BioLiP

>protein
ISAATIMAATAEYFDTTVEELRGPGKTRALAQSRQIAMYLCRELTDLSLPKIGQAFGRDHTTVMYAQRKILSEMAERREV
FDHVKELTTRIRQRSK

The query sequence (length=96) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3pvp:A	96	96	1.0000	1.0000	1.0000	1.73e-67	3pvp:B, 3pvv:A, 3pvv:B
2	8btg:B	335	93	0.4062	0.1164	0.4194	1.67e-18	8btg:A, 8btg:C, 8btg:D, 8btg:E, 8btg:F, 8btg:G, 8bv3:A, 8bv3:B, 8bv3:C, 8bv3:D, 8bv3:E
3	1j1v:A	94	71	0.3542	0.3617	0.4789	1.22e-16
4	1l8q:A	321	80	0.3021	0.0903	0.3625	2.87e-09	2hcb:A, 2hcb:B, 2hcb:C, 2hcb:D, 3r8f:A, 3r8f:B, 3r8f:C, 3r8f:D
5	7mq8:LL	510	67	0.1771	0.0333	0.2537	0.26	7mq9:LL
6	6pxs:A	370	42	0.1771	0.0459	0.4048	0.79	6pxs:B, 6pxs:C, 6pxs:D
7	8qp8:A	1918	40	0.1146	0.0057	0.2750	2.5
8	8q7x:A	1914	40	0.1146	0.0057	0.2750	2.6
9	7abg:A	2174	40	0.1146	0.0051	0.2750	2.6	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
10	8y6o:C	2227	40	0.1146	0.0049	0.2750	2.7	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
11	8i0p:A	2149	40	0.1146	0.0051	0.2750	2.7	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
12	5z56:A	2232	40	0.1146	0.0049	0.2750	2.8	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
13	8c6j:A	2261	40	0.1146	0.0049	0.2750	2.8	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
14	5z57:A	1978	40	0.1146	0.0056	0.2750	2.9
15	8h6k:5B	2253	40	0.1146	0.0049	0.2750	3.0	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
16	5hzg:A	257	46	0.1875	0.0700	0.3913	3.5	5hzg:E
17	7dco:A	2205	40	0.1250	0.0054	0.3000	6.5	7b9v:A, 5gm6:A, 3jcm:A, 5lj5:A, 5zwm:A, 5zwo:A
18	5lqw:A	2130	40	0.1250	0.0056	0.3000	6.5
19	5nrl:A	2216	40	0.1250	0.0054	0.3000	6.5	6bk8:A, 6exn:A, 7fju:A, 7fjv:A, 7fjw:A, 7fjy:A, 7fjz:A, 7fk1:A, 7fk2:A, 7fk3:A, 7fk4:A, 7fk6:A, 7fka:A, 7fkh:A, 7fkj:A, 7fkk:A, 7fkl:A, 7fkn:A, 7fko:A, 7fkp:A, 7fkr:A, 7fkt:A, 7fkv:A, 7fkw:A, 7fkx:A, 7fl1:A, 7fl3:A, 7fl6:A, 7fl9:A, 7fla:A, 7fld:A, 7fle:A, 7flf:A, 7flg:A, 7fli:A, 7flk:A, 7fll:A, 7flm:A, 7flp:A, 7flr:A, 7flu:A, 7flx:A, 7fly:A, 7fm7:A, 7fmb:A, 7fmf:A, 7fmg:A, 7fmi:A, 7fmk:A, 7fml:A, 7fmo:A, 7fmq:A, 7fms:A, 7fmx:A, 7fmy:A, 7fn1:A, 7fn2:A, 7fn4:A, 7fne:A, 7fno:A, 7fnq:A, 7fns:A, 7fnu:A, 7fny:A, 7fo3:A, 7fo4:A, 7fo6:A, 7fo8:A, 7fok:A, 7fol:A, 7fon:A, 7foo:A, 7foq:A, 7for:A, 7foy:A, 7fp0:A, 7fp1:A, 7fp2:A, 7fp3:A, 7fp8:A, 7fpb:A, 7fpd:A, 7fpj:A, 5gap:A, 5lj3:A, 5qy4:A, 5qy6:A, 5qy8:A, 5qy9:A, 5qya:A, 5qyb:A, 5qyc:A, 5qyd:A, 5qye:A, 5qyg:A, 5qyh:A, 5r0b:A, 5r0d:A, 5r0e:A, 5r0f:A, 5r0g:A, 5r0h:A, 5r0i:A, 5r0j:A, 5r0l:A, 5r0m:A, 5st1:A, 5st3:A, 5st9:A, 5stb:A, 5stc:A, 5stn:A, 5stq:A, 5str:A, 5stu:A, 5stz:A, 5su4:A, 5su6:A, 5su8:A, 5sub:A, 5suc:A, 5sue:A, 5sug:A, 5wsg:A, 5ylz:A
20	5gan:A	2196	40	0.1250	0.0055	0.3000	6.8	5gam:A, 5mps:A, 5mq0:A
21	6j6g:A	1913	40	0.1250	0.0063	0.3000	7.0	5gmk:A, 6j6h:A, 6j6n:A, 6j6q:A, 5y88:A
22	3jb9:A	1964	40	0.1146	0.0056	0.2750	7.4
23	6hyp:A	2272	60	0.1667	0.0070	0.2667	7.7
24	7w1m:E	1226	65	0.1562	0.0122	0.2308	8.3	6wg3:E, 6wge:E
25	7wge:A	698	53	0.1458	0.0201	0.2642	9.2
26	6kji:A	351	42	0.1458	0.0399	0.3333	9.4	6kji:B, 6kji:C

[Back]