LSHCGRAAHCEPLRYNVCLGSALPYGATTTLLAGDSDSQEEAHGKLVLWSGLRNAPRCWAVIQPLLCAVYMPKCENDRVE
LPSRTLCQATRGPCAIVERERGWPDFLRCTPDHFPEGCPNEVQNIKFNSSGQCEAPLVRTDNPKSWYEDVEGCGIQCQNP
LFTEAEHQDMHSYIAAFGAVTGLCTLFTLATFVADWRNSNRYPAVILFYVNACFFVGSIGWLAQFMDGARREIVCRADGT
MRFGEPTSSETLSCVIIFVIVYYALMAGVVWFVVLTYAWHTSFKALGTTYQPLSGKTSYFHLLTWSLPFVLTVAILAVAQ
VDGDSVSGICFVGYKNYRYRAGFVLAPIGLVLIVGGYFLIRGVMTLFSIKSNHPGLLSEKAASKINETMLRLGIFGFLAF
GFVLITFSCHFYDFFNQAEWERSFRDYVLCQANVTIGDCEIKNRPSLLVEKINLFAMFGTGIAMSTWVWTKATLLIWRRT
WCRL
The query sequence (length=484) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value | Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 6o3c:A | 484 | 484 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 0.0 | 6ot0:R, 6xbj:R, 6xbk:R, 6xbl:R, 6xbm:R |
| 2 | 5v57:A | 645 | 377 | 0.7562 | 0.5674 | 0.9708 | 0.0 | 1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A |
| 3 | 5v57:A | 645 | 113 | 0.2107 | 0.1581 | 0.9027 | 2.84e-60 | 1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A |
| 4 | 7zi0:A | 593 | 370 | 0.7417 | 0.6054 | 0.9703 | 0.0 | 256b:A, 256b:B, 5l7d:A, 5l7i:A, 5l7i:B, 4o9r:A, 4qim:A, 4qin:A, 1qpu:A, 7zi0:B |
| 5 | 7zi0:A | 593 | 110 | 0.2107 | 0.1720 | 0.9273 | 4.87e-61 | 256b:A, 256b:B, 5l7d:A, 5l7i:A, 5l7i:B, 4o9r:A, 4qim:A, 4qin:A, 1qpu:A, 7zi0:B |
| 6 | 4n4w:A | 457 | 355 | 0.7107 | 0.7527 | 0.9690 | 0.0 | 4jkv:A, 4jkv:B |
| 7 | 6d35:A | 581 | 374 | 0.6157 | 0.5129 | 0.7968 | 0.0 | 6d32:A, 5kzv:A, 5kzy:A, 5kzy:B, 5kzz:A, 1lm3:B, 1lm3:D, 1qq3:A |
| 8 | 6d35:A | 581 | 110 | 0.1839 | 0.1532 | 0.8091 | 7.95e-54 | 6d32:A, 5kzv:A, 5kzy:A, 5kzy:B, 5kzz:A, 1lm3:B, 1lm3:D, 1qq3:A |
| 9 | 8cxo:A | 551 | 247 | 0.5103 | 0.4483 | 1.0000 | 1.30e-178 | |
| 10 | 8cxo:A | 551 | 99 | 0.2004 | 0.1760 | 0.9798 | 4.47e-59 | |
| 11 | 8wm9:A | 320 | 344 | 0.1901 | 0.2875 | 0.2674 | 3.93e-37 | 8wm9:B |
| 12 | 6bd4:A | 379 | 389 | 0.1963 | 0.2507 | 0.2442 | 2.67e-33 | |
| 13 | 6tfb:A | 128 | 116 | 0.0682 | 0.2578 | 0.2845 | 7.79e-05 | 4f0a:A, 6tfb:B |
| 14 | 6c0b:B | 121 | 109 | 0.0620 | 0.2479 | 0.2752 | 0.013 | |
| 15 | 5ury:A | 119 | 110 | 0.0579 | 0.2353 | 0.2545 | 0.41 | 5urz:A |
| 16 | 6z1p:At | 183 | 70 | 0.0393 | 0.1038 | 0.2714 | 2.9 | |
| 17 | 5u77:A | 117 | 24 | 0.0207 | 0.0855 | 0.4167 | 4.6 | |
| 18 | 1ord:A | 730 | 42 | 0.0310 | 0.0205 | 0.3571 | 7.4 | 1c4k:A, 1ord:B |
umich.edu