, 8k2v:E, 8k2v:F
69 3pgy:B 404 85 0.0648 0.0644 0.3059 4.3 3pgy:A
70 4b10:A 385 33 0.0349 0.0364 0.4242 6.3 4a95:A, 4a95:B, 4a95:C, 4b10:B, 4b10:C, 4b11:A, 4b11:B, 4b11:C, 4b12:A, 4b12:B, 4b12:C, 4b13:A, 4b13:B, 4b13:C, 4b14:A, 4b14:B, 4b14:C, 6b1l:A, 4bbh:A, 4bbh:B, 4bbh:C, 4c68:A, 4c68:B, 4c68:C, 4cae:A, 4cae:B, 4cae:C, 4caf:A, 4caf:B, 4caf:C, 8fbq:A, 5g1z:A, 5g1z:B, 5g1z:C, 5g22:A, 5g22:B, 5g22:C, 6may:A, 6may:B, 6may:C, 6maz:A, 6maz:B, 6maz:C, 6mb0:A, 6mb0:B, 6mb0:C, 6mb1:A, 6mb1:B, 6mb1:C, 6nxg:A, 6nxg:B, 6nxg:C, 5o48:A, 5o48:B, 5o48:C, 5o4v:A, 5o4v:B, 5o4v:C, 6tw5:AAA, 6tw5:BBB, 6tw5:CCC, 6tw6:AAA, 6tw6:BBB, 6tw6:CCC, 4ufv:A, 4ufv:B, 4ufv:C, 4ufw:A, 4ufw:B, 4ufw:C, 4ufx:A, 4ufx:B, 4ufx:C, 5v0w:A, 5v0w:B, 5v0w:C, 5v0x:A, 5v0x:B, 5v0x:C, 8vka:A, 8vka:B, 8vka:C, 8vkb:A, 8vkb:B, 8vkb:C, 2ync:A, 2ync:B, 2ync:C, 2ynd:A, 2ynd:B, 2ynd:C, 2yne:A, 2yne:B, 2yne:C
71 1vjo:A 377 61 0.0324 0.0345 0.2131 6.3
72 6egr:A 396 163 0.0898 0.0909 0.2209 6.4 5d5s:A, 5e4z:A, 4hf8:A, 3jw9:A, 3jwa:A, 3jwb:A, 5k30:A, 5m3z:A, 3mkj:A, 4oma:A, 6s0c:A
73 3kgw:B 388 71 0.0374 0.0387 0.2113 6.7 3kgw:A, 3kgx:A
74 1cvm:A 353 84 0.0524 0.0595 0.2500 8.2 3amr:A, 3ams:A, 1h6l:A, 1poo:A, 2poo:A, 1qlg:A
75 2x8u:A 399 118 0.0723 0.0727 0.2458 8.5 2x8u:B
76 4kfu:A 205 41 0.0349 0.0683 0.3415 9.2 4kfs:A, 4kft:A, 4kft:B, 4kft:C, 4kft:D, 4kfu:B, 4kfu:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218