Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GSHMKKIFVGGLSVNTTVEDVKHYFEQFGKVDDAMLMFDKTTNRHRGFGFVTFESEDIVEKVCEIHFHEINNKMVECKKA
QPKEVMSPTGSARGRS

The query sequence (length=96) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5x3z:A 96 96 1.0000 1.0000 1.0000 2.19e-68
2 2cjk:A 167 78 0.3438 0.1976 0.4231 5.05e-20 2km8:C
3 2cjk:A 167 85 0.3333 0.1916 0.3765 2.70e-16 2km8:C
4 2rs2:A 84 83 0.3958 0.4524 0.4578 2.00e-19
5 5en1:A 184 89 0.3750 0.1957 0.4045 1.11e-18 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
6 5en1:A 184 88 0.3542 0.1848 0.3864 4.39e-17 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
7 9gpj:A 184 89 0.3438 0.1793 0.3708 4.11e-17 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
8 9gpj:A 184 89 0.3646 0.1902 0.3933 9.55e-17 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
9 1wtb:A 79 77 0.3542 0.4304 0.4416 2.12e-16 1x0f:A
10 2mgz:B 105 76 0.2917 0.2667 0.3684 1.50e-13 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
11 6jvx:A 87 76 0.2917 0.3218 0.3684 1.56e-13 6jvy:A
12 2mb0:B 95 76 0.2604 0.2632 0.3289 1.40e-11
13 5kw6:A 201 87 0.2500 0.1194 0.2759 4.31e-10 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
14 5kw6:A 201 72 0.1771 0.0846 0.2361 5.86e-06 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
15 7q33:A 93 59 0.2188 0.2258 0.3559 5.02e-10 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
16 2fy1:A 108 100 0.3021 0.2685 0.2900 3.83e-09
17 5ith:A 80 60 0.2292 0.2750 0.3667 4.60e-09 5o3j:A
18 2rra:A 99 54 0.2083 0.2020 0.3704 3.56e-08 2kxn:B
19 6m75:A 167 86 0.2396 0.1377 0.2674 4.99e-08
20 5x8p:v 190 74 0.2708 0.1368 0.3514 1.65e-07 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
21 5x8p:v 190 64 0.1979 0.1000 0.2969 5.62e-06 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
22 8any:A6 74 69 0.2500 0.3243 0.3478 1.67e-07
23 4bs2:A 174 88 0.3229 0.1782 0.3523 1.88e-07 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
24 4bs2:A 174 59 0.1875 0.1034 0.3051 5.68e-05 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
25 7zew:A 117 88 0.2708 0.2222 0.2955 3.57e-07 7zex:A
26 2xs2:A 87 64 0.2188 0.2414 0.3281 1.30e-06 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
27 8fkp:SH 150 63 0.2396 0.1533 0.3651 3.48e-06 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
28 8esq:o 137 73 0.2188 0.1533 0.2877 9.43e-06 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
29 5mqf:o 223 76 0.2396 0.1031 0.3026 1.46e-05 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
30 8xxm:3G 84 77 0.2292 0.2619 0.2857 1.88e-05 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
31 3d2w:A 72 58 0.1875 0.2500 0.3103 2.05e-05
32 2n82:B 104 92 0.2708 0.2500 0.2826 2.51e-05 2err:A, 7vrl:B
33 7dvq:Y 140 50 0.1875 0.1286 0.3600 2.57e-05 8i0p:Y, 8i0r:Y
34 4ed5:B 169 57 0.1667 0.0947 0.2807 2.78e-05 4ed5:A
35 4ed5:B 169 77 0.1979 0.1124 0.2468 2.13e-04 4ed5:A
36 2leb:A 101 61 0.1875 0.1782 0.2951 4.22e-05 2lec:A
37 6r5k:H 394 83 0.2708 0.0660 0.3133 4.44e-05 6r5k:D, 6r5k:F
38 6r5k:H 394 50 0.1562 0.0381 0.3000 5.4 6r5k:D, 6r5k:F
39 5ifm:C 256 59 0.1875 0.0703 0.3051 1.45e-04 5ifm:A
40 6qx9:1K 201 56 0.1562 0.0746 0.2679 1.64e-04 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
41 2x1f:A 94 82 0.1667 0.1702 0.1951 1.70e-04 2km8:B, 2x1a:A
42 1fnx:H 174 48 0.1354 0.0747 0.2708 1.98e-04 1fxl:A, 1g2e:A
43 6n7p:A 186 50 0.1458 0.0753 0.2800 2.58e-04 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
44 1fje:B 175 75 0.2812 0.1543 0.3600 2.62e-04 1rkj:A
45 5m8i:A 114 62 0.2188 0.1842 0.3387 3.56e-04
46 6g90:B 193 50 0.1458 0.0725 0.2800 3.94e-04
47 8i0v:4 161 75 0.2292 0.1366 0.2933 4.72e-04
48 4pkd:B 240 56 0.1562 0.0625 0.2679 5.03e-04 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
49 8h6e:4R 106 80 0.2083 0.1887 0.2500 0.001 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
50 7uj1:B 270 55 0.1667 0.0593 0.2909 0.002 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
51 7uj1:B 270 64 0.1979 0.0704 0.2969 0.11 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
52 2mki:A 203 89 0.2500 0.1182 0.2697 0.003
53 8i0s:Y 320 73 0.2083 0.0625 0.2740 0.004 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
54 8ch6:V 285 73 0.2083 0.0702 0.2740 0.005 7qtt:V
55 2xb2:D 89 49 0.1458 0.1573 0.2857 0.008 2xb2:Z
56 8y6o:W 167 62 0.1667 0.0958 0.2581 0.011
57 2mgz:A 94 92 0.2500 0.2553 0.2609 0.012
58 6gd2:A 84 71 0.1875 0.2143 0.2535 0.012 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
59 7dco:X 128 50 0.1458 0.1094 0.2800 0.015 5gm6:V, 5zwm:X
60 2rqc:A 115 36 0.1458 0.1217 0.3889 0.016
61 2mkc:A 118 50 0.1458 0.1186 0.2800 0.017 2my3:A
62 4a8x:A 88 64 0.1875 0.2045 0.2812 0.018
63 6snj:A 131 61 0.2292 0.1679 0.3607 0.031 6gbm:B
64 4lmz:A 176 56 0.1458 0.0795 0.2500 0.044 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
65 6xlv:A 203 76 0.1667 0.0788 0.2105 0.056 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
66 7ohx:o 112 47 0.1562 0.1339 0.3191 0.066
67 6c0f:o 133 47 0.1562 0.1128 0.3191 0.070 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
68 3hgy:A 202 36 0.1354 0.0644 0.3611 0.12 2qco:A, 3qqa:A
69 8pv1:CI 152 82 0.2083 0.1316 0.2439 0.13 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
70 7abi:P 237 64 0.1667 0.0675 0.2500 0.18 7aav:P, 7abg:P
71 2l41:A 77 67 0.1771 0.2208 0.2537 0.19 2xnr:A
72 8by6:B 152 56 0.1771 0.1118 0.3036 0.21 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
73 2n7c:A 89 61 0.2083 0.2247 0.3279 0.23
74 8ch6:U 295 64 0.1667 0.0542 0.2500 0.24 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
75 7nhk:F 132 74 0.2396 0.1742 0.3108 0.25
76 3smz:A 280 56 0.1146 0.0393 0.1964 0.31
77 4f02:A 175 63 0.1771 0.0971 0.2698 0.35 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
78 7csz:A 175 50 0.1354 0.0743 0.2600 0.38
79 1plj:A 147 37 0.1458 0.0952 0.3784 0.40
80 7p7q:F 226 72 0.2396 0.1018 0.3194 0.47 7p7r:F, 7p7s:F, 7p7t:F
81 2vod:B 188 63 0.1667 0.0851 0.2540 0.93 2vod:A, 2von:A, 2von:B, 2voo:A, 2voo:B, 2vop:A, 1yty:A, 1yty:B, 1zh5:A, 1zh5:B
82 4qu6:A 99 92 0.2292 0.2222 0.2391 1.1
83 6fec:u 76 47 0.1354 0.1711 0.2766 1.4
84 8wg3:A 548 54 0.1458 0.0255 0.2593 2.0
85 1rk8:A 87 49 0.1042 0.1149 0.2041 2.7
86 8idf:A 459 85 0.1979 0.0414 0.2235 2.7
87 5dzt:A 886 34 0.1042 0.0113 0.2941 3.0
88 5o1y:A 163 62 0.1562 0.0920 0.2419 3.1 5o1z:A, 5o20:A
89 5zji:F 158 20 0.0938 0.0570 0.4500 4.1
90 4x95:B 377 37 0.1250 0.0318 0.3243 4.7 6mtw:A, 6mtw:B, 4x91:A, 4x91:B, 4x91:C, 4x91:D, 4x95:A, 4x97:A, 4x97:B, 4x97:C, 4x97:D
91 7s7b:C 79 52 0.1771 0.2152 0.3269 4.7 7s7b:G, 7s7c:C
92 6ha8:8 212 47 0.1667 0.0755 0.3404 5.2
93 7ane:t 226 47 0.1250 0.0531 0.2553 5.4
94 2yka:A 124 49 0.1458 0.1129 0.2857 5.7
95 3j3v:5 120 47 0.1667 0.1333 0.3404 6.4 3j3w:5
96 8fbm:A 426 38 0.1562 0.0352 0.3947 6.6 8fbm:B, 8fbt:B, 8fbt:A, 8fbu:A, 8fbu:B
97 7slp:B 321 60 0.1667 0.0498 0.2667 7.2 6d12:A, 6d12:B, 7slq:B, 4wkr:A, 4wkr:B
98 5ech:B 214 54 0.1667 0.0748 0.2963 8.2 5ech:C, 5ech:E, 5ech:F, 5eci:B, 5eci:C, 5eci:E, 5eci:F, 5eck:B, 5eck:C, 5eck:E, 5eck:F, 5ecl:B, 5ecl:C, 5ecl:E, 5ecl:F, 5ecm:B, 5ecm:C, 5ecm:E, 5ecm:F, 5ecn:B, 5ecn:C, 5ecn:E, 5ecn:F, 5eco:B, 5eco:C, 5eco:E, 5eco:F, 5ecp:B, 5ecp:C, 5ecp:E, 5ecp:F, 5ecq:B, 5ecq:C, 5ecq:E, 5ecq:F, 5ecr:B, 5ecr:C, 5ecr:E, 5ecr:F, 5ecs:A, 5ecs:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218