BioLiP

>protein
HYPRPEGCSSPPNAVSVGLHMDLYNYPYLYVKGQCWNPEYQDPNFPRYGYKKYGSFGSSDHVNGKISWDHNEFKEGCKPI
MARLPTAYNYPAKITFSNFTMVLSGYFKPKSTGLYKFEIHADDFILFNFGSKNAFECCNREESIDNFGPYVAYAMWPNEA
DQELEVYLFEDSYYPIRLFYNNRDYHSKFMVGFYPPNTEEITYDFDGYLYMLDDTGNEC

The query sequence (length=219) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6y98:A	225	221	0.9909	0.9644	0.9819	6.86e-162	4cp0:A, 4cp1:A, 4cp2:A
2	6y9j:A	231	218	0.4658	0.4416	0.4679	4.07e-62	4a3x:A, 4af9:A, 4afa:A, 4afb:A, 4afc:A, 4asl:A, 4d3w:A
3	4coy:A	232	217	0.4292	0.4052	0.4332	7.86e-55	4cou:A, 4cov:A, 4cow:A, 4coz:A
4	4gq7:A	220	187	0.2557	0.2545	0.2995	3.25e-16	4lhk:A, 4lhk:B
5	6hos:A	213	136	0.1963	0.2019	0.3162	1.35e-11	6hos:B
6	2xjp:A	258	131	0.1689	0.1434	0.2824	1.73e-11	4lhn:A, 2xjr:A, 2xjs:A, 2xjt:A, 2xju:A, 2xjv:A
7	5a3l:A	209	146	0.1963	0.2057	0.2945	3.29e-09	5a3l:B, 5a3l:C, 5a3l:D, 5a3m:A, 5a3m:B, 5a3m:C, 5a3m:D
8	8kgn:A	1190	47	0.0731	0.0134	0.3404	2.3	8j9v:A, 8j9v:B, 8j9w:B, 8j9w:A, 8j9x:A, 8j9x:B, 8ja1:A, 8ja2:A, 8kgm:A, 8kgm:B, 8kgn:B, 8kgq:A, 8kgq:B, 8kgr:A, 8kgr:B, 8kgs:A, 8kgt:A, 8wwo:A, 8wwo:B, 8wwo:C, 8wwo:D, 8xrf:A, 8xrf:B, 8xrg:A, 8xrh:A, 8xri:A, 8xri:B, 8yge:A, 8yge:B
9	2qlt:A	251	29	0.0594	0.0518	0.4483	4.5
10	5min:B	453	65	0.0913	0.0442	0.3077	5.1	1c9u:A, 1c9u:B, 1cq1:A, 1cq1:B, 1cru:A, 1cru:B, 5min:A, 1qbi:A, 1qbi:B, 8re0:A, 8re0:B, 8rfk:A, 8rfk:B, 8rg1:A, 8rg1:B
11	1qjs:A	408	58	0.0776	0.0417	0.2931	5.4	1qhu:A, 1qjs:B

[Back]