BioLiP

>protein
EQIGTLTTETHPPLTWQTCTSGGSCTTNNGKVVLDANWRWLHSTSGSTNCYTGNTWNTTLCPDDTTCAQNCALDGADYEG
TYGITASGNSLRLNFVTNGSQKNVGSRTYLMKDDTHYQTFNLLNQEFTFDVDVSGLPCGLNGALYMVPMAADGGVSNEPN
NKAGAQYGVGYCDSQCPRDLKFIAGSANVQGWEPASNSANSGLGGNGSCCAELDIWEANSISAALTPHSADTVTQTVCNG
DDCGGTYSNDRYSGTTDPDGCDFNSYRQGDTSFYGPGKTVDTNSKFTVVTQFLTDSSGNLNEIKRFYVQNGVVIPNSQST
IAGISGNSITQDYCTAQKQVFGDTNTWEDHGGFQSMTNAFKAGMVLVMSLWDDYYADMLWLDSVAYPTDADPSTPGVARG
TCSTTSGVPSDIESSAASAYVIYSNIKVGPINSTFS

The query sequence (length=436) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4zzu:A	438	436	1.0000	0.9954	1.0000	0.0	4zzt:A, 4zzv:A, 4zzw:A
2	4v1z:A	440	438	0.7202	0.7136	0.7169	0.0	4v20:A
3	3pfx:A	436	439	0.7179	0.7179	0.7130	0.0	3pfz:A, 3pl3:A
4	4xeb:A	430	436	0.6881	0.6977	0.6881	0.0
5	4c4c:A	434	436	0.6330	0.6359	0.6330	0.0	4c4d:A, 1cel:A, 1cel:B, 2cel:A, 2cel:B, 3cel:A, 4cel:A, 4cel:B, 5cel:A, 6cel:A, 7cel:A, 4d5i:A, 4d5j:A, 4d5o:A, 4d5p:A, 4d5q:A, 4d5v:A, 1dy4:A, 1egn:A, 6grn:A, 7nyt:A, 7oc8:A, 1q2b:A, 1q2e:A, 1q2e:B, 6rwf:A, 4uwt:A, 4v0z:A, 2v3i:A, 2v3r:A
6	2xsp:A	440	442	0.6376	0.6318	0.6290	0.0	2yg1:A, 2yg1:B
7	5o59:A	430	438	0.6376	0.6465	0.6347	0.0	5o59:B
8	5w11:B	440	433	0.6170	0.6114	0.6212	0.0	5w11:A
9	1h46:X	431	440	0.6193	0.6265	0.6136	0.0	1z3t:A, 1z3v:A, 1z3w:A
10	4hap:A	431	439	0.5390	0.5452	0.5353	8.13e-159	4hap:B, 4haq:A, 4haq:B, 4ipm:A
11	2rfy:A	430	438	0.5000	0.5070	0.4977	1.01e-154	2rfy:B, 2rfy:C, 2rfy:D, 2rfz:A, 2rfz:D, 2rfz:B, 2rfz:C, 2rg0:A, 2rg0:B, 2rg0:C, 2rg0:D
12	4ovw:A	400	437	0.3853	0.4200	0.3844	1.07e-81	1ovw:A, 1ovw:B, 1ovw:C, 1ovw:D, 2ovw:A, 2ovw:B, 2ovw:C, 2ovw:D, 4ovw:B
13	6yoz:AAA	400	437	0.3647	0.3975	0.3638	1.41e-76	1ojj:A, 1ojj:B, 1ojk:A, 1ojk:B, 6yoz:BBB
14	4i3x:A	476	90	0.0573	0.0525	0.2778	6.0	4i3t:A, 4i3t:B, 4i3t:C, 4i3t:D, 4i3t:E, 4i3t:F, 4i3t:G, 4i3t:H, 4i3u:A, 4i3u:B, 4i3u:C, 4i3u:D, 4i3u:E, 4i3u:F, 4i3u:G, 4i3u:H, 4i3v:A, 4i3v:B, 4i3v:C, 4i3v:D, 4i3v:E, 4i3v:F, 4i3v:G, 4i3v:H, 4i3w:A, 4i3w:B, 4i3w:C, 4i3w:D, 4i3w:E, 4i3w:F, 4i3w:G, 4i3w:H, 4i3x:B, 4i3x:C, 4i3x:D, 4i3x:E, 4i3x:F, 4i3x:G, 4i3x:H
15	6lga:A	570	41	0.0344	0.0263	0.3659	7.4	6lga:B, 6lgb:A, 6lgb:B, 6lgc:A, 6lgc:B, 6lgd:A, 6lgd:B, 6lge:A, 6lge:B, 6lgf:A, 6lgf:B, 6lgg:A, 6lgg:B, 6lgh:A, 6lgh:B, 6lgi:A, 6lgi:B

[Back]