Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ETDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKEFVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKP

The query sequence (length=67) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2gli:A 155 67 1.0000 0.4323 1.0000 1.05e-46 7t91:A, 7t91:B
2 2gli:A 155 41 0.1940 0.0839 0.3171 0.41 7t91:A, 7t91:B
3 2rpc:A 155 78 0.4776 0.2065 0.4103 2.06e-13 2ej4:A
4 2rpc:A 155 67 0.3731 0.1613 0.3731 5.37e-06 2ej4:A
5 5y0u:A 109 66 0.4179 0.2569 0.4242 1.64e-11
6 6wmi:A 146 64 0.3433 0.1575 0.3594 1.00e-04 6wmi:D
7 6wmi:A 146 64 0.3134 0.1438 0.3281 7.10e-04 6wmi:D
8 6wmi:A 146 67 0.3134 0.1438 0.3134 8.55e-04 6wmi:D
9 6a57:A 131 64 0.3134 0.1603 0.3281 1.13e-04 6a58:A, 6a59:A, 6jnl:A, 6jnm:A, 6jnm:B, 6jnn:A, 6jnn:B, 6jnn:N, 6jnn:G
10 1p47:A 87 64 0.3284 0.2529 0.3438 1.47e-04 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
11 2ytq:A 46 27 0.1940 0.2826 0.4815 6.67e-04 2eog:A
12 2ebt:A 100 64 0.2985 0.2000 0.3125 7.05e-04
13 2ebt:A 100 59 0.2985 0.2000 0.3390 0.028
14 2ebt:A 100 37 0.1940 0.1300 0.3514 0.77
15 5ke9:A 88 64 0.2836 0.2159 0.2969 0.001 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
16 5ke9:A 88 59 0.2687 0.2045 0.3051 0.15 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
17 2dlk:A 79 60 0.2836 0.2405 0.3167 0.004
18 4is1:D 54 26 0.1940 0.2407 0.5000 0.006 4f2j:C, 4is1:C, 3uk3:C, 3uk3:D
19 1g2d:C 89 64 0.3284 0.2472 0.3438 0.007 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
20 2el4:A 46 27 0.1940 0.2826 0.4815 0.010
21 2ytf:A 46 26 0.1940 0.2826 0.5000 0.010 2eof:A
22 2ee8:A 106 36 0.2239 0.1415 0.4167 0.011
23 1ubd:C 114 59 0.2687 0.1579 0.3051 0.012
24 1ubd:C 114 64 0.2836 0.1667 0.2969 2.3
25 5v3g:D 170 59 0.2985 0.1176 0.3390 0.016 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
26 5v3g:D 170 59 0.3134 0.1235 0.3559 0.021 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
27 5v3g:D 170 59 0.3134 0.1235 0.3559 0.035 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
28 1tf6:D 182 64 0.2985 0.1099 0.3125 0.033 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
29 1tf6:D 182 35 0.1642 0.0604 0.3143 1.9 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
30 6b0o:A 119 35 0.2388 0.1345 0.4571 0.034 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
31 6b0o:A 119 64 0.3284 0.1849 0.3438 0.23 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
32 6b0o:A 119 22 0.1343 0.0756 0.4091 1.8 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
33 2dlq:A 124 21 0.1791 0.0968 0.5714 0.055
34 6ml4:A 143 59 0.2985 0.1399 0.3390 0.065 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
35 6ml4:A 143 61 0.2985 0.1399 0.3279 1.4 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
36 2en6:A 46 27 0.1791 0.2609 0.4444 0.073
37 6e93:A 112 58 0.3284 0.1964 0.3793 0.090 6e94:A
38 6e93:A 112 27 0.1791 0.1071 0.4444 0.89 6e94:A
39 2emw:A 44 26 0.1791 0.2727 0.4615 0.094
40 2em4:A 46 21 0.1642 0.2391 0.5238 0.096
41 8a4i:L 56 26 0.1791 0.2143 0.4615 0.100 8a4i:I, 8a4i:K, 8a4i:J, 8cuc:F, 8cuc:G, 7y3i:B, 7y3i:A, 7y3k:A, 7y3k:B
42 8e3e:F 121 19 0.1940 0.1074 0.6842 0.12 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
43 8e3e:F 121 59 0.2836 0.1570 0.3220 0.32 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
44 2m9a:A 89 35 0.1940 0.1461 0.3714 0.14
45 2emy:A 46 21 0.1493 0.2174 0.4762 0.19 2el5:A
46 1x6e:A 72 27 0.1940 0.1806 0.4815 0.27
47 2eoi:A 44 26 0.1791 0.2727 0.4615 0.30
48 2i13:B 144 59 0.2836 0.1319 0.3220 0.30
49 2i13:B 144 59 0.2836 0.1319 0.3220 2.6
50 2en7:A 44 33 0.1791 0.2727 0.3636 0.35
51 1f2i:G 66 60 0.2687 0.2727 0.3000 0.38 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
52 1f2i:G 66 42 0.1791 0.1818 0.2857 8.5 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
53 2eme:A 46 35 0.2239 0.3261 0.4286 0.42
54 2i13:A 151 59 0.2836 0.1258 0.3220 0.43
55 2i13:A 151 60 0.2985 0.1325 0.3333 2.3
56 5wjq:D 281 60 0.3284 0.0783 0.3667 0.46 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
57 5wjq:D 281 59 0.2836 0.0676 0.3220 4.7 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
58 1va1:A 37 37 0.1940 0.3514 0.3514 0.48
59 2csh:A 110 27 0.1940 0.1182 0.4815 0.54
60 2en9:A 46 26 0.1791 0.2609 0.4615 0.56
61 2epu:A 45 25 0.1791 0.2667 0.4800 0.67
62 2eow:A 46 21 0.1343 0.1957 0.4286 0.73
63 7y3l:A 57 21 0.1493 0.1754 0.4762 0.86
64 2ent:A 48 35 0.2090 0.2917 0.4000 0.92
65 2lce:A 64 63 0.2687 0.2812 0.2857 0.97
66 2epa:A 72 59 0.2687 0.2500 0.3051 1.1
67 2epa:A 72 35 0.2090 0.1944 0.4000 1.3
68 2el6:A 46 26 0.1791 0.2609 0.4615 1.1
69 2ep0:A 46 21 0.1642 0.2391 0.5238 1.2
70 2eop:A 46 21 0.1493 0.2174 0.4762 1.2
71 2emj:A 46 26 0.1642 0.2391 0.4231 1.2
72 8tho:A 100 36 0.2090 0.1400 0.3889 1.5 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
73 2em2:A 46 21 0.1493 0.2174 0.4762 1.5
74 1llm:C 87 22 0.1642 0.1264 0.5000 1.6 1llm:D
75 2ytb:A 42 26 0.1493 0.2381 0.3846 1.8
76 1pfk:A 320 30 0.1642 0.0344 0.3667 1.9 1pfk:B
77 2emg:A 46 26 0.1493 0.2174 0.3846 2.1
78 1zw8:A 64 24 0.1343 0.1406 0.3750 2.1
79 1zw8:A 64 43 0.1642 0.1719 0.2558 9.3
80 4gl9:F 126 37 0.1791 0.0952 0.3243 2.3 4gl9:G, 4gl9:E, 4gl9:H, 2hmh:A
81 2emx:A 44 27 0.1642 0.2500 0.4074 2.8
82 2rsj:A 92 58 0.2537 0.1848 0.2931 2.9 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
83 2rsj:A 92 35 0.1940 0.1413 0.3714 3.8 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
84 7w1m:H 322 64 0.3134 0.0652 0.3281 3.0 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
85 7w1m:H 322 15 0.1493 0.0311 0.6667 6.6 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
86 7txc:E 84 56 0.2687 0.2143 0.3214 3.2
87 8ffz:A 314 39 0.1642 0.0350 0.2821 3.4
88 2eq1:A 46 26 0.1642 0.2391 0.4231 3.5
89 2eol:A 42 24 0.1343 0.2143 0.3750 3.6
90 2yrh:A 44 36 0.1940 0.2955 0.3611 4.1
91 1mey:F 84 59 0.2687 0.2143 0.3051 4.4 1mey:C
92 6xyw:AH 110 13 0.1194 0.0727 0.6154 4.5
93 2en0:A 42 34 0.1791 0.2857 0.3529 4.6
94 2epy:A 42 24 0.1343 0.2143 0.3750 4.7
95 2emf:A 46 26 0.1493 0.2174 0.3846 4.9
96 2emk:A 46 21 0.1493 0.2174 0.4762 5.3
97 7y3m:C 70 19 0.1343 0.1286 0.4737 6.4 8u15:C, 8u15:F, 8u16:C, 8u16:F, 8u17:C, 8u17:F, 7y3m:B, 7y3m:A, 7y3m:F, 7y3m:J, 7y3m:I
98 2yrj:A 46 21 0.1493 0.2174 0.4762 6.6
99 2ep1:A 46 26 0.1791 0.2609 0.4615 6.7 2ep2:A
100 2dmd:A 96 28 0.1791 0.1250 0.4286 7.4
101 2ma7:A 73 14 0.1343 0.1233 0.6429 8.2
102 2emm:A 46 26 0.1642 0.2391 0.4231 9.4
103 2ysp:A 46 26 0.1194 0.1739 0.3077 9.6
104 2eq2:A 46 26 0.1642 0.2391 0.4231 9.6 2ytr:A
105 2em5:A 46 21 0.1642 0.2391 0.5238 9.7
106 2ely:A 46 19 0.1493 0.2174 0.5263 9.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218