Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EKKKKLILFDFDSTLVNNETIDEIAREAGVEEEVKKITKEAMEGKLNFEQSLRKRVSLLKDLPIEKVEKAIKRITPTEGA
EETIKELKNRGYVVAVVSGGFDIAVNKIKEKLGLDYAFANRLIVKDGKLTGDVEGEVLKENAKGEILEKIAKIEGINLED
TVAVGDGANDISMFKKAGLKIAFCAKPILKEKADICIEKRDLREILKYIK

The query sequence (length=210) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1f5s:A 210 210 1.0000 1.0000 1.0000 1.11e-144 1f5s:B, 1j97:A, 1j97:B, 1l7m:A, 1l7m:B, 1l7n:A, 1l7n:B, 1l7o:A, 1l7o:B, 1l7p:A, 1l7p:B
2 3m1y:C 208 202 0.4524 0.4567 0.4703 1.08e-56 3m1y:A, 3m1y:B, 3m1y:D
3 8q4s:A 295 210 0.4238 0.3017 0.4238 1.58e-49 7qpl:A
4 8a1z:A 396 205 0.4286 0.2273 0.4390 3.88e-48 8a21:A, 5is2:A, 5it0:A, 5it4:A, 5jjb:A, 5jlp:A, 5jlr:A, 5jma:A, 3p96:A, 5t41:A
5 6hyj:B 223 194 0.3000 0.2825 0.3247 3.49e-20 6hyj:A, 6hyy:A, 6hyy:B, 1l8l:A, 1l8l:B, 1l8o:A, 1l8o:B, 1nnl:A, 1nnl:B, 6q6j:A, 6q6j:B
6 4ap9:A 200 207 0.3048 0.3200 0.3092 2.49e-16 4ap9:B, 4ap9:C, 4ap9:D
7 3kd3:A 216 195 0.2524 0.2454 0.2718 4.26e-12 3kd3:B
8 6iuy:A 585 213 0.2429 0.0872 0.2394 1.67e-10 6iuy:B
9 3pgv:A 259 37 0.0857 0.0695 0.4865 1.66e-04 3pgv:B, 3pgv:C, 3pgv:D
10 3pgv:A 259 60 0.0857 0.0695 0.3000 2.9 3pgv:B, 3pgv:C, 3pgv:D
11 1nrw:A 285 70 0.1238 0.0912 0.3714 8.22e-04
12 7qbz:A 638 135 0.1810 0.0596 0.2815 8.60e-04 7qc0:A
13 2rar:A 261 36 0.0762 0.0613 0.4444 0.002 2rav:A, 2rb5:A, 2rbk:A, 1ymq:A
14 3e81:A 164 114 0.1524 0.1951 0.2807 0.007 3e81:B, 3e81:D, 3e81:C, 3e84:A, 3e84:B, 3e84:C, 3e84:D, 3e8m:A, 3e8m:B, 3e8m:C, 3e8m:D, 4hgo:A, 4hgo:B, 4hgo:C, 4hgo:D, 4hgq:A, 4hgq:B, 4hgq:C, 4hgq:D, 4hgq:E, 4hgq:F, 4hgq:G, 4hgq:H, 4hgr:A, 4hgr:B, 4hgr:C, 4hgr:D, 4hgr:E, 4hgr:F, 4hgr:G, 4hgr:H
15 1rku:A 206 142 0.1524 0.1553 0.2254 0.008 1rku:B, 1rkv:A, 1rkv:B
16 4dwo:A 268 41 0.0857 0.0672 0.4390 0.009 3niw:A
17 1rkq:A 271 63 0.1095 0.0849 0.3651 0.011 1rkq:B
18 4umv:A 605 150 0.2095 0.0727 0.2933 0.012 4umw:A
19 3sky:A 261 169 0.2238 0.1801 0.2781 0.013
20 7r0h:A 654 134 0.1762 0.0566 0.2761 0.043 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
21 3r09:A 197 135 0.1667 0.1777 0.2593 0.048 2ybd:A
22 2no5:B 226 38 0.0667 0.0619 0.3684 0.058 2no5:A
23 3l7y:A 266 74 0.1048 0.0827 0.2973 0.13
24 1wzc:B 244 172 0.2000 0.1721 0.2442 0.23 1wzc:A
25 3r4c:A 268 43 0.0714 0.0560 0.3488 0.25
26 7xrl:D 554 107 0.1667 0.0632 0.3271 0.27 3auj:A, 3auj:L, 1dio:A, 1dio:L, 1eex:A, 1eex:L, 1egm:A, 1egm:L, 1egv:A, 1egv:L, 1iwb:A, 1iwb:L, 1uc4:A, 1uc4:L, 1uc5:A, 1uc5:L, 7xrk:A, 7xrk:D, 7xrl:A, 5yrt:A, 5yrt:D, 5yrt:G, 5yrt:J, 5yrv:A, 5yrv:D, 5yrv:G, 5yrv:J, 5ysh:A, 5ysh:D, 5ysh:G, 5ysh:J
27 1nf2:A 267 39 0.0810 0.0637 0.4359 0.27 1nf2:B, 1nf2:C
28 4ex6:A 219 104 0.1429 0.1370 0.2885 0.31 4ex7:A
29 4een:A 229 103 0.1286 0.1179 0.2621 0.42
30 7v4y:A 402 92 0.1095 0.0572 0.2500 0.46
31 1zrm:A 220 55 0.0762 0.0727 0.2909 0.53
32 6k7l:A 992 35 0.0714 0.0151 0.4286 0.61 6k7i:A, 6k7j:A, 6k7k:A, 6k7m:A, 6k7n:A
33 8vii:A 449 111 0.1571 0.0735 0.2973 0.78 8vih:A, 8vih:B, 8vii:B, 8vik:A, 8vil:A
34 4fso:A 354 54 0.0762 0.0452 0.2963 0.93 4fso:B
35 8ox4:A 870 26 0.0524 0.0126 0.4231 0.94
36 3n1u:A 182 117 0.1333 0.1538 0.2393 0.97
37 8ox6:A 575 21 0.0524 0.0191 0.5238 1.0
38 8ox8:A 1125 26 0.0524 0.0098 0.4231 1.0 8ox7:A, 8ox9:A, 7py4:A, 7vgj:A
39 4bbj:A 664 142 0.1810 0.0572 0.2676 1.1 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
40 8oxa:A 1035 26 0.0524 0.0106 0.4231 1.1 8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
41 7vgh:B 1183 26 0.0524 0.0093 0.4231 1.1 7vgi:B
42 7bss:A 816 44 0.0667 0.0172 0.3182 1.4 7bsu:A, 7bsv:A, 7bsw:A, 7vsg:A
43 4zev:A 290 37 0.0667 0.0483 0.3784 1.7 4qjb:A, 4qjb:B, 4zev:B, 4zew:A, 4zew:B, 4zex:A, 4zex:B
44 6ote:A 409 44 0.0857 0.0440 0.4091 1.8
45 5bnt:C 371 79 0.0952 0.0539 0.2532 1.9 5bnt:B, 5bnt:A, 5bnt:D
46 6wmp:D 1159 91 0.1190 0.0216 0.2747 2.0 6wmr:D, 6wmt:D
47 7bsp:A 1028 44 0.0667 0.0136 0.3182 2.1 7bsq:A, 7vsh:A
48 6lkn:A 1064 44 0.0667 0.0132 0.3182 2.2 6lkn:E, 6lkn:I, 6lkn:M
49 7kyc:A 1178 24 0.0571 0.0102 0.5000 3.5 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
50 6lcp:A 1140 26 0.0429 0.0079 0.3462 3.6 6lcr:A
51 7f0b:A 282 50 0.0762 0.0567 0.3200 4.1 7f0c:A, 7f0f:A
52 2hcf:A 225 201 0.2238 0.2089 0.2338 4.1
53 4ygr:A 215 126 0.1333 0.1302 0.2222 4.3 4ygs:A
54 3x17:B 548 52 0.0762 0.0292 0.3077 4.5 3x17:A
55 2p1r:A 290 72 0.1048 0.0759 0.3056 4.5 2p1r:B, 2p1r:C, 2p1r:D
56 6okp:M 131 45 0.0571 0.0916 0.2667 4.5 6okp:O
57 3shx:A 175 54 0.0762 0.0914 0.2963 5.3 6i36:A, 6i9p:A, 6i9t:A, 6iaf:A, 6iaj:A, 5j8s:A, 5j8w:A, 5j93:A, 5j9v:A, 5jac:A, 3ka3:A, 3ka4:A, 3ka6:A, 3ka8:A, 3ka9:A, 4lpj:A, 4lpm:A, 4lpn:A, 4lqh:A, 4lqj:A, 4lqv:A, 4lyu:A, 4lyx:A, 1mfr:A, 1mfr:B, 1mfr:C, 1mfr:D, 1mfr:E, 1mfr:F, 1mfr:G, 1mfr:H, 1mfr:I, 1mfr:J, 1mfr:K, 1mfr:L, 1mfr:M, 1mfr:N, 1mfr:O, 1mfr:P, 1mfr:Q, 1mfr:R, 1mfr:S, 1mfr:T, 1mfr:U, 1mfr:V, 1mfr:W, 1mfr:X, 4mjy:A, 4mku:A, 4ml5:A, 4mn9:A, 4my7:A, 3rbc:A, 3rbc:B, 3rbc:C, 3rbc:D, 3rbc:E, 3rbc:F, 3rbc:G, 3rbc:H, 3rbc:I, 3rbc:J, 3rbc:K, 3rbc:L, 3rbc:M, 3rbc:N, 3rbc:O, 3rbc:P, 3rbc:Q, 3rbc:R, 3rbc:S, 3rbc:T, 3rbc:U, 3rbc:V, 3rbc:W, 3rbc:X, 3re7:A, 3re7:B, 3re7:C, 3re7:D, 3re7:E, 3re7:F, 3re7:G, 3re7:H, 3re7:I, 3re7:J, 3re7:K, 3re7:L, 3re7:V, 3re7:M, 3re7:N, 3re7:O, 3re7:P, 3re7:Q, 3re7:R, 3re7:S, 3re7:T, 3re7:U, 3re7:W, 3re7:X, 3rgd:A, 3rgd:B, 3rgd:C, 3rgd:D, 3rgd:E, 3rgd:F, 3rgd:G, 3rgd:H, 3rgd:I, 3rgd:J, 3rgd:K, 3rgd:L, 3rgd:M, 3rgd:N, 3rgd:O, 3rgd:P, 3rgd:Q, 3rgd:R, 3rgd:S, 3rgd:T, 3rgd:U, 3rgd:V, 3rgd:W, 3rgd:X, 3se1:A, 3sh6:A, 5xhi:A, 5xhm:A, 5xhn:A, 5xho:A
58 3gyg:D 250 37 0.0571 0.0480 0.3243 5.4
59 3gyg:B 230 37 0.0571 0.0522 0.3243 5.5
60 3gyg:A 285 37 0.0571 0.0421 0.3243 5.6 3gyg:C
61 7dfa:A 363 62 0.0952 0.0551 0.3226 5.6 8as2:A, 8as3:A, 7df9:A, 7dfb:A, 7dfc:A, 8go8:A, 8go8:B, 8gp3:A, 8gp3:B, 8hsv:A, 8hsv:B, 8i0n:B, 8i0n:A, 8i0q:B, 8i0q:A, 8j8z:A, 8j8z:B, 4jqi:A, 8jrv:A, 6ni2:B, 7r0j:C, 6up7:B, 8wrz:A, 1zsh:A
62 8jaf:A 320 62 0.0952 0.0625 0.3226 5.7 8j97:A, 8ja3:B, 8ja3:A
63 1y8a:A 313 59 0.0905 0.0607 0.3220 6.0
64 7kya:A 1174 26 0.0429 0.0077 0.3462 6.4 7ky5:A, 7ky7:A, 7ky8:A, 7ky9:A
65 8k1l:A 979 54 0.0857 0.0184 0.3333 7.8
66 6roh:A 1112 16 0.0476 0.0090 0.6250 7.9 7oh4:A, 7oh5:A, 7oh6:A, 7oh7:A, 7pem:A, 6roi:A, 6roj:A
67 5m1d:A 469 53 0.0810 0.0362 0.3208 8.5 5m1d:B, 5m1d:C, 5m1e:A, 5m1e:B, 5m1e:C
68 7x20:A 986 37 0.0667 0.0142 0.3784 9.2 8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218