BioLiP

>protein
MARRKVRPRLIAELARRVRALREQRERPRDSVRYALDYETLIRPHSGRKLPLRAWVDVRRESRLLQLLGRLPFFGLGRLV
TRKSWLWQHDEPCYWRLTRVRPDYTAQNLDHGKAWGILTFKGKTESEAREIEQVMHHDWRLVPKHEEAAFTSFTPAPEET
PRPVPYPPLLRAMILAERQKNGDPSTEEPMLSLERIRTDPWDYPENQEAKKKT

The query sequence (length=213) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3jd5:j	213	213	1.0000	1.0000	1.0000	5.45e-156	6neq:j, 6nf8:j
2	5aj3:j	213	212	0.8404	0.8404	0.8443	1.07e-120	5aj4:Aj, 6gaw:Aj, 6gaz:Aj, 7nqh:Aj, 7nql:Aj, 7nsi:Aj, 7nsj:Aj, 8oin:Aj, 8oip:Aj, 6ydp:Aj, 6ydw:Aj
3	8any:A0	215	210	0.8263	0.8186	0.8381	1.14e-120	8csp:0, 8csq:0, 8csr:0, 8css:0, 8cst:0, 8csu:0, 7l08:A0, 8oir:Aj, 8ois:Aj, 7p2e:0, 7pnx:0, 7pny:0, 7pnz:0, 7po0:0, 7po1:0, 7po2:0, 7po3:0, 7qi4:A0, 7qi5:A0, 7qi6:A0, 8qrk:0, 8qrl:0, 8qrm:0, 8qrn:0, 6rw4:0, 6rw5:0, 6vlz:A0, 6vmi:A0, 6zm5:A0, 6zm6:A0
4	7pnt:0	216	211	0.8075	0.7963	0.8152	4.11e-118	7a5f:a6, 7a5g:a6, 7a5i:a6, 7a5k:a6, 3j9m:A0, 8k2a:Sj, 6nu2:A0, 6nu3:A0, 7og4:A0, 7pnu:0, 7pnv:0, 7pnw:0, 8xt0:Sj, 8xt2:Sj, 6zs9:A0, 6zsa:A0, 6zsb:A0, 6zsc:A0, 6zsd:A0, 6zse:A0, 6zsg:A0
5	7aor:t	226	107	0.1268	0.1195	0.2523	0.008
6	7pub:Cj	227	113	0.1221	0.1145	0.2301	0.020	6hiv:Cj, 6hiw:Cj, 6hiy:Cj, 7pua:Cj, 6sga:Cj, 6sgb:Cj
7	6xyw:By	76	84	0.0986	0.2763	0.2500	0.079
8	7pkq:z	85	54	0.0939	0.2353	0.3704	0.15
9	7ane:t	226	109	0.1362	0.1283	0.2661	0.19
10	4ob3:A	204	67	0.1080	0.1127	0.3433	0.40	9d6k:A, 8i6n:A, 1ire:A, 4ob0:A, 4ob1:A, 4ob2:A, 1ugp:A, 1ugr:A, 1ugs:A, 3vyh:A, 7w8l:A, 7w8m:A
11	1v29:A	203	61	0.0986	0.1034	0.3443	1.5	2dpp:A, 3hht:A, 7qom:A, 7qop:A, 7qou:A, 7qov:A, 7qoy:A, 7z0v:A
12	6e85:A	331	28	0.0704	0.0453	0.5357	3.2
13	2j8w:A	128	61	0.0892	0.1484	0.3115	3.6	2j8w:B, 2j9b:A, 2j9b:B, 1jaf:A, 1jaf:B
14	1f76:A	336	34	0.0751	0.0476	0.4706	4.2	1f76:B, 1f76:D, 1f76:E, 7t5k:A, 7t5k:B, 7t5y:A, 7t5y:B, 7t6c:A, 7t6c:B, 7t6h:A, 7t6h:B
15	8d8p:A	420	81	0.1080	0.0548	0.2840	5.5	8d8p:B
16	5zb3:A	280	28	0.0563	0.0429	0.4286	5.8	5zb1:A, 5zb3:B
17	3qxe:A	201	58	0.0892	0.0945	0.3276	6.7	3qxe:C, 3qxe:E, 3qxe:G, 3qyg:A, 3qyg:C, 3qyg:E, 3qyg:G, 3qyh:A, 3qyh:C, 3qyh:E, 3qyh:G, 3qz5:A, 3qz5:C, 3qz5:E, 3qz5:G, 3qz9:A, 3qz9:C, 3qz9:E, 3qz9:G
18	4cda:A	127	57	0.0704	0.1181	0.2632	8.8	5agf:A, 4cdv:A, 4cdy:A, 1cgn:A, 1cgo:A, 4cip:A, 4cjg:A, 4cjo:A, 4d4n:A, 4d4x:A, 1e83:A, 1e84:A, 1e85:A, 1e86:A, 5jli:A, 5jp7:A, 5jra:A, 5js5:A, 5jsl:A, 5jt4:A, 5jua:A, 5jve:A, 5nc0:A, 5ngx:A, 4wgy:A, 4wgz:A, 2xl6:A, 2xl8:A, 2xld:A, 2xle:A, 2xlh:A, 2xlm:A, 2xlo:A, 2xlv:A, 2xlw:A, 2xm0:A, 2xm4:A, 2ykz:A, 2yl0:A, 2yl1:A, 2yl3:A, 2yl7:A, 2yld:A, 2ylg:A, 2yli:A, 3zqv:A, 3zqy:A, 3ztm:A, 3ztz:A, 3zwi:A

[Back]