Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KDVDECSLKPSICGTAVCKNIPGDFECECPEGYRYNLKSKSCEDIDECSENMCAQLCVNYPGGYTCYCDGKKGFKLAQDQ
KSCEVVS

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1z6c:A 87 87 1.0000 1.0000 1.0000 5.12e-59
2 1lmj:A 86 86 0.4138 0.4186 0.4186 4.18e-14
3 1n7d:A 639 73 0.3563 0.0485 0.4247 8.00e-12 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
4 5b4x:B 479 74 0.3103 0.0564 0.3649 1.61e-08 3a7q:B, 5b4x:D, 5b4y:B
5 5b4x:B 479 42 0.2069 0.0376 0.4286 0.018 3a7q:B, 5b4x:D, 5b4y:B
6 6pog:B 236 75 0.3793 0.1398 0.4400 2.60e-08
7 6pog:B 236 81 0.3218 0.1186 0.3457 1.88e-05
8 6pog:B 236 73 0.3218 0.1186 0.3836 1.08e-04
9 7pfp:A 563 74 0.3448 0.0533 0.4054 4.23e-08 7pfp:C, 7q3n:U
10 7pfp:A 563 37 0.1839 0.0284 0.4324 0.091 7pfp:C, 7q3n:U
11 8em7:A 4378 74 0.3103 0.0062 0.3649 1.00e-07 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
12 8em7:A 4378 69 0.2989 0.0059 0.3768 1.23e-05 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
13 8em7:A 4378 55 0.2759 0.0055 0.4364 1.69e-04 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
14 8em7:A 4378 56 0.2299 0.0046 0.3571 0.032 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
15 8em7:A 4378 42 0.1839 0.0037 0.3810 0.039 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
16 8em7:A 4378 66 0.2529 0.0050 0.3333 0.041 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
17 8em7:A 4378 35 0.1724 0.0034 0.4286 0.22 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
18 8em7:A 4378 25 0.1149 0.0023 0.4000 3.5 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
19 8em7:A 4378 33 0.1379 0.0027 0.3636 4.3 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
20 8em4:A 3818 74 0.3103 0.0071 0.3649 1.03e-07 8em4:B
21 8em4:A 3818 69 0.2989 0.0068 0.3768 1.21e-05 8em4:B
22 8em4:A 3818 49 0.2414 0.0055 0.4286 0.014 8em4:B
23 8em4:A 3818 56 0.2299 0.0052 0.3571 0.031 8em4:B
24 8em4:A 3818 42 0.1839 0.0042 0.3810 0.039 8em4:B
25 8em4:A 3818 66 0.2529 0.0058 0.3333 0.045 8em4:B
26 8em4:A 3818 35 0.1724 0.0039 0.4286 0.24 8em4:B
27 8em4:A 3818 25 0.1149 0.0026 0.4000 3.8 8em4:B
28 8em4:A 3818 33 0.1379 0.0031 0.3636 5.0 8em4:B
29 1emn:A 82 76 0.3678 0.3902 0.4211 5.03e-07 1emo:A
30 5ms9:A 177 43 0.2299 0.1130 0.4651 8.87e-07
31 5ms9:A 177 59 0.2184 0.1073 0.3220 0.035
32 2w86:A 147 42 0.1724 0.1020 0.3571 2.74e-05
33 2w86:A 147 28 0.1954 0.1156 0.6071 0.033
34 2w86:A 147 58 0.2529 0.1497 0.3793 0.34
35 2w86:A 147 32 0.1379 0.0816 0.3750 8.6
36 6pol:B 129 73 0.2989 0.2016 0.3562 3.87e-05 6pol:D, 6pol:F
37 6pol:B 129 68 0.3103 0.2093 0.3971 2.83e-04 6pol:D, 6pol:F
38 4d0f:A 125 72 0.3333 0.2320 0.4028 5.78e-05 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
39 4d0f:A 125 36 0.1379 0.0960 0.3333 5.0 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
40 1uzj:A 162 43 0.1954 0.1049 0.3953 5.85e-05 1uzj:B, 1uzj:C, 1uzk:A
41 1uzj:A 162 44 0.1954 0.1049 0.3864 0.004 1uzj:B, 1uzj:C, 1uzk:A
42 1uzj:A 162 66 0.2644 0.1420 0.3485 0.015 1uzj:B, 1uzj:C, 1uzk:A
43 8jxj:A 570 55 0.2759 0.0421 0.4364 2.12e-04 8jxj:B
44 8jxj:A 570 25 0.1149 0.0175 0.4000 3.3 8jxj:B
45 5mwb:A 118 79 0.3793 0.2797 0.4177 3.06e-04
46 5uk5:A 194 72 0.3218 0.1443 0.3889 4.93e-04 2rqz:A, 2rr2:A
47 5uk5:A 194 74 0.2644 0.1186 0.3108 2.5 2rqz:A, 2rr2:A
48 5to3:B 367 47 0.2299 0.0545 0.4255 5.42e-04 1dx5:I, 1dx5:J, 1dx5:K, 1dx5:L, 3gis:X, 3gis:Y, 3gis:Z
49 5to3:B 367 28 0.1609 0.0381 0.5000 2.0 1dx5:I, 1dx5:J, 1dx5:K, 1dx5:L, 3gis:X, 3gis:Y, 3gis:Z
50 2bo2:A 140 88 0.3333 0.2071 0.3295 6.86e-04 2bo2:B, 2bou:A, 7do4:A
51 2bo2:A 140 35 0.1609 0.1000 0.4000 1.3 2bo2:B, 2bou:A, 7do4:A
52 8eph:A 91 85 0.3333 0.3187 0.3412 7.31e-04 1edm:B, 1edm:C, 8eph:C
53 5ckn:A 278 51 0.2069 0.0647 0.3529 0.003 5cis:A, 5ckm:A, 5ckn:D, 1nt0:A, 1nt0:G
54 6f1c:A 291 63 0.2414 0.0722 0.3333 0.004 6f1c:C, 6f1d:A, 6f1h:A, 6f1h:C, 6f39:A, 6f39:B
55 8jxc:A 1337 66 0.2644 0.0172 0.3485 0.006 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
56 4xlw:C 118 69 0.2989 0.2203 0.3768 0.007 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
57 4xlw:C 118 77 0.2989 0.2203 0.3377 6.9 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
58 7alj:A 115 79 0.2759 0.2087 0.3038 0.007
59 7alj:A 115 83 0.3103 0.2348 0.3253 0.67
60 4aqb:A 345 47 0.2184 0.0551 0.4043 0.010 5ckq:A, 3dem:A, 3dem:B
61 4aqb:A 345 56 0.2069 0.0522 0.3214 4.3 5ckq:A, 3dem:A, 3dem:B
62 6l6r:A 610 42 0.1839 0.0262 0.3810 0.044 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
63 1h30:A 391 18 0.1149 0.0256 0.5556 0.067 2c5d:A, 2c5d:B, 4ra0:A, 4ra0:B, 5vxz:A, 5vxz:B
64 5l0t:B 40 27 0.1724 0.3750 0.5556 0.15 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
65 5l0t:B 40 43 0.1839 0.4000 0.3721 0.79 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
66 1szb:A 167 48 0.1839 0.0958 0.3333 0.20 1szb:B
67 1szb:A 167 46 0.1724 0.0898 0.3261 0.51 1szb:B
68 3h5c:B 312 70 0.2299 0.0641 0.2857 0.20
69 3h5c:B 312 31 0.1264 0.0353 0.3548 8.2
70 6f1c:D 276 45 0.1954 0.0616 0.3778 0.33 6f1c:B, 6f1h:D, 6f1h:B, 4lmf:A, 4lmf:B, 4lmf:C, 4lmf:D, 4lor:A, 1nzi:A, 1nzi:B
71 8dvm:A 612 40 0.1494 0.0212 0.3250 0.36 4a0p:A, 8dvl:A, 8dvn:A
72 2bz7:A 102 55 0.2069 0.1765 0.3273 1.6 2bzc:A, 1kdi:A, 1kdj:A
73 2rhp:A 622 41 0.1954 0.0273 0.4146 2.2 1yo8:A
74 8gry:A 597 24 0.1264 0.0184 0.4583 2.7 8ka8:A, 8kc2:A, 7wrh:D, 7wri:A, 7xo4:D, 7xo4:E, 7yv8:A, 7yvu:A
75 2w2m:E 49 30 0.1149 0.2041 0.3333 3.1 2w2n:E, 2w2o:E, 2w2p:E, 2w2q:E
76 5uk5:B 308 34 0.1379 0.0390 0.3529 5.1 4cbz:A, 4cc0:A, 4cc0:B, 4cc1:A, 4cc1:B
77 7w6u:A 597 24 0.1149 0.0168 0.4167 6.1 7w6r:A, 7xby:A
78 5f7q:E 396 13 0.1034 0.0227 0.6923 6.3 5f7p:E, 5f7p:A, 5f7q:C, 5f7q:J, 5f7q:L, 5f7r:E, 5f7r:A
79 6s54:A 453 57 0.1839 0.0353 0.2807 7.5 6s54:B, 6s54:C, 6s54:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218