Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GSHMKQLILALDVMDGEKAMEIAKKVAEHVDRIKVNYPLVLSAGVGIMKRLSEIKPVIADFKIADVPYTSSLIARIAFEN
SAESVIVHGFVGSDTLREVCRVAEEFGGKVYAVTELSSPGGEEFMSAVSLKIVEKAKEAGCHGLIAPSTRIERLREIRKA
AGDMEILCPGIGAQKGSIEAVKYADGIIVGRGIYASGNPAEEARKLRRVLKI

The query sequence (length=212) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4muz:A 212 212 1.0000 1.0000 1.0000 2.09e-152 4muz:B
2 4luj:A 214 214 0.4670 0.4626 0.4626 3.09e-60 4luj:B
3 1dvj:A 239 202 0.4057 0.3598 0.4257 5.30e-50 1dvj:B, 1dvj:C, 1dvj:D, 2e6y:A, 2e6y:B, 4fx6:M, 4fx6:N, 4fx8:A, 4fx8:B, 4fxr:A, 4fxr:B, 3g1a:A, 3g1a:B, 3g1d:A, 3g1d:B, 3g1f:A, 3g1f:B, 3g1f:C, 3g1f:D, 3g1f:E, 3g1f:F, 3g1f:G, 3g1f:H, 3g1f:I, 3g1f:J, 3g1f:K, 3g1f:L, 3g1f:M, 3g1h:A, 3g1h:B, 3g1h:C, 3g1h:D, 3g1h:E, 3g1h:F, 3g1h:G, 3g1h:H, 3g1h:I, 3g1h:J, 3g1h:K, 3g1h:L, 3g1h:M, 3g1v:A, 3g1v:B, 3g1x:A, 3g1x:B, 3g22:A, 3g22:B, 3g24:A, 3g24:B, 4gc4:A, 4gc4:B, 1kly:A, 1klz:A, 1km0:A, 1km0:B, 1km0:C, 1km0:D, 1km1:A, 1km1:B, 1km2:A, 1km3:A, 1km4:A, 1km5:A, 1km6:A, 4lc6:A, 4lc6:B, 4lc8:A, 4lc8:B, 3lht:A, 3lht:B, 3lhu:A, 3lhu:B, 3lhv:A, 3lhv:B, 3lhv:C, 3lhv:D, 3lhw:A, 3lhw:B, 3lhy:A, 3lhy:B, 3lhz:A, 3lhz:B, 3li0:A, 3li0:B, 3li1:A, 3li1:B, 3lld:A, 3lld:B, 3llf:A, 3llf:B, 1lol:A, 1lol:B, 1loq:A, 1lor:A, 1los:A, 1los:B, 1los:C, 1los:D, 1lp6:A, 1lp6:B, 3ltp:A, 3ltp:B, 3lts:A, 3lts:B, 3lty:A, 3lty:B, 3lv5:A, 3lv5:B, 3lv6:A, 3lv6:B, 4lw7:A, 4lw7:B, 3m1z:A, 3m1z:B, 3nq6:A, 3nq6:B, 3nq7:A, 3nq7:B, 3nqa:A, 3nqa:B, 3nqc:A, 3nqc:B, 3nqd:A, 3nqd:B, 3nqe:A, 3nqe:B, 3nqf:A, 3nqf:B, 3nqg:A, 3nqg:B, 3nqm:A, 3nqm:B, 4nt0:A, 4nt0:B, 4nuw:A, 4nuw:B, 4nx5:A, 4nx5:B, 4o11:A, 4o11:B, 4o8r:A, 4o8r:B, 4o8r:C, 4o8r:D, 4o8r:E, 4o8r:F, 4o8r:G, 4o8r:H, 4o8r:I, 4o8r:J, 4o8r:K, 4o8r:L, 4o8r:M, 3p5y:A, 3p5y:B, 3p5z:A, 3p5z:B, 3p60:A, 3p60:B, 3p61:A, 3p61:B, 3pbu:A, 3pbu:B, 3pbv:A, 3pbv:B, 3pbw:A, 3pbw:B, 3pby:A, 3pby:B, 3pc0:A, 3pc0:B, 3qez:A, 3qez:B, 3qf0:A, 3qf0:B, 3qmr:A, 3qmr:B, 3qms:A, 3qms:B, 3qmt:A, 3qmt:B, 3rlu:A, 3rlu:B, 3rlv:A, 3rlv:B, 3sec:A, 3sgu:A, 3siz:A, 3siz:B, 3sj3:A, 3sj3:B, 3ssj:A, 3sw6:A, 3sy5:A, 3sy5:B, 3thq:A, 3thq:B, 3v1p:A, 3v1p:B, 3w07:A, 3wjw:A, 3wjx:A, 3wjy:A, 3wjz:A, 3wk0:A, 3wk1:A, 3wk2:A, 3wk3:A, 1x1z:A, 1x1z:B, 2zz1:A, 2zz1:B, 2zz2:A, 2zz2:B, 2zz3:A, 2zz3:B, 2zz4:A, 2zz4:B, 2zz5:A, 2zz5:B, 2zz6:A, 2zz6:B, 2zz7:A
4 2cze:A 208 206 0.4481 0.4567 0.4612 7.50e-48 2cze:B, 2czf:A, 2czf:B
5 4dbe:A 213 205 0.2877 0.2864 0.2976 2.37e-21 4dbe:B
6 4df1:A 199 199 0.3019 0.3216 0.3216 8.47e-16 4df1:B
7 3ve7:A 206 215 0.3066 0.3155 0.3023 1.16e-14 3ve7:B
8 1xbz:B 216 219 0.2925 0.2870 0.2831 2.79e-09 1kv8:A, 1kv8:B, 1kw1:A, 1kw1:B, 1q6l:A, 1q6l:B, 1q6o:A, 1q6o:B, 1q6q:A, 1q6q:B, 1q6r:A, 1q6r:B, 1so3:A, 1so3:B, 1so4:A, 1so4:B, 1so5:A, 1so5:B, 1so6:A, 1so6:B, 1xbv:A, 1xbv:B, 1xbx:A, 1xbx:B, 1xby:A, 1xby:B, 1xbz:A
9 2ffc:A 318 225 0.2500 0.1667 0.2356 6.31e-09 2guu:A
10 3ajx:A 207 102 0.1604 0.1643 0.3333 7.57e-08 3ajx:B, 3ajx:C, 3ajx:D
11 3s9y:A 331 186 0.1981 0.1269 0.2258 1.15e-06 3bar:A, 3bar:B, 3bpw:A, 3bpw:B, 6dsr:A, 6dsr:B, 6dss:A, 6dss:B, 3mwa:A, 3mwa:B, 3n2m:A, 3n2m:B, 3n34:A, 3n34:B, 3n3m:A, 3n3m:B, 2q8z:A, 2q8z:B, 2qaf:A, 2qaf:B, 3s9y:B, 3s9y:C, 3s9y:D, 3vi2:A, 3vi2:B, 2za1:A, 2za1:B, 2za3:A, 2za3:B
12 3qw4:C 447 136 0.1792 0.0850 0.2794 7.12e-06 3qw4:B
13 3jr2:C 214 159 0.1651 0.1636 0.2201 3.66e-04 3jr2:A, 3jr2:B, 3jr2:D
14 3uwq:B 224 218 0.2358 0.2232 0.2294 0.005 3uwq:A
15 1dbt:A 237 232 0.2689 0.2405 0.2457 0.009 1dbt:B, 1dbt:C
16 8cso:C 231 230 0.2406 0.2208 0.2217 0.052 8cso:A, 8cso:B, 8cso:D, 8cso:E, 8cso:F, 8ek7:C, 8ek7:E
17 1dqx:A 267 238 0.2925 0.2322 0.2605 0.055 1dqx:B, 1dqx:C, 1dqx:D, 3gdl:A, 3gdl:B, 3gdt:A, 3gdt:B, 3gdt:C, 3gdt:D
18 3qh2:B 196 28 0.0708 0.0765 0.5357 0.38 3qh2:A, 3qh2:C, 3qh2:D
19 8u0z:A 260 24 0.0708 0.0577 0.6250 0.40 8u0z:B
20 5k2z:B 278 22 0.0566 0.0432 0.5455 0.44 5k2z:A, 5k2z:C, 5k2z:D, 5lnr:A, 5lnr:B, 5lnr:C, 5lnr:D, 5lns:A, 5lns:B, 5lns:C, 5lns:D, 5lnt:A, 5lnt:B, 5lnt:C, 5lnt:D, 5lnu:A, 5lnu:B, 5lnu:C, 5lnu:D, 5lnv:A, 5lnv:B, 5lnv:C, 5lnv:D, 5lnw:A, 5lnw:B, 5lnw:C, 5lnw:D, 7nhe:A, 7nhe:B, 7nhe:C, 7nhe:D
21 4jyo:X 217 62 0.0802 0.0783 0.2742 0.62 4epu:A, 4epu:B
22 6th0:A 176 111 0.1840 0.2216 0.3514 1.3 6tgx:A, 6tgx:B, 6th0:B
23 6b8s:B 336 24 0.0613 0.0387 0.5417 1.7 6b8s:A
24 7rd6:A 929 54 0.0802 0.0183 0.3148 2.0 7rd7:A, 7rd8:A
25 4wy0:B 260 80 0.1226 0.1000 0.3250 2.5 4wy0:D, 4wy0:E, 4wy0:G, 4wy0:I, 4wy0:J, 4wy0:K, 1znn:A, 1znn:B, 1znn:C, 1znn:D, 1znn:E, 1znn:F
26 2f6x:A 231 28 0.0613 0.0563 0.4643 3.4 2f6x:B
27 4fir:A 333 22 0.0519 0.0330 0.5000 3.6 4fir:B, 4fir:C, 4fir:D, 4fir:E, 4fir:F
28 3exs:D 218 224 0.2453 0.2385 0.2321 3.9 3exs:A, 3ext:A
29 1coz:A 126 71 0.0849 0.1429 0.2535 4.0 1coz:B, 1n1d:A, 1n1d:B, 1n1d:C, 1n1d:D
30 7xto:B 252 28 0.0519 0.0437 0.3929 4.3 7xto:A, 7xto:C, 7xto:D, 7xto:E, 7xto:F
31 5xk6:A 218 116 0.1415 0.1376 0.2586 4.3 5xk6:B, 5xk6:C, 5xk6:D, 5xk7:A, 5xk7:B, 5xk7:C, 5xk7:D, 5xk8:A, 5xk8:B, 5xk8:C, 5xk8:D, 5xk9:A, 5xk9:B, 5xk9:C, 5xk9:D, 5xk9:E, 5xk9:F, 5xk9:G, 5xk9:H
32 5ysq:B 280 27 0.0519 0.0393 0.4074 5.4 7e4l:A, 7e4l:B, 5ysp:A, 5ysp:B, 5ysq:A
33 5kof:A 407 73 0.1132 0.0590 0.3288 6.8 2aq7:A, 2aq7:B, 2aq7:D, 2aqb:A, 2aqb:B, 2aqb:D, 2bui:A, 2bui:B, 2bui:C, 2bui:D, 1fj4:A, 1fj4:B, 1fj4:C, 1fj4:D, 1fj8:A, 1fj8:B, 1fj8:C, 1fj8:D, 5kof:B, 6okc:A, 6okc:B, 6okf:A, 6okf:B, 8sms:B, 8sms:A, 7sqi:B, 7sqi:A, 7sz9:A, 7sz9:B, 2vb8:A, 2vb8:B, 2vb8:C, 2vb8:D, 2vba:A, 2vba:B
34 4q6x:A 278 57 0.0708 0.0540 0.2632 8.1
35 4ks0:A 466 97 0.1604 0.0730 0.3505 8.5
36 7xwi:B 224 28 0.0519 0.0491 0.3929 8.7 7xwh:A, 7xwh:B, 7xwh:C, 7xwh:D, 7xwi:A, 7xwi:C, 7xwi:D, 7xwj:A, 7xwj:B, 7xwj:C, 7xwj:D, 7xwk:A, 7xwk:B, 7xwk:C, 7xwk:D, 7xwl:A, 7xwl:B, 7xwl:C, 7xwl:D, 7xwm:A, 7xwm:B, 7xwm:C, 7xwm:D, 7xwn:A, 7xwn:B, 7xwn:C, 7xwn:D
37 3l77:A 235 41 0.0802 0.0723 0.4146 9.2 3tn7:A, 3tn7:B
38 3srk:B 405 107 0.1509 0.0790 0.2991 9.7 3qv7:B, 3qv8:A
39 1h1y:B 219 59 0.0755 0.0731 0.2712 9.8 1h1z:A, 1h1z:B
40 4ks0:B 499 97 0.1604 0.0681 0.3505 9.9

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218