BioLiP

>protein
KDPDVCTDPVQLTTYAMGVNIYKEGQDVPLKPDAEYPEWLFEMNLGPPKTLEELDPESREYWRRLRKQNIWRHNRLSKNK

The query sequence (length=80) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8k2a:L4	83	80	1.0000	0.9639	1.0000	2.65e-56	8any:l, 6i9r:l, 8k2b:L4, 7l08:l, 7l20:l, 7o9k:l, 7o9m:l, 7odr:l, 7ods:l, 7odt:l, 7og4:l, 8oir:Bc, 8oit:Bc, 7po4:l, 7qi4:l, 7qi5:l, 7qi6:l, 6vlz:l, 6vmi:l, 8xt0:L4, 8xt1:L4, 8xt2:L4, 8xt3:L4, 6zm5:l, 6zm6:l, 6zs9:l, 6zsa:l, 6zsb:l, 6zsc:l, 6zsd:l, 6zse:l, 6zsg:l
2	6ydp:Bq	85	80	0.8500	0.8000	0.8500	1.77e-48	5aj4:Bq, 6gaw:Bq, 6gb2:Bq, 7nqh:Bq, 7nql:Bq, 7nsh:Bq, 7nsi:Bq, 7nsj:Bq, 8oin:Bc, 8oiq:Bc, 6ydw:Bq
3	8pk0:l	72	17	0.2125	0.2361	1.0000	2.62e-06
4	6ywe:i	124	51	0.2250	0.1452	0.3529	0.31	6yws:i, 6ywv:i, 6ywx:i, 6ywy:i
5	8wm6:A	742	19	0.1000	0.0108	0.4211	2.9	8wmj:A, 8wmv:A, 8wmw:A, 7y7b:A, 7y8a:A
6	6ly5:a	742	19	0.1000	0.0108	0.4211	2.9	6l4u:A
7	5oy0:A	751	19	0.1000	0.0107	0.4211	2.9	8am5:a, 8asl:a, 8asp:a, 6hqb:A, 4kt0:A, 4l6v:A, 4l6v:a, 4l6v:1, 6nwa:A, 6nwa:a, 6nwa:H, 7o1v:A, 5oy0:a, 5oy0:1, 7umh:A, 7umh:H, 7umh:a, 6uzv:A, 6uzv:a, 6uzv:1, 6vpv:A, 6vpv:a, 6vpv:1
8	6kmx:aA	717	18	0.1000	0.0112	0.4444	3.5	6kmx:bA, 6kmx:cA
9	6kmw:aA	721	18	0.1000	0.0111	0.4444	3.5	6kmw:bA, 6kmw:cA
10	7qco:A	728	18	0.1000	0.0110	0.4444	3.5	7qco:E, 7qco:e, 7qco:a
11	7dr0:A	739	18	0.1000	0.0108	0.4444	3.5	7dr1:A, 7dr2:aA, 7dr2:bA, 7dr2:cA, 7dr2:dA
12	7yca:A	742	18	0.1000	0.0108	0.4444	3.5	7a4p:A, 7bgi:A, 7blx:A, 8cmo:A, 7d0j:A, 7dz7:A, 7dz8:A, 8h2u:A, 6ijj:A, 6ijo:A, 6jo5:A, 6jo6:A, 7r3k:A, 7wyi:A, 7wzn:A, 7zq9:A, 7zqc:A, 7zqd:A, 7zqd:A2, 6zzx:A, 6zzy:A
13	6k61:A	742	18	0.1000	0.0108	0.4444	3.5	6jeo:aA, 6jeo:bA, 6jeo:cA, 6jeo:dA, 6k61:a, 6tcl:A1, 6tcl:A2, 6tcl:A, 6tcl:AA, 7y3f:A
14	5l8r:A	743	18	0.1000	0.0108	0.4444	3.5	8bcv:A, 8bcw:A, 7dkz:A, 7ew6:A, 7ewk:A, 7f9o:A, 7f9o:e, 8htu:A, 8j6z:A, 8j7a:A, 8j7b:A, 7ksq:A, 7kux:A, 6l35:A, 3lw5:A, 2o01:A, 4rku:A, 7wfd:AA, 7wfe:BA, 7wg5:AA, 7wg5:BA, 8wgh:A, 2wsc:A, 2wse:A, 2wsf:A, 4xk8:A, 4xk8:a, 7xqp:A, 4y28:A, 6yac:A, 6yez:A, 5zji:A, 6zoo:A, 6zxs:A
15	7blz:A	743	18	0.1000	0.0108	0.4444	3.5	6fos:A, 8wey:A, 5zgb:A, 5zgh:A
16	7y5e:AN	745	18	0.1000	0.0107	0.4444	3.5	7y5e:A2, 7y7a:A7, 7y7a:Ao
17	6tra:A	746	18	0.1000	0.0107	0.4444	3.5	4fe1:A, 7fix:A1, 7fix:A2, 7fix:A3, 1jb0:A, 6k33:aA, 6k33:bA, 6k33:cA, 6lu1:A, 7m75:A, 7m76:A, 7m78:A, 3pcq:A, 6pfy:A, 6pfy:G, 6pfy:Y, 6pgk:A, 6pgk:G, 6pgk:Y, 6trc:A, 6trc:a, 6trc:1, 6trd:A, 6trd:a, 6trd:1, 5zf0:A1, 5zf0:A2, 5zf0:A3, 5zf0:A4, 5zf0:A6, 5zf0:A5
18	7s3d:A	749	18	0.1000	0.0107	0.4444	3.5	7s3d:G, 7s3d:a
19	7lx0:G	751	18	0.1000	0.0107	0.4444	3.5	7lx0:a, 7lx0:A, 6pnj:A, 6pnj:G, 6pnj:a
20	6kif:A	751	18	0.1000	0.0107	0.4444	3.5	6kif:G, 6kif:e, 6kig:A, 6kig:G, 6kig:e
21	7f4v:aA	772	18	0.1000	0.0104	0.4444	3.5	7f4v:bA, 7f4v:cA
22	5z98:B	182	25	0.1500	0.0659	0.4800	3.7	5z98:A
23	6igz:A	740	18	0.1000	0.0108	0.4444	5.0	6qph:A, 6rhz:A, 6sl5:A, 6yxr:A
24	5oql:Z	639	63	0.1875	0.0235	0.2381	7.2
25	4n76:A	641	36	0.1750	0.0218	0.3889	8.2	5gq9:A, 3hxm:A
26	5xou:B	574	36	0.1750	0.0244	0.3889	8.7	5xou:A
27	5w45:A	181	22	0.1500	0.0663	0.5455	8.7	6b0b:A, 6b0b:E, 6bbo:A, 6bbo:E, 8fvi:A, 5w45:B
28	4kik:A	619	26	0.1250	0.0162	0.3846	9.7

[Back]