Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GPPKKLEELDPETREYWRLLRKHNIWRHNRLSKNRKF

The query sequence (length=37) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6ydp:Bq 85 37 1.0000 0.4353 1.0000 1.48e-21 5aj4:Bq, 6gaw:Bq, 6gb2:Bq, 7nqh:Bq, 7nql:Bq, 7nsh:Bq, 7nsi:Bq, 7nsj:Bq, 8oin:Bc, 8oiq:Bc, 6ydw:Bq
2 8k2a:L4 83 37 0.8108 0.3614 0.8108 8.73e-17 8any:l, 6i9r:l, 8k2b:L4, 7l08:l, 7l20:l, 7o9k:l, 7o9m:l, 7odr:l, 7ods:l, 7odt:l, 7og4:l, 8oir:Bc, 8oit:Bc, 7po4:l, 7qi4:l, 7qi5:l, 7qi6:l, 6vlz:l, 6vmi:l, 8xt0:L4, 8xt1:L4, 8xt2:L4, 8xt3:L4, 6zm5:l, 6zm6:l, 6zs9:l, 6zsa:l, 6zsb:l, 6zsc:l, 6zsd:l, 6zse:l, 6zsg:l
3 9f17:A 413 19 0.2432 0.0218 0.4737 0.43 9f17:B, 7pvo:A, 8qwa:A, 6zxq:A
4 8em7:A 4378 25 0.2432 0.0021 0.3600 0.77 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
5 8jxj:A 570 25 0.2432 0.0158 0.3600 0.89 8jxj:B
6 8em4:A 3818 25 0.2432 0.0024 0.3600 0.92 8em4:B
7 5oy0:A 751 19 0.2162 0.0107 0.4211 1.7 8am5:a, 8asl:a, 8asp:a, 6hqb:A, 4kt0:A, 4l6v:A, 4l6v:a, 4l6v:1, 6nwa:A, 6nwa:a, 6nwa:H, 7o1v:A, 5oy0:a, 5oy0:1, 7umh:A, 7umh:H, 7umh:a, 6uzv:A, 6uzv:a, 6uzv:1, 6vpv:A, 6vpv:a, 6vpv:1
8 8wm6:A 742 19 0.2162 0.0108 0.4211 1.8 8wmj:A, 8wmv:A, 8wmw:A, 7y7b:A, 7y8a:A
9 6ly5:a 742 19 0.2162 0.0108 0.4211 2.1 6l4u:A
10 6kmx:aA 717 18 0.2162 0.0112 0.4444 2.1 6kmx:bA, 6kmx:cA
11 6kmw:aA 721 18 0.2162 0.0111 0.4444 2.1 6kmw:bA, 6kmw:cA
12 6k61:A 742 18 0.2162 0.0108 0.4444 2.1 6jeo:aA, 6jeo:bA, 6jeo:cA, 6jeo:dA, 6k61:a, 6tcl:A1, 6tcl:A2, 6tcl:A, 6tcl:AA, 7y3f:A
13 6tra:A 746 18 0.2162 0.0107 0.4444 2.1 4fe1:A, 7fix:A1, 7fix:A2, 7fix:A3, 1jb0:A, 6k33:aA, 6k33:bA, 6k33:cA, 6lu1:A, 7m75:A, 7m76:A, 7m78:A, 3pcq:A, 6pfy:A, 6pfy:G, 6pfy:Y, 6pgk:A, 6pgk:G, 6pgk:Y, 6trc:A, 6trc:a, 6trc:1, 6trd:A, 6trd:a, 6trd:1, 5zf0:A1, 5zf0:A2, 5zf0:A3, 5zf0:A4, 5zf0:A6, 5zf0:A5
14 7s3d:A 749 18 0.2162 0.0107 0.4444 2.1 7s3d:G, 7s3d:a
15 7dr0:A 739 18 0.2162 0.0108 0.4444 2.1 7dr1:A, 7dr2:aA, 7dr2:bA, 7dr2:cA, 7dr2:dA
16 7blz:A 743 18 0.2162 0.0108 0.4444 2.1 6fos:A, 8wey:A, 5zgb:A, 5zgh:A
17 6kif:A 751 18 0.2162 0.0107 0.4444 2.1 6kif:G, 6kif:e, 6kig:A, 6kig:G, 6kig:e
18 7yca:A 742 18 0.2162 0.0108 0.4444 2.2 7a4p:A, 7bgi:A, 7blx:A, 8cmo:A, 7d0j:A, 7dz7:A, 7dz8:A, 8h2u:A, 6ijj:A, 6ijo:A, 6jo5:A, 6jo6:A, 7r3k:A, 7wyi:A, 7wzn:A, 7zq9:A, 7zqc:A, 7zqd:A, 7zqd:A2, 6zzx:A, 6zzy:A
19 7y5e:AN 745 18 0.2162 0.0107 0.4444 2.3 7y5e:A2, 7y7a:A7, 7y7a:Ao
20 7lx0:G 751 18 0.2162 0.0107 0.4444 2.3 7lx0:a, 7lx0:A, 6pnj:A, 6pnj:G, 6pnj:a
21 7f4v:aA 772 18 0.2162 0.0104 0.4444 2.3 7f4v:bA, 7f4v:cA
22 7qco:A 728 18 0.2162 0.0110 0.4444 2.4 7qco:E, 7qco:e, 7qco:a
23 5l8r:A 743 18 0.2162 0.0108 0.4444 2.4 8bcv:A, 8bcw:A, 7dkz:A, 7ew6:A, 7ewk:A, 7f9o:A, 7f9o:e, 8htu:A, 8j6z:A, 8j7a:A, 8j7b:A, 7ksq:A, 7kux:A, 6l35:A, 3lw5:A, 2o01:A, 4rku:A, 7wfd:AA, 7wfe:BA, 7wg5:AA, 7wg5:BA, 8wgh:A, 2wsc:A, 2wse:A, 2wsf:A, 4xk8:A, 4xk8:a, 7xqp:A, 4y28:A, 6yac:A, 6yez:A, 5zji:A, 6zoo:A, 6zxs:A
24 3ahm:A 564 22 0.2703 0.0177 0.4545 2.5 3ahm:B, 3ahn:A, 3ahn:B, 3aho:A, 3aho:B
25 8amp:A 65 22 0.2703 0.1538 0.4545 3.0
26 6igz:A 740 18 0.2162 0.0108 0.4444 3.4 6qph:A, 6rhz:A, 6sl5:A, 6yxr:A
27 2h1n:A 566 19 0.2432 0.0159 0.4737 3.5 2h1j:A, 2h1j:B, 2h1n:B
28 2pfz:A 301 43 0.3243 0.0399 0.2791 4.7
29 7air:A 885 13 0.1892 0.0079 0.5385 5.0 7aip:A, 7aip:B, 7aiq:A, 7aiq:B, 7air:B, 6kkr:A, 6kkr:B, 6kkt:A, 6kkt:B, 6kku:A, 6kku:B, 7tti:A, 7tti:B
30 7d99:A 891 13 0.1892 0.0079 0.5385 5.0 7d99:B, 6ukn:A
31 6m0r:A 750 22 0.1892 0.0093 0.3182 5.2 7tao:A
32 1vpm:A 155 30 0.2703 0.0645 0.3333 5.2 1vpm:B, 1vpm:C
33 1gjq:A 541 21 0.2703 0.0185 0.4762 5.4 1bl9:A, 1bl9:B, 1gjq:B, 5guw:M, 5guw:N, 1hzu:A, 1hzv:A, 1n15:A, 1n15:B, 1n50:A, 1n50:B, 1n90:A, 1n90:B, 1nir:A, 1nir:B, 1nno:A, 1nno:B, 6tpo:A, 6tsi:A, 6tsi:B
34 7wrg:A 812 26 0.2162 0.0099 0.3077 6.0
35 2g9h:D 213 31 0.2703 0.0469 0.3226 7.0
36 4f86:A 275 17 0.2162 0.0291 0.4706 7.6 4f84:A, 4f86:B, 4f86:C, 4f86:E, 4f86:F, 4f86:H, 4f86:I, 4f86:J, 4f86:K, 4f86:L
37 8jjr:a 665 18 0.1892 0.0105 0.3889 9.0
38 8jze:a 670 18 0.1892 0.0104 0.3889 9.0 8jzf:a

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218