BioLiP

>protein
HNPYYFHSQGLRSRHESGEGEVKYLERFTERTELLRGIENYRVVILEANPNTFVLPYHKDAESVIVVTRGRATLTFVSQE
RRESFNLEYGDVIRVPAGATEYVINQDSNERLEMVKLLQPVNNPGQFREYYAAGAQSTESYLRVFSNDILVAALNTPRDR
LERFFDQQEQREGVIIRASQEKLRALSQGPISLKSQRSSYSNQFGQFFEACPEEHRQLQEMDVLVNYAEIKRGAMMVPHY
NSKATVVVYVVEGTGRFEMACPHDQFQKVTARLARGDIFVIPAGHPIAITASQNENLRLVGFGINGKNNQRNFLAGQNNI
INQLEREAKELSFNMPREEIEEIFERQVESYFVPMERQ

The query sequence (length=358) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5e1r:C	358	358	0.9944	0.9944	0.9944	0.0	5e1r:A, 5e1r:B, 5e1r:D, 5e1r:E, 5e1r:F
2	6l4c:C	353	354	0.5251	0.5326	0.5311	1.76e-138
3	6km8:A	345	356	0.5475	0.5681	0.5506	2.82e-137
4	6l4c:B	373	374	0.5279	0.5067	0.5053	9.87e-135	6l4c:A
5	6l4m:A	357	359	0.5056	0.5070	0.5042	2.19e-132
6	5vf5:A	370	361	0.5000	0.4838	0.4958	2.97e-128
7	5yjs:A	370	369	0.5084	0.4919	0.4932	8.85e-128	5yjs:B
8	5cad:A	379	371	0.4441	0.4195	0.4286	1.84e-108
9	2ea7:A	390	380	0.3799	0.3487	0.3579	2.23e-90	2ea7:B, 2ea7:C, 2eaa:A, 2eaa:B, 2eaa:C
10	4lej:A	355	351	0.4078	0.4113	0.4160	5.45e-89
11	6v7g:A	357	356	0.3743	0.3754	0.3764	1.68e-87	1dgr:X, 1dgr:V, 1dgr:N, 1dgw:X, 6v7j:A, 6v7j:B, 6v7j:C, 6v7l:A, 6v7l:B, 6v7l:C
12	3fz3:A	388	348	0.2095	0.1933	0.2155	6.91e-09	3fz3:D, 3fz3:E
13	2d5f:B	385	274	0.1676	0.1558	0.2190	4.50e-08	2d5f:A, 2d5h:A, 2d5h:C, 2d5h:D, 2d5h:E, 2d5h:F, 1od5:A, 1od5:B
14	2d5f:B	385	94	0.0754	0.0701	0.2872	0.003	2d5f:A, 2d5h:A, 2d5h:C, 2d5h:D, 2d5h:E, 2d5h:F, 1od5:A, 1od5:B
15	5wxu:B	400	381	0.2374	0.2125	0.2231	3.44e-06	5wxu:A, 5wxu:D, 5wxu:F, 5wxu:C, 5wxu:E
16	3fz3:B	410	164	0.1117	0.0976	0.2439	0.002	3fz3:C, 3fz3:F
17	3fz3:B	410	117	0.0810	0.0707	0.2479	0.002	3fz3:C, 3fz3:F
18	2evx:A	382	330	0.1704	0.1597	0.1848	0.003
19	6nwo:D	165	66	0.0531	0.1152	0.2879	0.14	6nwh:A, 6nwh:B, 6nwj:A, 6nwj:B, 6nwm:A, 6nwm:B, 6nx3:A, 6nx3:B, 6nx3:C, 6nx3:D, 6nx3:E, 6nx3:F
20	4ccl:B	372	121	0.0894	0.0860	0.2645	0.14	4ccl:A, 4lit:A, 4liv:A, 4nub:A
21	5i8s:A	179	118	0.0754	0.1508	0.2288	0.18	5i8t:A, 5i8y:A, 5i91:A, 5i93:A
22	5fq0:C	109	61	0.0531	0.1743	0.3115	0.44
23	6l9i:A	338	106	0.0754	0.0799	0.2547	0.51	6l9i:B, 6l9i:C, 6l9i:D, 6l9i:E, 6l9i:F
24	5lhk:A	455	87	0.0670	0.0527	0.2759	0.57
25	7jxg:A	178	38	0.0307	0.0618	0.2895	1.6	4qgn:A
26	6hm1:A	386	99	0.0782	0.0725	0.2828	2.2
27	3i7h:A	1114	70	0.0559	0.0180	0.2857	2.5	4a0b:A, 9bbe:A, 9bbg:A, 9bbh:A, 9bbi:A, 6dsz:A, 3i7k:A, 3i7l:A, 3i7n:A, 3i7o:A, 3i7p:A, 3i89:A, 3i8c:A, 3i8e:A, 3i8e:B
28	4f30:A	521	62	0.0531	0.0365	0.3065	2.6	8doc:A, 4f2z:A, 4f2z:E, 4f3a:A, 4f3d:A, 4f3d:B, 3fsn:A, 3fsn:B, 7k88:B, 7k89:A, 7k89:B, 7k8g:B, 7l0e:A, 7l0e:B, 4rsc:A, 4rsc:B, 4rse:A, 4rse:B, 4ryx:A, 4ryy:A, 4ryy:B, 4ryz:A, 4ryz:B, 5ul5:A, 5ul5:B, 5ulg:A, 5ulg:B, 4zhk:A, 4zhk:B
29	8tl6:A	798	72	0.0559	0.0251	0.2778	2.6	8g46:A
30	8bu1:D	827	72	0.0559	0.0242	0.2778	2.6	8bu1:A, 8bu1:G, 8bu2:A, 8bu2:D, 8bu2:G, 8bu3:A, 8bu3:D, 8bu3:G, 8bu4:A, 8bu4:D, 8bu4:G, 8bu5:A, 8bu5:D, 8bu5:G, 8bu6:G, 8bu6:D, 8bu6:A, 8bu7:A, 8bu7:D, 8bu7:G, 8bua:A, 8bua:D, 8bua:G, 8bub:A, 8bub:D, 8bub:G, 8buc:A, 8buc:D, 8buc:G, 8bud:A, 8bud:D, 8bud:G, 8bue:A, 8bue:D, 8bue:G, 8buf:D, 8bug:A, 8bug:D, 8bug:G, 8buh:A, 8buh:D, 8buh:G, 8bui:A, 8bui:D, 8bui:G, 8buj:A, 8buj:G, 8buk:D, 8bul:A, 8bul:D, 8bul:G, 8bum:A, 8bum:D, 8bum:G, 8bun:A, 8bun:D, 8bun:G, 8buo:A, 8buo:D, 8buo:G, 8bup:A, 8bup:D, 8bup:G, 8buq:A, 8buq:D, 8buq:G, 8bur:D, 8bur:A, 8bur:G, 8bus:D, 8bus:A, 8bus:G, 8but:A, 8but:D, 8but:G, 6td3:A, 6td3:D, 6td3:G
31	2vqa:A	356	71	0.0531	0.0534	0.2676	2.8	2vqa:B, 2vqa:C
32	2vqa:A	356	76	0.0531	0.0534	0.2500	3.1	2vqa:B, 2vqa:C
33	2et1:A	201	72	0.0559	0.0995	0.2778	3.9	2et7:A, 2ete:A, 2ete:B, 1fi2:A
34	6ecx:A	283	122	0.0894	0.1131	0.2623	4.3	6ect:A
35	7k88:A	501	53	0.0475	0.0339	0.3208	4.5	7k8g:A, 3kvc:A, 3kvc:B
36	7nfc:C	477	69	0.0559	0.0419	0.2899	4.7
37	7ukn:A	1059	69	0.0559	0.0189	0.2899	4.7
38	5oyj:C	223	104	0.0754	0.1211	0.2596	6.4
39	3nl1:A	366	57	0.0475	0.0464	0.2982	6.4	4fag:A, 4fah:A, 4fbf:A, 3njz:A, 3nkt:A, 3nst:A, 3nvc:A, 3nw4:A, 2phd:A, 2phd:B, 2phd:C, 2phd:D
40	1fje:B	175	29	0.0335	0.0686	0.4138	6.5	1rkj:A
41	8tc8:A	435	48	0.0447	0.0368	0.3333	8.8	8h53:A, 8h53:B, 8h53:C, 8h53:D, 8tc8:B, 8tc8:C, 8tc8:D, 8tc9:A, 8tc9:B, 8tc9:C, 8tc9:D
42	5dx6:B	557	40	0.0279	0.0180	0.2500	9.8	5d6r:B, 5d6r:M, 5dx6:A, 1ozf:A, 1ozf:B, 1ozg:A, 1ozg:B, 1ozh:A, 1ozh:B, 1ozh:C, 1ozh:D, 5wdg:A, 5wdg:B

[Back]