BioLiP

>protein
EVSQDLFNQFNLFAQYSAAAYCGKNNDAPAGTNITCTGNACPEVEKADATFLYSFEDSGVGDVTGFLALDNTNKLIVLSF
RGSRSIENWIGNLNFDLKEINDICSGCRGHDGFTSSWRSVADTLRQKVEDAVREHPDYRVVFTGHSLGGALATVAGADLR
GNGYDIDVFSYGAPRVGNRAFAEFLTVQTGGTLYRITHTNDIVPRLPPREFGYSHSSPEYWIKSGTLVPVTRNDIVKIEG
IDATGGNNQPNIPDIPAHLWYFGLIGTCL

The query sequence (length=269) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7apn:A	269	269	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7apn:B, 4flf:A, 4gi1:A, 4gi1:B, 4glb:A, 4glb:B, 1gt6:A, 1gt6:B, 6hw1:B, 4kjx:B, 4n8s:A, 4n8s:B, 6o8v:A, 6o9f:A, 6o9f:F, 6o9f:B, 6o9f:C, 6o9f:E, 6o9f:D, 6osz:A, 6osz:F, 6osz:B, 6osz:C, 6osz:E, 6osz:D, 4s0x:B, 6xok:A, 6xrv:A, 6xrv:F, 6xrv:B, 6xrv:C, 6xrv:E, 6xrv:D, 6xs3:A, 6xs3:F, 6xs3:B, 6xs3:C, 6xs3:E, 6xs3:D
2	5ch8:A	270	266	0.4201	0.4185	0.4248	4.29e-74
3	1uwc:A	261	281	0.3197	0.3295	0.3060	7.43e-34	2bjh:A, 2bjh:B, 2bjh:C, 1uwc:B
4	5gw8:B	286	225	0.2156	0.2028	0.2578	4.19e-16
5	3uue:A	279	123	0.1524	0.1470	0.3333	1.02e-14	4zrd:A
6	7xey:B	519	77	0.0781	0.0405	0.2727	0.020
7	4nfu:A	619	109	0.1190	0.0517	0.2936	0.035	7xey:A
8	7xjp:A	580	108	0.1152	0.0534	0.2870	0.049
9	7p0y:A	278	87	0.0929	0.0899	0.2874	0.22	7p0y:B
10	2ppl:A	449	107	0.0967	0.0579	0.2430	0.24
11	7prm:A	295	43	0.0595	0.0542	0.3721	0.51	8aqf:A, 6ax1:A, 6ax1:B, 6bq0:A, 6bq0:B, 3hju:A, 3hju:B, 3jwe:A, 3jwe:B, 7l4t:A, 7l4u:A, 7l4u:B, 7l4w:A, 7l4w:B, 7l50:A, 7l50:B, 7l50:C, 7l50:D, 3pe6:A, 8ptc:A, 8ptq:A, 8ptr:A, 4uuq:A, 4uuq:B, 7zpg:A, 5zun:A
12	5v4a:A	268	64	0.0781	0.0784	0.3281	1.0	5v4a:B
13	5tuo:F	199	57	0.0595	0.0804	0.2807	1.4	5tt8:D
14	2vfr:A	418	85	0.0929	0.0598	0.2941	1.8	2vfs:A, 2vft:A, 2vfu:A, 2vfv:A
15	1e6i:A	110	90	0.0743	0.1818	0.2222	2.1
16	1rp1:A	441	190	0.1673	0.1020	0.2368	2.2
17	7c1s:A	433	50	0.0706	0.0439	0.3800	2.6	7c1l:A, 7c1r:A
18	1gpl:A	432	160	0.1413	0.0880	0.2375	3.0
19	5dxi:A	290	75	0.0706	0.0655	0.2533	3.2	5dxi:B
20	6qgn:A	223	114	0.0967	0.1166	0.2281	4.1	6qgn:B, 6qgn:C, 6qgn:D, 5sym:A, 5sym:B
21	5fcz:A	499	72	0.0855	0.0461	0.3194	4.8	4c7f:A, 4c7f:B, 4c7g:A, 1hp5:A, 1jak:A, 1m01:A, 1m03:A, 1m04:A
22	1ygp:A	858	24	0.0335	0.0105	0.3750	5.4	1ygp:B
23	1w52:X	448	120	0.1152	0.0692	0.2583	5.6
24	4p9c:A	136	42	0.0483	0.0956	0.3095	5.8	4p9c:B, 4p9c:C, 4p9c:D, 4p9c:E, 4p9c:F, 4p9c:G, 4p9c:H, 4p9c:I, 4p9c:J, 4p9c:K, 4p9c:L, 4p9d:A, 4p9d:B, 4p9d:C, 4p9d:D, 4p9d:E, 4p9d:F, 4p9e:A
25	7prb:B	438	41	0.0483	0.0297	0.3171	6.1	8ohw:AAA, 8ohw:BBB, 7pr9:A, 7pr9:B, 7prb:A
26	7ubz:D	202	90	0.0967	0.1287	0.2889	7.2	7ubz:B
27	6gy5:A	285	148	0.1338	0.1263	0.2432	7.4
28	3a52:A	400	82	0.0892	0.0600	0.2927	9.0	3a52:B
29	6hiv:DD	791	50	0.0558	0.0190	0.3000	9.5	6hiw:DD, 6hiy:DD, 7pua:DD, 7pub:DD, 6sga:DD, 6sgb:DD
30	7ryt:B	368	49	0.0595	0.0435	0.3265	9.8	8f2l:B, 8f2l:A, 8f2l:C, 8f2l:D, 8f2l:F, 8f2l:G, 8f2l:H, 8f2l:I, 8f2l:J, 8f2l:K, 8f2l:L, 6pux:A, 6pux:B, 7ryt:A, 7ryt:C, 7ryt:D, 7ryt:E, 7ryt:F

[Back]