BioLiP

>protein
LVPRGSHMNPKRIRALKSGKQGDGPVVYWMSRDQRAEDNWALLFSRAIAKEANVPVVVVFCLTDEFLEAGIRQYEFMLKG
LQELEVSLSRKKIPSFFLRGDPGEKISRFVKDYNAGTLVTDFSPLRIKNQWIEKVISGISIPFFEVDAHNVVPCWEASQK
HEYAAHTFRPKLYALLPEFLEEFPELEPNSVTPDPLFEPWHFEPGEKAAKKVMESFIADRLDSYGALRNDPTKNMLSNLS
PYLHFGQISSQRVVLEVEKAESNPGSKKAFLDEILIWKEISDNFCYYNPGYDGFESFPSWAKESLNAHRNDVRSHIYTLE
EFEAGKTHDPLWNASQMELLSTGKMHGYTRMYWAKKILEWSESPEKALEIAICLNDRYELDGRDPNGYAGIAWSIGGVHD
RAWGEREVTGKIRYMSYEGCKRKFDVKLYIEKYS

The query sequence (length=434) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4cdn:B	438	438	1.0000	0.9909	0.9909	0.0	8kcm:B, 8oet:B, 8oy3:B, 8oy4:B, 8oy5:B, 8oy6:B, 8oy7:B, 8oy8:B, 8oy9:B, 8oya:B, 8oyb:B, 8oyc:B, 2xrz:B, 7yc7:B, 7ycm:B, 7ycp:B, 7ycr:B, 7yd6:B, 7yd7:B, 7yd8:B, 7ydz:B, 7ye0:B, 7yeb:B, 7yec:B, 7yee:B, 7yei:B, 7yej:B, 7yek:B, 7yel:B, 7yem:B, 5zcw:B
2	4cdn:A	463	463	1.0000	0.9374	0.9374	0.0	4cdm:A, 7f8t:A, 8kcm:A, 5o86:A, 5o8d:A, 5o8e:A, 8oet:A, 8oy3:A, 8oy4:A, 8oy5:A, 8oy6:A, 8oy7:A, 8oy8:A, 8oy9:A, 8oya:A, 8oyb:A, 8oyc:A, 7viw:A, 7vix:A, 7viy:A, 7viz:A, 7vj0:A, 7vj1:A, 7vj2:A, 7vj3:A, 7vj4:A, 7vj5:A, 7vj6:A, 7vj7:A, 7vj8:A, 7vj9:A, 7vja:A, 7vjb:A, 7vjc:A, 7vje:A, 7vjg:A, 7vjh:A, 7vji:A, 7vjj:A, 7vjk:A, 2xry:A, 2xrz:A, 7yc7:A, 7ycm:A, 7ycp:A, 7ycr:A, 7yd6:A, 7yd7:A, 7yd8:A, 7ydz:A, 7ye0:A, 7yeb:A, 7yec:A, 7yee:A, 7yei:A, 7yej:A, 7yek:A, 7yel:A, 7yem:A, 5zcw:A
3	3umv:A	472	460	0.5069	0.4661	0.4783	7.96e-126	3umv:B
4	1dnp:A	469	362	0.2120	0.1962	0.2541	1.60e-13	1dnp:B
5	1qnf:A	475	372	0.1982	0.1811	0.2312	8.60e-13	1owl:A, 1owm:A, 1own:A, 1owo:A, 1owp:A, 1tez:A, 1tez:B, 1tez:C, 1tez:D
6	2e0i:B	431	337	0.1912	0.1926	0.2463	5.46e-09	2e0i:A, 2e0i:C, 2e0i:D
7	2j07:A	419	350	0.1912	0.1981	0.2371	5.64e-08	1iqr:A, 1iqu:A, 2j08:A, 2j09:A
8	3fy4:A	522	382	0.2074	0.1724	0.2356	7.05e-08	3fy4:B, 3fy4:C
9	6k8k:G	490	378	0.2051	0.1816	0.2354	6.12e-07	6k8i:A, 6k8i:B, 6k8k:A, 6k8k:B, 6k8k:D, 6m79:A, 6m79:B, 6m79:C, 6m79:D, 7x0x:D, 7x0x:B, 7x0x:C, 7x0x:A, 7x0y:B, 7x0y:D, 7x0y:C, 7x0y:A, 6x24:A, 6x24:B, 6x24:C, 6x24:D
10	4u63:A	482	362	0.1982	0.1784	0.2376	6.79e-07
11	8p4x:A	526	376	0.1866	0.1540	0.2154	3.24e-06	8p4x:B
12	3cvv:A	519	370	0.1843	0.1541	0.2162	5.20e-06	7ayv:A, 7azt:A, 8c1u:A, 8c69:A, 8c6a:A, 8c6b:A, 8c6c:A, 8c6f:A, 8c6h:A, 3cvu:A, 3cvw:A, 3cvx:A, 3cvy:A, 7qut:A, 2wb2:A, 2wq6:A, 2wq7:A
13	2vtb:A	500	375	0.2051	0.1780	0.2373	2.37e-05	2ijg:X, 2j4d:A, 2j4d:B, 2vtb:B, 2vtb:C, 2vtb:D, 2vtb:E, 2vtb:F
14	6lz3:A	486	160	0.1060	0.0947	0.2875	3.12e-05	6lz3:B, 6lz3:C, 6lz3:D
15	4mlp:C	492	99	0.0668	0.0589	0.2929	3.03e-04	7ej9:A, 7ej9:B, 4i6g:A, 4i6g:B, 6kx8:A, 6kx8:B, 4mlp:A, 4mlp:B, 4mlp:D, 4u8h:A, 4u8h:C, 7v8y:A, 7v8z:A
16	4mlp:C	492	118	0.0714	0.0630	0.2627	3.6	7ej9:A, 7ej9:B, 4i6g:A, 4i6g:B, 6kx8:A, 6kx8:B, 4mlp:A, 4mlp:B, 4mlp:D, 4u8h:A, 4u8h:C, 7v8y:A, 7v8z:A
17	1u3c:A	485	374	0.2051	0.1835	0.2380	0.001	1u3d:A
18	6lz7:A	492	373	0.2120	0.1870	0.2466	0.001
19	6fn0:A	496	137	0.0806	0.0706	0.2555	0.001	6fn2:A, 6fn3:A, 5zm0:A
20	7d1c:A	491	100	0.0599	0.0530	0.2600	0.002	4ct0:A, 7d19:A, 7d19:B, 7dli:A, 7dli:B, 7dli:C, 6kx5:A, 6kx6:A, 6kx6:B, 6kx7:A, 6lue:A, 6lue:B, 7wva:A
21	7d1c:A	491	118	0.0622	0.0550	0.2288	2.3	4ct0:A, 7d19:A, 7d19:B, 7dli:A, 7dli:B, 7dli:C, 6kx5:A, 6kx6:A, 6kx6:B, 6kx7:A, 6lue:A, 6lue:B, 7wva:A
22	6wtb:B	547	397	0.2051	0.1627	0.2242	0.016	8dd7:A, 4gu5:A, 4gu5:B, 4jzy:A, 4jzy:B, 4k03:A, 4k03:B, 7ud0:A, 7ud0:B, 6wtb:A
23	5yko:A	487	138	0.0853	0.0760	0.2681	1.4	5ykn:A
24	6nys:B	679	82	0.0599	0.0383	0.3171	2.8	6nys:A
25	6nys:B	679	119	0.0783	0.0501	0.2857	4.6	6nys:A
26	6pu0:A	480	100	0.0530	0.0479	0.2300	3.6	6ptz:A
27	5izr:C	659	42	0.0300	0.0197	0.3095	3.9
28	5ixc:A	684	42	0.0300	0.0190	0.3095	4.1	5ixc:B, 5izr:A, 5izr:B, 5izr:D
29	7edc:A	236	12	0.0253	0.0466	0.9167	4.2
30	3dty:A	374	61	0.0415	0.0481	0.2951	4.5	3dty:E
31	3fbv:D	425	74	0.0530	0.0541	0.3108	4.7	3fbv:A, 3fbv:B, 3fbv:C, 3fbv:E, 3fbv:F, 3fbv:G, 3fbv:H, 3fbv:I, 3fbv:J, 3fbv:K, 3fbv:L, 3fbv:M, 3fbv:N, 3lj0:A, 3lj0:B, 3lj1:A, 3lj1:B, 3lj2:A, 3lj2:B, 3sdj:A, 3sdj:B, 3sdj:C, 3sdj:D, 3sdj:E, 3sdj:F, 3sdj:G, 3sdj:H, 3sdj:I, 3sdj:J, 3sdj:K, 3sdj:L, 3sdj:M, 3sdj:N
32	2rio:A	396	74	0.0530	0.0581	0.3108	5.3	2rio:B
33	3e78:A	365	82	0.0599	0.0712	0.3171	6.4	3e79:A, 3eki:A
34	8h0m:A	392	40	0.0323	0.0357	0.3500	6.9	8gqr:A, 8gqr:B
35	3nc6:B	389	62	0.0507	0.0566	0.3548	8.8	3nc3:A, 3nc3:B, 3nc5:A, 3nc5:B, 3nc6:A, 3nc7:A, 3nc7:B
36	7mq9:LM	2005	47	0.0346	0.0075	0.3191	9.2
37	7mqa:LM	2041	47	0.0346	0.0073	0.3191	9.2
38	7x3t:V	792	37	0.0369	0.0202	0.4324	9.6	6iro:L, 6jyl:K, 6k1p:K, 7x3w:K, 2y9z:A
39	1o4t:A	115	46	0.0369	0.1391	0.3478	9.9	1o4t:B
40	1mow:A	248	47	0.0369	0.0645	0.3404	9.9	1mow:D, 1mow:G, 1mow:J

[Back]