BioLiP

>protein
GATAVSEWTEYKTADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELK

The query sequence (length=37) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2jup:W	37	37	1.0000	1.0000	1.0000	2.22e-21	2rly:W, 2rm0:W
2	8pxx:A	99	34	0.5946	0.2222	0.6471	6.50e-10	2dyf:A
3	8pxx:A	99	29	0.4865	0.1818	0.6207	1.04e-06	2dyf:A
4	7lp2:E	37	28	0.3514	0.3514	0.4643	0.006	2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
5	6jjy:A	128	28	0.2703	0.0781	0.3571	0.12	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
6	1i5h:W	50	27	0.2162	0.1600	0.2963	0.31
7	2nc3:A	33	26	0.2703	0.3030	0.3846	0.48	2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
8	2ltv:A	36	27	0.2432	0.2500	0.3333	0.50	2law:A
9	4xjj:A	105	26	0.2432	0.0857	0.3462	0.72	4p7u:A
10	2laj:A	40	27	0.2162	0.2000	0.2963	0.83
11	8sg2:A	163	20	0.2432	0.0552	0.4500	1.1	6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
12	2n8t:A	39	26	0.2432	0.2308	0.3462	1.2
13	2vrq:A	493	33	0.4054	0.0304	0.4545	1.2	2vrq:B, 2vrq:C, 6zt7:A, 6zt7:B, 6zt7:C, 6zt9:A, 6zt9:B, 6zt9:C
14	5dws:C	40	27	0.2162	0.2000	0.2963	1.3
15	1jmq:A	46	28	0.2432	0.1957	0.3214	1.4	1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
16	1z3a:A	156	30	0.2432	0.0577	0.3000	1.5	3ocq:A, 1z3a:B
17	7np8:B	620	26	0.3243	0.0194	0.4615	1.6	7np8:A, 7np8:C, 7np8:D
18	2g7c:B	254	20	0.2703	0.0394	0.5000	2.7	2g7c:A
19	2g7c:B	254	17	0.2432	0.0354	0.5294	5.3	2g7c:A
20	5cq2:A	76	27	0.2162	0.1053	0.2963	2.8	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
21	8jhz:A	2615	12	0.2432	0.0034	0.7500	3.4
22	8jhz:A	2615	17	0.2432	0.0034	0.5294	7.6
23	8jhz:A	2615	17	0.2432	0.0034	0.5294	7.6
24	8jhz:A	2615	13	0.2162	0.0031	0.6154	8.8
25	2m3o:W	43	27	0.1892	0.1628	0.2593	3.6	2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
26	7pog:A	2382	27	0.3243	0.0050	0.4444	4.4	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
27	7pog:A	2382	16	0.2162	0.0034	0.5000	5.1	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
28	7pog:A	2382	20	0.2703	0.0042	0.5000	6.5	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
29	2pfy:A	301	17	0.2432	0.0299	0.5294	5.3	2pfy:B, 2pfy:C, 2pfy:D
30	1kb0:A	670	21	0.2703	0.0149	0.4762	5.3
31	2ez5:W	46	28	0.1622	0.1304	0.2143	6.1
32	8x2h:A	2363	19	0.2432	0.0038	0.4737	7.0	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
33	8x2i:A	2303	19	0.2432	0.0039	0.4737	7.3
34	7lp3:A	37	26	0.2432	0.2432	0.3462	7.4	7lp3:C
35	7lcc:A	1369	29	0.2162	0.0058	0.2759	7.7
36	7kb1:A	428	19	0.2162	0.0187	0.4211	7.9	7kb1:B, 7kb1:C, 7kb1:D
37	1yiq:A	684	21	0.2432	0.0132	0.4286	9.2
38	4lcd:A	419	29	0.2162	0.0191	0.2759	9.3	4lcd:B

[Back]