Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GPKPGDIFEVELAKNDNSLGICVTGGVNTSVRHGGIYVKAVIPQGAAESDGRIHKGDRVLAVNGVSLEGATHKQAVCTLR
NTGQVVHLLLEKGQSPT

The query sequence (length=97) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2m0z:A 97 97 1.0000 1.0000 1.0000 3.01e-67 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
2 8bq8:C 93 90 0.3814 0.3978 0.4111 1.42e-16 8bq8:A, 8bq8:B
3 7pc3:A 405 91 0.4021 0.0963 0.4286 9.98e-16 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
4 2ka9:A 189 93 0.4021 0.2063 0.4194 1.01e-15 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
5 2ka9:A 189 93 0.3196 0.1640 0.3333 7.69e-11 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
6 4xhv:A 94 85 0.3402 0.3511 0.3882 4.47e-13
7 7p73:A 420 85 0.3196 0.0738 0.3647 4.85e-12 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 5heb:A 119 73 0.2784 0.2269 0.3699 1.21e-11 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
9 4wyu:A 201 101 0.3505 0.1692 0.3366 6.18e-11 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
10 4wyu:A 201 99 0.3711 0.1791 0.3636 1.61e-08 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
11 2exg:A 101 90 0.3402 0.3267 0.3667 6.49e-11 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
12 2qt5:A 194 84 0.3196 0.1598 0.3690 7.22e-11 2qt5:B
13 2qt5:A 194 95 0.3299 0.1649 0.3368 5.47e-06 2qt5:B
14 2r4h:C 98 91 0.2680 0.2653 0.2857 7.37e-11
15 6xa7:B 96 84 0.3402 0.3438 0.3929 9.96e-11 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
16 3jxt:A 96 74 0.2887 0.2917 0.3784 1.84e-10 3jxt:B
17 1n7f:A 86 86 0.3196 0.3605 0.3605 5.93e-10 1n7f:B
18 8b82:A 108 93 0.3505 0.3148 0.3656 1.41e-09 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
19 7weg:B 96 77 0.2887 0.2917 0.3636 1.43e-09 7weg:A
20 8cn1:H 101 88 0.2990 0.2871 0.3295 1.66e-09 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
21 2koh:A 111 78 0.3299 0.2883 0.4103 2.73e-09 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
22 8bp4:A 93 82 0.2577 0.2688 0.3049 3.11e-09 8bp4:C, 8bp4:B
23 6gbe:A 119 87 0.3505 0.2857 0.3908 3.20e-09
24 6zbq:A 89 71 0.2784 0.3034 0.3803 3.61e-09 6zc4:A
25 7pcb:A 415 85 0.3711 0.0867 0.4235 4.59e-09 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
26 1l6o:A 95 65 0.2680 0.2737 0.4000 5.50e-09 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
27 7pc5:A 405 71 0.2784 0.0667 0.3803 6.89e-09
28 8c1t:A 90 87 0.2784 0.3000 0.3103 1.30e-08 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
29 2kaw:A 90 62 0.2680 0.2889 0.4194 1.86e-08 6lcb:A, 2mx6:A
30 4e34:A 87 76 0.3299 0.3678 0.4211 5.88e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
31 6x23:A 89 85 0.2474 0.2697 0.2824 5.09e-07
32 7qct:A 90 89 0.2887 0.3111 0.3146 5.48e-07 7qct:B
33 5zys:A 90 85 0.2577 0.2778 0.2941 5.54e-07
34 5wou:A 95 88 0.2784 0.2842 0.3068 5.56e-07
35 2i0i:A 81 81 0.2887 0.3457 0.3457 6.84e-07 2i0i:B, 2i0i:C
36 8bv7:A 95 58 0.1959 0.2000 0.3276 7.58e-07 8buw:A, 8buw:B
37 1ihj:B 95 65 0.2371 0.2421 0.3538 1.59e-06 1ihj:A
38 2pdz:A 86 70 0.2577 0.2907 0.3571 1.96e-05
39 4xh7:A 110 55 0.1753 0.1545 0.3091 2.16e-05
40 2m0v:A 128 56 0.2062 0.1562 0.3571 2.58e-05
41 1n7t:A 103 82 0.2577 0.2427 0.3049 3.16e-05 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
42 7qqm:A 413 93 0.2887 0.0678 0.3011 3.51e-05
43 7p70:A 407 70 0.2474 0.0590 0.3429 3.82e-05 7pc4:A, 7qql:A
44 2m0u:A 117 56 0.2268 0.1880 0.3929 8.21e-05
45 1rzx:A 98 66 0.2165 0.2143 0.3182 9.41e-05 5i7z:A, 1x8s:A
46 5oak:A 90 49 0.2062 0.2222 0.4082 1.56e-04 5oak:C
47 7qqn:C 414 69 0.2165 0.0507 0.3043 2.17e-04 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
48 3vqg:A 85 87 0.2577 0.2941 0.2874 2.23e-04
49 5n7d:A 423 91 0.2680 0.0615 0.2857 3.48e-04 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
50 3ch8:A 190 77 0.2577 0.1316 0.3247 4.05e-04 2qbw:A
51 2kpl:A 129 91 0.2680 0.2016 0.2857 5.20e-04
52 3r0h:D 199 91 0.2680 0.1307 0.2857 5.80e-04 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
53 3r0h:D 199 44 0.1340 0.0653 0.2955 8.0 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
54 6kz1:A 97 72 0.2474 0.2474 0.3333 6.80e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
55 4wsi:A 372 34 0.1340 0.0349 0.3824 0.001 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
56 2l4t:A 124 84 0.2784 0.2177 0.3214 0.001 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
57 2os6:A 89 87 0.2680 0.2921 0.2989 0.003
58 1b8q:A 127 64 0.2165 0.1654 0.3281 0.004
59 6q0m:B 94 82 0.2371 0.2447 0.2805 0.006
60 1zub:A 109 78 0.2474 0.2202 0.3077 0.008
61 7x2e:A 163 64 0.1959 0.1166 0.2969 0.018 2kbs:A
62 1u38:A 89 44 0.1546 0.1685 0.3409 0.039
63 4ydp:A 83 51 0.1443 0.1687 0.2745 0.073 4ydp:B
64 2egn:A 83 56 0.1753 0.2048 0.3036 0.074
65 3cyy:B 81 36 0.1443 0.1728 0.3889 0.086 3cyy:A
66 6hks:B 94 70 0.1649 0.1702 0.2286 0.17 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
67 7d6f:A 87 48 0.1649 0.1839 0.3333 0.18
68 6ar4:B 87 64 0.2165 0.2414 0.3281 0.22 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
69 4qys:B 418 43 0.1753 0.0407 0.3953 1.0 6hte:B, 6hte:D, 4qys:A
70 5ez0:D 95 87 0.2268 0.2316 0.2529 1.3 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
71 3pep:A 326 31 0.1134 0.0337 0.3548 1.3 1psa:A, 1psa:B, 6xct:A, 6xcy:A, 6xcz:A, 6xd2:A
72 3ghg:I 394 43 0.1649 0.0406 0.3721 1.9 3bvh:F, 3bvh:C, 3e1i:C, 3e1i:F, 2ffd:C, 2ffd:F, 1fib:A, 1fic:A, 1fic:B, 1fid:A, 2fib:A, 3fib:A, 1fza:C, 1fza:F, 1fzb:C, 1fzb:F, 1fzc:C, 1fzc:F, 1fze:C, 1fze:F, 1fzf:C, 1fzf:F, 1fzg:C, 1fzg:F, 3ghg:C, 3ghg:F, 3ghg:L, 3h32:C, 3h32:F, 2h43:C, 2h43:F, 2hlo:C, 2hlo:F, 2hod:C, 2hod:F, 2hod:I, 2hod:L, 2hpc:C, 2hpc:F, 2hpc:I, 2hpc:L, 3hus:C, 3hus:F, 1lt9:C, 1lt9:F, 1ltj:C, 1ltj:F, 1n86:C, 1n86:F, 2oyh:C, 2oyh:F, 2oyi:C, 2oyi:F, 2q9i:C, 2q9i:F, 1re3:C, 1re3:F, 1re4:C, 1re4:F, 1rf0:C, 1rf0:F, 1rf1:C, 1rf1:F, 2z4e:C, 2z4e:F
73 6nid:B 88 43 0.1340 0.1477 0.3023 2.8 6nid:A, 6nid:C
74 6gaw:BK 176 65 0.1546 0.0852 0.2308 4.4 7a5f:J3, 7a5g:J3, 7a5h:J, 7a5i:J3, 7a5j:J, 7a5k:J3, 5aj4:BK, 8any:J, 6gb2:BK, 6i9r:J, 3j7y:J, 3j9m:J, 8k2a:LK, 8k2b:LK, 7l08:J, 7l20:J, 7nqh:BK, 7nql:BK, 7nsh:BK, 7nsi:BK, 7nsj:BK, 6nu2:J, 6nu3:J, 7o9k:J, 7o9m:J, 7odr:J, 7ods:J, 7odt:J, 7of0:J, 7of2:J, 7of3:J, 7of4:J, 7of5:J, 7of6:J, 7of7:J, 7og4:XJ, 7oi6:J, 7oi7:J, 7oi8:J, 7oi9:J, 7oia:J, 7oib:J, 7oic:J, 7oid:J, 7oie:J, 8oin:BQ, 8oiq:BQ, 8oir:BQ, 8oit:BQ, 5ool:J, 5oom:J, 7pd3:J, 8pk0:J, 7po4:J, 7qi4:J, 7qi5:J, 7qi6:J, 8qsj:J, 8qu1:J, 8qu5:J, 4v19:K, 6vlz:J, 6vmi:J, 8xt0:LK, 8xt1:LK, 8xt2:LK, 8xt3:LK, 6ydp:BK, 6ydw:BK, 6zm5:J, 6zm6:J, 6zs9:XJ, 6zsa:XJ, 6zsb:XJ, 6zsc:XJ, 6zsd:XJ, 6zse:XJ, 6zsg:XJ
75 6gqi:A 529 27 0.0928 0.0170 0.3333 5.2 6gqi:B, 5m0z:A, 5m10:A, 7v8o:A, 7v8o:B, 7v8r:A, 7v8s:A, 7v8s:B
76 7koe:C 438 64 0.1959 0.0434 0.2969 5.3 7koe:G
77 1pso:E 326 40 0.1237 0.0368 0.3000 7.8 1qrp:E
78 2b1g:A 590 34 0.1340 0.0220 0.3824 8.5 2b1g:D, 2b1i:A, 2b1i:B, 1g8m:A, 2iu0:B, 2iu3:B, 1m9n:A, 1m9n:B, 1oz0:A, 1oz0:B, 1thz:A, 1thz:B
79 5a31:O 685 50 0.1753 0.0248 0.3400 8.6 5lcw:O, 6tlj:O, 4ui9:O
80 6yx0:B 112 47 0.1546 0.1339 0.3191 9.3 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
81 1mkm:A 246 97 0.2268 0.0894 0.2268 9.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218