BioLiP

>protein
MALYEEEQVERIEERGKILVSLMYSTQQGGLIVGIIRCVHLAAMDANGYSDPFVKLWLKPKKAKHKTQIKKKTLNPEFNE
EFFYDIKHSDLAKKSLDISVWDYDIGKSNDYIGGCQLGISAKGERLKHWYECLKNKDKKIERWHQLQNE

The query sequence (length=149) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2cm6:A	149	149	1.0000	1.0000	1.0000	6.02e-110	2cm5:A, 2cm6:B, 5lo8:A, 5lo8:B, 5lob:A, 5lob:B, 5lob:C, 5low:A, 5low:B, 5low:C, 5low:H, 5low:I, 5low:J
2	4ldc:A	149	140	0.7114	0.7114	0.7571	6.77e-79
3	3hn8:A	279	138	0.3826	0.2043	0.4130	6.72e-27	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
4	3hn8:A	279	103	0.2819	0.1505	0.4078	1.80e-20	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
5	5h4z:A	129	122	0.2953	0.3411	0.3607	7.85e-24	5h4y:A, 5h4z:B
6	6ank:B	263	137	0.3289	0.1863	0.3577	2.04e-23	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
7	6ank:B	263	107	0.2685	0.1521	0.3738	1.61e-16	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
8	5cch:E	280	107	0.3020	0.1607	0.4206	1.20e-22	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
9	5cch:E	280	144	0.3960	0.2107	0.4097	3.22e-21	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
10	1w15:A	132	135	0.3356	0.3788	0.3704	1.13e-20
11	2uzp:A	142	132	0.3154	0.3310	0.3561	5.38e-19	2uzp:B, 2uzp:C
12	3pfq:A	523	115	0.2953	0.0841	0.3826	7.76e-18	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
13	6uwa:A	187	110	0.2685	0.2139	0.3636	2.31e-16	1dsy:A, 3gpe:A, 2nce:A, 3twy:A, 5w4s:A
14	4lt7:A	128	124	0.2953	0.3438	0.3548	4.65e-16	2k3h:A, 4np9:A, 4ns0:A
15	4lcv:C	129	123	0.2953	0.3411	0.3577	1.06e-15
16	7atp:A	129	92	0.2215	0.2558	0.3587	2.04e-09
17	6bty:B	128	131	0.2685	0.3125	0.3053	2.52e-09	2b3r:A, 2b3r:B, 6btz:A, 6btz:D, 6btz:B, 6btz:C, 6bu0:A, 6bu0:B, 6bu0:C
18	5a50:A	165	107	0.2349	0.2121	0.3271	3.68e-08	5a4x:A, 5a4x:B, 5a50:B, 5a51:A, 5a51:B, 4v29:A, 4v29:B
19	7a1r:A	121	77	0.2148	0.2645	0.4156	1.27e-06	7a1r:B
20	5a52:A	154	103	0.2013	0.1948	0.2913	2.62e-06
21	6nyt:A	135	109	0.1946	0.2148	0.2661	2.12e-04
22	5ue8:A	847	83	0.1477	0.0260	0.2651	0.015	5ue8:B, 1y8f:A
23	1djg:B	561	76	0.1342	0.0357	0.2632	0.033	1djg:A, 1djh:A, 1djh:B, 1dji:A, 1dji:B, 1djw:A, 1djw:B, 1djx:A, 1djx:B, 1djy:A, 1djy:B, 1djz:A, 1djz:B
24	4ihb:E	126	57	0.1141	0.1349	0.2982	0.25	7jof:A, 7jof:B, 7jof:C, 7jof:D
25	3b7y:A	144	102	0.1745	0.1806	0.2549	0.26
26	6zu5:SBB	80	58	0.1141	0.2125	0.2931	0.30
27	5ek8:A	668	77	0.1477	0.0329	0.2857	0.66
28	6kxk:D	553	93	0.1544	0.0416	0.2473	0.68	6kxk:F, 6kxu:A, 6kxu:B, 6kxu:C, 6kxu:D, 6kxu:E, 6kxu:F, 6kxu:G, 6kxu:H
29	3m34:A	632	60	0.1208	0.0285	0.3000	1.0	3m6l:A, 3m7i:A
30	6vkj:A	305	53	0.1342	0.0656	0.3774	1.6
31	3d46:A	405	32	0.0872	0.0321	0.4062	2.0	3box:A, 3box:B, 3cxo:A, 3cxo:B, 3d46:B, 3d46:C, 3d46:D, 3d46:E, 3d46:F, 3d46:G, 3d46:H, 3d47:A, 3d47:B, 3d47:C, 3d47:D, 3d47:E, 3d47:F, 3d47:G, 3d47:H, 2gsh:A, 2gsh:B
32	3nsj:A	530	86	0.1477	0.0415	0.2558	2.5	7pag:A, 5ug7:A, 4y1s:A, 4y1t:A
33	6pmp:C	617	23	0.0671	0.0162	0.4348	3.0	6pmp:A, 6pmp:B, 6pmp:D
34	4h1g:A	670	32	0.0872	0.0194	0.4062	3.7
35	1wuf:A	371	33	0.0738	0.0296	0.3333	4.3	1wuf:B
36	1ekj:G	220	88	0.1544	0.1045	0.2614	5.3	1ekj:A, 1ekj:B, 1ekj:C, 1ekj:D, 1ekj:E, 1ekj:F, 1ekj:H
37	7lxt:H	220	45	0.0872	0.0591	0.2889	9.4	7lxt:V
38	7x6v:A	1381	23	0.0738	0.0080	0.4783	9.6

[Back]