BioLiP

>protein
GTTLTVDLSTTYQRIDGFGTSEAFQRAVQMSRLPEEGQRRALDVLFSTTNGAGLSILRNGIGSSPDMSSDHMVSIAPKSP
GSPNNPLIYSWDGSDNKQLWVSQEAVHTYGVKTIYADAWSAPGYMKTNGNDANGGTLCGLSGAQCASGDWRQAYADYLTK
YVEFYQESNVTVTHLGFINAPELTTSYASMRFSASQAAEFIRILYPTIQKSNLTYKPTIACCDAEGWNSQAGMLGALSSV
NSMFGLVTAHAYTSQPGFSMNTPHPVWMTAAADLQGAWTSAWYSYGGAGEGWTWANNVYNAIVNGNASAYLYWIGAQTGN
TNSHMVHIDANAGTVEPSKRLWALGQWSRFVRPGARRVAVSGASGSLRTAAFRNEDGSVAVVVINSGGDAAVNVRLASSS
SADQQPASAKAWATDNSRAIEEIQASFADGVATVNVPSRSMTTVVLYPAADAL

The query sequence (length=453) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8cbc:A	455	453	1.0000	0.9956	1.0000	0.0	8c48:A, 8c48:B, 8cbc:B, 7o0e:A, 7o0e:G, 8p67:A, 8p67:B
2	6krn:A	456	455	0.4393	0.4364	0.4374	1.20e-123
3	6m5z:A	433	448	0.4128	0.4319	0.4174	1.24e-106	6m5z:B
4	8idp:A	446	457	0.3532	0.3587	0.3501	6.56e-74	8idp:C, 8idp:B, 8idp:D, 8idq:A, 8idq:B, 8idq:C, 8idq:D
5	7n6o:A	433	437	0.3091	0.3233	0.3204	7.11e-55	7n6o:B
6	2y24:A	383	457	0.2450	0.2898	0.2429	7.14e-13
7	4qaw:A	537	372	0.1965	0.1657	0.2392	2.07e-09	4qaw:B, 4qaw:C, 4qaw:D, 4qaw:E, 4qaw:F, 4qaw:G, 4qaw:H, 4qb1:A, 4qb2:A, 4qb6:A
8	2wnw:B	445	290	0.1479	0.1506	0.2310	1.58e-08	2wnw:A
9	9fa6:A	501	228	0.1280	0.1158	0.2544	1.19e-06	8awk:AAA, 8awr:AAA, 8ax3:A, 8ax3:B, 9f9z:A, 9fa3:A, 9fad:A, 9fal:A, 9fay:A, 9faz:A, 9fb2:A, 9fdi:A, 3gxf:B, 3gxf:D, 5lvx:C, 5lvx:B, 5lvx:A, 5lvx:D, 6moz:A, 2nsx:A, 2nsx:B, 2nsx:C, 2nsx:D, 2nt0:A, 2nt0:B, 2nt0:C, 2nt0:D, 7nwv:AAA, 7nwv:BBB, 8p3e:B, 8p41:A, 8p41:B, 6q1n:A, 6q1n:B, 6q1p:A, 6q1p:B, 6q6k:A, 6q6k:B, 6q6l:A, 6q6l:B, 6q6n:A, 6q6n:B, 3rik:B, 3rik:D, 3ril:A, 3ril:B, 3ril:C, 3ril:D, 6t13:B, 6t13:C, 6t13:A, 6t13:D, 6tjq:BBB, 6tn1:AAA, 2v3d:A, 2v3d:B, 2v3e:A, 2v3e:B, 2vt0:A, 2vt0:B, 2wcg:A, 2wcg:B, 2xwd:A, 2xwd:B, 2xwe:A, 2xwe:B, 1y7v:A, 1y7v:B, 6ytp:AAA, 6ytp:BBB, 6ytr:AAA, 6ytr:BBB, 6yut:AAA, 6yut:BBB, 6yv3:AAA, 6yv3:BBB, 6z39:AAA, 6z39:BBB, 6z3i:BBB
10	9fa6:A	501	70	0.0464	0.0419	0.3000	0.008	8awk:AAA, 8awr:AAA, 8ax3:A, 8ax3:B, 9f9z:A, 9fa3:A, 9fad:A, 9fal:A, 9fay:A, 9faz:A, 9fb2:A, 9fdi:A, 3gxf:B, 3gxf:D, 5lvx:C, 5lvx:B, 5lvx:A, 5lvx:D, 6moz:A, 2nsx:A, 2nsx:B, 2nsx:C, 2nsx:D, 2nt0:A, 2nt0:B, 2nt0:C, 2nt0:D, 7nwv:AAA, 7nwv:BBB, 8p3e:B, 8p41:A, 8p41:B, 6q1n:A, 6q1n:B, 6q1p:A, 6q1p:B, 6q6k:A, 6q6k:B, 6q6l:A, 6q6l:B, 6q6n:A, 6q6n:B, 3rik:B, 3rik:D, 3ril:A, 3ril:B, 3ril:C, 3ril:D, 6t13:B, 6t13:C, 6t13:A, 6t13:D, 6tjq:BBB, 6tn1:AAA, 2v3d:A, 2v3d:B, 2v3e:A, 2v3e:B, 2vt0:A, 2vt0:B, 2wcg:A, 2wcg:B, 2xwd:A, 2xwd:B, 2xwe:A, 2xwe:B, 1y7v:A, 1y7v:B, 6ytp:AAA, 6ytp:BBB, 6ytr:AAA, 6ytr:BBB, 6yut:AAA, 6yut:BBB, 6yv3:AAA, 6yv3:BBB, 6z39:AAA, 6z39:BBB, 6z3i:BBB
11	4uqa:A	391	150	0.0971	0.1125	0.2933	2.54e-06	5a6l:A, 5a6m:A, 4ckq:A, 4uqc:A
12	3kl0:A	397	344	0.1678	0.1914	0.2209	1.92e-05	3kl3:A, 3kl3:B, 3kl5:A, 3kl5:B, 3kl5:C
13	5ngl:B	454	218	0.1082	0.1079	0.2248	6.42e-04	5ngl:A, 5ngl:C
14	5ngl:B	454	59	0.0397	0.0396	0.3051	0.018	5ngl:A, 5ngl:C
15	6yyi:B	502	124	0.0706	0.0637	0.2581	3.2
16	8ayz:A	278	80	0.0508	0.0827	0.2875	6.5	1eah:1, 3epf:1

[Back]