Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
IFSVDKVRADFPVLSREVNGLPLAYLDSAASAQKPSQVIDAEAEFYRHGYAAVHRGIHTLSAQATEKMENVRKRASLFIN
ARSAEELVFVRGTTEGINLVANSWGNSNVRAGDNIIISQMEHHANIVPWQMLCARVGAELRVIPLNPDGTLQLETLPTLF
DEKTRLLAITHVSNVLGTENPLAEMITLAHQHGAKVLVDGAQAVMHHPVDVQALDCDFYVFSGHKLYGPTGIGILYVKEA
LLQEMPPWEGGGSMIATVSLSEGTTWTKAPWRFEAGTPNTGGIIGLGAALEYVSALGLNNIAEYEQNLMHYALSQLESVP
DLTLYGPQNRLGVIAFNLGKHHAYDVGSFLDNYGIAVRTGHHCAMPLMAYYNVPAMCRASLAMYNTHEEVDRLVTGLQRI
HRLLG

The query sequence (length=405) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6ndn:A 406 404 0.9975 0.9951 1.0000 0.0 1c0n:A, 5db5:A, 5db5:B, 1i29:A, 1jf9:A, 1kmj:A, 1kmk:A, 6mr2:A, 6mr6:A, 6mre:A, 6mrh:A, 6mri:A, 6o10:A, 6o11:A, 6o12:A, 6o13:A, 7rrn:A, 7ruj:A, 7rw3:A, 6uy5:A, 6uy5:B
2 7cep:A 414 398 0.4765 0.4662 0.4849 1.16e-145 7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
3 1t3i:A 406 402 0.4815 0.4803 0.4851 2.10e-134 1t3i:B
4 8odq:D 410 407 0.4568 0.4512 0.4545 2.91e-121 8odq:B
5 5ft8:A 401 404 0.4296 0.4339 0.4307 1.65e-109 5ft4:A, 5ft4:B, 5ft5:A, 5ft5:B, 5ft6:A, 5ft6:B, 5ft8:C, 5ft8:E, 5ft8:G, 5ft8:I, 5ft8:K, 5ft8:M, 5ft8:O, 4lw2:A, 4lw2:B, 4lw2:C, 4lw4:A, 4lw4:B
6 6a6e:A 422 406 0.4074 0.3910 0.4064 4.25e-102 6a6e:B, 6a6e:C, 6a6e:D, 6a6g:A, 6a6g:B
7 7tlm:A 415 406 0.3877 0.3783 0.3867 6.02e-102 7tlp:B, 7tlp:C, 7tlp:D, 7tlp:E, 7tlp:F, 7tlq:A, 7tlq:B, 7tlr:A, 7tlr:B
8 7tlp:A 391 404 0.3704 0.3836 0.3713 1.40e-93
9 5b7u:A 402 400 0.3901 0.3930 0.3950 1.24e-88 5b7u:B, 5b87:A, 5b87:B, 5b89:A, 5b89:B
10 1ecx:B 365 387 0.2494 0.2767 0.2610 1.44e-31 1ecx:A, 1eg5:A, 1eg5:B
11 6nzu:A 402 400 0.2395 0.2413 0.2425 2.31e-25 6nzu:E, 8pk8:A, 8pk9:A, 8pka:A, 7rtk:A, 8tvt:A, 6uxe:A, 6w1d:A, 6wi2:A, 6wih:A, 5wkp:A, 5wkp:E, 5wlw:A, 5wlw:E
12 4eb5:A 379 388 0.2469 0.2639 0.2577 2.56e-25 4eb5:B, 4eb7:A, 4eb7:B, 4hvk:A, 4r5f:A
13 5wt6:A 366 385 0.2494 0.2760 0.2623 1.16e-24 7cet:A, 7ceu:A, 6kg0:A, 6kg1:A, 5wt2:A, 5wt4:A, 7xeq:A, 7xes:A
14 5zss:A 388 404 0.2568 0.2680 0.2574 7.73e-23
15 3lvm:B 394 225 0.1778 0.1827 0.3200 3.81e-22 3lvj:A, 3lvj:B, 3lvk:A, 3lvl:B, 3lvm:A, 1p3w:B, 1p3w:A
16 6m4j:A 347 292 0.1852 0.2161 0.2568 2.17e-21 6m4j:B
17 5wgb:A 291 293 0.1778 0.2474 0.2457 5.48e-19
18 1n31:A 386 259 0.2000 0.2098 0.3127 1.72e-17 1elq:A, 1elq:B, 1elu:A, 1elu:B, 1n2t:A, 1n2t:B, 1n31:B
19 3vax:A 358 240 0.1728 0.1955 0.2917 4.22e-14 3vax:B
20 3a9y:A 403 315 0.2099 0.2109 0.2698 5.45e-13 3a9x:A, 3a9x:B, 3a9y:B, 3a9z:A, 3a9z:B
21 8irk:A 379 229 0.1481 0.1583 0.2620 7.68e-12 8irk:B, 8irk:C, 8irk:D, 8iry:A, 8iry:B, 8iry:C, 8iry:D, 8irz:A, 8irz:B, 8is0:A, 8is0:B
22 3gzc:A 403 256 0.1802 0.1811 0.2852 7.70e-12 3gzc:B, 3gzd:A, 3gzd:B, 3gzd:C, 3gzd:D
23 5hh9:A 390 317 0.1802 0.1872 0.2303 1.57e-10 5hh9:B, 5i90:A, 5i90:B
24 1m32:B 362 137 0.0864 0.0967 0.2555 1.52e-04 1m32:A, 1m32:C, 1m32:D, 1m32:E, 1m32:F
25 5v1x:D 447 77 0.0543 0.0492 0.2857 2.04e-04 5v12:F, 5v12:B, 5v1x:C, 5v1x:A, 5v1x:B
26 2ch1:A 388 100 0.0716 0.0747 0.2900 4.82e-04 2ch1:D, 2ch1:B, 2ch1:C, 2ch2:A, 2ch2:D, 2ch2:B, 2ch2:C
27 9azb:A 396 186 0.1037 0.1061 0.2258 4.88e-04 9aza:A
28 2e7i:A 344 133 0.0790 0.0930 0.2406 6.18e-04 2e7i:B, 2e7j:A, 2e7j:B
29 2z9v:A 392 133 0.0963 0.0995 0.2932 0.001 2z9v:B, 2z9w:A, 2z9w:B, 2z9x:A, 2z9x:B
30 1qz9:A 404 95 0.0617 0.0619 0.2632 0.002
31 3zrq:A 382 102 0.0568 0.0602 0.2255 0.003 3zrp:A, 3zrp:B, 3zrq:B, 3zrr:A, 3zrr:B
32 6pd2:C 616 101 0.0691 0.0455 0.2772 0.003 6pd1:A, 6pd1:B, 6pd1:D, 6pd2:A, 6pd2:B, 6pd2:D
33 5x6b:J 377 135 0.0864 0.0928 0.2593 0.003 5x6b:I
34 8ovh:A 400 106 0.0667 0.0675 0.2547 0.003 8ovh:B, 8ovh:C, 8ovh:D
35 4bmk:A 398 118 0.0840 0.0854 0.2881 0.009 4bmk:B, 2jg2:A, 2w8j:A, 2w8t:A, 2w8u:A, 2w8v:A, 2w8w:A, 2xbn:A
36 2x8u:A 399 156 0.1062 0.1078 0.2756 0.030 2x8u:B
37 1j04:A 387 115 0.0815 0.0853 0.2870 0.045 4cbr:A, 4cbs:A, 5f9s:A, 5f9s:B, 1h0c:A, 5hhy:A, 5hhy:B, 5luc:A, 5luc:B, 5luc:E, 5luc:G, 5luc:M, 5luc:N, 5luc:S, 5luc:T, 5ofy:A, 5og0:A, 6rv0:A, 6rv1:A, 2yob:A, 2yob:B
38 1vjo:A 377 121 0.0741 0.0796 0.2479 0.085
39 2dr1:A 381 78 0.0543 0.0577 0.2821 0.098 2dr1:B
40 2huf:A 385 123 0.0790 0.0831 0.2602 0.44 2huf:B, 2hui:A, 2hui:B, 2huu:A, 2huu:B
41 6pk3:B 400 145 0.0889 0.0900 0.2483 0.68 6pk1:A, 6pk1:B, 6pk3:A
42 6mfb:D 386 114 0.0593 0.0622 0.2105 1.1 6mfb:A, 6mfb:B, 6mfb:C
43 3hqt:B 386 42 0.0296 0.0311 0.2857 1.3 3hqt:A, 3kki:A, 3kki:B, 2wk8:A, 2wk9:A, 2wk9:B, 2wka:A, 2wka:B
44 2yta:A 41 38 0.0321 0.3171 0.3421 1.3
45 2wk8:B 364 42 0.0296 0.0330 0.2857 1.4
46 7bkx:AAA 155 35 0.0222 0.0581 0.2571 1.6 8f0v:A, 4nyq:A, 7q02:A
47 2r5c:B 419 92 0.0642 0.0621 0.2826 1.8 2r5e:A, 2r5e:B, 1yiy:A, 1yiy:B
48 8im8:A 557 104 0.0667 0.0485 0.2596 1.9 8im8:B, 8im8:C, 8im8:D
49 1bag:A 425 32 0.0370 0.0353 0.4688 2.6 3dc0:A, 1ua7:A
50 4uqv:G 429 146 0.0840 0.0793 0.2329 2.8 4uqv:A, 4uqv:B, 4uqv:C, 4uqv:D, 4uqv:E, 4uqv:F, 4uqv:H, 4uqv:I, 4uqv:J, 4uqv:K, 4uqv:L
51 3kgw:B 388 115 0.0840 0.0876 0.2957 2.9 3kgw:A, 3kgx:A
52 5fp2:A 499 98 0.0691 0.0561 0.2857 3.3
53 8t7j:A 365 159 0.0864 0.0959 0.2201 3.4 8t7j:B, 8t7j:C, 8t7j:D
54 6hrh:A 429 40 0.0346 0.0326 0.3500 3.4 6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
55 3k8k:A 650 38 0.0370 0.0231 0.3947 4.7 6bs6:A, 6bs6:B, 3k8k:B, 3k8l:A, 3k8l:B, 3k8m:A, 3k8m:B
56 6i34:B 954 68 0.0469 0.0199 0.2794 5.7 6i33:A, 6i34:A, 6i34:C, 6i34:D, 6i35:A, 6i35:B, 6i35:C, 6i35:D
57 2z1k:A 474 30 0.0272 0.0232 0.3667 7.9 2z1k:B, 2z1k:C, 2z1k:D
58 2ctz:A 421 90 0.0543 0.0523 0.2444 8.4 2ctz:B
59 8w7x:A 225 74 0.0519 0.0933 0.2838 8.5 8w7x:B, 8w7x:C, 8w7x:D
60 8om2:U 237 50 0.0444 0.0759 0.3600 9.5 8d8k:U, 8d8l:U, 5mrc:UU, 5mre:UU, 5mrf:UU, 8om3:U, 8om4:U
61 6hyp:A 2272 60 0.0370 0.0066 0.2500 9.7

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218