Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFV
LAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHF
TFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLN
KKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLK

The query sequence (length=320) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1agr:A 350 320 0.9938 0.9086 0.9938 0.0 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
2 3ffb:A 327 320 0.9187 0.8991 0.9187 0.0 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
3 3v00:C 353 319 0.7719 0.6997 0.7743 0.0 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
4 3c7k:C 311 311 0.7094 0.7299 0.7299 3.24e-167 3c7k:A
5 1shz:D 327 328 0.7031 0.6881 0.6860 6.13e-166 1shz:A
6 8pjk:A 222 170 0.5156 0.7432 0.9706 5.58e-123 7e2x:A, 7e2z:A
7 8pjk:A 222 33 0.0750 0.1081 0.7273 1.16e-06 7e2x:A, 7e2z:A
8 7rkf:A 350 320 0.5375 0.4914 0.5375 1.76e-113
9 8iys:A 355 326 0.5375 0.4845 0.5276 2.53e-110 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
10 1zca:A 318 321 0.4281 0.4308 0.4268 9.43e-89 1zca:B
11 3ab3:A 322 327 0.4313 0.4286 0.4220 1.27e-88 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
12 8fn0:B 212 168 0.3969 0.5991 0.7560 5.78e-87
13 8fn0:B 212 27 0.0688 0.1038 0.8148 1.31e-05
14 8htg:B 334 327 0.4500 0.4311 0.4404 4.08e-85 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
15 6eg8:I 372 334 0.4469 0.3844 0.4281 2.19e-82 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
16 2xtz:A 343 332 0.4156 0.3878 0.4006 6.91e-76
17 4fid:A 318 321 0.3844 0.3868 0.3832 1.81e-71 4fid:B
18 2xtz:B 291 325 0.4031 0.4433 0.3969 2.65e-69
19 8uo1:A 334 333 0.4156 0.3982 0.3994 1.36e-66 8gga:A
20 8ggb:A 310 331 0.4031 0.4161 0.3897 3.81e-64 8gg9:A, 8ggc:A
21 2xtz:C 270 325 0.3719 0.4407 0.3662 5.35e-59
22 8uo4:A 292 330 0.3594 0.3938 0.3485 7.59e-49 8uo2:A
23 8xql:A 240 185 0.2656 0.3542 0.4595 7.15e-44
24 8xql:A 240 23 0.0563 0.0750 0.7826 3.57e-04
25 8unx:A 244 184 0.2500 0.3279 0.4348 1.92e-43 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
26 8unx:A 244 21 0.0594 0.0779 0.9048 1.34e-04 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
27 3lvq:E 420 97 0.0969 0.0738 0.3196 5.38e-09 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28 6bbp:A 520 97 0.0938 0.0577 0.3093 8.70e-08 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
29 6bbp:A 520 93 0.0813 0.0500 0.2796 0.34 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
30 8d4c:C 180 97 0.0938 0.1667 0.3093 2.75e-07 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
31 3lrp:A 181 97 0.0938 0.1657 0.3093 4.19e-07
32 6a8d:A 181 110 0.0969 0.1713 0.2818 1.22e-06
33 6a8d:A 181 52 0.0531 0.0939 0.3269 0.46
34 2k5u:A 181 99 0.0938 0.1657 0.3030 3.46e-06 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
35 7rll:B 177 95 0.0906 0.1638 0.3053 4.05e-06 7rll:A
36 7rll:B 177 43 0.0406 0.0734 0.3023 7.4 7rll:A
37 1z6x:A 175 97 0.0875 0.1600 0.2887 5.71e-06 1z6x:B
38 2h57:B 167 145 0.1156 0.2216 0.2552 1.68e-05 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
39 2h57:B 167 44 0.0500 0.0958 0.3636 9.4 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
40 8e0c:A 185 114 0.0844 0.1459 0.2368 9.99e-05 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
41 1upt:G 170 97 0.0844 0.1588 0.2784 1.15e-04 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
42 3aq4:A 170 97 0.0844 0.1588 0.2784 1.87e-04 3aq4:B
43 1yzg:A 168 84 0.0781 0.1488 0.2976 1.99e-04
44 3o47:A 289 97 0.0875 0.0969 0.2887 2.48e-04 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
45 5di3:B 204 103 0.0875 0.1373 0.2718 3.20e-04 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
46 5uf8:D 160 97 0.0844 0.1688 0.2784 3.34e-04
47 6pta:A 165 97 0.0813 0.1576 0.2680 5.58e-04 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
48 4y0v:A 165 97 0.0844 0.1636 0.2784 7.68e-04 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
49 2b6h:A 171 97 0.0781 0.1462 0.2577 0.001
50 5de3:A 166 79 0.0656 0.1265 0.2658 0.002 5di3:A
51 4ile:A 176 95 0.0719 0.1307 0.2421 0.002 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
52 3doe:A 189 86 0.0750 0.1270 0.2791 0.002 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
53 3doe:A 189 21 0.0344 0.0582 0.5238 6.9 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
54 6zga:C 168 115 0.0906 0.1726 0.2522 0.004 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
55 2x77:A 181 85 0.0688 0.1215 0.2588 0.006 2x77:B
56 8oun:A 181 193 0.1125 0.1989 0.1865 0.016 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
57 8oul:A 185 99 0.0875 0.1514 0.2828 0.040 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
58 4v0l:A 168 95 0.0781 0.1488 0.2632 0.070 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
59 6mao:A 137 58 0.0563 0.1314 0.3103 0.26
60 4bas:A 172 55 0.0531 0.0988 0.3091 0.27
61 4q66:C 134 69 0.0594 0.1418 0.2754 0.44
62 6i3p:C 630 87 0.0656 0.0333 0.2414 0.54 6i3p:A, 6i3p:B, 6i3p:D, 6qic:A, 6qic:B, 6qic:C, 6qic:D
63 3p27:B 444 195 0.1500 0.1081 0.2462 0.69 3p27:A
64 1moz:A 178 88 0.0719 0.1292 0.2614 0.96 8ezj:C, 8ezj:D, 1moz:B
65 8e0a:A 168 85 0.0594 0.1131 0.2235 1.1 8e0b:A
66 4zi2:A 185 79 0.0563 0.0973 0.2278 1.4 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
67 4zi2:A 185 22 0.0344 0.0595 0.5000 3.4 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
68 5z3g:X 202 39 0.0344 0.0545 0.2821 1.4
69 8dr5:A 646 38 0.0469 0.0232 0.3947 2.4 8dqx:A, 8dqz:A, 8dr0:A, 8dr1:A, 8dr3:A, 8dr4:A, 8dr6:A, 8dr7:A, 1sxj:A, 7tfh:A, 7tfi:A, 7tfj:A, 7thj:A, 7thv:A, 7ti8:A, 7tib:A, 7tic:A, 7tid:A, 7tku:A, 7u19:A, 7u1a:A, 7u1p:A
70 7tfk:A 360 38 0.0469 0.0417 0.3947 2.7 7tfl:A
71 4wnr:A 323 21 0.0344 0.0341 0.5238 2.9
72 8e0h:A 179 106 0.0688 0.1229 0.2075 3.0 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
73 5djs:A 520 98 0.0844 0.0519 0.2755 3.3 5djs:B, 5djs:C, 5djs:D
74 6rm8:A 655 74 0.0813 0.0397 0.3514 9.9 6fa5:A, 6faa:A, 6fac:A, 6rm9:A, 6rma:A, 6rmb:A, 6rmc:A, 6rmc:B, 6zm2:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218