BioLiP

>protein
EEIFIGVAWPFASLDDLFAEGLELAVQEINEQGGVQGRKLSLVKADDEAELEKGLAIAQAFADNAGIQAVIGHRNSFISI
PAASIYDQAGLVMLSPASTSPDLTDHGYIHVFRNIPSDQEIARQLAIYLAEQGHERMVIYYTDDSYGNGLANAFEDYARA
QGITIVDRFNYYGNLKDLERLYDKWQAFGMDGIFIAKTATGGGTEFLVDAKSVGIEVPLIAGNSWDAMTAEGLLVGSFFN
PQRPDSRTQDFVEAFRREYGQPPTSYAAAGYDAVILLAEALEKSDLTHPATLAQGLRDLGPWEGVMGMHRFDGRGDDIGD
LVVLKKMKDGRFEYL

The query sequence (length=335) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4mlc:A	336	336	1.0000	0.9970	0.9970	0.0	4q6b:A
2	1usi:A	345	318	0.2925	0.2841	0.3082	9.49e-32	1usi:C, 1usk:A, 1usk:D, 1usk:B, 1usk:C
3	1z16:A	344	321	0.2925	0.2849	0.3053	8.62e-30	1z17:A, 1z18:A
4	3ip5:A	348	349	0.2896	0.2787	0.2779	3.02e-28	3ip6:A, 3ip7:A, 3ip9:A, 3ipa:A, 3ipc:A
5	4n0q:B	345	333	0.2746	0.2667	0.2763	1.00e-26	4n0q:A, 4n0q:C, 4n0q:D
6	4gnr:A	348	326	0.2299	0.2213	0.2362	2.31e-23
7	3td9:A	350	329	0.2597	0.2486	0.2644	5.83e-19
8	4q6w:A	376	351	0.2418	0.2154	0.2308	9.62e-11	4q6w:B
9	8wch:A	396	377	0.2269	0.1919	0.2016	1.54e-08	8wch:B
10	4eyg:B	364	308	0.1940	0.1786	0.2110	7.89e-07	4eyg:A
11	3i45:A	378	347	0.2478	0.2196	0.2392	1.19e-06
12	1qo0:B	374	284	0.1970	0.1765	0.2324	1.19e-06	1pea:A, 1qnl:A, 1qo0:A
13	3lop:A	353	201	0.1463	0.1388	0.2438	5.71e-06
14	4nqr:A	364	306	0.1612	0.1484	0.1765	9.74e-06	4nqr:B, 4nv3:A, 4nv3:B, 4oat:A, 4oat:B, 4obb:A, 4obb:B, 4og2:A, 4og2:B, 4otz:A, 4otz:B, 4qym:A, 4qym:B, 4rdc:A, 4rv5:A, 4rv5:B
15	6e5v:B	447	120	0.1045	0.0783	0.2917	7.39e-05	6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
16	8tao:B	771	114	0.0866	0.0376	0.2544	9.15e-05	7fd8:A, 7fd8:B, 7fd9:A, 7fd9:B, 3lmk:A, 3lmk:B, 8t8m:A
17	6n51:B	793	109	0.0866	0.0366	0.2661	9.21e-05	6n4x:B, 6n4y:C, 6n50:A, 6n50:B, 6n50:C, 6n51:A, 8t6j:B, 8t6j:A, 8t7h:A, 8t7h:B, 8t8m:B, 8tao:A
18	8jd6:R	774	119	0.1045	0.0452	0.2941	2.79e-04	7e9h:R, 7e9h:S, 8jd4:4, 8jd5:4, 8jd6:S
19	4zpj:A	371	314	0.2299	0.2075	0.2452	6.23e-04
20	5c5c:A	432	140	0.1104	0.0856	0.2643	0.001
21	7lzh:A	798	290	0.1910	0.0802	0.2207	0.002	7lzh:B, 7lzh:C, 7lzh:D, 7lzi:A, 7lzi:B, 7lzi:C, 7lzi:D
22	4dqd:A	361	168	0.1104	0.1025	0.2202	0.002	3sg0:A
23	5ere:A	540	297	0.2179	0.1352	0.2458	0.002
24	8tr2:A	745	155	0.1343	0.0604	0.2903	0.003	2e4u:A, 2e4u:B, 2e4v:A, 2e4v:B, 2e4w:A, 2e4w:B, 2e4x:A, 2e4x:B, 2e4y:A, 2e4y:B, 8tqb:A, 8tqb:B, 8tr0:B, 8tr2:B, 8trc:A, 8trc:B, 8trd:A, 8trd:B, 7wi6:A, 7wi6:B, 7wi8:A, 7wi8:B
25	7dge:A	784	109	0.0836	0.0357	0.2569	0.008	1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
26	8jd5:2	785	148	0.1224	0.0522	0.2770	0.009	5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
27	8jcu:3	765	156	0.1313	0.0575	0.2821	0.011	6b7h:A, 5cnk:A, 5cnm:A, 8jcv:3, 8jcw:3, 8jcx:3, 8jcy:3, 8jcz:3, 8jd0:3, 8jd1:3, 8jd2:3, 8jd3:3, 3sm9:A, 8tr0:A, 7wih:A, 7wih:B, 4xar:A
28	7cum:B	675	107	0.1045	0.0519	0.3271	0.012	7c7q:B, 6w2x:B, 6wiv:B
29	7mtq:B	744	122	0.1104	0.0497	0.3033	0.012	8jd4:2
30	6uo8:B	696	107	0.1045	0.0503	0.3271	0.015	7ca3:B, 7eb2:D
31	7epb:A	779	101	0.0925	0.0398	0.3069	0.096	7epb:B, 7mtq:A
32	6oe7:A	258	58	0.0537	0.0698	0.3103	0.31	6oea:A, 6oeb:A, 6oov:A
33	3mq4:A	386	77	0.0746	0.0648	0.3247	0.83
34	4fyg:A	743	40	0.0448	0.0202	0.3750	3.0	4fye:A, 4fyf:A
35	6c75:A	378	78	0.0627	0.0556	0.2692	6.5	6c75:B, 6c76:A, 6c7l:A
36	3a74:A	484	29	0.0388	0.0269	0.4483	8.2	3a74:B, 3a74:C, 3a74:D, 3e9h:A, 3e9h:B, 3e9h:C, 3e9h:D, 3e9i:A, 3e9i:B, 3e9i:C, 3e9i:D
37	9bh5:AO	135	75	0.0746	0.1852	0.3333	9.4	9cai:AO

[Back]