BioLiP

>protein
GIYYTPKIIVDYIVKKTLKNHDIIKNPYPRILDISCGCGNFLLEVYDILYDLFEENIYELKKKYDENYWTVDNIHRHILN
YCIYGADIDEKAISILKDSLTNKIKINLFCCDSLKKKWRYKFDYIVGNPPYIGHKKLEKKYKKFLLEKYSEVYKDKADLY
FCFYKKIIDILKQGGIGSVITPRYFLESLSGKDLREYIKSNVNVQEIVDFLGANIFKNIGVSSCILTFDKKKTKETYIDV
FKIKNEDICINKFETLEELLKSSKFEHFNINQRLLSDEWILVNKDDETFYNKIQEKCKYSLEDIAISFQGIITGCDKAFI
LSKDDVKLNLVDDKFLKCWIKSKNINKYIVDKSEYRLIYSNDIDNENTNKRILDEIIGLYKTKLENRRECKSGIRKWYEL
QWGREKLFFERKKIMYPYKSNENRFAIDYDNNFSSADVYSFFIKEEYLDKFSYEYLVGILNSSVYDKYFKITAKKMSKNI
YDYYPNKVMKIRIFRDNNYEEIENLSKQIISILLNKSIDKGKVEKLQIKMDNLIMDSLGI

The query sequence (length=540) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7lt5:B	576	550	1.0000	0.9375	0.9818	0.0	8cxs:A, 8cxs:B, 8cxs:C, 8cxt:A, 8cxt:B, 8cxt:C, 8cxu:A, 8cxu:B, 8cxu:C, 8cxv:A, 8cxv:B, 8cxv:C, 8cxw:A, 8cxw:B, 8cxw:C, 8cxx:A, 8cxx:B, 8cxx:C, 8cxy:A, 8cxy:B, 8cxy:C, 8cxz:A, 8cxz:B, 8cxz:C, 8cy0:A, 8cy0:B, 8cy0:C, 8cy1:A, 8cy1:B, 8cy1:C, 8cy2:A, 8cy2:B, 8cy2:C, 8cy3:A, 8cy3:B, 8cy3:C, 8cy4:A, 8cy4:B, 8cy4:C, 8cy5:A, 8cy5:B, 8cy5:C, 8fs1:A, 8fs1:B, 8fs1:C, 8fs2:A, 8fs2:B, 8fs2:C, 7lni:A, 7lni:B, 7lni:C, 7lnj:A, 7lnj:B, 7lnj:C, 7lt5:A, 7lt5:C, 7rfk:A, 7rfk:B, 7rfk:C, 7rfl:A, 7rfl:B, 7rfl:C, 7rfm:A, 7rfm:B, 7rfm:C, 7rfn:A, 7rfn:B, 7rfn:C, 8vpg:A, 8vpg:B, 8vpg:C, 8vph:A, 8vph:B, 8vph:C, 8vpi:A, 8vpi:B, 8vpi:C
2	7qw6:A	556	509	0.2444	0.2374	0.2593	9.18e-29	7qw5:A, 7qw7:A
3	2okc:B	426	247	0.1148	0.1455	0.2510	6.49e-09	2okc:A
4	7vru:A	497	257	0.1111	0.1207	0.2335	1.71e-06	7vs4:A
5	2np6:A	394	234	0.1074	0.1472	0.2479	1.84e-06	2adm:A, 2adm:B, 1aqi:A, 1aqi:B, 1aqj:A, 1aqj:B, 1g38:A, 1g38:D, 2ibs:A, 2ibs:D, 2ibt:A, 2ibt:D, 2ih2:A, 2ih2:D, 2ih4:A, 2ih4:D, 2ih5:A, 2jg3:A, 2jg3:D, 2np6:D, 2np7:A
6	8c45:A	1218	132	0.0630	0.0279	0.2576	1.68e-05	8c45:B, 8q56:A
7	8c45:A	1218	66	0.0407	0.0181	0.3333	1.73e-04	8c45:B, 8q56:A
8	7lo5:A	1016	322	0.1426	0.0758	0.2391	6.30e-05	7lo5:B, 7lo5:C, 7lo5:D, 7lvv:A, 7lvv:B, 7lvv:C, 7lvv:D
9	7btq:A	474	243	0.0944	0.1076	0.2099	0.001	7btq:D
10	2y7h:B	529	245	0.0981	0.1002	0.2163	0.009	2y7h:C
11	3ldu:A	377	146	0.0759	0.1088	0.2808	0.009
12	7vru:B	494	118	0.0630	0.0688	0.2881	0.084	7vs4:B
13	4ymu:J	240	95	0.0519	0.1167	0.2947	0.98	4ymu:A, 4ymv:J, 4ymv:A
14	5ffj:A	1044	188	0.0852	0.0441	0.2447	1.8
15	4xqk:A	1517	408	0.1611	0.0574	0.2132	2.3	4xqk:B
16	2yxo:B	265	123	0.0500	0.1019	0.2195	4.5	2yxo:A, 2yz5:A, 2yz5:B, 2z4g:A, 2z4g:B
17	2a9g:D	406	43	0.0296	0.0394	0.3721	6.6	2a9g:A, 2a9g:B, 2a9g:C
18	8x3w:A	270	50	0.0352	0.0704	0.3800	6.7	8x3w:B, 8x41:A, 8x41:B, 8x44:A, 8x44:B, 8x45:A, 8x45:B, 8x46:A, 8x46:B, 8x47:A, 8x4i:A, 8x4l:A, 8x4l:B, 8x4o:A, 8x4o:B, 8x4p:A, 8x4p:B
19	7d5c:A	919	147	0.0685	0.0403	0.2517	7.1
20	4c3h:A	1523	172	0.0778	0.0276	0.2442	7.5	4c2m:A, 4c2m:P, 4c3j:A
21	4ym7:BA	1462	172	0.0778	0.0287	0.2442	7.5	6hko:A, 6hlq:A, 6hlr:A, 5m5x:A, 5oa1:A, 5w5y:A, 5w64:A, 5w65:A, 5w66:A
22	6hls:A	1431	172	0.0778	0.0294	0.2442	7.6	5lmx:A
23	5m5w:A	1493	172	0.0778	0.0281	0.2442	7.7	4c3i:A, 4ym7:AA, 4ym7:CA, 4ym7:DA, 4ym7:EA, 4ym7:FA
24	5g5l:A	1480	172	0.0778	0.0284	0.2442	8.0	6h67:A, 6h68:A, 5m3m:A, 5m5y:A, 5m64:A, 5n5y:A, 5n5z:A, 5n60:A, 6rqt:A, 6rrd:A, 6rui:A, 6ruo:A, 6rwe:A, 6tps:A
25	7yjk:A	445	184	0.0741	0.0899	0.2174	8.1	7yjk:E, 7yjn:A, 7yjo:A
26	5m3f:A	1459	172	0.0778	0.0288	0.2442	8.2	5n61:A

[Back]