Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GSTGIKPFQCTWPDCDRSFSRSDHLALHRKRHMLV

The query sequence (length=35) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1p7a:A 37 35 0.9429 0.8919 0.9429 1.24e-17 1u85:A, 1u86:A
2 2ebt:A 100 31 0.6571 0.2300 0.7419 1.87e-08
3 2ebt:A 100 30 0.4571 0.1600 0.5333 1.58e-06
4 2ebt:A 100 23 0.2286 0.0800 0.3478 2.0
5 5ke9:A 88 31 0.6286 0.2500 0.7097 3.25e-08 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
6 6b0o:A 119 33 0.5429 0.1597 0.5758 7.61e-08 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
7 6b0o:A 119 31 0.4571 0.1345 0.5161 4.40e-06 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
8 6b0o:A 119 30 0.5143 0.1513 0.6000 2.33e-05 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
9 6b0o:A 119 28 0.2571 0.0756 0.3214 0.008 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
10 2epa:A 72 30 0.4857 0.2361 0.5667 7.71e-08
11 2epa:A 72 32 0.2857 0.1389 0.3125 0.78
12 2ent:A 48 30 0.5143 0.3750 0.6000 1.20e-07
13 6zr5:D 38 30 0.4286 0.3947 0.5000 3.06e-07 6zr5:C
14 6pv0:A 31 28 0.4000 0.4516 0.5000 8.59e-07 6pv1:A, 6pv2:A, 6pv3:A, 1sp2:A, 6uco:A, 6ucp:A, 1va2:A
15 1mey:F 84 31 0.4857 0.2024 0.5484 2.12e-06 1mey:C
16 1mey:F 84 31 0.4000 0.1667 0.4516 0.004 1mey:C
17 1mey:F 84 28 0.3429 0.1429 0.4286 0.042 1mey:C
18 2rpc:A 155 30 0.4000 0.0903 0.4667 2.76e-05 2ej4:A
19 2rpc:A 155 33 0.4571 0.1032 0.4848 0.004 2ej4:A
20 1f2i:G 66 30 0.5143 0.2727 0.6000 8.52e-05 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
21 1f2i:G 66 28 0.3714 0.1970 0.4643 0.003 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
22 2yta:A 41 33 0.4286 0.3659 0.4545 1.24e-04
23 2i13:B 144 28 0.4571 0.1111 0.5714 1.28e-04
24 2i13:B 144 31 0.4286 0.1042 0.4839 3.98e-04
25 2i13:B 144 31 0.4000 0.0972 0.4516 0.013
26 2i13:B 144 31 0.3714 0.0903 0.4194 0.027
27 2i13:B 144 31 0.3714 0.0903 0.4194 0.075
28 1p47:A 87 30 0.5143 0.2069 0.6000 2.54e-04 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
29 1p47:A 87 23 0.3429 0.1379 0.5217 0.011 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
30 1p47:A 87 31 0.4286 0.1724 0.4839 0.096 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
31 2i13:A 151 31 0.4286 0.0993 0.4839 4.84e-04
32 2i13:A 151 30 0.4286 0.0993 0.5000 7.99e-04
33 2i13:A 151 31 0.4000 0.0927 0.4516 0.016
34 2i13:A 151 31 0.3714 0.0861 0.4194 0.032
35 2i13:A 151 28 0.3143 0.0728 0.3929 2.0
36 2i13:A 151 14 0.2857 0.0662 0.7143 2.5
37 2eol:A 42 33 0.3714 0.3095 0.3939 5.06e-04
38 1llm:C 87 28 0.4571 0.1839 0.5714 0.001 1llm:D
39 1llm:C 87 27 0.4000 0.1609 0.5185 0.11 1llm:D
40 2emx:A 44 33 0.3714 0.2955 0.3939 0.001
41 2yte:A 42 34 0.3714 0.3095 0.3824 0.002
42 2eqw:A 42 33 0.3714 0.3095 0.3939 0.005
43 1zfd:A 32 28 0.3143 0.3438 0.3929 0.006
44 2gli:A 155 30 0.3714 0.0839 0.4333 0.007 7t91:A, 7t91:B
45 2gli:A 155 29 0.3143 0.0710 0.3793 0.18 7t91:A, 7t91:B
46 2emj:A 46 28 0.3714 0.2826 0.4643 0.010
47 1ubd:C 114 30 0.4000 0.1228 0.4667 0.011
48 1ubd:C 114 26 0.2571 0.0789 0.3462 0.57
49 8e3e:F 121 29 0.4000 0.1157 0.4828 0.013 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
50 8e3e:F 121 30 0.3429 0.0992 0.4000 0.13 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
51 2em1:A 44 35 0.3429 0.2727 0.3429 0.015
52 2emc:A 46 35 0.4286 0.3261 0.4286 0.024
53 7y3l:A 57 31 0.4000 0.2456 0.4516 0.026
54 2em3:A 46 28 0.3143 0.2391 0.3929 0.029
55 2eq2:A 46 28 0.3143 0.2391 0.3929 0.034 2ytr:A
56 2epq:A 45 32 0.3714 0.2889 0.4062 0.036
57 2eoe:A 46 30 0.3143 0.2391 0.3667 0.037 2ytk:A
58 6ml4:A 143 30 0.4286 0.1049 0.5000 0.038 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
59 2emv:A 44 34 0.3429 0.2727 0.3529 0.043
60 2emk:A 46 28 0.2857 0.2174 0.3571 0.070
61 2eoj:A 44 26 0.3143 0.2500 0.4231 0.099
62 2yto:A 46 28 0.2857 0.2174 0.3571 0.10
63 2ely:A 46 27 0.3429 0.2609 0.4444 0.12
64 2dlk:A 79 30 0.3429 0.1519 0.4000 0.13
65 2dlk:A 79 27 0.3429 0.1519 0.4444 0.18
66 2ytd:A 46 28 0.3143 0.2391 0.3929 0.14
67 7w1m:H 322 28 0.3714 0.0404 0.4643 0.14 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
68 7w1m:H 322 30 0.3429 0.0373 0.4000 1.2 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
69 2elz:A 46 28 0.2857 0.2174 0.3571 0.14
70 2emf:A 46 27 0.3143 0.2391 0.4074 0.15
71 2eoo:A 46 28 0.3143 0.2391 0.3929 0.15
72 2ytf:A 46 28 0.2571 0.1957 0.3214 0.15 2eof:A
73 5y0u:A 109 31 0.3429 0.1101 0.3871 0.18
74 2emz:A 46 27 0.3143 0.2391 0.4074 0.22
75 2enf:A 46 27 0.2857 0.2174 0.3704 0.24 2yti:A, 2ytn:A, 2yu8:A
76 1ncs:A 47 28 0.2571 0.1915 0.3214 0.24
77 1tf6:D 182 30 0.3429 0.0659 0.4000 0.24 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
78 1tf6:D 182 26 0.2857 0.0549 0.3846 3.1 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
79 6wmi:A 146 30 0.3143 0.0753 0.3667 0.26 6wmi:D
80 6wmi:A 146 33 0.3714 0.0890 0.3939 0.40 6wmi:D
81 6wmi:A 146 27 0.3143 0.0753 0.4074 1.5 6wmi:D
82 6wmi:A 146 30 0.3143 0.0753 0.3667 6.3 6wmi:D
83 2ep1:A 46 27 0.2857 0.2174 0.3704 0.26 2ep2:A
84 6a57:A 131 29 0.2571 0.0687 0.3103 0.27 6a58:A, 6a59:A, 6jnl:A, 6jnm:A, 6jnm:B, 6jnn:A, 6jnn:B, 6jnn:N, 6jnn:G
85 6a57:A 131 23 0.2571 0.0687 0.3913 4.9 6a58:A, 6a59:A, 6jnl:A, 6jnm:A, 6jnm:B, 6jnn:A, 6jnn:B, 6jnn:N, 6jnn:G
86 5wjq:D 281 30 0.3429 0.0427 0.4000 0.27 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
87 5wjq:D 281 30 0.3143 0.0391 0.3667 0.42 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
88 5wjq:D 281 30 0.3429 0.0427 0.4000 1.3 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
89 5wjq:D 281 30 0.3143 0.0391 0.3667 8.7 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
90 2el4:A 46 31 0.2857 0.2174 0.3226 0.28
91 1x6e:A 72 30 0.3143 0.1528 0.3667 0.32
92 1x6e:A 72 27 0.3143 0.1528 0.4074 0.42
93 7mc3:A 31 28 0.3714 0.4194 0.4643 0.37
94 2ept:A 41 33 0.3143 0.2683 0.3333 0.40
95 2eps:A 54 26 0.3429 0.2222 0.4615 0.43
96 1x6h:A 86 30 0.3429 0.1395 0.4000 0.44
97 3mw4:A 178 17 0.2857 0.0562 0.5882 0.46
98 2ytg:A 46 28 0.2857 0.2174 0.3571 0.50
99 2yt9:A 95 31 0.4286 0.1579 0.4839 0.53
100 2yt9:A 95 30 0.3143 0.1158 0.3667 1.7
101 7joz:R 446 16 0.2286 0.0179 0.5000 0.60 7ckw:R, 7ckx:R, 7cky:R, 7ckz:R, 7crh:R, 7f0t:F, 7f1o:F, 7f1z:F, 7f23:F, 7f24:F, 8irr:R, 7jv5:R, 7jvp:R, 7jvq:R, 8jxr:A, 8jxs:A, 7ljc:R, 7ljd:R, 7x2c:F, 7x2d:F, 7x2f:F
102 2kmk:A 82 30 0.3429 0.1463 0.4000 0.62
103 2eov:A 46 28 0.3143 0.2391 0.3929 0.70
104 2yts:A 46 27 0.3143 0.2391 0.4074 0.71
105 5yj3:C 70 32 0.3429 0.1714 0.3750 0.73 5yj3:D
106 2ee8:A 106 28 0.3429 0.1132 0.4286 0.77
107 2ee8:A 106 30 0.3429 0.1132 0.4000 6.5
108 2epu:A 45 27 0.3143 0.2444 0.4074 0.83
109 5v3g:D 170 31 0.3429 0.0706 0.3871 0.99 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
110 5v3g:D 170 31 0.3429 0.0706 0.3871 2.2 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
111 5v3g:D 170 28 0.3143 0.0647 0.3929 3.6 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
112 8odq:D 410 35 0.3429 0.0293 0.3429 1.2 8odq:B
113 5l3z:A 280 19 0.2857 0.0357 0.5263 1.2 5l4l:A
114 2epz:A 46 28 0.3429 0.2609 0.4286 1.2
115 2ena:A 46 34 0.4286 0.3261 0.4412 1.2
116 1g2d:C 89 27 0.2857 0.1124 0.3704 1.3 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
117 1g2d:C 89 30 0.4000 0.1573 0.4667 1.8 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
118 2en6:A 46 28 0.2571 0.1957 0.3214 1.4
119 2el6:A 46 28 0.2571 0.1957 0.3214 1.5
120 2n26:A 55 27 0.3143 0.2000 0.4074 1.6
121 2eml:A 46 27 0.2571 0.1957 0.3333 1.9
122 2epy:A 42 32 0.3143 0.2619 0.3438 2.0
123 8b3c:B 383 39 0.3714 0.0339 0.3333 2.3 8b32:A, 8b32:B, 8b35:A, 8b35:B, 8b3c:A
124 2emp:A 46 28 0.2571 0.1957 0.3214 2.9
125 2eoh:A 46 27 0.2571 0.1957 0.3333 2.9
126 2ema:A 46 27 0.2857 0.2174 0.3704 3.1
127 2emm:A 46 27 0.2857 0.2174 0.3704 3.4
128 2eoi:A 44 33 0.3143 0.2500 0.3333 3.4
129 2en9:A 46 27 0.2571 0.1957 0.3333 3.6
130 2em6:A 46 19 0.2286 0.1739 0.4211 3.6
131 2emg:A 46 27 0.2571 0.1957 0.3333 4.0
132 2r1b:A 198 16 0.2286 0.0404 0.5000 4.2 2r1b:B
133 3poy:A 1005 16 0.2286 0.0080 0.5000 4.2 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
134 7ysf:A 113 26 0.3143 0.0973 0.4231 4.7
135 2adr:A 60 29 0.3143 0.1833 0.3793 4.7 1paa:A
136 2adr:A 60 18 0.2286 0.1333 0.4444 6.9 1paa:A
137 5frt:E 105 35 0.3143 0.1048 0.3143 4.8 5ffi:E
138 2emy:A 46 27 0.2571 0.1957 0.3333 5.0 2el5:A
139 2eop:A 46 27 0.2857 0.2174 0.3704 5.1
140 2eoy:A 46 35 0.3714 0.2826 0.3714 5.2
141 6nig:C 549 28 0.2857 0.0182 0.3571 5.3 6nig:A, 6nig:B, 6nig:D, 2z7x:A
142 8ffz:A 314 29 0.3143 0.0350 0.3793 7.6
143 2ep3:A 46 28 0.2571 0.1957 0.3214 8.3
144 2epw:A 46 28 0.2571 0.1957 0.3214 8.4
145 4r7e:A 69 16 0.2000 0.1014 0.4375 8.5 8ieg:A, 8ieg:B, 8t3t:K, 8t3t:L, 8t3w:K, 8t3w:L, 8t3y:K, 8t3y:L
146 1zw8:A 64 12 0.1714 0.0938 0.5000 8.6
147 2em0:A 46 25 0.2857 0.2174 0.4000 8.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218