Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
HHHSSGLVPRGSHMTAIREIRLSEPESAQAALLALECAQRYAEPDSADFLADAAVLAHDLPRAVRREVERARLDDRLHAL
VVRGNDVDQDALGPTPPHWRQARTAASRRYGFLLVLYASLLGDVVGWATQQDGRVVTDVLPIEGQEDSLVSSSSSVELGW
HTEDAFSPYRADYVGLFSLRNPDSVATTVAGLDPDLVGPAVVDVLFGERFHIRPDNSHSDYFAGIVEAVENPRAVSILRG
HRDAPQLCVDSDFTTAVDGDAEAAGALDTLIKHLGGALYEVVLGPGDVAFLDNRNVVHGRRPFRARFDGTDRWLKRINVT
ADLRKSRAARRDAQARVLGEA

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7y5f:B 341 341 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7vgn:A, 7y5f:A, 7y5i:A, 7y5i:B, 7y5p:A, 7y5p:B, 7yhe:A, 7yhe:B, 7yw9:A
2 6alm:A 338 333 0.6012 0.6065 0.6156 4.69e-118 6aln:A, 6alo:A, 6alp:A, 6alq:A, 6alr:A, 6dax:A, 6daz:A, 6db2:A, 9eqf:A, 6mp9:A, 2wbo:A, 2wbp:A, 2wbq:A, 6y0n:A, 6y12:A
3 6mp8:A 308 322 0.5748 0.6364 0.6087 1.61e-109
4 6daw:A 342 342 0.4399 0.4386 0.4386 3.03e-73 6daw:B
5 4m25:B 317 319 0.4076 0.4385 0.4357 5.77e-71 4m25:C, 4m25:D, 4m26:B, 4m27:B, 4m2f:B, 4m2g:B, 4m2i:B, 4m2i:C, 4m2i:D, 4ne0:B, 4ne0:D
6 4ne0:A 337 331 0.4135 0.4184 0.4260 2.33e-70 4m25:A, 4m26:A, 4m26:C, 4m26:D, 4m27:A, 4m27:C, 4m27:D, 4m2c:B, 4m2c:C, 4m2c:D, 4m2e:B, 4m2e:C, 4m2e:D, 4m2f:A, 4m2f:C, 4m2f:D, 4m2g:A, 4m2g:C, 4m2g:D, 4m2i:A, 4ne0:C
7 2og6:A 323 311 0.3255 0.3437 0.3569 2.82e-32 2og7:A
8 6f2a:C 326 245 0.2258 0.2362 0.3143 1.87e-19 6f2a:A, 6f2a:B, 6f2a:D, 6f2b:A, 6f2b:B, 6f2b:C, 6f2b:D, 6f6j:A, 6f6j:B, 6f6j:C, 6f6j:D
9 6eur:B 328 294 0.2229 0.2317 0.2585 2.44e-18 6exf:B
10 6euo:C 354 299 0.2317 0.2232 0.2642 1.23e-17 6euo:A, 6euo:B, 6euo:D, 6eur:A, 6eur:C, 6eur:D, 6exf:A, 6exf:C, 6exf:D, 6exh:A, 6exh:B, 6exh:C, 6exh:D, 6f9p:A, 6f9p:C, 6f9p:D
11 1ds1:A 323 257 0.2346 0.2477 0.3113 7.73e-15 1drt:A, 1dry:A, 1gvg:A
12 6vwq:A 325 301 0.2669 0.2800 0.3023 1.26e-12 6vwr:A
13 6f9p:B 289 149 0.1173 0.1384 0.2685 4.60e-04
14 4c20:B 605 22 0.0469 0.0264 0.7273 0.002 4c20:A, 4c21:A, 4c21:B, 4c22:A, 4c22:B
15 7rm7:A 222 16 0.0411 0.0631 0.8750 0.007 7rzk:A, 7snb:A, 7uq1:A
16 8of1:A 505 24 0.0469 0.0317 0.6667 0.011 8of1:B, 8ofm:A, 8ofm:B
17 1r1z:A 247 24 0.0469 0.0648 0.6667 0.013 1r1z:B, 1r1z:C, 1r1z:D
18 4qqq:A 483 14 0.0411 0.0290 1.0000 0.018
19 5sct:A 173 17 0.0411 0.0809 0.8235 0.018 2cig:A, 8cop:A, 8cop:B, 8coq:A, 8coq:B, 8cow:A, 8cow:B, 8cox:A, 8cox:B, 8cq8:A, 8cq8:B, 8cq9:A, 8cq9:B, 8cqa:A, 8cqa:B, 6ddp:A, 6ddp:B, 6ddp:C, 6ddp:D, 6dds:A, 6dds:B, 6dds:C, 6dds:D, 6ddw:A, 1df7:A, 1dg5:A, 1dg7:A, 1dg8:A, 5ja3:A, 5ja3:B, 5ja3:C, 5ja3:D, 4kl9:A, 4klx:A, 4klx:B, 4km0:A, 4km0:B, 4km2:A, 4km2:B, 4kne:A, 4kne:B, 4m2x:A, 4m2x:C, 4m2x:E, 4m2x:G, 6nnc:A, 6nnc:B, 6nnd:A, 6nnd:B, 6nne:A, 6nne:B, 6nnh:A, 6nnh:B, 6nni:A, 6nni:B, 5scm:A, 5scn:A, 5sco:A, 5scp:A, 5scp:B, 5scq:A, 5scr:A, 5scs:A, 5scu:A, 5scv:A, 5scv:B, 5scw:A, 5scx:A, 5scy:A, 5scz:A, 5sd0:A, 5sd1:A, 5sd2:A, 5sd3:A, 5sd4:A, 5sd5:A, 5u26:A, 5u27:A, 5ujf:A, 6vs5:A, 6vs5:B, 6vs6:A, 6vs6:B, 6vs8:A, 6vs8:B, 6vs9:A, 6vs9:B, 6vsd:A, 6vsd:B, 6vse:A, 6vse:B, 6vsf:A, 6vsf:B, 6vsg:A, 6vsg:B, 6vv6:A, 6vv6:B, 6vv7:A, 6vv7:B, 6vv8:A, 6vv8:B, 6vv9:A, 6vv9:B, 6vvb:A
20 3sur:A 504 15 0.0411 0.0278 0.9333 0.019 3sus:A, 3sut:A, 3suu:A, 3suv:A, 3suw:A
21 3w6z:A 296 14 0.0411 0.0473 1.0000 0.022 3w6u:A, 3ws7:A, 5xvh:A
22 4bkq:A 415 14 0.0411 0.0337 1.0000 0.024 4bkr:A, 5g2o:A, 5jai:A, 5jam:A, 5jaq:A, 3zu2:A, 3zu3:A, 3zu4:A, 3zu5:A
23 5hab:B 463 16 0.0411 0.0302 0.8750 0.031 5haa:A, 5haa:B, 5hab:A, 6llb:A, 6llb:B, 5ws2:A, 5ws2:B
24 6iz8:C 234 14 0.0411 0.0598 1.0000 0.032
25 5ejw:A 80 13 0.0381 0.1625 1.0000 0.039 5epj:A, 2kvm:A, 2l12:A, 2l1b:A, 4mn3:A, 8sii:A, 8sii:B, 6v2r:A, 4x3k:A, 4x3k:B, 4x3s:B, 4x3s:A, 4x3t:A, 4x3t:B, 4x3t:C, 4x3t:D, 4x3t:E, 4x3t:F, 4x3u:A, 4x3u:B
26 2l6e:A 94 22 0.0440 0.1596 0.6818 0.043
27 5bxp:A 636 26 0.0469 0.0252 0.6154 0.049 5bxp:B, 5bxr:A, 5bxr:B, 5bxs:A, 5bxs:B, 5bxt:A, 5bxt:B, 4h04:A, 4h04:B, 4jaw:A, 4jaw:B
28 3qvf:A 274 14 0.0411 0.0511 1.0000 0.083 3d40:A, 3d41:A, 3quo:A, 3qvh:A
29 3hlf:A 425 16 0.0411 0.0329 0.8750 0.092 3hld:A, 3hle:A, 3hlg:A
30 3tmb:B 318 22 0.0469 0.0503 0.7273 0.11 3tm8:A, 3tm8:B, 3tmb:A, 3tmc:A, 3tmc:B, 3tmd:A
31 2pyu:A 208 16 0.0381 0.0625 0.8125 0.12 2q16:A, 2q16:B
32 2liw:A 99 21 0.0411 0.1414 0.6667 0.21
33 7ag4:D 425 29 0.0469 0.0376 0.5517 0.21 7ag4:A, 7ag4:B, 7ag4:F, 7ag4:C, 7ag4:E, 2zbl:A, 2zbl:B, 2zbl:C, 2zbl:D, 2zbl:E, 2zbl:F
34 2f17:A 255 13 0.0381 0.0510 1.0000 0.27 2f17:B, 1ig3:A, 1ig3:B
35 6ihr:A 257 14 0.0381 0.0506 0.9286 0.46 5f1m:A, 6ihl:A, 6ihs:A, 6iht:A, 6ihw:A
36 3im9:A 313 15 0.0381 0.0415 0.8667 0.54
37 7xey:B 519 68 0.0616 0.0405 0.3088 0.64
38 7dwa:B 327 13 0.0352 0.0367 0.9231 0.87 7dvj:B, 7dvj:A, 7dw8:A, 7dw8:B, 7dwa:A
39 5m1i:A 539 16 0.0352 0.0223 0.7500 0.91 6gta:A, 6gvd:A, 6gwf:A, 6gwg:A, 6gx8:A, 5m0x:A, 5m12:A, 5m16:A
40 3wnb:A 361 15 0.0352 0.0332 0.8000 1.0 3wnc:A
41 4hac:A 312 14 0.0352 0.0385 0.8571 1.1 4hac:B, 6mde:A, 6mdf:A, 6mdf:B
42 3wnk:A 712 14 0.0352 0.0169 0.8571 1.2 3wnl:A, 3wnm:A, 3wnn:A, 3wnn:B, 3wno:A, 3wno:B, 3wnp:A, 3wnp:B
43 5cio:A 770 15 0.0352 0.0156 0.8000 1.5 5cio:B
44 6v40:A 193 12 0.0352 0.0622 1.0000 1.5 6v40:B, 6v40:C, 6v40:D
45 8aq2:A 520 15 0.0381 0.0250 0.8667 1.5
46 1i5h:W 50 30 0.0381 0.2600 0.4333 1.7
47 5ejl:A 235 12 0.0352 0.0511 1.0000 1.9 5kgo:D, 5kgo:A
48 3o2g:A 386 27 0.0323 0.0285 0.4074 2.0 4bg1:A, 4bgk:A, 4bgm:A, 4bhf:A, 4bhg:A, 4bhi:A, 4c5w:A, 4c8r:A, 4c8r:B, 4c8r:C, 4c8r:D, 4c8r:E, 4c8r:F, 4cwd:A, 3ms5:A, 3n6w:A
49 5faw:B 806 12 0.0352 0.0149 1.0000 2.1 5fau:A, 5fau:B, 5fau:C, 5fau:D, 5faw:A, 5fay:A, 5fay:B, 6nd3:A, 6nd3:B, 6nd3:C, 6nd3:D, 6nd3:E, 6nd3:F, 6nd3:G, 6nd3:H, 6vue:A, 6vue:B
50 3gtx:A 333 13 0.0381 0.0390 1.0000 2.2 3fdk:A, 3gtf:A, 3gth:A, 3gti:A, 3gu1:A, 3gu2:A, 3gu9:A, 3htw:A, 4j2m:A, 4j35:A, 4j5n:A, 2zc1:A
51 6h0h:A 410 50 0.0469 0.0390 0.3200 2.6 6h0h:B
52 3esw:A 333 14 0.0352 0.0360 0.8571 2.6 1x3w:A, 1x3z:A
53 8ug1:B 305 16 0.0323 0.0361 0.6875 2.6 9fhd:A, 9fhd:B, 9fhe:A, 9fhe:B, 3nbv:A, 3nbv:B, 3nbw:A, 3nbw:B, 3nc2:A, 3nc2:B, 3nc9:A, 3nc9:B, 3nca:A, 8omf:A, 8omf:B, 8omj:A, 8omj:B, 8omk:A, 8omk:B, 3q92:A, 3q92:B, 3qa2:A, 3qa2:B, 3qai:A, 3qai:B, 3ro4:A, 8ug1:A, 8ug3:A, 8ug3:B, 6ul7:A, 6w0n:A, 6w0n:B, 6w0w:A, 6w0w:B, 6w0x:A, 6w0x:B, 6w0y:A, 6w0y:B, 6w0z:A, 6w0z:B, 5wbm:A, 5wbm:B, 5wbo:A, 5wbo:B, 5wbp:A, 5wbq:A, 5wbq:B, 5wbr:A, 5wbr:B, 5wbz:A, 5wbz:B
54 2xjp:A 258 53 0.0557 0.0736 0.3585 2.7 4lhn:A, 2xjr:A, 2xjs:A, 2xjt:A, 2xju:A, 2xjv:A
55 7t3s:A 210 30 0.0411 0.0667 0.4667 3.2 7uqu:AAA
56 2a5j:A 177 47 0.0469 0.0904 0.3404 3.5 1z0a:A, 1z0a:B, 1z0a:D
57 4d8f:B 334 13 0.0352 0.0359 0.9231 4.2 2ani:A, 4d8f:A, 4d8f:C, 4d8f:D, 4d8g:A, 4d8g:B, 4d8g:C, 4d8g:D, 4m1i:A, 4m1i:B, 4m1i:C, 4m1i:D, 1syy:A
58 5tfm:A 320 30 0.0411 0.0437 0.4667 4.4 5tfl:A, 5tfl:B
59 3wxb:A 269 15 0.0352 0.0446 0.8000 4.5 3wxb:B
60 2imc:B 405 23 0.0352 0.0296 0.5217 5.4 3dse:A, 4hev:A, 4hev:B, 2ima:A, 2ima:B, 2imb:A, 2imb:B, 2imc:A, 7ky2:A, 7ky2:B, 7kyh:A, 7kyh:B, 7kyh:C, 7kyh:D, 7n18:A, 7n18:B, 3nf3:A, 3qix:A, 3qix:B, 3qiy:A, 3qiz:A, 3qj0:A, 5v8p:A, 5v8p:B, 5v8r:A, 5v8r:B, 5v8u:A, 5v8u:B
61 8kbc:B 132 11 0.0323 0.0833 1.0000 5.6 8kbc:G, 8kbc:J, 8kbc:A, 8kbc:H, 8kbc:I, 8kbc:L, 8kbc:C, 8kbc:E, 8kbc:K, 8kbc:D, 8kbc:F, 8kbd:A, 8kbd:H, 8kbd:I, 8kbd:B, 8kbd:G, 8kbd:J, 8kbd:L, 8kbd:C, 8kbd:E, 8kbd:K, 8kbd:D, 8kbd:F
62 5us1:A 189 68 0.0674 0.1217 0.3382 6.0 7jzs:A, 5us1:B, 5us1:C, 5us1:D, 5us1:E, 5us1:F, 5us1:G, 5us1:H, 5us1:I, 5us1:K, 5us1:L, 6vou:A, 6vou:B, 6vr2:A, 6vr2:B, 6vr3:A, 6vr3:B, 6vta:A, 6vta:B
63 5f8f:B 361 17 0.0352 0.0332 0.7059 6.1 5f8e:A, 5f8e:B, 5f8f:A, 5f8f:C
64 6dtn:B 233 18 0.0352 0.0515 0.6667 6.8 5cvd:A, 5cvd:B, 5cve:A, 5cve:B, 5e1b:A, 5e1b:B, 5e1d:A, 5e1d:B, 5e1m:A, 5e1m:B, 5e1o:A, 5e1o:B, 5e2a:A, 5e2a:B, 5e2b:A, 5e2b:B, 2ex4:A, 2ex4:B, 7k3d:B, 7k3d:A, 6kdq:A, 6kdq:B, 6pva:B, 6pvb:B, 7ss1:A, 7ss1:B, 7u1m:A, 7u1m:B, 6wh8:B, 6wh8:A, 6wj7:B
65 2q4a:B 322 18 0.0323 0.0342 0.6111 7.1 2q4a:A, 1y0z:A, 1y0z:B
66 5flh:A 190 37 0.0411 0.0737 0.3784 7.2 5flh:B, 5fli:A, 5fli:B, 5fli:C, 5fli:D, 5fli:E, 5fli:F, 5fli:G, 5fli:H, 5fli:I, 5fli:J, 5fli:K, 5fli:L, 5flj:A, 5flj:B, 5flj:C, 5flj:D, 5flj:E, 5flj:F, 5flj:G, 5flj:H, 5flj:I, 5flj:J, 5flj:K, 5flj:L
67 3r4c:A 268 14 0.0323 0.0410 0.7857 7.7
68 7tcl:X 259 45 0.0381 0.0502 0.2889 8.0
69 7syv:x 627 27 0.0381 0.0207 0.4815 8.5 8pj3:0, 8pj4:0, 8pj5:0, 7syw:x, 7syx:x, 7tql:1, 4ujc:AB, 4ujd:BB
70 6orr:C 273 11 0.0323 0.0403 1.0000 8.6 7bkg:A, 7bkg:B, 7bkg:C, 7bkg:D, 7ble:A, 7ble:B, 7ble:C, 7ble:D, 6chh:A, 6chh:B, 6chh:C, 6chh:D, 7egu:A, 7ehz:A, 7ei2:A, 7et7:A, 7et7:B, 7et7:C, 7et7:D, 7eu5:A, 7eu5:B, 7eu5:C, 7eu5:D, 2iip:A, 2iip:B, 2iip:C, 2iip:D, 7nbj:A, 7nbj:B, 7nbj:C, 7nbj:D, 7nbm:A, 7nbm:B, 7nbm:C, 7nbm:D, 7nbq:A, 7nbq:B, 7nbq:C, 7nbq:D, 6orr:A, 6orr:B, 6orr:D, 6pve:A, 6pve:B, 6pve:C, 6pve:D, 6pvs:A, 6pvs:B, 6pvs:C, 6pvs:D, 7rkk:A, 7rkk:B, 7rkl:A, 7rkl:B, 7rkl:C, 7rkl:D, 3rod:A, 3rod:B, 3rod:C, 3rod:D, 7sok:C, 7sok:A, 7sok:B, 7sok:D, 7wmc:A, 7wmc:B, 7wmt:A, 5xvq:A, 5xvq:B, 5yjf:A, 5yjf:B, 5yjf:C, 5yjf:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218