Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ERVAVVGVPMDLGVDMGPSALRYARLLEQLEDLGYTVEDLGDVPVSLAYLEEIRAAALVLKERLAALPEGVFPIVLGGDH
SLSMGSVAGAARGRRVGVVWVDAHADFNTPETSSGNVHGMPLAVLSGLGHPRLTEVFRAVDPKDVVLVGVRSLDPGEKRL
LKEAGVRVYTMHEVDRLGVARIAEEVLKHLQGLPLHVSLDADVLDPTLAPGVGTPVPGGLTYREAHLLMEILAESGRVQS
LDLVEVNPILDERNRTAEMLVGLALSLLGKRIF

The query sequence (length=273) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2ef5:A 273 273 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 2ef5:B, 2ef5:D, 2ef5:E, 2ef5:F, 2ef5:G
2 1cev:A 299 297 0.5714 0.5217 0.5253 2.21e-97 1cev:B, 1cev:C, 1cev:D, 1cev:E, 1cev:F, 2cev:A, 2cev:C, 2cev:B, 2cev:D, 2cev:E, 2cev:F, 3cev:A, 3cev:B, 3cev:C, 3cev:D, 3cev:E, 3cev:F, 4cev:A, 4cev:B, 4cev:C, 4cev:D, 4cev:E, 4cev:F, 5cev:A, 5cev:B, 5cev:C, 5cev:D, 5cev:F, 5cev:E
3 6nfp:A 292 292 0.5495 0.5137 0.5137 7.34e-97 6dkt:A, 6dkt:B, 6dkt:C, 6dkt:D, 6dkt:F, 6nfp:B, 6nfp:C, 6nfp:D, 6nfp:E, 6nfp:F
4 6nbk:A 289 288 0.5092 0.4810 0.4826 1.05e-88 6nbk:B, 6nbk:C, 6nbk:D, 6nbk:E, 6nbk:F
5 6dkt:E 268 283 0.5018 0.5112 0.4841 3.50e-87
6 1hqf:A 314 304 0.4322 0.3758 0.3882 8.61e-61 1d3v:A, 1d3v:B, 3e8q:A, 3e8q:B, 3e8q:C, 3e8z:A, 3e8z:B, 3e8z:C, 3e9b:A, 3e9b:B, 3e9b:C, 1hq5:A, 1hq5:B, 1hqf:B, 1hqf:C, 1hqg:A, 1hqg:B, 1hqg:C, 1hqh:A, 1hqh:B, 1hqh:C, 1hqx:A, 1hqx:B, 1hqx:C, 1p8m:A, 1p8m:B, 1p8m:C, 1p8n:A, 1p8n:B, 1p8n:C, 1p8o:A, 1p8o:B, 1p8o:C, 1p8p:A, 1p8p:B, 1p8p:C, 1p8q:A, 1p8q:B, 1p8q:C, 1p8r:A, 1p8r:B, 1p8s:A, 1p8s:B, 1p8s:C, 1r1o:A, 1r1o:B, 1r1o:C, 1rla:A, 1rla:B, 1rla:C, 2rla:A, 2rla:B, 2rla:C, 3rla:A, 3rla:B, 3rla:C, 4rla:A, 4rla:B, 4rla:C, 5rla:A, 5rla:B, 5rla:C, 1t4p:A, 1t4p:B, 1t4p:C, 1t4r:A, 1t4r:B, 1t4r:C, 1t4s:A, 1t4s:B, 1t4s:C, 1t4t:A, 1t4t:B, 1t4t:C, 1t5f:A, 1t5f:B, 1t5f:C, 1t5g:A, 1t5g:B, 1t5g:C, 1ta1:A, 1ta1:B, 1ta1:C, 1tbh:A, 1tbh:B, 1tbh:C, 1tbj:A, 1tbj:B, 1tbj:C, 1tbl:A, 1tbl:B, 1tbl:C, 1zpe:A, 1zpe:B, 1zpe:C, 1zpg:A, 1zpg:B, 1zpg:C
7 7k4g:E 319 298 0.4249 0.3636 0.3893 3.31e-60 2aeb:A, 2aeb:B, 8aup:A, 8aup:B, 8aup:C, 8aup:D, 8aup:E, 8aup:F, 3dj8:A, 3dj8:B, 8e5m:A, 8e5m:B, 8e5m:C, 8e5m:D, 8e5m:E, 8e5m:F, 8e5n:A, 8e5n:B, 8e5n:C, 8e5n:D, 8e5n:E, 8e5n:F, 3e6k:A, 3e6k:B, 3e6v:A, 3e6v:B, 3f80:A, 3f80:B, 4fci:A, 4fci:B, 4fck:A, 4fck:B, 3gmz:A, 3gmz:B, 3gn0:A, 3gn0:B, 4gsv:A, 4gsv:B, 4gsz:A, 4gsz:B, 4gwc:A, 4gwc:B, 4gwd:A, 4gwd:B, 4hww:A, 4hww:B, 4hxq:A, 4hxq:B, 4ie1:A, 4ie1:B, 7k4g:A, 7k4g:B, 7k4g:C, 7k4g:D, 7k4g:F, 7k4h:A, 7k4h:B, 7k4h:C, 7k4h:D, 7k4h:E, 7k4h:F, 7k4i:A, 7k4i:B, 7k4i:C, 7k4i:D, 7k4i:E, 7k4i:F, 7k4j:A, 7k4j:B, 7k4j:C, 7k4j:D, 7k4j:E, 7k4j:F, 7k4k:A, 7k4k:B, 7k4k:C, 7k4k:D, 7k4k:E, 7k4k:F, 7klk:A, 7klk:B, 7klk:C, 7klk:D, 7klk:E, 7klk:F, 7kll:A, 7kll:B, 7kll:C, 7kll:D, 7kll:E, 7kll:F, 7klm:A, 7klm:B, 7klm:C, 7klm:D, 7klm:E, 7klm:F, 3kv2:A, 3kv2:B, 7ley:A, 7ley:B, 7ley:C, 7lez:A, 7lez:B, 7lez:C, 7lez:M, 7lez:N, 7lez:J, 7lf1:A, 7lf1:B, 7lf1:C, 7lf1:J, 7lf1:M, 7lf1:N, 7lf2:A, 7lf2:B, 7lf2:C, 7lf2:J, 7lf2:Q, 7lf2:R, 3lp4:A, 3lp4:B, 3lp7:A, 3lp7:B, 3mfv:A, 3mfv:B, 3mfw:A, 3mfw:B, 3mjl:A, 3mjl:B, 2pha:A, 2pha:B, 2pho:A, 2pho:B, 2pll:A, 2pll:B, 6q92:A, 6q92:B, 6q9p:A, 6q9p:B, 6qaf:A, 6qaf:B, 3sjt:A, 3sjt:B, 3skk:A, 3skk:B, 3th7:A, 3th7:B, 3the:A, 3the:B, 3thh:A, 3thh:B, 3thj:A, 3thj:B, 6v7c:A, 6v7c:B, 6v7c:C, 6v7c:D, 6v7c:E, 6v7c:F, 6v7d:A, 6v7d:B, 6v7d:C, 6v7d:D, 6v7d:E, 6v7d:F, 6v7e:A, 6v7e:B, 6v7e:C, 6v7e:D, 6v7e:E, 6v7e:F, 6v7f:A, 6v7f:B, 6v7f:C, 6v7f:D, 6v7f:E, 6v7f:F, 1wva:A, 1wva:B, 1wvb:A, 1wvb:B, 2zav:A, 2zav:B
8 6ss2:AAA 320 299 0.4249 0.3625 0.3880 1.46e-55 4hze:A, 4hze:B, 4hze:C, 4i06:A, 4i06:B, 4i06:C, 4ie2:A, 4ie2:B, 4ie2:C, 4ie3:A, 4ie3:B, 4ie3:C, 4ixu:A, 4ixu:B, 4ixu:C, 4ixv:A, 4ixv:B, 4ixv:C, 1pq3:A, 1pq3:B, 1pq3:C, 1pq3:D, 1pq3:E, 1pq3:F, 6q37:A, 6q37:B, 6q37:C, 6q39:A, 6q39:B, 6q39:C, 6ss4:AAA, 6ss6:AAA, 6ss6:BBB, 6ss6:CCC
9 3mmr:A 308 277 0.3443 0.3052 0.3394 2.85e-48 3sl0:A, 3sl1:A
10 5hj9:A 311 294 0.3700 0.3248 0.3435 1.87e-47 5hja:A, 4ity:A, 4iu0:A, 4iu1:A, 4iu4:A, 4iu5:A
11 5zee:B 297 291 0.3590 0.3300 0.3368 2.56e-46 5zee:A, 5zef:A, 5zef:B, 5zeh:A, 5zeh:B
12 4q3v:C 339 279 0.3150 0.2537 0.3082 3.23e-38 4q3p:A, 4q3p:B, 4q3p:C, 4q3p:D, 4q3q:A, 4q3q:B, 4q3q:C, 4q3q:D, 4q3r:A, 4q3r:B, 4q3r:C, 4q3r:D, 4q3s:A, 4q3s:B, 4q3s:C, 4q3s:D, 4q3t:A, 4q3t:B, 4q3t:C, 4q3t:D, 4q3u:A, 4q3u:B, 4q3u:C, 4q3u:D, 4q3v:A, 4q3v:B, 4q3v:D, 4q40:A, 4q40:B, 4q40:C, 4q40:D, 4q41:A, 4q41:B, 4q41:C, 4q41:D, 4q42:A, 4q42:B, 4q42:C, 4q42:D
13 3nip:B 316 287 0.3297 0.2848 0.3136 2.23e-23 3nip:C, 3nip:E, 3nip:D, 3nip:F, 3niq:A, 3niq:B
14 1gq6:B 301 198 0.2418 0.2193 0.3333 2.45e-21 1gq6:A, 1gq6:C, 1gq7:A, 1gq7:B, 1gq7:C, 1gq7:D, 1gq7:E, 1gq7:F
15 3nio:A 316 289 0.3114 0.2690 0.2941 3.57e-21 3nio:B, 3nio:C, 3nio:D, 3nio:E, 3nio:F
16 3lhl:A 276 232 0.2234 0.2210 0.2629 5.26e-20
17 3pzl:B 293 270 0.2747 0.2560 0.2778 1.19e-18 3pzl:A, 3pzl:C
18 4g3h:C 310 243 0.2161 0.1903 0.2428 2.55e-17 4g3h:A, 4g3h:B, 4g3h:D
19 9fek:G 377 292 0.2674 0.1936 0.2500 2.72e-17 9fek:A, 9fek:B, 9fek:C, 9fek:D, 9fek:E, 9fek:F, 9fek:H, 9fek:I, 9fek:J, 9fek:K, 9fek:L
20 6vst:D 320 227 0.2637 0.2250 0.3172 1.38e-16 6vss:A, 6vss:B, 6vss:C, 6vss:D, 6vss:E, 6vss:F, 6vst:A, 6vst:B, 6vst:C, 6vst:E, 6vst:F, 6vst:G, 6vst:H, 6vst:I, 6vst:J, 6vst:K, 6vst:L
21 7esr:A 378 285 0.2821 0.2037 0.2702 2.32e-15
22 4dz4:B 323 281 0.2857 0.2415 0.2776 4.35e-15 4dz4:A, 4dz4:C, 4dz4:D, 4dz4:E, 4dz4:F
23 6vsu:E 318 247 0.2711 0.2327 0.2996 7.05e-15 6vsu:A, 6vsu:B, 6vsu:C, 6vsu:D, 6vsu:F, 6vsu:G, 6vsu:I, 6vsu:H, 6vsu:J, 6vsu:K, 6vsu:L, 6vsu:M, 6vsu:N, 6vsu:O, 6vsu:P, 6vsu:Q, 6vsu:R, 6vsu:S, 6vsu:T, 6vsu:U, 6vsu:V, 6vsu:W, 6vsu:X
24 3m1r:D 321 227 0.2271 0.1931 0.2731 1.11e-14 3m1r:A, 3m1r:B, 3m1r:C, 3m1r:E, 3m1r:F
25 1wog:A 303 294 0.3040 0.2739 0.2823 1.79e-14 1wog:B, 1wog:C, 1wog:D, 1wog:E, 1wog:F, 1woi:A, 1woi:B, 1woi:C, 1woi:D, 1woi:E, 1woi:F
26 9iq9:B 275 197 0.2271 0.2255 0.3147 2.17e-14 7euk:A, 7euk:B, 7eul:A, 7eun:A, 7eun:B, 7euq:A, 7euq:B, 9iq9:A, 8ius:A, 8ius:B, 8iut:A, 8iut:B, 8iuu:A, 8iuu:B, 8iuv:A, 8iuv:B, 8iuw:A, 8iuw:B, 6lug:A, 6lug:B, 6luh:A, 6luh:B
27 7lba:B 310 265 0.2601 0.2290 0.2679 1.37e-13 7lba:A, 7lba:C, 7lba:D, 7lba:E, 7lba:F, 7lba:G, 7lba:H, 7lba:I, 7lba:J, 7lba:K, 7lba:L, 7lba:M, 7lba:P, 7lba:Q, 7lol:A, 7lox:A, 7lox:B, 7lox:C
28 4rhm:A 308 207 0.2234 0.1981 0.2947 6.67e-12 4rhl:A, 4rhl:B, 4rhm:B, 4rhm:C
29 8ryi:E 361 291 0.2747 0.2078 0.2577 1.73e-11 8ryi:B, 8snf:D, 8snf:F, 8snk:I, 8snk:A, 8sp2:G, 8sp2:H, 8sp2:I, 8sp2:J, 8x3g:A, 8x3g:B
30 4myn:A 298 272 0.2674 0.2450 0.2684 3.35e-11 4mxr:A, 4mxr:B, 4myf:A, 4myk:A
31 6ksy:B 289 137 0.1355 0.1280 0.2701 6.76e-08 6ksy:A, 6ksy:C, 6ksy:D
32 1rv8:B 305 99 0.1099 0.0984 0.3030 0.69 1rv8:A, 1rv8:C, 1rv8:D, 1rvg:A, 1rvg:B, 1rvg:C, 1rvg:D
33 8foc:B 450 79 0.0769 0.0467 0.2658 0.75 6di2:A, 6di6:A, 6dtv:A, 6dtz:A, 6du0:A, 8fod:B, 8foh:B, 8foj:B, 8fok:B, 3lgb:A, 3lgb:B, 7tl2:A, 7tl3:A, 7tl4:A
34 6z6p:M 534 37 0.0549 0.0281 0.4054 2.2
35 7jrg:A 487 221 0.2051 0.1150 0.2534 4.4 8e73:A, 8e73:M, 7jrg:M, 7jrp:A, 7jrp:M
36 3m6i:A 358 73 0.0623 0.0475 0.2329 5.8 3m6i:B
37 7w2i:A 183 31 0.0549 0.0820 0.4839 6.0 7w2i:B, 7w2i:C, 7w2i:D
38 1o8b:B 212 43 0.0586 0.0755 0.3721 6.4 1o8b:A
39 1cg0:A 431 150 0.1392 0.0882 0.2533 6.7 1cg1:A, 1cg3:A, 1cg4:A, 1ch8:A, 1cib:A, 2gcq:A, 1gim:A, 1gin:A, 1hon:A, 1hoo:A, 1juy:A, 1kjx:A, 1kkb:A, 1kkf:A, 1ksz:A, 1nht:A, 1qf4:A, 1qf5:A, 1son:A, 1soo:A
40 2p6y:A 131 53 0.0659 0.1374 0.3396 7.4
41 5i2u:B 297 69 0.0769 0.0707 0.3043 8.4 5i2u:A
42 3sbx:A 177 31 0.0513 0.0791 0.4516 9.7 3sbx:B, 3sbx:C, 3sbx:D, 3sbx:E, 3sbx:F, 3sbx:G, 3sbx:H

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218